Heatmap: Cluster_212 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.05 0.17 0.26 0.34 0.54 0.59 0.56 0.43 0.37 0.32 0.2 0.18 0.04 0.46 0.53 0.73 0.5 1.0 0.88 0.57 0.4 0.27 0.48 0.43 0.28 0.34
0.1 0.21 0.36 0.42 0.74 1.0 0.96 0.88 0.57 0.38 0.24 0.22 0.06 0.35 0.49 0.55 0.49 0.53 0.56 0.57 0.12 0.33 0.57 0.32 0.53 0.39
0.06 0.3 0.42 0.48 0.68 0.85 0.81 0.74 0.6 0.55 0.37 0.3 0.03 0.28 0.63 0.61 0.62 1.0 0.93 0.73 0.75 0.07 0.74 0.55 0.8 0.55
0.1 0.27 0.3 0.42 0.69 1.0 0.78 0.58 0.49 0.26 0.22 0.2 0.13 0.54 0.46 0.52 0.57 0.72 0.72 0.52 0.07 0.84 0.62 0.36 0.8 0.53
0.29 0.43 0.51 0.61 0.82 1.0 0.78 0.69 0.67 0.7 0.66 0.48 0.24 0.52 0.64 0.51 0.51 0.51 0.84 0.63 0.06 0.97 0.46 0.76 0.59 0.53
0.2 0.38 0.35 0.46 0.73 0.99 0.79 0.67 0.67 0.61 0.46 0.36 0.19 0.34 0.48 0.45 0.51 0.68 0.51 0.64 0.1 0.77 0.7 0.64 1.0 0.55
0.02 0.16 0.26 0.34 0.46 0.64 0.46 0.46 0.62 0.49 0.4 0.36 0.04 0.49 0.45 0.45 0.3 0.42 0.46 0.27 0.17 0.46 1.0 0.74 0.35 0.5
0.11 0.21 0.3 0.33 0.57 0.76 1.0 0.73 0.65 0.39 0.24 0.12 0.07 0.27 0.54 0.54 0.76 0.81 0.92 0.77 0.25 0.43 0.82 0.34 0.54 0.43
0.08 0.15 0.33 0.28 0.59 0.69 0.81 0.73 1.0 0.51 0.34 0.19 0.06 0.23 0.5 0.7 0.54 0.74 0.82 0.53 0.46 0.22 0.32 0.15 0.43 0.29
0.08 0.27 0.42 0.37 0.58 1.0 1.0 0.69 0.73 0.45 0.32 0.25 0.09 0.25 0.52 0.58 0.71 0.85 0.94 0.81 0.26 0.6 0.46 0.66 0.4 0.53
0.09 0.21 0.37 0.38 0.58 0.7 1.0 0.79 0.68 0.42 0.35 0.24 0.06 0.38 0.5 0.71 0.71 0.9 0.79 0.87 0.27 0.76 0.67 0.68 0.52 0.61
0.32 0.22 0.29 0.39 0.49 0.86 1.0 0.87 0.99 0.78 0.65 0.44 0.35 0.21 0.3 0.37 0.45 0.91 0.78 0.62 0.35 0.25 0.51 0.41 0.33 0.35
0.14 0.25 0.45 0.61 0.74 0.91 0.95 0.82 0.56 0.29 0.21 0.16 0.08 0.52 0.57 1.0 0.65 0.68 0.89 0.8 0.17 0.4 0.78 0.27 0.83 0.66
0.07 0.16 0.21 0.29 0.67 1.0 0.64 0.5 0.25 0.11 0.09 0.05 0.03 0.1 0.15 0.29 0.22 0.36 0.35 0.31 0.1 0.03 0.23 0.11 0.28 0.18
0.01 0.17 0.26 0.4 0.55 0.89 0.57 0.57 0.22 0.2 0.15 0.1 0.03 0.32 0.37 0.67 0.56 0.5 0.5 0.99 0.0 0.37 1.0 0.28 0.86 0.55
