Heatmap: Cluster_200 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

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(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.75 0.74 0.73 0.8 0.82 0.77 0.93 0.97 0.81 0.77 0.67 0.6 0.72 0.69 0.57 1.0 0.7 0.87 0.84 0.81 0.04 0.86 0.33 0.45 0.88 0.73
0.66 0.67 0.65 0.64 0.63 0.73 0.62 0.61 0.58 0.51 0.43 0.42 0.53 0.47 0.69 0.53 0.67 1.0 0.84 0.8 0.29 0.81 0.84 0.64 0.83 0.78
0.72 0.76 0.68 0.82 0.81 0.68 0.84 0.82 0.89 0.98 0.84 0.91 0.85 0.67 0.6 0.79 0.6 0.7 0.54 0.44 0.06 1.0 0.37 0.55 0.93 0.63
0.22 0.48 0.65 0.78 0.8 0.7 0.73 0.71 0.76 0.73 0.67 0.63 0.21 0.74 0.69 0.95 0.56 0.72 0.71 0.51 0.29 1.0 0.85 0.64 0.66 0.67
0.78 0.75 0.72 0.79 0.82 0.83 0.95 1.0 0.96 0.9 0.88 0.88 0.88 0.68 0.57 0.76 0.56 0.73 0.68 0.53 0.22 0.9 0.38 0.49 0.72 0.59
0.84 0.58 0.55 0.77 0.88 0.73 0.89 0.98 0.89 0.77 0.78 0.62 0.9 0.65 0.79 0.62 0.59 0.91 0.66 0.49 0.17 0.9 0.69 0.47 1.0 0.69
0.73 0.63 0.74 0.85 0.83 0.65 0.92 0.95 0.8 0.93 0.86 0.76 1.0 0.83 0.66 0.91 0.7 1.0 0.71 0.71 0.01 0.74 0.17 0.2 0.84 0.56
0.94 0.88 0.76 1.0 0.96 0.65 0.78 0.94 0.69 0.67 0.61 0.47 0.9 0.74 0.56 0.98 0.56 0.8 0.63 0.64 0.03 0.52 0.81 0.16 0.81 0.66
0.66 0.49 0.48 0.62 0.64 0.68 0.81 0.89 0.52 0.46 0.39 0.27 0.6 0.77 0.64 0.79 0.7 1.0 0.7 0.53 0.03 1.0 0.17 0.19 0.95 0.48
0.48 0.65 0.52 0.66 0.93 1.0 0.81 0.75 0.43 0.51 0.48 0.42 0.42 0.58 0.43 0.53 0.55 0.86 0.79 0.61 0.03 0.86 0.37 0.46 0.76 0.54
0.33 0.39 0.24 0.71 0.67 0.38 0.51 0.59 0.64 0.81 0.82 0.49 0.39 0.53 0.4 0.66 0.54 0.78 0.53 0.39 0.17 0.57 0.85 0.63 0.94 1.0
0.12 0.21 0.44 0.65 0.83 0.84 0.87 0.7 0.72 0.69 0.58 0.46 0.18 0.71 0.79 0.77 0.68 0.65 0.71 0.65 0.09 1.0 0.86 0.52 0.64 0.49
0.91 0.75 0.73 0.93 0.89 0.76 0.98 1.0 0.92 0.96 0.92 0.85 0.85 0.72 0.57 0.69 0.57 0.78 0.77 0.61 0.15 0.92 0.92 0.89 0.97 0.86
0.53 0.55 0.59 0.67 0.91 0.97 1.0 0.88 0.69 0.58 0.62 0.59 0.65 0.6 0.57 0.57 0.5 0.77 0.58 0.56 0.04 0.81 0.35 0.41 0.57 0.53
0.7 0.67 0.68 0.72 0.87 0.87 1.0 0.91 0.83 0.84 0.79 0.77 0.74 0.64 0.75 0.63 0.69 0.93 0.74 0.7 0.07 0.81 0.38 0.5 0.72 0.61
0.12 0.33 0.35 0.36 0.43 0.49 0.49 0.39 0.51 0.36 0.3 0.25 0.12 0.54 0.62 0.57 0.49 0.74 0.47 0.38 0.18 0.71 1.0 0.71 0.66 0.57
0.51 0.56 0.57 0.78 1.0 0.72 0.91 0.97 0.66 0.48 0.63 0.46 0.42 0.34 0.4 0.5 0.26 0.79 0.47 0.33 0.05 0.4 0.29 0.18 0.64 0.32
