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Heatmap: Cluster_210 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.82 -0.39 -0.29 -0.08 0.29 -0.26 -0.16 -0.54 -0.23 0.07 -0.04 -0.07 -1.52 -0.54 -0.99 -0.1 -0.19 0.15 0.08 0.5 -1.45 0.48 0.64 1.5 -0.11 0.53
0.69 0.23 0.16 -0.32 -2.26 -3.53 -1.39 -0.03 -0.77 -0.17 -0.23 -0.22 0.75 -0.64 -0.51 0.05 -0.58 1.17 0.74 0.04 -3.12 -0.41 0.01 -0.18 0.98 1.04
0.53 0.15 -0.48 -0.73 -0.49 -0.51 0.05 0.09 0.04 0.09 0.01 -0.48 0.1 0.19 -0.21 0.33 -0.11 1.02 0.3 -0.14 -2.25 0.01 -0.23 -0.78 0.68 0.14
-0.63 -0.12 -0.29 0.06 0.04 -0.09 0.16 -0.25 0.23 0.17 -0.07 -0.19 -1.07 -0.2 -0.13 -0.07 -0.2 0.77 0.48 -0.05 -1.44 -0.25 0.45 0.59 -0.06 0.42
0.09 0.05 -0.02 0.01 0.09 -0.23 -0.19 -0.16 -0.09 0.07 0.31 0.32 0.09 -0.45 -0.79 -0.13 -0.45 0.4 0.35 0.26 -1.81 0.04 0.22 -0.15 0.25 0.45
-0.29 -0.29 0.01 -0.13 -1.0 -0.93 -0.09 -0.08 0.15 -0.1 -0.43 -0.4 -0.56 0.5 0.19 0.53 -0.04 1.03 0.0 0.16 -1.12 -1.86 0.5 -0.12 0.84 0.42
-0.44 -0.6 -0.72 -0.3 -0.28 -0.05 0.05 0.04 0.47 0.67 0.57 0.79 0.0 -0.69 -0.69 -0.38 -0.0 0.43 0.34 0.44 -1.95 -0.98 0.0 -0.45 0.59 0.2
- - - - - - - - - - - - - - - - - 1.95 2.63 2.38 2.74 - 2.04 - - -
-3.05 -0.51 0.09 0.21 0.2 0.08 -0.36 -0.26 0.36 0.31 0.32 0.52 -4.35 -1.38 -0.48 -1.83 -0.03 0.34 0.26 0.84 -3.46 -0.69 0.46 1.07 0.57 0.69
-0.41 -0.97 -1.43 -0.82 -0.24 0.12 0.38 0.11 0.19 -0.03 0.12 -0.28 -0.59 -1.2 -1.03 -1.3 -0.35 0.49 0.25 -0.46 -2.56 0.56 1.04 0.85 1.25 0.56
-0.02 0.21 0.06 0.33 0.41 -0.45 0.01 0.39 0.13 0.2 0.63 0.64 -0.14 -1.48 -0.84 -1.06 -0.77 0.55 0.22 -0.34 -4.49 0.02 -0.1 0.28 0.47 -0.1
- - - - - -0.61 - - - 0.1 1.11 - - -1.02 -0.94 0.21 - 1.0 0.38 1.92 - - 2.83 1.26 0.5 0.93
-0.9 -0.57 -0.94 0.4 0.47 -0.21 0.09 0.28 0.46 -0.02 0.12 -0.53 -1.45 -0.63 -0.7 -0.14 -0.68 0.73 0.2 -0.57 -2.14 0.19 0.52 0.17 1.07 0.7
-0.87 -0.94 -1.03 -0.93 -0.81 -1.16 -0.65 -0.61 -0.66 -0.14 -0.25 -0.18 -1.49 0.12 0.52 0.63 0.88 0.77 0.3 -0.05 -0.82 0.81 0.69 0.62 0.64 0.21
- - -1.47 - - - - - -1.72 - - - - - -0.87 - 0.1 2.9 1.77 2.58 0.33 -2.1 -2.08 0.05 1.29 0.71
-2.85 -0.68 0.06 0.2 0.3 -0.11 0.06 -0.29 0.21 0.35 0.17 -0.27 -2.86 0.11 -0.35 0.38 -0.05 0.66 0.27 -0.1 -2.45 0.06 0.15 0.66 0.65 0.23
