Heatmap: Cluster_86 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.32 0.24 0.28 0.6 0.56 0.43 0.56 0.44 0.52 0.71 0.93 1.0 0.45 0.02 0.0 0.04 0.0 0.18 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.87 0.78 0.6 0.7 0.64 0.62 0.7 0.84 0.93 0.86 0.97 1.0 0.64 0.13 0.24 0.17 0.26 0.43 0.43 0.33 0.21 0.52 0.71 0.74 0.58 0.42
0.3 0.1 0.19 0.29 0.53 0.44 0.58 0.53 0.69 0.86 0.96 1.0 0.56 0.18 0.16 0.14 0.16 0.26 0.26 0.2 0.01 0.03 0.24 0.28 0.25 0.19
0.39 0.48 0.52 0.4 0.81 0.46 0.47 0.42 0.2 0.47 0.74 0.95 1.0 0.16 0.24 0.26 0.24 0.17 0.13 0.25 0.0 0.0 0.01 0.12 0.01 0.16
0.19 0.09 0.1 0.15 0.36 0.25 0.36 0.3 0.29 0.47 1.0 0.83 0.35 0.26 0.39 0.24 0.09 0.28 0.24 0.06 0.0 0.04 0.11 0.5 0.08 0.16
0.16 0.07 0.12 0.17 0.17 0.37 0.28 0.45 0.46 0.74 1.0 0.73 0.25 0.13 0.22 0.18 0.05 0.3 0.16 0.05 0.0 0.06 0.24 0.37 0.17 0.22
0.4 0.15 0.21 0.36 0.47 0.52 0.62 0.57 0.55 0.86 1.0 0.77 0.45 0.11 0.03 0.08 0.01 0.04 0.05 0.1 0.01 0.01 0.45 0.18 0.04 0.09
0.24 0.21 0.34 0.33 0.41 0.57 0.6 0.59 0.8 1.0 0.87 0.81 0.35 0.02 0.66 0.04 0.39 0.11 0.18 0.11 0.1 0.31 0.11 0.33 0.48 0.49
0.19 0.22 0.28 0.31 0.34 0.33 0.59 0.63 0.66 1.0 0.97 0.72 0.32 0.02 0.68 0.04 0.49 0.12 0.12 0.15 0.09 0.32 0.15 0.23 0.44 0.53
0.73 0.47 0.41 0.81 0.68 0.36 0.39 0.55 0.71 0.82 0.67 0.82 1.0 0.17 0.1 0.08 0.03 0.18 0.3 0.14 0.05 0.13 0.4 0.15 0.32 0.2
0.37 0.27 0.12 0.34 0.52 0.38 0.33 0.37 0.62 0.73 1.0 0.75 0.4 0.09 0.03 0.03 0.12 0.09 0.19 0.15 0.09 0.06 0.34 0.51 0.15 0.28
0.8 0.79 0.58 0.72 0.69 0.62 0.46 0.59 0.66 0.71 0.93 1.0 0.54 0.1 0.13 0.04 0.24 0.43 0.38 0.47 0.01 0.08 0.25 0.47 0.27 0.28
0.55 0.45 0.35 0.32 0.35 0.33 0.34 0.46 0.58 0.8 1.0 0.94 0.51 0.08 0.1 0.1 0.18 0.14 0.14 0.26 0.07 0.03 0.51 0.46 0.19 0.26
0.5 0.32 0.44 0.44 0.43 0.43 0.46 0.47 0.6 0.52 0.94 1.0 0.66 0.26 0.26 0.33 0.24 0.17 0.32 0.35 0.07 0.06 0.46 0.28 0.3 0.14
0.19 0.01 0.03 0.1 0.27 0.4 0.38 0.25 0.42 0.95 1.0 0.8 0.3 0.08 0.02 0.02 0.12 0.07 0.08 0.23 0.05 0.1 0.35 0.48 0.09 0.22
0.39 0.21 0.23 0.36 0.51 0.48 0.53 0.58 0.63 0.78 0.89 1.0 0.59 0.13 0.16 0.12 0.13 0.18 0.09 0.24 0.15 0.57 0.45 0.45 0.32 0.31
0.63 0.31 0.28 0.67 0.66 0.45 0.43 0.45 0.29 0.33 0.63 0.83 1.0 0.0 0.06 0.01 0.02 0.06 0.08 0.09 0.01 0.02 0.0 0.0 0.03 0.02
0.46 0.49 0.41 0.68 0.71 0.54 0.66 0.78 0.93 0.99 0.96 1.0 0.43 0.27 0.35 0.24 0.38 0.47 0.39 0.31 0.01 0.04 0.42 0.32 0.34 0.31
0.6 0.49 0.45 0.49 0.72 0.67 0.56 0.54 0.8 0.76 0.87 1.0 0.78 0.21 0.27 0.26 0.24 0.31 0.44 0.3 0.05 0.01 0.2 0.28 0.13 0.23
0.6 0.43 0.41 0.53 0.46 0.41 0.39 0.43 0.49 0.53 0.72 1.0 0.88 0.09 0.04 0.12 0.06 0.15 0.07 0.11 0.17 0.26 0.53 0.63 0.19 0.19
0.85 0.76 0.56 0.68 0.86 0.83 0.67 0.79 0.87 0.91 1.0 0.91 0.65 0.32 0.38 0.33 0.39 0.52 0.48 0.46 0.16 0.19 0.59 0.49 0.42 0.42
0.17 0.47 0.28 0.58 0.4 0.46 0.48 0.36 0.42 0.7 1.0 0.83 0.09 0.13 0.12 0.01 0.08 0.15 0.21 0.13 0.22 0.39 0.43 0.42 0.27 0.19
0.69 0.58 0.53 0.88 0.75 0.38 0.57 0.67 0.55 0.75 0.85 0.81 1.0 0.05 0.04 0.05 0.52 0.12 0.07 0.11 0.03 0.23 0.04 0.1 0.19 0.29
