Heatmap: Cluster_162 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.78 0.51 0.39 0.48 0.6 0.56 0.67 0.51 0.43 0.7 0.73 0.95 0.82 0.51 0.3 0.36 0.19 0.22 0.22 0.23 0.07 1.0 0.61 0.67 0.7 0.61
0.14 0.44 0.42 0.52 0.65 0.71 1.0 0.78 0.62 0.8 0.88 0.91 0.75 0.48 0.19 0.51 0.19 0.64 0.37 0.3 0.1 0.57 0.65 0.35 0.71 0.55
0.64 0.33 0.33 0.46 0.4 0.31 0.3 0.29 0.33 0.39 0.53 0.44 0.66 0.62 0.48 0.52 0.32 0.45 0.31 0.21 0.11 1.0 0.36 0.32 0.47 0.29
0.81 0.49 0.39 0.39 0.33 0.29 0.41 0.45 0.41 0.58 0.72 0.86 1.0 0.66 0.46 0.69 0.57 0.6 0.37 0.44 0.1 0.95 0.23 0.46 0.7 0.5
0.77 0.41 0.32 0.43 0.36 0.32 0.51 0.54 0.51 0.46 0.56 0.66 1.0 0.4 0.42 0.37 0.24 0.25 0.23 0.17 0.23 0.6 0.63 0.48 0.51 0.4
0.76 0.53 0.5 0.57 0.39 0.31 0.43 0.54 0.31 0.46 0.58 0.71 1.0 0.46 0.34 0.35 0.39 0.31 0.23 0.2 0.05 0.86 0.2 0.55 0.69 0.57
0.66 0.53 0.44 0.3 0.13 0.09 0.21 0.39 0.17 0.27 0.49 0.63 1.0 0.28 0.23 0.24 0.29 0.3 0.24 0.31 0.14 0.55 0.33 0.34 0.56 0.52
0.67 0.33 0.33 0.55 0.35 0.24 0.34 0.44 0.54 0.59 0.65 0.66 0.94 0.21 0.15 0.15 0.3 0.27 0.17 0.13 0.04 1.0 0.12 0.29 0.69 0.39
0.51 0.39 0.47 0.65 0.56 0.69 0.84 0.68 0.72 0.91 0.97 1.0 0.81 0.74 0.13 0.59 0.13 0.88 0.27 0.25 0.19 0.72 0.82 0.28 0.74 0.5
0.61 0.43 0.37 0.42 0.41 0.34 0.57 0.56 0.43 0.6 0.6 0.59 0.72 0.41 0.33 0.33 0.51 0.47 0.35 0.36 0.08 1.0 0.24 0.36 0.62 0.43
0.81 0.6 0.61 0.77 0.8 0.67 0.86 0.87 0.8 0.85 0.86 0.84 0.91 0.62 0.51 0.59 0.57 0.83 0.64 0.66 0.43 1.0 0.75 0.58 0.73 0.59
0.67 0.25 0.22 0.3 0.13 0.03 0.12 0.1 0.11 0.25 0.41 0.8 1.0 0.06 0.03 0.05 0.06 0.07 0.05 0.09 0.11 0.38 0.27 0.29 0.23 0.23
0.87 0.41 0.25 0.35 0.39 0.44 0.72 0.63 0.51 0.51 0.63 0.65 1.0 0.12 0.09 0.18 0.04 0.2 0.18 0.14 0.06 0.06 0.27 0.69 0.39 0.32
1.0 0.38 0.58 0.82 0.74 0.6 0.5 0.64 0.85 0.61 0.82 0.9 0.7 0.1 0.1 0.18 0.11 0.15 0.25 0.12 0.11 0.93 0.74 0.71 0.99 0.59
1.0 0.49 0.56 0.48 0.55 0.55 0.64 0.75 0.73 0.89 0.76 0.61 0.9 0.28 0.21 0.2 0.19 0.27 0.26 0.39 0.01 0.02 0.3 0.74 0.61 0.43
1.0 0.56 0.37 0.41 0.35 0.61 0.4 0.24 0.21 0.31 0.42 0.63 0.88 0.05 0.05 0.04 0.08 0.18 0.15 0.13 0.05 0.82 0.42 0.48 0.36 0.29
