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Heatmap: Cluster_132 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.29 0.03 -0.4 -0.3 0.08 -0.01 -0.4 -0.34 -0.08 -0.21 -0.17 -0.08 -0.57 -1.04 -0.82 -0.84 -0.25 -0.19 -0.38 -0.38 -0.25 -0.28 2.0 0.81 0.46 0.04
-0.16 -0.07 0.23 0.1 -0.65 -1.31 -0.82 -0.37 -0.96 -1.17 -1.05 -0.99 -0.59 -0.67 -0.64 -0.65 -0.55 -0.5 -0.7 -0.31 0.09 0.02 2.45 0.36 0.77 0.72
0.51 -1.11 -1.66 -0.26 -0.7 - -0.79 -1.78 -0.06 -0.74 -1.13 0.43 0.63 -2.32 -2.76 -2.52 -2.46 -3.25 -1.13 - -0.76 0.56 3.2 -0.06 0.94 0.24
-1.16 -0.87 -0.54 -1.08 -0.22 -0.14 -0.29 -0.54 0.07 -0.35 0.01 -0.39 -1.34 0.11 0.0 0.14 -0.45 0.12 0.68 -0.32 -0.65 -1.31 2.24 0.6 -0.45 0.21
-0.79 -0.39 -0.71 -0.04 -0.48 -1.08 -1.36 -0.68 -1.3 -0.95 -0.28 -0.4 -1.28 -1.82 -3.82 -2.02 -2.34 -1.17 -2.15 -1.88 -0.17 0.65 2.92 0.16 1.79 0.71
-0.97 -0.21 -0.19 -0.93 -0.9 -0.66 -0.75 -0.43 -0.85 -1.16 -0.55 -0.75 -1.15 0.28 0.05 -0.25 -0.35 0.41 0.37 -0.25 -0.85 -0.45 2.37 -0.56 0.96 0.65
-0.18 -0.25 -0.24 0.19 0.2 0.01 0.05 0.17 0.1 -0.02 -0.09 -0.2 -0.22 -0.43 -0.36 -0.43 -0.45 -0.04 -0.06 -0.39 -0.6 0.01 1.35 0.43 -0.05 0.05
-0.23 -1.03 -0.98 -0.5 -0.38 -0.06 0.09 0.16 0.22 0.08 0.04 -0.42 -0.21 -0.46 -0.8 -0.74 -1.06 -0.0 -0.3 -0.9 -0.27 -0.08 1.98 0.67 0.36 0.43
-0.25 -0.52 -0.46 -0.28 -0.33 -0.4 -0.2 -0.16 -0.22 -0.31 -0.06 -0.04 -0.29 -0.12 -0.42 -0.08 -0.36 0.06 0.03 -0.54 0.03 -0.48 1.29 1.05 0.58 0.35
-0.29 -0.45 -0.43 -0.35 -0.18 -0.08 -0.04 0.07 0.14 0.09 0.03 -0.07 -0.11 0.14 0.09 0.19 0.03 -0.25 0.07 -0.08 -0.44 -0.08 1.42 0.26 -0.63 -0.67
-2.06 -1.94 -1.64 -0.29 -0.35 -0.94 -0.88 -1.28 -0.71 -0.24 0.07 0.19 -1.62 -0.85 -2.22 -1.36 -1.41 -0.89 -1.05 -2.18 1.06 -1.74 2.0 1.94 1.49 1.22
-0.4 -0.83 -0.74 -0.33 -0.25 -0.27 -0.21 -0.18 -0.18 -0.18 -0.19 -0.15 -0.55 0.33 0.72 0.2 -0.39 0.36 -0.18 -0.49 -0.64 -0.19 1.74 0.08 0.04 -0.0
0.58 -0.2 -0.6 -0.61 -1.01 -0.74 -0.34 -0.56 -0.52 -0.13 -0.18 -0.21 -0.42 -1.92 -1.23 -1.11 -1.25 -0.74 -0.51 -0.84 0.58 1.05 2.17 1.07 0.01 0.07