0.31 0.26 0.33 0.48 0.54 0.51 0.72 0.74 0.7 0.64 0.55 0.47 0.25 0.74 0.48 0.77 0.57 0.78 0.59 0.46 0.5 0.39 1.0 0.8 0.66 0.53
0.56 0.51 0.45 0.52 0.58 0.6 0.54 0.52 0.65 0.8 0.86 0.83 0.49 0.66 0.8 0.87 0.56 0.68 0.79 0.57 0.44 0.66 1.0 0.94 0.65 0.7
0.3 0.49 0.45 0.51 0.55 0.86 0.78 0.71 0.63 0.55 0.46 0.44 0.25 0.32 0.58 0.48 0.57 1.0 0.84 0.81 0.46 0.05 0.76 0.32 0.28 0.42
0.25 0.34 0.47 0.57 0.79 1.0 0.78 0.63 0.64 0.61 0.41 0.44 0.21 0.56 0.5 0.48 0.37 0.71 0.58 0.37 0.11 0.51 0.56 0.56 0.49 0.58
0.03 0.22 0.29 0.4 0.69 1.0 0.81 0.57 0.38 0.2 0.15 0.13 0.02 0.28 0.37 0.56 0.52 0.54 0.69 0.63 0.35 0.06 0.6 0.43 0.25 0.3
0.35 0.35 0.63 0.64 0.9 1.0 0.87 0.88 0.77 0.62 0.43 0.4 0.33 0.36 0.33 0.49 0.6 0.61 0.78 0.65 0.28 0.25 0.72 0.8 0.56 0.57
0.39 0.5 0.55 0.72 0.93 1.0 0.66 0.6 0.5 0.41 0.35 0.26 0.27 0.35 0.4 0.35 0.35 0.65 0.52 0.41 0.07 0.85 0.42 0.54 0.97 0.61
0.43 0.52 0.51 0.61 0.8 1.0 0.89 0.86 0.92 0.72 0.79 0.67 0.39 0.52 0.55 0.52 0.49 0.81 0.71 0.6 0.33 0.71 0.79 0.87 0.91 0.55
0.09 0.27 0.42 0.5 0.63 0.79 0.72 0.59 0.6 0.52 0.44 0.39 0.11 0.33 0.51 0.71 1.0 0.74 0.74 0.64 0.34 0.3 0.56 0.54 0.43 0.36
0.07 0.31 0.32 0.45 0.8 1.0 0.69 0.57 0.28 0.25 0.18 0.13 0.05 0.13 0.37 0.52 0.65 0.73 0.78 0.9 0.14 0.07 0.58 0.37 0.35 0.2
0.04 0.31 0.7 0.79 0.8 1.0 0.66 0.6 0.86 0.68 0.56 0.48 0.07 0.44 0.39 0.4 0.5 0.71 0.75 0.68 0.26 0.69 0.54 0.94 0.85 0.67
0.43 0.5 0.5 0.41 0.61 0.71 0.64 0.61 0.59 0.53 0.44 0.34 0.36 0.55 0.58 0.68 0.71 0.8 0.98 1.0 0.6 0.36 0.25 0.34 0.46 0.55
0.05 0.28 0.33 0.36 0.68 1.0 0.73 0.61 0.37 0.28 0.23 0.17 0.03 0.27 0.22 0.41 0.48 0.62 0.66 0.63 0.09 0.12 0.53 0.36 0.6 0.36
0.2 0.26 0.52 0.63 0.74 0.79 0.8 0.6 0.9 0.67 0.67 0.55 0.15 0.78 0.53 0.86 0.52 0.68 0.55 0.46 0.09 0.86 1.0 0.42 0.55 0.47
0.14 0.18 0.31 0.31 0.46 0.59 1.0 0.81 0.71 0.33 0.22 0.14 0.11 0.14 0.33 0.37 0.48 0.8 0.93 0.55 0.4 0.12 0.73 0.23 0.34 0.29
0.21 0.4 0.31 0.36 0.48 0.61 0.69 0.6 0.65 0.65 0.57 0.54 0.18 0.51 0.48 1.0 0.3 0.75 0.47 0.36 0.36 0.57 1.0 0.36 0.39 0.39