0.7 0.5 0.49 0.47 0.53 0.5 0.59 0.7 0.67 0.76 0.82 0.96 0.87 0.56 0.46 0.6 0.49 0.6 0.46 0.48 0.19 1.0 0.59 0.45 0.69 0.54
1.0 0.23 0.13 0.01 0.0 0.03 0.13 0.29 0.18 0.24 0.3 0.52 0.82 0.03 0.2 0.01 0.19 0.07 0.08 0.1 0.12 0.19 0.13 0.48 0.19 0.13
0.78 0.51 0.34 0.35 0.37 0.35 0.44 0.55 0.49 0.51 0.66 0.69 1.0 0.24 0.31 0.23 0.19 0.31 0.22 0.23 0.03 0.86 0.24 0.39 0.39 0.44
0.78 0.41 0.32 0.34 0.26 0.29 0.31 0.3 0.33 0.36 0.48 0.69 1.0 0.16 0.1 0.09 0.09 0.2 0.24 0.15 0.07 0.54 0.35 0.42 0.52 0.45
0.96 0.46 0.3 0.24 0.25 0.29 0.46 0.47 0.38 0.51 0.47 0.41 0.91 0.45 0.54 0.75 0.3 0.34 0.24 0.26 0.07 1.0 0.3 0.52 0.6 0.5
0.94 0.36 0.26 0.47 0.3 0.39 0.78 0.73 0.47 0.34 0.37 0.37 1.0 0.18 0.19 0.23 0.18 0.29 0.24 0.17 0.23 0.3 0.42 0.28 0.6 0.45
0.85 0.39 0.38 0.47 0.63 0.55 0.66 0.62 0.71 0.69 0.82 0.85 1.0 0.57 0.44 0.57 0.29 0.35 0.3 0.25 0.16 0.72 0.62 0.47 0.63 0.49
0.81 0.52 0.36 0.33 0.2 0.18 0.27 0.34 0.34 0.54 0.67 0.8 0.96 0.16 0.11 0.1 0.14 0.3 0.12 0.17 0.1 1.0 0.07 0.14 0.38 0.28
0.85 0.4 0.32 0.32 0.25 0.27 0.55 0.61 0.5 0.58 0.6 0.51 1.0 0.36 0.3 0.28 0.27 0.33 0.3 0.23 0.28 0.31 0.59 0.54 0.61 0.46
0.89 0.59 0.42 0.77 0.77 0.54 0.56 0.58 0.8 0.64 0.83 0.89 0.92 0.25 0.23 0.22 0.22 0.3 0.29 0.27 0.05 1.0 0.8 0.51 0.7 0.46
1.0 0.5 0.34 0.32 0.31 0.22 0.42 0.52 0.51 0.55 0.61 0.55 0.95 0.23 0.18 0.17 0.19 0.26 0.31 0.2 0.03 0.5 0.46 0.36 0.55 0.33
0.88 0.43 0.37 0.36 0.31 0.26 0.43 0.45 0.36 0.34 0.44 0.68 1.0 0.14 0.08 0.27 0.09 0.12 0.11 0.07 0.04 0.2 0.47 0.6 0.38 0.3
1.0 0.49 0.21 0.2 0.39 0.48 0.55 0.54 0.35 0.42 0.48 0.45 0.98 0.34 0.24 0.68 0.28 0.38 0.32 0.31 0.09 0.67 0.26 0.37 0.52 0.37
0.99 0.65 0.5 0.51 0.49 0.44 0.66 0.75 0.71 0.72 0.76 0.81 1.0 0.54 0.5 0.49 0.43 0.59 0.63 0.43 0.26 0.54 0.65 0.71 0.93 0.62
0.89 0.82 0.6 0.78 0.65 0.4 0.62 0.76 0.9 0.97 0.96 0.98 0.98 0.24 0.21 0.25 0.3 0.5 0.33 0.41 0.08 0.97 1.0 0.91 0.97 0.63
0.65 0.27 0.23 0.21 0.14 0.13 0.28 0.34 0.33 0.48 0.79 1.0 0.99 0.15 0.06 0.11 0.13 0.21 0.17 0.18 0.11 0.22 0.39 0.73 0.56 0.8
0.87 0.87 0.65 0.5 0.15 0.13 0.35 0.56 0.5 0.63 0.71 0.76 0.94 0.38 0.34 0.36 0.3 0.52 0.37 0.32 0.09 0.94 0.31 0.42 1.0 0.67
