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Heatmap: Cluster_162 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.55 -0.06 -0.44 -0.14 0.17 0.07 0.33 -0.07 -0.31 0.39 0.46 0.84 0.63 -0.07 -0.82 -0.55 -1.52 -1.25 -1.26 -1.19 -2.9 0.91 0.2 0.34 0.39 0.2
-1.95 -0.3 -0.38 -0.07 0.24 0.37 0.87 0.51 0.19 0.54 0.69 0.74 0.45 -0.2 -1.5 -0.09 -1.51 0.22 -0.57 -0.88 -2.44 0.05 0.24 -0.65 0.37 0.01
0.62 -0.33 -0.33 0.13 -0.06 -0.44 -0.48 -0.53 -0.33 -0.1 0.34 0.08 0.66 0.57 0.2 0.32 -0.38 0.09 -0.44 -0.99 -1.87 1.25 -0.22 -0.4 0.16 -0.52
0.6 -0.13 -0.46 -0.43 -0.69 -0.89 -0.38 -0.24 -0.38 0.11 0.44 0.7 0.91 0.32 -0.22 0.38 0.11 0.16 -0.54 -0.27 -2.38 0.83 -1.23 -0.21 0.4 -0.1
0.78 -0.16 -0.48 -0.08 -0.34 -0.5 0.17 0.27 0.18 0.03 0.3 0.54 1.15 -0.18 -0.12 -0.28 -0.89 -0.88 -0.98 -1.44 -0.99 0.4 0.47 0.07 0.16 -0.19
0.68 0.16 0.07 0.27 -0.27 -0.6 -0.14 0.18 -0.59 -0.03 0.3 0.58 1.08 -0.05 -0.47 -0.45 -0.3 -0.59 -1.02 -1.22 -3.12 0.86 -1.25 0.21 0.55 0.27
0.83 0.52 0.23 -0.3 -1.5 -1.98 -0.85 0.06 -1.14 -0.44 0.38 0.75 1.43 -0.4 -0.67 -0.64 -0.34 -0.32 -0.61 -0.24 -1.38 0.56 -0.16 -0.12 0.6 0.49
0.72 -0.28 -0.28 0.43 -0.23 -0.78 -0.25 0.11 0.41 0.55 0.69 0.7 1.22 -0.92 -1.47 -1.44 -0.44 -0.61 -1.27 -1.62 -3.39 1.3 -1.72 -0.5 0.77 -0.06
-0.22 -0.62 -0.33 0.13 -0.08 0.22 0.5 0.2 0.27 0.62 0.7 0.75 0.44 0.31 -2.22 -0.0 -2.15 0.57 -1.13 -1.24 -1.68 0.27 0.46 -1.08 0.32 -0.24
0.39 -0.11 -0.32 -0.14 -0.19 -0.45 0.28 0.26 -0.11 0.36 0.35 0.33 0.62 -0.19 -0.51 -0.51 0.14 0.01 -0.42 -0.38 -2.58 1.1 -0.93 -0.38 0.41 -0.13
0.17 -0.26 -0.24 0.09 0.15 -0.11 0.26 0.28 0.15 0.24 0.26 0.22 0.33 -0.23 -0.5 -0.3 -0.33 0.2 -0.18 -0.13 -0.74 0.47 0.06 -0.32 0.03 -0.3
1.45 0.02 -0.13 0.32 -0.94 -2.83 -1.0 -1.24 -1.15 0.03 0.74 1.72 2.04 -2.07 -2.83 -2.22 -1.91 -1.86 -2.15 -1.4 -1.13 0.66 0.16 0.26 -0.06 -0.11
