Heatmap: Cluster_11 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.52 0.41 0.54 0.53 0.47 0.36 0.59 0.7 0.7 0.83 1.0 0.86 0.59 0.72 0.6 0.91 0.75 0.51 0.38 0.53 0.39 0.63 0.59 0.62 0.54 0.66
0.5 0.46 0.42 0.48 0.5 0.28 0.61 0.66 0.8 0.85 1.0 0.84 0.66 0.67 0.54 0.95 0.67 0.58 0.49 0.51 0.38 0.5 0.58 0.43 0.56 0.54
0.51 0.38 0.48 0.57 0.57 0.36 0.51 0.56 0.38 0.47 0.55 0.66 0.67 1.0 0.51 0.87 0.55 0.56 0.46 0.42 0.42 0.77 0.5 0.53 0.68 0.65
0.64 0.45 0.55 0.63 0.62 0.48 0.49 0.54 0.43 0.54 0.62 0.73 0.78 1.0 0.51 0.85 0.5 0.48 0.53 0.38 0.41 0.78 0.45 0.56 0.69 0.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.14 1.0 0.27 0.23 0.67
0.24 0.46 0.59 0.55 0.38 0.15 0.36 0.45 0.43 0.51 0.59 0.43 0.35 0.71 0.55 0.92 0.52 0.92 0.69 0.58 0.08 0.46 1.0 0.33 0.42 0.55
0.52 0.71 0.47 0.53 0.57 0.36 0.65 0.7 0.48 0.81 0.73 0.59 0.46 0.63 0.5 0.62 0.37 0.62 0.52 0.39 0.29 0.79 1.0 0.8 0.73 0.65
0.61 0.85 0.59 0.62 0.62 0.38 0.69 0.77 0.5 0.82 0.81 0.65 0.51 0.94 0.64 0.89 0.58 0.92 0.73 0.51 0.31 0.73 1.0 0.68 0.72 0.74
0.32 0.38 0.46 0.45 0.3 0.29 0.35 0.51 0.33 0.52 0.72 0.35 0.36 0.68 0.58 0.67 0.42 0.82 0.56 0.47 0.3 0.77 1.0 0.39 0.67 0.61
0.61 0.64 0.46 0.39 0.21 0.17 0.43 0.49 0.38 0.5 0.52 0.54 0.48 0.88 0.6 1.0 0.71 0.79 0.74 0.6 0.17 0.46 0.92 0.72 0.55 0.44
0.09 0.03 0.17 0.38 0.66 0.79 1.0 0.81 0.87 0.92 0.88 0.64 0.15 0.7 0.45 0.74 0.4 0.29 0.34 0.4 0.42 0.39 0.51 0.27 0.38 0.34
0.62 0.53 0.55 0.64 0.63 0.47 0.64 0.67 0.61 0.85 0.98 0.92 0.66 0.68 0.47 0.57 0.33 0.4 0.47 0.36 0.5 0.74 1.0 0.55 0.71 0.43
0.7 0.53 0.49 0.68 0.63 0.42 0.75 0.82 0.65 0.78 1.0 0.92 0.65 0.81 0.53 0.67 0.55 0.43 0.54 0.4 0.14 0.6 1.0 0.56 0.78 0.51
0.52 0.41 0.47 0.51 0.34 0.32 0.56 0.6 0.45 0.59 0.63 0.76 0.44 1.0 0.75 1.0 0.79 0.69 0.76 0.58 0.13 0.8 0.97 0.94 0.73 0.51
0.41 0.41 0.36 0.46 0.32 0.27 0.55 0.62 0.45 0.41 0.48 0.61 0.42 1.0 0.76 0.87 0.86 0.59 0.64 0.61 0.11 0.52 0.6 0.6 0.5 0.37
0.29 0.34 0.32 0.39 0.23 0.15 0.39 0.41 0.29 0.32 0.43 0.47 0.22 0.8 0.74 0.83 0.65 0.44 0.53 0.47 0.11 0.64 0.95 0.32 1.0 0.26
0.04 0.0 0.01 0.03 0.09 0.13 0.24 0.17 0.23 0.34 0.35 0.27 0.06 0.35 0.47 0.36 0.13 0.11 0.12 0.12 0.11 0.18 1.0 0.62 0.49 0.46