0.75 0.55 0.46 0.45 0.51 0.43 0.53 0.56 0.51 0.57 0.67 0.82 1.0 0.46 0.36 0.42 0.31 0.44 0.38 0.34 0.07 0.88 0.35 0.38 0.58 0.46
0.64 0.44 0.42 0.41 0.53 0.55 0.58 0.54 0.66 0.61 0.72 0.81 0.78 0.62 0.47 0.6 0.64 0.48 0.51 0.44 0.28 1.0 0.22 0.61 0.4 0.44
1.0 0.41 0.31 0.27 0.27 0.26 0.35 0.38 0.36 0.41 0.53 0.71 0.94 0.16 0.25 0.15 0.23 0.23 0.22 0.27 0.17 0.51 0.42 0.43 0.48 0.34
1.0 0.58 0.32 0.31 0.46 0.56 0.73 0.76 0.68 0.67 0.6 0.45 0.93 0.49 0.39 0.31 0.34 0.4 0.39 0.24 0.39 0.4 0.67 0.78 0.72 0.54
1.0 0.6 0.34 0.3 0.44 0.52 0.78 0.8 0.61 0.66 0.6 0.46 0.93 0.63 0.48 0.42 0.46 0.47 0.5 0.31 0.37 0.34 0.6 0.83 0.6 0.55
0.75 0.77 0.78 0.87 0.85 0.81 0.93 1.0 0.98 0.93 0.9 0.88 0.86 0.66 0.67 0.72 0.57 0.59 0.54 0.63 0.37 0.71 0.52 0.57 0.63 0.63
0.5 0.34 0.36 0.5 0.48 0.48 0.81 0.78 0.61 0.54 0.6 0.55 0.74 0.46 0.25 0.41 0.24 0.36 0.23 0.25 0.21 1.0 0.39 0.45 0.66 0.61
0.88 0.67 0.73 0.83 0.79 0.74 0.63 0.61 0.57 0.6 0.72 0.91 1.0 0.41 0.35 0.37 0.38 0.52 0.37 0.32 0.16 0.86 0.83 0.52 0.63 0.57
1.0 0.85 0.66 0.43 0.21 0.14 0.19 0.35 0.32 0.53 0.62 0.73 0.96 0.37 0.28 0.53 0.32 0.45 0.34 0.4 0.06 0.91 0.32 0.49 0.86 0.75
1.0 0.55 0.53 0.65 0.56 0.39 0.28 0.41 0.4 0.5 0.65 0.68 0.51 0.09 0.07 0.14 0.04 0.05 0.09 0.07 0.11 0.15 0.48 0.43 0.26 0.55
0.82 0.53 0.46 0.51 0.45 0.41 0.62 0.66 0.52 0.58 0.69 0.68 1.0 0.63 0.3 0.45 0.35 0.51 0.25 0.37 0.12 0.99 0.25 0.35 0.68 0.79
0.68 0.52 0.47 0.57 0.64 0.64 0.67 0.7 1.0 0.85 0.8 0.69 0.63 0.45 0.62 0.63 0.38 0.65 0.56 0.3 0.25 0.77 0.67 0.47 0.4 0.38
0.83 0.74 0.58 0.44 0.26 0.21 0.41 0.48 0.56 0.62 0.71 0.77 1.0 0.43 0.31 0.44 0.25 0.47 0.31 0.38 0.16 0.85 0.69 0.6 0.48 0.58
0.81 0.49 0.41 0.48 0.52 0.52 0.65 0.69 0.66 0.62 0.72 0.77 0.87 0.61 0.48 0.47 0.44 0.5 0.46 0.35 0.15 1.0 0.3 0.38 0.37 0.42
0.89 0.68 0.48 0.46 0.29 0.22 0.41 0.58 0.66 0.81 0.83 0.81 1.0 0.44 0.43 0.5 0.39 0.57 0.54 0.41 0.09 0.56 0.49 0.46 0.7 0.53
0.46 0.23 0.34 0.42 0.4 0.4 0.48 0.53 0.5 0.41 0.45 0.47 0.37 0.06 0.07 0.05 0.08 0.18 0.14 0.17 0.07 0.31 0.32 0.41 1.0 0.31