1.17 0.08 -0.65 -0.16 0.02 0.17 0.88 0.7 0.4 0.39 0.71 0.74 1.36 -1.69 -2.06 -1.1 -3.33 -0.94 -1.08 -1.5 -2.68 -2.79 -0.53 0.84 0.0 -0.3
0.87 -0.52 0.08 0.58 0.44 0.15 -0.14 0.22 0.63 0.15 0.58 0.72 0.35 -2.46 -2.45 -1.64 -2.35 -1.82 -1.11 -2.14 -2.27 0.77 0.44 0.38 0.85 0.11
1.02 -0.01 0.19 -0.02 0.15 0.16 0.39 0.6 0.57 0.85 0.62 0.3 0.86 -0.84 -1.23 -1.3 -1.36 -0.89 -0.94 -0.33 -5.27 -4.98 -0.7 0.58 0.31 -0.19
1.46 0.61 0.0 0.16 -0.07 0.74 0.13 -0.6 -0.8 -0.21 0.2 0.79 1.27 -2.95 -3.02 -3.1 -2.2 -1.01 -1.31 -1.47 -2.77 1.17 0.22 0.4 -0.03 -0.34
0.22 -0.26 -0.31 -0.35 -0.19 -0.27 -0.02 0.22 0.14 0.34 0.44 0.68 0.52 -0.11 -0.4 0.0 -0.29 0.0 -0.39 -0.32 -1.69 0.73 -0.04 -0.43 0.2 -0.15
2.17 0.03 -0.74 -5.22 -5.6 -2.81 -0.8 0.4 -0.3 0.13 0.44 1.22 1.88 -3.08 -0.17 -4.36 -0.25 -1.7 -1.54 -1.19 -0.85 -0.21 -0.79 1.09 -0.24 -0.81
0.86 0.26 -0.34 -0.29 -0.2 -0.3 0.05 0.36 0.18 0.25 0.63 0.68 1.22 -0.85 -0.47 -0.9 -1.16 -0.47 -0.93 -0.88 -3.81 1.01 -0.81 -0.14 -0.14 0.06
1.13 0.2 -0.16 -0.05 -0.48 -0.28 -0.19 -0.24 -0.11 0.02 0.43 0.96 1.49 -1.12 -1.81 -1.97 -2.05 -0.85 -0.58 -1.27 -2.27 0.61 -0.04 0.25 0.55 0.35
1.05 0.01 -0.6 -0.96 -0.88 -0.67 0.01 0.03 -0.29 0.16 0.04 -0.18 0.98 -0.04 0.22 0.71 -0.62 -0.44 -0.95 -0.82 -2.75 1.12 -0.61 0.18 0.37 0.11
1.2 -0.17 -0.62 0.21 -0.42 -0.06 0.95 0.85 0.2 -0.25 -0.14 -0.12 1.3 -1.14 -1.11 -0.83 -1.14 -0.51 -0.78 -1.23 -0.8 -0.44 0.04 -0.52 0.57 0.14
0.61 -0.5 -0.55 -0.25 0.18 -0.03 0.25 0.16 0.35 0.31 0.55 0.62 0.84 0.02 -0.34 0.02 -0.96 -0.66 -0.87 -1.16 -1.84 0.38 0.17 -0.23 0.18 -0.2
1.16 0.53 -0.01 -0.14 -0.82 -0.98 -0.4 -0.07 -0.09 0.57 0.89 1.14 1.41 -1.2 -1.72 -1.92 -1.41 -0.27 -1.61 -1.06 -1.81 1.47 -2.48 -1.33 0.09 -0.38
0.92 -0.16 -0.49 -0.46 -0.85 -0.73 0.3 0.45 0.16 0.36 0.43 0.19 1.16 -0.3 -0.59 -0.65 -0.73 -0.42 -0.58 -0.94 -0.68 -0.52 0.4 0.28 0.45 0.04
0.68 0.07 -0.4 0.46 0.47 -0.04 0.0 0.06 0.52 0.2 0.57 0.68 0.73 -1.18 -1.3 -1.31 -1.37 -0.89 -0.95 -1.03 -3.63 0.84 0.52 -0.13 0.32 -0.27