-1.1 -0.22 -0.05 0.14 -0.16 -0.43 0.3 0.28 0.19 0.21 0.19 -0.14 -1.2 -0.25 0.05 -0.12 -0.32 0.83 0.16 0.33 -4.72 -0.74 0.03 0.47 0.68 0.44
0.34 0.09 -0.36 -0.75 -1.1 -0.78 -0.4 -0.32 -0.58 -0.35 -0.54 -0.35 0.13 0.15 0.14 0.17 0.12 0.97 0.89 0.06 -1.28 -0.16 -0.06 0.08 0.72 0.49
-1.21 -1.0 -1.18 -0.22 0.29 0.46 0.14 0.25 0.08 -0.04 0.12 -1.07 -1.77 -1.35 -0.64 -1.63 -0.31 0.88 0.57 -0.25 -1.6 0.69 0.72 0.32 1.21 0.6
-0.06 -0.04 0.05 -0.16 -0.58 -0.88 -0.24 -0.06 -0.46 -0.07 -0.43 -0.45 -0.39 -0.05 0.32 -0.09 -0.07 1.11 0.53 -0.01 -2.43 0.07 0.67 0.24 0.14 0.47
-0.8 -0.81 -0.35 -0.16 -0.66 -1.08 -0.09 0.18 -0.35 0.35 0.47 0.27 -0.88 -0.28 -1.38 -0.68 -0.04 0.32 0.23 0.18 -1.37 -0.05 0.86 0.66 1.02 0.72
-0.93 -0.82 -0.61 -0.11 -1.12 -1.78 0.2 0.13 -1.02 -0.09 0.13 0.13 -1.61 -0.23 -1.49 -0.17 0.22 0.51 0.1 0.59 -0.99 -0.25 1.14 0.55 0.95 1.11
0.26 -0.03 -0.01 0.3 0.44 -0.05 0.28 0.29 -0.08 -0.5 -0.44 -0.64 -0.47 -0.65 -0.44 -0.33 -0.15 0.39 0.42 -0.12 -3.03 0.53 0.35 -0.52 0.74 0.3
-0.78 0.1 -0.02 -0.23 -0.24 -0.52 0.19 -0.14 0.12 -0.09 -0.11 0.04 -0.83 0.15 -0.1 0.13 -0.16 0.86 0.51 -0.13 -2.39 -0.47 0.24 0.55 0.56 0.19
-1.42 -0.44 0.29 0.4 0.03 -0.52 -0.1 0.18 0.44 0.64 0.53 0.42 -1.01 -1.78 -1.49 -2.53 0.23 0.58 0.04 0.75 -3.95 -0.47 -0.12 0.61 0.54 0.56
-0.63 -0.57 -0.2 0.09 0.1 -0.35 0.19 0.33 0.25 0.2 -0.12 -0.53 -1.21 -0.25 -0.48 -0.27 -0.36 0.59 0.05 0.01 -1.83 0.29 0.8 -0.17 0.87 0.51
-0.64 -0.44 -0.37 -0.17 0.06 0.05 0.31 0.27 0.22 0.19 0.06 -0.22 -0.89 -0.41 0.01 -0.1 -0.04 0.37 0.22 0.03 -2.07 0.32 0.49 0.14 0.65 -0.01
-0.51 -0.08 -0.21 -0.12 0.15 -0.32 0.39 0.48 -0.12 0.24 -0.13 -0.35 -0.69 -0.7 -0.01 -0.77 -0.28 1.31 0.55 -0.16 -3.85 -0.14 0.7 0.23 -0.53 0.27
0.19 0.15 0.15 0.27 -0.33 -1.02 -0.12 0.18 -0.71 -0.39 -0.68 -0.71 -0.09 -0.55 0.25 -0.39 -0.53 1.16 0.3 0.34 -0.89 0.16 -0.76 -0.66 0.99 0.7
-0.71 0.07 0.14 0.05 -0.28 -0.71 0.21 0.3 0.37 0.48 0.69 0.64 -0.31 -1.87 -2.15 -1.43 -0.39 0.9 -0.19 0.35 -4.05 -0.37 -0.17 0.48 0.58 0.54
-1.07 -0.18 0.24 0.31 0.16 0.04 -0.07 -0.07 0.02 -0.3 -0.26 -0.29 -0.88 0.37 0.01 0.39 0.14 -0.07 -0.12 -0.1 -1.26 0.15 0.57 -0.47 0.95 -0.07
-1.06 -0.81 -0.9 -0.49 -0.25 -0.37 0.18 0.13 0.61 0.16 0.17 -0.27 -1.33 -0.11 -0.03 -0.4 -0.06 0.41 0.42 0.08 -1.62 0.15 0.99 0.25 0.86 0.16