-0.94 -0.02 -0.21 0.01 -0.01 0.26 -0.28 -0.31 -0.26 -0.52 -0.54 -0.31 -1.15 0.04 0.03 0.24 -0.48 -0.06 -0.19 -0.49 -0.46 -0.18 2.04 0.11 -0.09 0.12
-2.01 -2.11 -1.31 -1.3 -1.43 -1.19 -1.07 -0.99 -1.35 -1.6 -1.42 -1.43 -1.56 -1.25 0.27 0.24 -0.46 0.29 0.53 -0.12 0.82 -0.88 2.84 0.31 0.73 0.69
0.64 -0.24 -0.71 -0.03 -0.52 -0.84 -0.62 -0.28 -0.54 -0.35 0.36 0.03 -0.26 -1.31 -2.29 -1.57 -1.44 -0.85 -1.28 -1.84 0.95 0.53 2.3 0.55 0.67 -0.4
-1.06 -4.24 -5.09 -5.48 -4.44 -3.27 -0.29 -0.28 -0.26 0.6 0.46 0.03 -1.12 0.22 -1.33 -0.68 -1.15 -0.08 -0.75 -0.64 0.3 -3.39 2.16 1.42 1.07 1.6
-0.12 -0.22 -0.28 0.13 0.09 -0.16 0.21 0.28 0.07 -0.07 -0.18 -0.37 -0.27 -0.9 -0.71 -0.63 -0.35 0.26 -0.23 -0.19 -0.42 0.17 1.55 -0.0 0.38 -0.2
-0.09 -0.13 -0.4 -0.39 -0.1 0.03 -0.14 0.23 0.2 0.19 0.18 0.18 -1.25 -0.89 -0.15 -1.13 -0.58 -0.3 -0.17 -0.91 -3.27 -1.47 2.0 0.95 0.47 0.07
-0.86 -0.95 -0.87 -0.6 -0.77 -0.94 -0.48 -0.38 -0.49 -0.48 -0.22 0.05 -0.56 0.13 1.01 -0.11 -0.71 0.16 -0.5 -1.02 0.62 0.34 2.12 -0.1 0.21 -0.08
-0.5 -0.52 -0.6 -1.03 -0.28 -0.42 -0.02 -0.48 0.03 -0.08 -0.09 -0.28 -0.85 -0.89 -0.24 -0.22 -0.45 0.29 0.18 -0.09 -0.83 -0.1 2.07 1.09 0.13 -0.54
-0.62 -0.56 -1.0 -0.02 0.11 -0.48 -0.11 0.25 -0.04 0.18 -0.28 -0.24 -1.85 0.09 -0.64 0.01 -0.09 0.29 -0.38 -0.31 -1.15 -0.72 1.92 0.29 0.72 0.1
-0.57 -0.35 -0.34 -0.26 -0.19 -0.18 0.02 0.02 0.26 0.26 0.22 0.21 -0.93 -0.08 -0.24 -0.38 -0.26 -0.16 -0.59 -0.28 0.4 -1.19 1.82 -0.17 0.04 -0.14
-0.9 -0.47 -0.24 0.26 0.51 0.61 0.52 0.41 0.25 0.22 0.1 0.01 -0.63 -0.77 -0.94 -1.19 -0.74 -0.58 -0.56 -0.61 0.09 -0.34 1.61 0.01 -0.25 -0.02
0.21 -0.22 -0.24 -0.1 -0.41 -0.29 -0.15 0.36 0.1 -0.25 0.16 0.04 -0.29 -1.68 -1.17 -1.49 -1.19 -0.47 -0.77 -1.02 0.28 -0.48 2.08 0.47 0.7 0.05
-2.21 -0.65 -0.29 -0.85 -1.14 -0.83 -0.18 0.1 -0.04 -0.02 -0.05 -0.28 -2.38 -0.64 -0.31 -0.93 -0.5 -0.13 -0.27 -0.33 0.2 -2.12 2.44 0.54 1.13 0.27
-0.19 -0.48 -0.59 -0.26 -0.04 0.18 -0.04 0.03 0.21 0.04 0.12 -0.01 -0.31 -0.25 0.16 -0.11 -0.32 -0.34 -0.06 -0.12 -0.4 -0.11 1.48 0.37 -0.23 -0.37