1.29 0.3 -0.26 -0.33 -0.4 -0.86 0.04 0.35 0.33 0.43 0.59 0.44 1.23 -0.81 -1.16 -1.29 -1.12 -0.62 -0.38 -1.05 -3.74 0.31 0.19 -0.17 0.43 -0.32
1.31 0.28 0.05 0.04 -0.18 -0.42 0.28 0.35 0.02 -0.05 0.33 0.95 1.5 -1.36 -2.09 -0.38 -1.94 -1.61 -1.74 -2.35 -2.98 -0.79 0.4 0.77 0.1 -0.24
1.2 0.16 -1.08 -1.14 -0.18 0.13 0.33 0.3 -0.31 -0.05 0.13 0.04 1.16 -0.37 -0.84 0.65 -0.66 -0.19 -0.46 -0.51 -2.33 0.61 -0.75 -0.22 0.27 -0.24
0.65 0.06 -0.32 -0.29 -0.35 -0.51 0.08 0.26 0.18 0.19 0.28 0.36 0.67 -0.21 -0.32 -0.36 -0.54 -0.09 -0.01 -0.56 -1.25 -0.21 0.06 0.17 0.56 -0.02
0.43 0.32 -0.14 0.24 -0.01 -0.7 -0.08 0.22 0.45 0.56 0.54 0.57 0.57 -1.44 -1.66 -1.43 -1.15 -0.39 -0.98 -0.67 -3.08 0.56 0.6 0.47 0.56 -0.05
0.81 -0.48 -0.68 -0.8 -1.37 -1.57 -0.41 -0.14 -0.17 0.38 1.08 1.43 1.42 -1.28 -2.6 -1.79 -1.53 -0.84 -1.13 -1.07 -1.81 -0.77 0.09 0.98 0.6 1.11
0.73 0.72 0.3 -0.07 -1.78 -2.02 -0.59 0.1 -0.06 0.27 0.43 0.54 0.85 -0.45 -0.61 -0.56 -0.82 -0.01 -0.52 -0.72 -2.52 0.85 -0.77 -0.32 0.93 0.35
0.56 0.1 -0.16 -0.17 0.0 -0.25 0.06 0.12 -0.0 0.17 0.39 0.69 0.97 -0.14 -0.48 -0.28 -0.71 -0.22 -0.42 -0.6 -2.84 0.79 -0.54 -0.43 0.18 -0.14
0.21 -0.34 -0.39 -0.44 -0.06 -0.0 0.08 -0.05 0.24 0.14 0.38 0.55 0.5 0.16 -0.24 0.12 0.2 -0.2 -0.11 -0.33 -0.97 0.85 -1.33 0.13 -0.48 -0.32
1.37 0.07 -0.32 -0.53 -0.5 -0.55 -0.14 -0.03 -0.11 0.07 0.46 0.88 1.27 -1.31 -0.61 -1.33 -0.74 -0.75 -0.83 -0.53 -1.19 0.4 0.12 0.16 0.31 -0.18
0.88 0.11 -0.78 -0.79 -0.23 0.03 0.42 0.48 0.34 0.3 0.16 -0.27 0.78 -0.14 -0.48 -0.8 -0.66 -0.44 -0.48 -1.17 -0.49 -0.44 0.3 0.52 0.4 -0.02
0.83 0.08 -0.71 -0.89 -0.34 -0.11 0.48 0.5 0.13 0.22 0.1 -0.3 0.72 0.16 -0.22 -0.42 -0.28 -0.25 -0.16 -0.88 -0.6 -0.72 0.1 0.57 0.09 -0.02
0.04 0.07 0.09 0.23 0.21 0.14 0.33 0.44 0.41 0.33 0.3 0.26 0.23 -0.15 -0.13 -0.03 -0.36 -0.32 -0.46 -0.22 -0.97 -0.05 -0.5 -0.37 -0.23 -0.22