0.22 0.19 0.17 0.18 0.2 0.14 0.25 0.25 0.23 0.19 0.3 0.31 0.15 0.3 0.25 0.36 0.32 0.4 0.31 0.24 0.06 0.7 1.0 0.31 0.54 0.38
0.41 0.29 0.22 0.15 0.18 0.1 0.15 0.25 0.17 0.34 0.43 0.47 0.19 0.53 0.32 0.55 0.53 0.48 0.45 0.25 0.06 0.84 1.0 0.35 0.51 0.39
0.58 0.53 0.41 0.36 0.3 0.2 0.31 0.45 0.32 0.56 0.78 0.75 0.52 0.63 0.43 0.58 0.53 0.4 0.48 0.3 0.05 0.55 1.0 0.32 0.5 0.37
0.6 0.39 0.42 0.53 0.59 0.48 0.67 0.69 0.67 0.74 0.81 0.81 0.75 0.94 0.63 1.0 0.65 0.63 0.51 0.52 0.62 0.83 0.63 0.68 0.65 0.67
0.3 0.35 0.52 0.65 0.74 0.66 0.96 0.86 1.0 0.94 0.81 0.66 0.26 0.63 0.43 0.65 0.49 0.53 0.4 0.41 0.32 0.49 0.49 0.43 0.43 0.41
0.46 0.33 0.29 0.47 0.34 0.27 0.37 0.44 0.4 0.44 0.56 0.53 0.5 0.51 0.32 0.32 0.34 0.28 0.31 0.27 0.26 0.48 1.0 0.73 0.65 0.56
0.6 0.38 0.38 0.41 0.37 0.23 0.32 0.42 0.32 0.43 0.58 0.59 0.55 0.81 0.51 0.69 0.56 0.4 0.37 0.34 0.34 0.59 1.0 0.66 0.98 0.7
0.57 0.38 0.36 0.42 0.33 0.2 0.3 0.39 0.36 0.4 0.51 0.53 0.54 0.66 0.42 0.5 0.4 0.28 0.26 0.23 0.31 0.61 1.0 0.53 0.86 0.62
0.31 0.17 0.21 0.22 0.21 0.12 0.21 0.31 0.16 0.28 0.32 0.31 0.21 0.55 0.29 0.38 0.34 0.25 0.26 0.19 0.28 0.36 1.0 0.53 0.55 0.49
0.28 0.22 0.25 0.24 0.21 0.12 0.22 0.26 0.2 0.3 0.34 0.31 0.23 0.49 0.3 0.35 0.3 0.24 0.3 0.26 0.25 0.39 1.0 0.49 0.51 0.48
0.34 0.27 0.34 0.32 0.23 0.14 0.29 0.32 0.27 0.39 0.35 0.38 0.3 0.59 0.42 0.47 0.39 0.25 0.34 0.3 0.28 0.45 1.0 0.56 0.65 0.54
0.16 0.3 0.28 0.26 0.2 0.1 0.15 0.19 0.16 0.26 0.28 0.22 0.18 0.52 0.24 0.29 0.24 0.24 0.32 0.28 0.28 0.32 1.0 0.52 0.76 0.57
0.09 0.04 0.03 0.04 0.05 0.03 0.04 0.05 0.05 0.08 0.09 0.06 0.04 0.2 0.16 0.13 0.13 0.15 0.06 0.03 0.07 0.41 1.0 0.09 0.3 0.26
0.18 0.08 0.06 0.04 0.07 0.04 0.05 0.09 0.06 0.12 0.11 0.1 0.06 0.21 0.13 0.15 0.14 0.14 0.11 0.04 0.07 0.39 1.0 0.16 0.32 0.22
0.28 0.16 0.09 0.04 0.12 0.09 0.1 0.13 0.07 0.19 0.18 0.18 0.09 0.24 0.14 0.13 0.21 0.15 0.15 0.05 0.07 0.2 1.0 0.15 0.22 0.22
0.34 0.15 0.1 0.08 0.11 0.09 0.17 0.17 0.13 0.12 0.22 0.16 0.1 0.26 0.19 0.22 0.17 0.19 0.14 0.04 0.1 0.62 1.0 0.3 0.35 0.37
0.29 0.17 0.12 0.12 0.15 0.1 0.16 0.21 0.12 0.26 0.22 0.22 0.15 0.33 0.17 0.21 0.23 0.15 0.19 0.08 0.07 0.34 1.0 0.21 0.35 0.23
