1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_26 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - 0.23 - - - - - 0.16 - - - - - - - - - - 1.83 4.05 1.48 - -0.34 -
-1.6 -2.83 - -0.7 -0.96 -2.12 -1.35 -0.03 -0.71 -0.57 -0.3 -0.4 -1.91 - - -2.02 -1.29 -0.87 - -2.43 -0.4 2.41 1.37 0.7 2.06 1.94
- - - - - - - - - - - - - - 3.6 - - 2.11 - 2.53 1.91 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
0.24 -0.31 - - 0.81 - - - 0.1 1.02 1.12 1.2 - 1.53 0.01 - - 1.52 - - - 2.1 - - 0.43 1.19
- 0.93 1.58 - - - 1.8 - - - - - - 2.34 - 1.24 - - - 1.26 - 1.95 - 1.24 0.67 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.71 - - - - - - - - - - - - - 4.47 1.16 - - - - - - - - - -
- 0.41 - 0.91 - - 0.84 - - - - - - - 0.58 1.86 - 0.09 - 0.45 1.86 2.79 - - 1.54 -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- -1.72 -0.86 -1.78 0.81 -0.77 -0.61 0.07 1.02 -0.94 0.43 - -1.96 -2.44 -1.03 -1.87 -1.62 -2.45 1.05 1.58 1.28 0.36 1.16 -0.25 0.29 1.1
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
-2.08 0.25 -1.77 0.28 0.2 -1.52 - -0.07 -1.65 -0.28 -1.81 -1.66 - 1.39 1.71 0.53 -0.04 0.64 -0.03 -2.15 -0.17 2.04 -0.56 - -0.08 0.24
- 0.4 - - - - - - 0.94 - - - - 2.16 3.2 - 1.79 - 1.74 0.44 -0.12 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.41 -0.03 0.67 0.42 0.39 - -1.15 -0.4 0.11 -1.03 -0.64 -1.85 -0.64 - -2.19 - -1.73 -1.02 -3.3 -2.32 -2.61 1.0 1.46 1.59 1.69 1.4
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - 3.18 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.08 - - - -
1.3 -0.52 -0.93 -1.72 - 0.48 -0.71 -2.72 - -0.26 -2.73 -1.06 -0.76 -1.24 -0.25 -1.8 -2.54 0.54 1.14 - 0.13 2.89 0.01 -0.55 -0.82 0.72
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.43 -2.34 -1.75 -0.54 -1.22 -2.6 -0.54 -0.3 -0.47 -0.82 0.44 -1.64 -2.22 -2.07 -4.34 -1.74 -3.16 -0.27 -1.95 -2.0 0.33 2.03 1.55 0.78 2.17 1.42
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.19 0.78 - 1.93 0.63 0.26 1.23 2.35 0.26 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.34 - - - - - - - - - - - - - 4.39 - - - - - - - - - - -
-0.37 - - 1.18 -0.17 - -0.35 - - - -0.43 - - - 1.98 - 2.87 -0.95 - - 2.21 -0.75 - 1.83 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
- - - 1.45 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.85 1.0 - 0.7 2.38
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.71 1.86 3.98 - - - -
-0.93 -0.23 -1.42 0.46 -0.38 -0.85 -0.97 0.16 0.79 0.49 0.82 0.36 -1.3 - - -3.6 - -1.08 - - -3.68 2.32 0.36 -0.28 0.97 1.87
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.13 3.09 - - - - -
-1.29 - -2.98 0.04 -1.93 - -0.87 - -0.15 0.25 -1.42 -1.88 -2.55 - - -2.84 - -0.01 -2.05 -3.36 -0.3 2.26 1.04 2.02 1.83 2.0
0.95 -0.71 -0.13 -0.57 -0.54 -1.02 -0.27 0.41 0.05 0.2 -0.92 -2.09 0.98 -0.35 -3.04 -1.02 -2.34 -0.93 -3.35 -6.02 -0.12 2.68 0.16 -0.71 0.23 0.23
- - - - - - - - - - - - - - 4.16 - - - 3.02 - - - - - - -
0.04 0.59 - - - 1.48 - 0.55 - 0.23 - - 1.78 - - 1.48 - 1.64 0.27 1.96 0.94 - - - -0.33 -0.16
- -2.66 - -1.16 -1.34 - -0.5 -1.18 -2.25 -0.73 - -2.15 -1.85 -1.6 - 0.24 -2.27 0.27 -2.31 - -3.23 3.73 2.28 - -0.49 -1.11
- - - - - - - - - - - - - 0.04 - 1.95 2.41 0.98 - 0.88 -0.06 - -0.03 2.56 1.29 0.77
0.19 - - - 0.2 0.39 - - - - - 0.58 - 1.5 - - - - -0.86 - 2.59 2.58 1.89 - 0.88 -
- - - - - - - - - - - - - - 4.58 - 1.03 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.51 - 3.87 - - - - - - - - - - -
- - 2.32 - - - - - - - - - - - 3.07 - - - 2.32 - - 2.93 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 2.56 1.63 - - - - 2.85 3.29 - - - -
- 3.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.16 2.7 - - 2.48 -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.26 0.54 2.21 -0.28 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 2.41 - - 4.37 - - - - - - - - - - -
- - - - 0.52 - - - - - - - - 0.97 2.62 - 2.6 1.8 - 1.4 1.51 - - 0.52 - -
- - 1.07 - - 2.32 - - - - - - - - 2.4 - - 0.32 - - - 1.67 - 2.67 - 1.49
- - - - - 2.18 - - - - - - - 1.58 1.92 - - - 2.16 - - 3.36 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - - 1.83 1.45 - - - - - - 1.86 - - 3.82 - - 1.0 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
- - - 2.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.0 - 3.69 - -
- - - 0.99 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.17 3.13 0.53 - 2.28 -
- - - - - - - - - - - - - - 2.71 - 2.93 - - - - - - 3.56 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
-0.32 -2.14 -5.41 -3.06 -5.51 -5.16 - - -3.79 -5.46 -3.43 -2.99 -0.87 -1.05 -4.5 - -3.69 -4.11 -3.85 -3.73 3.04 3.63 0.11 -1.81 -0.81 -0.8
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.11 - - 3.13 -
- - - - 1.54 - - - - - - 1.95 - 2.19 2.59 - 1.81 1.3 - - - 1.44 - - - -
- - - 0.79 - - - 1.83 0.76 1.95 - 0.8 - - - 0.7 - 0.12 - - 1.1 1.64 - - 2.1 0.21
- -0.05 -0.59 1.79 1.01 0.99 0.23 -0.24 -0.83 -0.27 -3.25 -2.09 -2.01 -2.83 -0.53 -1.15 -1.36 -1.17 -0.41 0.37 1.28 1.63 -0.71 0.08 0.0 -0.86
- - - - - 2.12 - - - 0.01 - - - 2.9 - - - 1.53 - - - 3.37 - - - -
- - - - - - - - - - - - - 2.43 - - - - - - - 3.19 - - 3.52 -
- - - - - - 1.58 - - 1.01 - - 1.52 2.74 2.87 - - - 1.05 1.04 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.57 2.16 2.18 - 2.91 -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
- - 1.95 - - -0.46 - - - - - - - 1.88 -0.72 - - - - 2.74 1.71 2.32 - - - 1.11
- 0.91 - - - 1.34 - - - - - - - - 3.07 - 2.88 - - 1.0 - 1.93 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.