-1.52 0.1 0.39 0.34 0.09 -0.46 -0.05 0.02 -0.29 -0.27 -0.43 -0.4 -1.3 0.13 0.37 0.54 -0.27 0.71 0.29 0.11 -1.13 -0.49 0.34 -0.26 0.76 0.16
0.08 0.04 0.04 0.48 0.07 -0.59 -0.51 -0.12 -0.07 -0.17 0.22 0.27 -0.37 -0.98 -0.47 -0.34 -0.79 0.69 0.68 0.1 -2.64 0.38 -0.02 0.25 0.47 0.35
-0.11 -0.06 0.05 0.27 0.22 -0.23 0.17 0.14 0.06 0.11 -0.07 -0.29 -0.45 -0.41 -0.25 -0.22 -0.17 0.47 0.01 -0.2 -1.2 0.15 0.41 -0.2 0.56 0.25
-0.45 0.16 -0.1 0.12 -0.22 -0.41 -0.33 -0.58 -0.17 0.12 0.34 -0.07 -0.99 -0.29 -0.05 -0.75 -0.26 0.65 0.76 0.83 -2.8 -1.36 0.24 0.53 0.49 0.63
-0.67 -0.5 -0.58 -0.53 -0.36 -0.15 0.18 0.41 0.38 0.48 0.4 0.11 -0.77 0.19 -0.15 -0.34 -0.51 0.73 0.17 0.4 -2.42 -1.56 -0.22 0.88 0.53 0.23
-0.94 -0.15 -0.01 0.63 0.16 -0.27 -0.13 0.23 0.22 0.58 0.77 0.67 -1.64 -1.9 -1.12 -1.61 0.54 0.29 -0.18 -0.22 -5.21 -0.19 -0.01 0.56 0.95 -0.05
-2.38 -0.46 -0.59 -0.74 -0.35 -0.45 0.03 0.23 0.58 0.86 0.74 0.46 -1.63 -1.51 -0.92 -1.66 -0.05 0.58 0.49 0.4 -5.05 0.52 0.5 0.65 0.64 0.05
-1.36 -1.12 -0.48 -1.15 -1.71 -1.97 -1.32 -0.62 -1.11 0.28 -0.33 -0.42 -1.04 0.62 0.28 -0.96 -0.63 2.17 -0.42 1.35 -3.55 -0.93 0.36 -0.17 1.49 0.43
-1.19 -1.87 -1.66 -1.74 -1.0 -1.89 -1.2 -1.53 -1.18 -0.66 -0.43 -0.66 -1.25 -0.41 -0.21 -3.51 -1.13 1.98 -0.5 1.81 -2.52 -1.63 0.78 1.4 1.69 0.88
-0.31 0.31 -0.02 -0.18 -0.7 -1.42 -0.66 -0.16 -0.32 -0.39 -0.41 -0.52 -0.44 -0.2 0.2 -0.23 0.01 0.97 0.68 0.29 -3.63 -0.08 0.31 0.01 1.39 0.34
0.03 -0.43 -0.28 -0.08 0.22 0.11 0.04 0.18 0.24 0.5 0.59 0.6 0.21 -0.04 -0.69 -0.1 -0.63 0.19 0.13 -0.27 -1.12 -1.16 -0.25 -0.53 0.3 0.47
0.25 0.27 -0.01 -0.16 -0.19 -0.1 -0.14 -0.12 -0.26 -0.34 -0.62 -0.61 0.15 0.02 0.44 0.16 -0.07 0.73 0.45 -0.06 -1.16 0.11 -0.56 -0.43 0.64 0.14
-0.52 -0.08 -0.28 -0.35 -0.48 -0.63 -0.1 0.12 0.31 0.6 0.42 0.42 -0.17 -0.56 0.11 -0.29 0.03 0.99 0.54 0.19 -4.61 0.03 0.08 -0.3 0.27 -0.46
-0.66 -0.64 -1.13 0.12 0.56 -0.28 0.37 -0.14 0.14 0.0 -0.24 -0.48 -1.49 -0.9 -0.57 -0.42 -0.35 0.58 0.42 -0.41 -2.67 0.11 1.17 0.27 1.23 0.4
-1.44 -0.86 -0.46 -0.36 0.22 -0.08 -0.03 0.74 0.47 0.5 0.52 0.15 -2.53 -1.1 -0.78 -0.63 -0.61 0.83 0.62 -0.23 - -2.13 0.71 1.07 0.85 0.04
0.06 -0.06 -0.06 -0.3 -0.72 -1.07 -0.44 -0.15 -0.13 0.08 0.1 0.06 0.24 -0.79 -0.65 -0.67 0.02 0.79 0.08 0.69 -1.21 -0.28 0.41 0.35 0.78 0.49