0.11 -0.01 -0.48 -0.4 -0.87 -1.11 -0.66 -0.21 -0.1 -0.23 -0.18 -0.37 -0.09 -0.38 -0.41 -0.42 -0.36 0.52 0.63 -0.76 -0.65 -0.01 1.91 0.42 0.34 -0.07
-0.3 -0.56 -0.43 -0.61 -0.34 -0.46 -0.52 -0.25 -0.1 -0.13 -0.15 -0.33 -0.55 -0.11 -0.07 0.0 -0.33 0.09 -0.08 -0.42 -0.01 -0.44 1.71 0.63 0.49 0.52
-2.04 -4.2 -4.4 -3.77 -4.34 -4.26 -3.67 -3.88 -4.38 -2.47 -2.43 -1.97 -4.23 -0.33 1.65 0.32 -1.6 -0.23 -0.35 -0.99 1.06 0.38 3.11 1.45 -0.36 0.5
-1.95 -3.09 -4.49 -2.84 -5.79 -5.48 -2.75 -2.23 -1.57 -3.55 -2.37 -1.48 -1.82 -1.4 1.62 -0.13 -1.57 -0.09 -0.05 -1.36 1.0 0.21 3.08 1.37 -0.38 0.87
-1.32 -1.17 -1.13 -0.78 -0.89 -1.57 -1.04 -0.4 -0.68 -0.96 -0.7 -1.45 -2.24 0.58 0.05 0.69 -0.79 -0.1 0.13 -0.32 -0.47 -0.1 2.58 0.14 0.89 0.61
0.08 -0.42 -1.21 -0.57 -1.08 -0.38 -0.53 -0.38 -0.17 0.01 0.08 -0.12 -0.75 0.23 -0.41 0.14 -0.41 -0.64 0.29 -0.08 -0.05 -0.65 1.55 0.34 0.79 0.85
0.13 -0.21 -0.48 0.05 0.55 0.31 0.31 0.13 0.29 0.11 0.19 0.08 -0.21 -0.63 -0.08 -0.7 -0.86 -0.61 -0.67 -0.97 -0.38 -1.42 1.67 0.36 -0.09 -0.33
-0.39 -1.03 -1.08 -0.78 -0.83 -1.14 -0.62 -0.6 -0.06 0.03 0.3 0.19 -0.57 -1.4 -0.52 -1.57 -1.32 -0.33 -0.57 -0.71 0.26 0.75 2.19 0.85 0.73 0.63
-0.15 -0.22 -0.58 -0.84 -0.45 -0.61 -0.54 -0.82 -0.75 -0.17 0.04 0.06 -0.48 0.41 -0.45 -0.12 -0.19 -0.26 0.26 -0.24 0.13 -2.02 1.44 1.3 0.29 0.7
0.05 0.31 0.27 0.45 0.47 0.35 -0.11 0.19 0.15 -0.22 0.06 0.02 -0.25 -0.44 -0.41 -0.63 -0.86 -0.31 -0.52 -0.77 -0.7 -0.87 1.32 0.13 0.18 -0.17
0.29 -0.83 -1.57 -1.78 -1.09 -0.49 0.05 0.04 -0.23 -0.17 -0.24 -0.4 0.19 -0.95 -1.11 -1.17 -0.6 -0.52 -0.7 -0.87 -0.28 -0.1 2.34 0.95 1.24 -0.36
-0.11 -0.63 -1.2 -0.37 -0.25 -0.82 -0.42 -0.12 -0.07 0.02 0.3 -0.19 -0.13 -0.47 0.08 -0.39 -0.46 -0.37 -0.78 -0.97 -1.01 -0.87 1.93 1.23 0.74 0.2
0.25 -0.59 -0.75 -0.49 -0.5 -0.94 -0.5 -0.48 -0.28 -0.49 0.08 -0.43 -0.48 -1.64 -1.09 -1.63 -1.02 -0.62 0.06 -1.16 0.42 -1.2 2.47 0.68 0.98 0.6