1.0 0.42 0.14 0.11 0.04 0.03 0.06 0.11 0.25 0.21 0.35 0.36 0.82 0.15 0.12 0.11 0.11 0.15 0.08 0.08 0.04 0.05 0.24 0.62 0.4 0.16
0.48 0.51 0.5 0.58 0.51 0.51 0.67 0.65 0.55 0.59 0.57 0.54 0.51 0.68 0.39 0.59 0.33 0.76 0.4 0.51 0.48 1.0 0.65 0.45 0.64 0.55
0.85 0.77 0.73 0.91 0.96 0.85 0.96 1.0 0.92 0.93 0.98 0.92 0.98 0.78 0.46 0.65 0.36 0.67 0.47 0.51 0.41 0.85 0.64 0.44 0.57 0.55
0.89 0.76 0.66 0.77 0.72 0.78 0.73 0.71 0.59 0.49 0.72 0.92 1.0 0.24 0.29 0.33 0.21 0.34 0.41 0.26 0.2 0.52 0.72 0.62 0.53 0.54
0.81 0.7 0.69 0.63 0.54 0.53 0.43 0.37 0.52 0.54 0.77 0.95 0.8 0.59 0.45 0.73 0.29 0.29 0.34 0.27 0.25 1.0 0.73 0.65 0.42 0.49
1.0 0.72 0.52 0.47 0.28 0.29 0.52 0.59 0.61 0.6 0.67 0.71 0.99 0.23 0.32 0.19 0.3 0.35 0.26 0.26 0.05 0.79 0.54 0.43 0.56 0.5
0.77 0.47 0.41 0.61 0.65 0.69 0.75 0.91 0.67 0.64 0.69 0.69 1.0 0.57 0.33 0.56 0.28 0.38 0.33 0.38 0.15 0.58 0.6 0.42 0.58 0.45
0.59 0.56 0.65 0.8 0.91 1.0 0.88 0.7 0.95 0.91 0.85 0.86 0.6 0.62 0.43 0.7 0.46 0.86 0.41 0.55 0.42 0.91 0.59 0.56 0.51 0.6
0.78 0.4 0.32 0.67 0.58 0.32 0.53 0.43 0.39 0.51 0.71 0.86 1.0 0.56 0.23 0.34 0.29 0.26 0.24 0.16 0.13 0.88 0.35 0.39 0.54 0.35
0.88 0.71 0.79 1.0 0.83 0.73 0.9 0.88 0.76 0.81 0.99 0.97 0.9 0.77 0.49 0.76 0.43 0.42 0.43 0.43 0.25 0.68 0.57 0.63 0.66 0.71
0.82 0.57 0.39 0.56 0.25 0.09 0.19 0.29 0.29 0.42 0.75 0.98 1.0 0.2 0.15 0.19 0.2 0.24 0.16 0.24 0.14 0.89 0.53 0.65 0.45 0.45
0.99 0.41 0.46 0.74 0.34 0.39 0.39 0.56 0.6 0.69 0.99 1.0 0.99 0.52 0.42 0.3 0.16 0.42 0.34 0.18 0.11 0.48 0.92 0.67 0.98 0.46
0.18 0.26 0.2 0.22 0.89 0.29 0.35 0.42 0.25 0.66 0.72 0.81 0.53 0.14 0.09 0.11 0.1 0.68 0.08 0.12 0.25 1.0 0.58 0.21 0.77 0.71
0.59 0.26 0.2 0.41 0.3 0.17 0.25 0.25 0.3 0.27 0.61 0.67 0.57 0.33 0.2 0.25 0.17 0.16 0.17 0.13 0.15 1.0 0.41 0.41 0.29 0.19
0.77 0.68 0.48 0.69 0.68 0.54 0.55 0.82 0.54 0.57 0.73 1.0 0.9 0.19 0.18 0.2 0.16 0.48 0.3 0.19 0.27 0.41 0.99 0.31 0.58 0.35
0.96 0.58 0.41 0.36 0.15 0.05 0.14 0.38 0.34 0.55 0.72 1.0 0.97 0.38 0.16 0.2 0.12 0.18 0.25 0.26 0.09 0.73 0.54 0.51 0.99 0.72

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)