0.47 0.46 0.59 0.71 0.78 0.75 0.82 0.84 0.97 0.97 1.0 0.99 0.65 0.53 0.48 0.5 0.51 0.56 0.46 0.49 0.1 0.39 0.63 0.53 0.35 0.48
0.12 0.05 0.17 0.14 0.15 0.34 0.51 0.29 0.48 0.82 1.0 0.52 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.19 0.01 0.39 0.0 0.02 0.02
0.19 0.07 0.08 0.12 0.23 0.35 0.24 0.27 0.49 1.0 0.98 0.77 0.21 0.09 0.1 0.16 0.06 0.09 0.05 0.07 0.12 0.38 0.25 0.32 0.2 0.27
0.08 0.09 0.01 0.23 0.2 0.14 0.39 0.38 0.36 0.66 1.0 0.58 0.14 0.07 0.01 0.08 0.07 0.02 0.0 0.03 0.16 0.06 0.38 0.56 0.17 0.2
0.06 0.01 0.01 0.04 0.05 0.04 0.05 0.04 0.73 0.64 1.0 0.85 0.12 0.05 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01
0.37 0.35 0.33 0.33 0.43 0.49 0.58 0.57 0.69 0.9 1.0 0.89 0.48 0.17 0.26 0.23 0.18 0.17 0.2 0.26 0.02 0.23 0.3 0.35 0.27 0.27
0.22 0.22 0.33 0.19 0.18 0.18 0.2 0.2 0.44 0.61 0.98 1.0 0.22 0.03 0.03 0.01 0.02 0.01 0.01 0.04 0.03 0.04 0.17 0.11 0.02 0.06
0.72 0.7 0.66 0.69 0.6 0.44 0.59 0.73 0.55 0.77 0.9 0.86 1.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0 0.07 0.18
0.78 0.67 0.54 0.53 0.57 0.62 0.87 0.92 0.94 1.0 0.88 0.78 0.86 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.02 0.26 0.5
0.5 0.45 0.45 0.61 0.54 0.34 0.4 0.5 0.42 0.6 0.94 1.0 0.81 0.02 0.01 0.02 0.62 0.02 0.02 0.03 0.01 0.43 0.12 0.11 0.18 0.35
0.34 0.42 0.42 0.41 0.39 0.31 0.48 0.52 0.74 0.96 1.0 0.93 0.44 0.05 0.1 0.06 0.21 0.35 0.24 0.43 0.22 0.36 0.57 0.46 0.27 0.22
0.5 0.43 0.43 0.47 0.38 0.38 0.42 0.53 0.7 0.7 0.89 1.0 0.5 0.31 0.44 0.39 0.31 0.38 0.39 0.26 0.04 0.14 0.57 0.35 0.18 0.21
0.69 0.51 0.36 0.47 0.54 0.5 0.67 0.69 0.77 0.88 1.0 0.85 0.81 0.1 0.13 0.17 0.08 0.14 0.09 0.08 0.04 0.04 0.27 0.62 0.13 0.14
0.2 0.14 0.23 0.36 0.36 0.17 0.35 0.26 0.27 0.53 0.66 1.0 0.25 0.12 0.07 0.21 0.08 0.08 0.07 0.05 0.14 0.01 0.52 0.38 0.32 0.19
0.57 0.3 0.2 0.41 0.4 0.28 0.27 0.32 0.42 0.51 0.89 1.0 0.78 0.24 0.05 0.11 0.1 0.08 0.04 0.07 0.1 0.11 0.31 0.63 0.26 0.18
0.44 0.52 0.33 1.0 0.75 0.31 0.52 0.65 0.42 0.68 0.69 0.51 0.87 0.0 0.02 0.0 0.05 0.2 0.04 0.05 0.0 0.0 0.09 0.0 0.01 0.0
0.18 0.38 0.28 0.39 0.46 0.44 0.54 0.54 0.75 0.89 1.0 0.98 0.24 0.04 0.05 0.04 0.14 0.1 0.07 0.09 0.07 0.0 0.24 0.72 0.27 0.21
0.16 0.23 0.25 0.29 0.3 0.48 0.39 0.38 0.52 0.85 1.0 0.71 0.19 0.04 0.05 0.0 0.11 0.22 0.13 0.15 0.15 0.47 0.02 0.11 0.21 0.31
0.66 0.71 0.57 0.59 0.5 0.41 0.51 0.6 0.91 0.78 1.0 0.95 0.63 0.11 0.2 0.13 0.17 0.29 0.22 0.17 0.04 0.12 0.73 0.46 0.26 0.19
0.25 0.3 0.3 0.28 0.24 0.17 0.08 0.17 0.24 0.55 1.0 0.97 0.15 0.0 0.02 0.05 0.0 0.08 0.08 0.1 0.25 0.01 0.15 0.11 0.14 0.04
0.81 0.77 0.63 0.7 0.56 0.41 0.51 0.59 0.81 0.75 1.0 0.91 0.65 0.08 0.16 0.07 0.22 0.39 0.33 0.37 0.05 0.13 0.6 0.48 0.34 0.24
0.43 0.13 0.21 0.3 0.47 0.53 0.8 0.88 0.63 0.99 1.0 0.8 0.46 0.34 0.04 0.01 0.16 0.07 0.03 0.42 0.04 0.11 0.21 0.36 0.38 0.5
0.39 0.14 0.25 0.29 0.38 0.58 0.8 0.79 0.7 0.96 1.0 0.7 0.54 0.27 0.03 0.02 0.11 0.06 0.05 0.35 0.02 0.1 0.13 0.31 0.24 0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)