0.03 -0.52 -0.47 0.03 -0.02 -0.05 0.72 0.66 0.3 0.13 0.3 0.15 0.58 -0.11 -0.96 -0.27 -1.06 -0.46 -1.07 -0.97 -1.26 1.02 -0.32 -0.14 0.42 0.3
0.52 0.13 0.25 0.43 0.37 0.27 0.02 -0.0 -0.1 -0.04 0.23 0.57 0.7 -0.57 -0.83 -0.72 -0.71 -0.23 -0.74 -0.95 -1.98 0.48 0.43 -0.23 0.03 -0.1
0.99 0.76 0.39 -0.22 -1.28 -1.81 -1.42 -0.52 -0.66 0.07 0.3 0.54 0.93 -0.43 -0.85 0.09 -0.64 -0.16 -0.57 -0.32 -3.14 0.86 -0.65 -0.05 0.77 0.57
1.43 0.57 0.5 0.81 0.6 0.05 -0.39 0.13 0.11 0.43 0.82 0.88 0.47 -2.02 -2.41 -1.44 -3.25 -2.76 -1.98 -2.41 -1.82 -1.3 0.36 0.21 -0.5 0.57
0.6 -0.02 -0.22 -0.08 -0.25 -0.38 0.21 0.31 -0.06 0.12 0.35 0.33 0.9 0.22 -0.84 -0.27 -0.62 -0.07 -1.08 -0.53 -2.11 0.89 -1.08 -0.62 0.33 0.55
0.19 -0.19 -0.32 -0.04 0.11 0.11 0.18 0.25 0.76 0.52 0.43 0.22 0.09 -0.41 0.06 0.09 -0.65 0.15 -0.07 -0.99 -1.25 0.39 0.18 -0.32 -0.57 -0.64
0.66 0.5 0.16 -0.25 -1.0 -1.33 -0.35 -0.12 0.1 0.26 0.44 0.57 0.94 -0.29 -0.75 -0.24 -1.07 -0.15 -0.75 -0.45 -1.73 0.71 0.41 0.21 -0.13 0.15
0.57 -0.15 -0.39 -0.19 -0.06 -0.07 0.27 0.34 0.29 0.19 0.41 0.49 0.68 0.17 -0.19 -0.22 -0.3 -0.13 -0.24 -0.65 -1.89 0.88 -0.84 -0.52 -0.56 -0.39
0.7 0.32 -0.19 -0.26 -0.92 -1.31 -0.42 0.08 0.27 0.56 0.6 0.56 0.87 -0.32 -0.36 -0.12 -0.51 0.07 -0.02 -0.41 -2.67 0.04 -0.15 -0.25 0.36 -0.03
0.47 -0.51 0.02 0.33 0.27 0.27 0.53 0.68 0.58 0.3 0.44 0.49 0.15 -2.53 -2.22 -2.61 -1.97 -0.91 -1.25 -0.99 -2.17 -0.08 -0.07 0.3 1.59 -0.08
2.06 0.8 -0.75 -1.12 -2.57 -2.84 -1.98 -1.15 0.05 -0.17 0.56 0.58 1.78 -0.66 -0.96 -1.11 -1.09 -0.68 -1.52 -1.58 -2.65 -2.16 -0.01 1.36 0.75 -0.58
-0.24 -0.14 -0.18 0.04 -0.13 -0.14 0.26 0.2 -0.04 0.06 0.02 -0.06 -0.14 0.28 -0.51 0.08 -0.76 0.45 -0.5 -0.14 -0.23 0.83 0.21 -0.31 0.19 -0.03
0.21 0.07 -0.0 0.31 0.38 0.21 0.39 0.44 0.32 0.35 0.41 0.32 0.42 0.08 -0.68 -0.18 -1.05 -0.12 -0.64 -0.54 -0.85 0.21 -0.19 -0.73 -0.38 -0.42