0.23 0.38 0.37 0.53 0.86 1.0 0.57 0.46 0.2 0.31 0.31 0.26 0.12 0.32 0.34 0.41 0.35 0.53 0.49 0.56 0.06 0.74 0.27 0.52 0.36 0.54
0.31 0.45 0.49 0.53 0.75 1.0 0.84 0.76 0.74 0.56 0.43 0.33 0.24 0.5 0.6 0.54 0.7 0.7 0.69 0.77 0.61 0.42 0.36 0.32 0.47 0.48
0.2 0.31 0.5 0.53 0.6 1.0 0.86 0.7 0.83 0.51 0.35 0.33 0.17 0.2 0.35 0.61 0.57 0.65 0.94 0.88 0.26 0.09 0.49 0.92 0.36 0.51
0.04 0.03 0.11 0.18 0.48 0.85 0.57 0.43 0.8 0.49 0.36 0.26 0.01 0.57 0.34 0.54 0.36 0.34 0.38 0.33 0.25 0.39 1.0 0.58 0.51 0.52
0.16 0.4 0.54 0.63 0.81 0.99 0.83 0.84 0.95 0.67 0.59 0.58 0.09 0.56 0.69 1.0 0.59 0.78 0.74 0.65 0.07 0.64 0.58 0.71 0.65 0.62
0.51 0.71 0.7 0.76 0.76 1.0 0.85 0.77 0.71 0.45 0.36 0.37 0.41 0.5 0.51 0.51 0.44 0.78 0.65 0.57 0.11 0.87 0.44 0.61 0.79 0.72
0.13 0.35 0.51 0.64 0.73 0.59 0.78 0.7 0.54 0.6 0.58 0.52 0.12 0.48 0.51 0.63 0.64 1.0 0.97 0.95 0.45 0.25 0.64 0.89 0.79 0.59
0.18 0.36 0.52 0.57 0.67 0.69 0.66 0.62 0.88 0.78 0.62 0.63 0.24 0.76 0.64 0.99 0.61 0.87 0.66 0.6 0.4 0.56 0.94 1.0 0.58 0.7
0.15 0.23 0.38 0.45 0.62 0.69 1.0 0.76 0.7 0.46 0.29 0.21 0.12 0.4 0.4 0.45 0.62 0.97 0.85 0.67 0.45 0.55 0.38 0.3 0.75 0.57
0.05 0.06 0.24 0.32 0.41 0.58 0.64 0.63 0.71 0.59 0.43 0.3 0.04 0.81 0.46 0.91 0.43 0.61 0.34 0.4 0.33 0.36 1.0 0.36 0.72 0.68
0.45 0.49 0.58 0.65 0.72 0.76 1.0 0.88 0.89 0.67 0.61 0.59 0.49 0.81 0.61 0.91 0.63 0.93 0.68 0.6 0.58 0.62 0.95 0.46 0.67 0.58
0.39 0.71 0.74 0.73 0.8 0.83 0.78 0.71 0.66 0.56 0.47 0.41 0.35 0.49 0.66 0.65 0.63 1.0 0.8 0.65 0.67 0.65 0.68 0.63 0.55 0.48
0.02 0.21 0.45 0.63 1.0 0.99 0.81 0.55 0.4 0.37 0.25 0.24 0.02 0.15 0.37 0.24 0.4 0.64 0.64 0.63 0.03 0.06 0.27 0.13 0.35 0.42
0.32 0.35 0.47 0.51 0.63 0.75 0.89 0.74 0.7 0.51 0.42 0.4 0.3 0.53 0.75 0.73 0.76 1.0 0.95 0.81 0.63 0.46 0.78 0.41 0.54 0.47
0.21 0.23 0.25 0.31 0.43 0.56 0.9 0.82 0.75 0.47 0.32 0.31 0.13 0.59 0.32 1.0 0.42 0.5 0.59 0.47 0.29 0.28 0.78 0.51 0.7 0.59
0.13 0.25 0.3 0.44 0.39 0.35 0.59 0.55 0.7 0.62 0.46 0.36 0.13 0.89 0.66 0.99 0.67 0.52 0.54 0.54 0.35 0.51 1.0 0.71 0.61 0.53

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)