-1.44 -0.92 -0.49 -0.3 -0.21 -0.14 -0.19 -0.13 -0.09 -0.07 -0.1 0.04 -1.52 0.02 -0.12 -0.01 -0.12 0.25 0.04 -0.23 0.0 0.02 1.59 0.46 0.37 0.27
-0.44 -0.03 -0.07 -0.39 -1.44 -2.03 -1.45 -0.66 -0.46 -0.19 -0.16 -0.14 -0.4 0.14 -0.21 0.31 -0.3 0.01 0.28 -0.04 -0.73 -0.49 1.96 0.26 0.76 0.59
-2.53 -1.12 -0.02 -0.15 -0.49 -1.02 -0.46 0.13 -0.01 -0.15 0.02 -0.25 -2.85 0.07 0.01 -0.24 -0.36 0.56 0.53 -0.32 -1.44 -0.59 2.1 0.12 0.56 0.36
0.01 -1.13 -1.52 -1.6 -0.84 -0.41 -0.16 -0.06 0.1 0.14 0.09 -0.01 0.02 -0.29 -0.69 -0.59 -0.63 0.01 -0.13 -0.46 -0.16 0.29 1.94 0.63 0.77 -0.24
-1.16 -1.21 -1.28 -0.88 -0.96 -1.05 -0.87 -0.94 -0.84 -0.87 -0.65 -0.74 -1.14 0.49 1.28 1.04 -0.73 0.34 0.24 -0.8 0.48 -0.04 2.27 0.28 -1.01 -0.16
-2.48 -0.44 0.05 -0.13 -0.03 -0.0 -0.2 0.11 0.18 -0.2 0.02 0.08 -3.52 0.12 -0.24 0.12 -0.39 0.19 -0.33 -0.75 -1.62 -0.6 1.98 0.09 0.85 -0.12
-1.35 -1.76 -0.85 -0.87 -0.53 -0.12 -0.48 -0.79 -0.31 -0.03 -0.04 -0.02 -1.59 -0.74 -0.28 -0.37 -0.3 -0.3 0.28 0.26 -0.3 -0.9 2.35 0.8 0.33 0.63
- -2.94 - -2.48 - - -3.65 - -3.98 - -3.16 -4.01 -3.71 -1.02 0.94 -0.45 -0.04 0.88 1.58 -0.28 0.45 -1.98 3.34 0.38 -0.07 0.6
0.72 -0.14 -1.01 -0.33 -1.26 -1.64 -1.46 -0.36 -0.2 -0.5 0.36 0.35 0.54 -2.44 -3.42 -3.06 -2.15 -1.37 -1.56 -2.19 0.28 0.58 2.42 0.87 1.08 0.17
0.02 -1.46 -1.36 -0.46 -1.01 -2.17 -0.91 -0.35 -0.55 -0.39 0.35 0.34 -0.17 -0.49 -1.51 -1.61 -2.02 -0.54 -1.46 -3.06 0.24 -0.12 2.64 -0.45 1.67 0.62
-0.43 -0.94 -0.78 -0.74 -0.62 -0.65 -0.48 -0.65 -0.44 -0.48 -0.34 -0.27 -0.82 -1.04 -1.39 -1.12 -1.13 -0.02 0.03 -0.38 0.39 0.31 2.38 0.89 0.66 0.61
-1.51 -1.05 -1.02 -0.41 -0.03 -0.35 -0.04 -0.04 -1.09 -0.42 -0.25 -0.28 -2.01 -0.68 -0.47 -0.46 -0.3 0.22 -0.1 0.21 0.59 -2.3 2.31 0.61 0.53 0.37
-1.44 -1.42 -2.92 -1.9 -3.19 -3.28 -2.71 -1.08 -1.31 -1.35 -1.98 -2.81 -4.35 -2.57 -1.69 -1.9 -2.95 0.19 0.29 -3.46 1.18 0.88 3.16 1.54 0.8 0.78
- - -4.68 -4.61 - -4.67 - - - - -4.72 - - 0.36 -0.07 0.58 0.27 0.58 0.9 -0.09 0.36 0.32 3.31 0.71 0.43 0.26

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.