0.63 0.4 0.19 0.42 0.32 0.45 0.35 0.3 0.04 -0.22 0.32 0.68 0.8 -1.29 -0.98 -0.81 -1.45 -0.76 -0.51 -1.13 -1.55 -0.14 0.33 0.11 -0.13 -0.08
0.52 0.31 0.27 0.15 -0.07 -0.11 -0.39 -0.61 -0.13 -0.08 0.44 0.74 0.49 0.04 -0.35 0.36 -0.99 -0.98 -0.73 -1.09 -1.16 0.82 0.36 0.19 -0.44 -0.21
1.03 0.56 0.07 -0.04 -0.79 -0.74 0.09 0.26 0.32 0.28 0.45 0.54 1.02 -1.12 -0.62 -1.35 -0.73 -0.49 -0.91 -0.93 -3.31 0.68 0.13 -0.2 0.19 0.03
0.46 -0.24 -0.44 0.12 0.21 0.3 0.42 0.7 0.26 0.2 0.31 0.29 0.84 0.02 -0.78 -0.01 -0.99 -0.56 -0.78 -0.58 -1.87 0.05 0.11 -0.41 0.04 -0.3
-0.21 -0.28 -0.09 0.22 0.41 0.54 0.35 0.02 0.47 0.4 0.3 0.33 -0.19 -0.15 -0.69 0.04 -0.58 0.33 -0.74 -0.33 -0.72 0.41 -0.23 -0.3 -0.44 -0.21
0.73 -0.24 -0.54 0.51 0.3 -0.55 0.18 -0.11 -0.28 0.11 0.6 0.87 1.09 0.26 -1.01 -0.48 -0.68 -0.86 -0.99 -1.59 -1.82 0.9 -0.42 -0.28 0.19 -0.41
0.32 0.0 0.15 0.5 0.24 0.04 0.36 0.31 0.11 0.2 0.49 0.46 0.34 0.12 -0.52 0.1 -0.73 -0.75 -0.73 -0.71 -1.51 -0.05 -0.3 -0.16 -0.1 -0.0
0.95 0.41 -0.14 0.39 -0.76 -2.18 -1.13 -0.53 -0.58 -0.01 0.82 1.21 1.23 -1.12 -1.53 -1.13 -1.13 -0.82 -1.42 -0.84 -1.62 1.06 0.32 0.61 0.06 0.07
0.83 -0.46 -0.26 0.4 -0.7 -0.51 -0.53 0.01 0.11 0.3 0.83 0.84 0.82 -0.1 -0.4 -0.9 -1.82 -0.42 -0.73 -1.63 -2.29 -0.23 0.73 0.26 0.81 -0.28
-1.15 -0.66 -1.0 -0.86 1.12 -0.51 -0.21 0.03 -0.73 0.68 0.83 0.99 0.37 -1.52 -2.24 -1.87 -2.05 0.73 -2.43 -1.71 -0.72 1.29 0.51 -0.98 0.92 0.81
0.81 -0.37 -0.71 0.28 -0.16 -0.98 -0.4 -0.45 -0.19 -0.3 0.87 0.99 0.75 -0.01 -0.73 -0.41 -0.98 -1.09 -1.01 -1.34 -1.13 1.57 0.3 0.3 -0.19 -0.83
0.56 0.38 -0.13 0.4 0.38 0.04 0.07 0.66 0.04 0.13 0.49 0.94 0.79 -1.45 -1.53 -1.38 -1.71 -0.11 -0.8 -1.46 -0.93 -0.36 0.93 -0.75 0.15 -0.56
1.08 0.35 -0.13 -0.34 -1.61 -3.08 -1.71 -0.26 -0.42 0.28 0.68 1.15 1.1 -0.26 -1.49 -1.15 -1.96 -1.31 -0.84 -0.79 -2.25 0.69 0.25 0.19 1.13 0.68

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.