- - - -2.02 - -1.85 -3.22 - -0.53 -2.52 -0.52 - -3.02 0.25 0.24 -0.5 -0.19 -0.63 0.63 1.93 -1.06 0.06 2.06 0.57 1.02 2.18
0.18 -0.16 -0.38 -0.13 -0.48 -0.72 -0.51 0.07 0.25 0.24 0.52 0.22 0.11 -1.04 -0.77 -0.9 -0.28 0.17 0.2 0.44 -1.68 0.1 0.35 0.23 0.93 0.45
0.04 -0.01 -0.5 -0.87 -0.97 -0.85 -0.23 -0.23 0.08 0.41 0.32 0.08 -0.26 0.18 0.05 -0.13 0.28 0.85 0.62 -0.01 -2.57 0.02 -0.09 0.35 0.23 0.3
-0.35 -0.18 -0.28 -0.26 -0.26 0.06 -0.12 -0.0 -0.1 -0.09 -0.22 -0.1 -0.7 -0.02 0.17 0.41 -0.03 0.55 0.41 0.13 -1.78 -0.2 0.4 -0.4 0.75 0.44
-0.26 -0.59 -0.57 -0.32 -0.39 -1.31 -0.08 -0.02 -0.43 0.0 -0.19 -0.54 -0.45 -0.02 -0.19 0.01 0.02 0.97 0.13 -0.13 -1.69 -0.06 0.92 -0.02 1.12 0.78
0.32 -1.89 -0.58 -1.27 -1.64 -0.83 -0.24 -0.01 -0.69 0.2 0.26 0.58 0.66 -0.34 -0.92 -0.54 -1.96 -0.41 -0.74 -3.57 -1.04 0.85 1.48 -0.39 1.91 0.4
0.01 0.34 0.15 -0.21 -0.71 -1.34 -0.38 -0.42 -0.68 -0.17 -0.1 -0.11 0.19 0.53 0.35 0.02 0.08 0.9 0.34 0.31 -1.82 -0.07 -0.46 -0.29 0.37 0.58
0.1 0.29 0.02 -0.53 -0.84 -0.73 -0.39 -0.66 -0.67 -0.28 -0.6 -0.44 -0.15 0.55 0.44 0.09 0.22 0.93 0.87 0.52 -1.97 -0.1 -0.7 -0.06 0.19 0.65
0.26 0.28 0.12 0.23 0.05 -0.58 -0.7 -0.61 -0.5 -0.37 0.15 0.23 -0.72 -1.18 -0.27 -1.31 0.55 0.38 0.35 0.93 -2.33 -2.0 0.8 1.04 -0.58 0.55
0.14 0.16 0.16 0.25 0.11 -0.35 -0.66 -0.66 -0.72 -0.46 0.14 0.21 -0.66 -1.41 -0.37 -1.66 0.52 0.37 0.55 0.82 -1.41 -1.72 0.53 1.06 -0.25 0.72
-0.34 -0.5 -0.69 -0.19 -0.48 -1.19 -0.57 -0.63 -0.7 -0.39 -0.26 -0.22 -0.64 0.44 0.66 0.22 0.27 0.96 0.51 0.25 -2.61 -0.65 0.68 0.52 0.49 0.78
0.06 -0.04 -0.62 0.27 -0.12 -0.56 0.19 0.18 0.4 0.17 0.34 -0.15 -0.12 -0.49 -0.66 -1.03 -0.34 0.71 0.03 -0.16 -2.98 0.07 0.64 -0.89 1.1 0.16
-0.07 -0.4 -0.49 0.45 0.44 -0.16 -0.15 0.3 -0.06 0.44 0.48 0.11 -0.26 -0.58 -0.63 -0.24 -1.05 0.2 -0.17 -0.61 -3.64 -0.53 0.29 1.03 0.67 0.32
-0.79 -0.4 -0.37 -0.29 -0.26 -0.85 -0.34 -0.49 -0.46 -0.37 -0.56 -0.74 -0.9 0.32 0.45 0.22 -0.04 1.08 0.5 0.06 -0.77 0.26 0.71 0.17 0.86 0.25
-0.34 -0.81 -1.06 -1.6 -2.06 -1.59 -0.87 -0.37 -0.02 0.12 -0.09 0.29 -0.7 -0.45 -0.19 0.58 -0.19 0.18 0.04 0.36 -0.98 0.24 1.05 -0.07 1.77 0.62

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.