0.58 0.39 0.33 0.41 0.37 0.28 0.52 0.56 0.4 0.56 0.62 0.64 0.49 0.43 0.28 0.28 0.3 0.17 0.28 0.15 0.07 0.46 1.0 0.33 0.33 0.25
0.47 0.45 0.4 0.52 0.51 0.52 0.68 0.69 0.69 0.8 0.68 0.75 0.55 0.87 0.67 1.0 0.65 0.71 0.53 0.62 0.14 0.85 0.81 0.88 0.72 0.55
0.66 0.53 0.52 0.66 0.82 0.85 1.0 0.9 0.86 0.92 0.96 0.85 0.67 0.83 0.66 0.9 0.6 0.48 0.56 0.46 0.46 0.75 0.86 0.53 0.5 0.46
0.39 0.21 0.37 0.46 0.61 0.5 0.6 0.61 0.54 0.58 0.85 0.54 0.35 0.74 0.3 0.74 0.44 0.64 0.47 0.28 0.23 1.0 0.78 0.37 0.36 0.48
0.88 0.56 0.52 0.64 0.62 0.51 0.69 0.69 0.65 0.76 0.98 0.99 0.87 0.77 0.52 0.65 0.46 0.49 0.53 0.38 0.19 0.57 1.0 0.97 0.82 0.7
0.57 0.39 0.31 0.42 0.41 0.34 0.5 0.44 0.32 0.53 0.58 0.58 0.53 0.54 0.34 0.55 0.32 0.39 0.35 0.29 0.27 0.68 1.0 0.7 0.65 0.64
0.14 0.23 0.22 0.07 0.02 0.02 0.09 0.29 0.31 0.44 0.58 0.47 0.08 0.44 0.55 0.31 0.29 0.36 0.33 0.22 0.08 0.15 1.0 0.55 0.64 0.62
0.59 0.44 0.42 0.49 0.46 0.41 0.54 0.54 0.47 0.53 0.59 0.57 0.73 1.0 0.62 0.85 0.7 0.5 0.5 0.41 0.45 0.68 0.64 0.6 0.76 0.7
0.52 0.44 0.43 0.4 0.43 0.35 0.59 0.7 0.65 0.86 1.0 0.77 0.58 0.52 0.51 0.52 0.62 0.44 0.56 0.53 0.08 0.36 1.0 0.55 0.97 0.79
0.37 0.29 0.28 0.22 0.18 0.16 0.44 0.56 0.39 0.64 0.6 0.42 0.34 0.24 0.26 0.39 0.37 0.39 0.33 0.36 0.08 0.21 1.0 0.43 0.69 0.47
0.45 0.25 0.37 0.59 0.68 0.52 0.45 0.55 0.55 0.87 1.0 1.0 0.64 0.84 0.19 0.41 0.33 0.19 0.21 0.4 0.38 0.19 0.87 0.25 0.48 0.58
0.38 0.18 0.31 0.44 0.56 0.32 0.37 0.41 0.37 0.71 0.85 0.81 0.47 0.72 0.17 0.4 0.32 0.2 0.17 0.32 0.46 0.22 1.0 0.45 0.6 0.54
0.36 0.48 0.39 0.4 0.34 0.28 0.54 0.69 0.58 0.74 0.94 0.8 0.41 0.7 0.65 0.77 1.0 0.42 0.52 0.38 0.06 0.32 0.9 0.39 0.58 0.41
0.44 0.33 0.23 0.25 0.25 0.16 0.24 0.32 0.22 0.36 0.43 0.39 0.25 0.97 0.31 0.56 0.6 0.39 0.37 0.21 0.09 0.5 1.0 0.34 0.72 0.43
0.38 0.23 0.22 0.32 0.23 0.1 0.25 0.33 0.16 0.32 0.43 0.32 0.25 0.76 0.28 0.5 0.43 0.42 0.3 0.22 0.1 0.74 1.0 0.34 0.81 0.66
0.67 0.38 0.38 0.37 0.36 0.2 0.3 0.48 0.23 0.57 0.65 0.54 0.36 1.0 0.39 0.67 0.72 0.44 0.4 0.25 0.11 0.41 0.81 0.34 0.83 0.43
0.51 0.4 0.35 0.36 0.32 0.2 0.31 0.38 0.29 0.43 0.56 0.53 0.38 1.0 0.39 0.66 0.6 0.34 0.41 0.29 0.08 0.4 0.79 0.26 0.57 0.39