0.23 0.41 0.51 0.57 0.57 0.54 0.54 0.47 0.59 0.63 0.64 0.63 0.17 0.57 0.56 0.55 0.42 0.73 0.5 0.45 0.11 1.0 0.62 0.64 0.69 0.57
0.96 0.65 0.57 0.72 0.76 0.88 1.0 1.0 0.71 0.65 0.66 0.62 0.84 0.46 0.4 0.4 0.52 0.68 0.67 0.55 0.1 0.85 0.76 0.62 0.69 0.53
0.14 0.31 0.4 0.47 0.65 0.7 0.78 0.7 0.62 0.8 0.71 0.63 0.18 0.27 0.18 0.3 0.53 1.0 0.47 0.65 0.05 0.67 0.14 0.38 0.48 0.58
0.39 0.43 0.51 0.53 0.6 0.45 0.63 0.65 0.61 0.73 0.64 0.57 0.37 0.74 0.59 0.7 0.64 0.86 0.67 0.71 0.04 1.0 0.82 0.45 0.79 0.56
0.09 0.13 0.23 0.29 0.23 0.24 0.35 0.44 0.36 0.46 0.4 0.45 0.17 0.56 0.46 0.54 0.34 0.78 0.45 0.34 0.2 0.91 0.98 1.0 0.61 0.72
0.35 0.42 0.51 0.49 0.39 0.42 0.32 0.61 0.69 0.8 0.62 0.65 0.39 0.82 0.57 0.75 0.54 0.7 0.64 0.61 0.08 1.0 0.53 0.31 0.68 0.65
0.49 0.55 0.5 0.54 0.61 0.56 0.7 0.64 0.67 0.63 0.55 0.51 0.46 0.59 0.71 0.66 0.5 0.76 0.75 0.53 0.07 1.0 0.96 0.45 0.8 0.65
0.65 0.45 0.48 0.71 0.73 0.68 0.85 0.92 1.0 0.88 0.9 0.9 0.76 0.55 0.37 0.59 0.4 0.61 0.48 0.38 0.08 0.77 0.84 0.49 0.66 0.64
0.64 0.62 0.62 0.76 0.77 0.65 0.81 0.77 0.65 0.68 0.62 0.58 0.63 0.54 0.68 0.72 0.8 0.93 0.91 0.74 0.05 1.0 0.43 0.46 0.8 0.62
0.24 0.52 0.52 0.57 0.67 0.74 0.68 0.6 0.61 0.49 0.41 0.35 0.24 0.51 0.65 0.77 0.58 1.0 0.87 0.65 0.18 0.99 0.98 0.66 0.91 0.65
0.87 0.61 0.75 0.78 0.77 0.64 0.88 0.94 0.81 0.71 0.75 0.67 0.91 0.76 0.61 0.83 0.63 0.95 0.79 0.64 0.13 0.64 0.73 0.57 1.0 0.9
0.34 0.42 0.51 0.48 0.46 0.45 0.52 0.38 0.43 0.44 0.36 0.31 0.32 0.47 0.57 0.57 0.57 0.99 0.82 0.59 0.26 0.6 0.8 0.8 0.81 1.0
0.61 0.64 0.71 0.83 0.94 0.95 1.0 0.97 0.92 0.91 0.85 0.76 0.72 0.69 0.55 0.69 0.63 0.79 0.6 0.64 0.12 0.8 0.39 0.46 0.58 0.57
0.26 0.18 0.23 0.21 0.19 0.25 0.23 0.21 0.24 0.21 0.25 0.23 0.3 0.41 0.39 0.43 0.28 0.38 0.39 0.2 0.2 1.0 0.6 0.44 0.45 0.66
0.38 0.34 0.38 0.48 0.6 0.83 0.82 0.66 0.82 0.85 0.65 0.6 0.41 0.65 0.5 0.62 0.72 0.8 0.68 0.64 0.08 0.49 0.59 0.66 0.82 1.0
0.87 0.65 0.61 0.72 0.67 0.57 0.65 0.71 0.59 0.61 0.69 0.67 1.0 0.59 0.5 0.67 0.57 0.64 0.56 0.57 0.23 0.51 0.56 0.64 0.77 0.72
0.33 0.43 0.51 0.6 0.59 0.62 0.67 0.68 0.66 0.49 0.43 0.41 0.15 0.61 0.81 0.65 0.59 0.8 0.87 0.58 0.04 1.0 0.7 0.59 0.98 0.76
0.88 0.75 0.8 0.87 0.84 0.91 0.92 1.0 0.9 0.87 0.79 0.73 0.82 0.83 0.74 0.68 0.62 0.93 0.72 0.72 0.02 0.66 0.31 0.34 0.85 0.76
0.32 0.39 0.39 0.55 0.73 0.93 0.93 0.91 0.81 0.79 0.76 0.64 0.28 0.79 0.78 0.78 0.63 0.77 0.93 0.71 0.22 0.89 1.0 0.52 0.88 0.77
0.52 0.17 0.11 0.22 0.48 0.69 0.88 1.0 0.91 0.72 0.61 0.28 0.47 0.54 0.14 0.23 0.3 0.53 0.34 0.29 0.05 0.56 0.42 0.46 0.66 0.38
0.88 0.7 0.73 0.86 0.89 0.74 0.94 0.98 0.78 0.71 0.67 0.63 0.87 0.46 0.43 0.59 0.49 0.59 0.59 0.5 0.1 0.55 1.0 0.41 0.66 0.46
0.18 0.35 0.63 0.67 0.85 1.0 0.94 0.85 0.71 0.64 0.53 0.53 0.2 0.75 0.54 0.74 0.57 0.79 0.78 0.65 0.19 0.73 0.8 0.83 0.64 0.63
0.93 0.73 0.65 0.9 0.85 0.85 0.86 0.94 0.98 0.75 0.87 0.74 0.87 0.73 0.8 0.61 0.56 0.82 0.91 0.51 0.14 0.85 0.61 0.51 1.0 0.8
0.27 0.29 0.35 0.46 0.65 0.67 0.77 0.62 0.64 0.68 0.52 0.44 0.29 0.59 0.58 0.64 0.65 0.81 0.67 0.74 0.08 1.0 0.79 0.58 0.66 0.57
0.66 0.77 0.82 0.76 0.77 0.61 0.68 0.68 0.79 0.82 0.78 0.72 0.75 0.68 0.63 0.72 0.68 1.0 0.84 0.7 0.18 0.62 0.68 0.69 0.82 0.91
0.86 0.61 0.48 0.69 0.7 0.68 0.99 1.0 0.73 0.7 0.58 0.46 0.69 0.69 0.39 0.56 0.55 0.75 0.74 0.58 0.04 0.97 0.53 0.43 0.86 0.54
0.94 0.78 0.69 0.78 0.89 0.73 0.95 0.91 0.77 0.88 0.82 0.78 0.87 0.75 0.8 0.93 0.8 0.82 0.86 0.82 0.18 0.84 0.85 0.71 1.0 0.69
0.4 0.37 0.4 0.49 0.46 0.3 0.53 0.54 0.48 0.52 0.48 0.43 0.34 0.51 0.8 0.55 0.67 0.96 0.86 0.65 0.08 1.0 0.82 0.52 0.68 0.57
0.06 0.3 0.38 0.48 0.61 0.73 0.72 0.62 0.75 0.66 0.59 0.52 0.11 0.57 0.59 0.6 0.55 0.75 0.72 0.43 0.09 1.0 0.58 0.47 0.67 0.59
0.53 0.55 0.52 0.53 0.58 0.65 0.71 0.64 0.6 0.57 0.5 0.49 0.4 0.62 0.78 0.63 0.67 1.0 0.98 0.69 0.16 0.97 1.0 0.81 0.89 0.94
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0.77 0.37 0.21 0.55 0.54 0.3 0.31 0.45 0.3 0.27 0.39 0.27 0.37 0.37 0.44 0.43 0.36 0.47 0.34 0.28 0.05 0.59 0.46 0.39 1.0 0.66
0.31 0.4 0.41 0.44 0.55 0.57 0.63 0.56 0.53 0.48 0.41 0.38 0.29 0.48 0.59 0.46 0.64 1.0 0.86 0.7 0.18 0.87 0.82 0.68 0.67 0.79
0.91 0.71 0.69 0.88 0.95 0.93 1.0 0.98 0.68 0.63 0.68 0.81 0.89 0.73 0.77 0.71 0.75 0.8 0.94 0.66 0.18 0.92 0.52 0.43 0.81 0.88
0.08 0.24 0.27 0.36 0.44 0.27 0.4 0.41 0.44 0.39 0.4 0.33 0.03 0.59 0.55 0.53 0.36 0.7 0.43 0.32 0.08 1.0 0.51 0.46 0.65 0.41
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0.42 0.69 0.71 0.87 0.83 0.68 0.85 0.91 0.82 0.8 0.78 0.51 0.25 0.6 0.66 0.6 0.72 0.99 0.85 0.68 0.03 1.0 0.46 0.51 0.71 0.5
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0.87 0.77 0.72 0.68 0.68 0.68 0.92 0.96 0.87 0.85 0.83 0.77 0.86 0.44 0.5 0.71 0.55 1.0 0.65 0.59 0.03 0.8 0.54 0.45 0.87 0.72

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)