0.67 0.55 0.5 0.57 0.49 0.31 0.51 0.6 0.5 0.64 0.8 0.81 0.59 1.0 0.43 0.62 0.58 0.3 0.41 0.31 0.1 0.48 0.88 0.51 0.79 0.51
0.55 0.41 0.49 0.48 0.47 0.4 0.69 0.49 0.46 0.73 0.83 0.84 0.52 0.57 0.46 0.67 0.67 0.34 0.41 0.45 0.19 0.58 1.0 0.37 0.72 0.44
0.83 0.55 0.52 0.59 0.6 0.45 0.69 0.73 0.59 0.77 0.87 0.84 0.84 0.95 0.64 0.98 0.75 0.56 0.57 0.51 0.36 0.6 1.0 0.63 0.79 0.5
0.57 0.35 0.37 0.33 0.43 0.28 0.39 0.51 0.27 0.55 0.62 0.52 0.49 0.78 0.44 0.87 0.64 0.6 0.43 0.41 0.35 1.0 0.96 0.48 0.65 0.37
0.65 0.48 0.49 0.56 0.55 0.39 0.62 0.67 0.59 0.77 0.86 0.84 0.72 0.83 0.64 0.86 0.67 0.59 0.56 0.47 0.31 0.76 1.0 0.68 0.76 0.53
0.41 0.16 0.21 0.22 0.25 0.16 0.25 0.37 0.25 0.58 0.81 0.69 0.44 0.57 0.2 0.46 0.76 0.25 0.27 0.29 0.1 0.48 1.0 0.66 0.7 0.54
0.23 0.03 0.03 0.09 0.03 0.03 0.11 0.23 0.07 0.47 0.51 0.32 0.19 0.25 0.29 0.26 0.2 0.09 0.09 0.05 0.06 0.26 1.0 0.43 0.32 0.61
0.23 0.02 0.04 0.05 0.05 0.05 0.12 0.21 0.07 0.31 0.51 0.38 0.19 0.34 0.29 0.16 0.22 0.08 0.11 0.07 0.08 0.16 1.0 0.55 0.4 0.55
0.51 0.37 0.38 0.32 0.27 0.26 0.4 0.58 0.6 0.89 1.0 0.9 0.71 0.49 0.62 0.62 0.62 0.45 0.39 0.44 0.21 0.46 0.41 0.56 0.59 0.54
0.62 0.47 0.5 0.6 0.6 0.51 0.66 0.69 0.7 0.73 0.81 0.83 0.78 0.93 0.58 1.0 0.53 0.5 0.47 0.4 0.54 0.86 0.77 0.69 0.93 0.77
0.48 0.38 0.41 0.52 0.49 0.33 0.55 0.6 0.45 0.59 0.75 0.68 0.62 0.92 0.51 1.0 0.5 0.59 0.42 0.36 0.5 0.78 0.63 0.64 0.66 0.63
0.48 0.28 0.21 0.36 0.3 0.18 0.26 0.34 0.33 0.43 0.53 0.53 0.51 0.44 0.42 0.39 0.26 0.29 0.16 0.17 0.25 0.56 1.0 0.41 0.86 0.61
0.7 0.62 0.61 0.54 0.43 0.33 0.42 0.53 0.49 0.66 0.76 0.61 0.58 0.98 0.82 0.88 0.78 0.73 0.65 0.78 0.31 0.92 0.92 0.93 1.0 0.76
0.65 0.62 0.69 0.73 0.74 0.8 1.0 0.98 0.84 0.74 0.83 0.78 0.68 0.79 0.6 0.65 0.72 0.65 0.73 0.58 0.47 0.53 1.0 0.6 0.7 0.55
0.73 0.72 0.66 0.71 0.69 0.44 0.71 0.69 0.54 0.9 0.89 0.9 0.64 1.0 0.8 0.95 0.95 0.7 0.79 0.83 0.23 0.72 0.87 0.91 0.77 0.73
0.38 0.34 0.32 0.37 0.32 0.2 0.43 0.39 0.25 0.49 0.44 0.41 0.26 0.6 0.49 0.55 0.55 0.61 0.51 0.42 0.18 1.0 0.94 0.61 0.96 0.59

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)