Heatmap: Cluster_176 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.12 0.33 0.52 0.6 0.72 0.71 0.57 0.51 0.54 0.47 0.47 0.43 0.17 0.79 0.94 0.85 1.0 0.56 0.57 0.51 0.01 0.13 0.23 0.3 0.62 0.68
0.7 0.46 0.52 0.53 0.75 0.94 0.87 0.82 0.89 0.96 0.98 1.0 0.79 0.61 0.7 0.71 0.84 0.85 0.92 0.93 0.1 0.48 0.89 0.78 0.55 0.8
0.05 0.27 0.46 0.93 0.82 0.85 1.0 0.75 0.73 0.49 0.43 0.32 0.05 0.4 0.34 0.51 0.42 0.59 0.57 0.46 0.06 0.1 0.2 0.29 0.71 0.62
0.22 0.42 0.53 0.66 0.89 0.92 1.0 0.8 0.99 0.88 0.81 0.61 0.15 0.49 0.6 0.61 0.48 0.67 0.63 0.47 0.01 0.33 0.41 0.54 0.45 0.45
0.67 0.93 0.94 0.84 0.93 1.0 0.89 0.75 0.75 0.61 0.56 0.51 0.65 0.34 0.4 0.35 0.43 0.55 0.41 0.5 0.04 0.59 0.36 0.59 0.87 0.82
0.31 0.43 0.71 0.7 0.84 1.0 0.86 0.69 0.69 0.62 0.57 0.5 0.29 0.56 0.49 0.48 0.49 0.55 0.82 0.84 0.12 0.6 0.44 0.39 0.85 0.94
0.2 0.29 0.67 0.88 1.0 0.99 0.97 0.88 0.77 0.67 0.53 0.41 0.23 0.26 0.33 0.25 0.61 0.55 0.5 0.74 0.03 0.37 0.41 0.29 0.81 0.78
0.32 0.56 0.62 0.75 0.88 1.0 0.76 0.69 0.74 0.45 0.39 0.39 0.29 0.65 0.78 0.77 0.5 0.61 0.73 0.55 0.01 0.23 0.21 0.13 0.52 0.33
0.24 0.67 0.91 1.0 0.97 0.67 0.54 0.62 0.67 0.69 0.65 0.54 0.24 0.27 0.5 0.41 0.46 0.75 0.72 0.66 0.04 0.35 1.0 0.69 0.74 0.69
0.27 0.5 0.55 0.58 0.67 0.67 0.66 0.57 0.36 0.21 0.18 0.18 0.27 0.64 0.57 0.82 0.61 0.49 0.44 0.32 0.02 0.15 0.14 0.11 1.0 0.38
0.31 0.51 0.73 0.86 0.88 0.87 0.88 0.83 0.66 0.55 0.52 0.52 0.43 0.7 0.61 0.8 0.66 0.58 0.51 0.51 0.09 0.35 0.38 0.25 1.0 0.52
0.0 0.17 0.4 0.51 0.67 0.8 0.45 0.32 0.24 0.21 0.14 0.15 0.01 0.34 0.27 0.32 0.27 0.42 0.39 0.26 0.01 0.32 0.06 0.12 1.0 0.7
0.42 0.69 0.81 1.0 0.92 0.84 0.75 0.74 0.7 0.45 0.43 0.41 0.38 0.37 0.49 0.39 0.33 0.45 0.42 0.52 0.04 0.53 0.16 0.29 0.73 0.67
0.1 0.49 0.72 0.69 0.86 0.96 1.0 0.78 0.72 0.74 0.73 0.74 0.19 0.67 0.79 0.49 0.91 0.67 0.6 0.96 0.01 0.59 0.27 0.34 0.72 0.57
0.05 0.17 0.5 0.76 0.86 0.68 0.38 0.28 0.35 0.31 0.26 0.22 0.02 0.15 0.15 0.13 0.26 0.15 0.14 0.33 0.16 1.0 0.4 0.61 0.66 0.94
0.25 0.54 0.77 0.95 0.78 0.59 0.84 0.84 0.75 0.81 0.63 0.67 0.27 0.93 0.78 1.0 0.86 0.75 0.9 0.91 0.02 0.11 0.54 0.45 0.85 0.97
0.1 0.35 0.79 0.97 0.81 0.53 0.64 0.62 0.65 0.78 0.7 0.68 0.14 1.0 0.47 0.62 0.73 0.9 0.56 0.87 0.19 0.38 0.63 0.65 0.85 0.98
0.44 0.48 0.58 0.76 0.93 0.83 1.0 0.89 0.77 0.84 0.71 0.51 0.37 0.28 0.22 0.09 0.34 0.49 0.36 0.68 0.1 0.61 0.31 0.39 0.9 0.69
0.29 0.46 0.51 0.69 0.88 1.0 0.89 0.69 0.91 0.69 0.72 0.59 0.3 0.51 0.58 0.64 0.42 0.63 0.56 0.4 0.08 0.48 0.48 0.5 0.71 0.51
0.39 0.46 0.56 0.66 0.82 1.0 0.73 0.64 0.6 0.47 0.49 0.47 0.45 0.36 0.32 0.28 0.42 0.44 0.47 0.46 0.01 0.42 0.24 0.32 0.55 0.41
0.36 0.41 0.68 0.84 0.95 1.0 0.96 0.9 0.81 0.71 0.61 0.52 0.4 0.18 0.28 0.2 0.5 0.53 0.48 0.75 0.03 0.26 0.56 0.45 0.85 0.46
0.12 0.26 0.45 0.5 0.55 0.65 1.0 0.86 0.97 0.94 0.74 0.49 0.16 0.86 0.72 0.66 0.79 0.61 0.68 0.95 0.01 0.3 0.39 0.52 0.59 0.92
0.12 0.21 0.31 0.23 0.55 0.69 0.72 0.32 0.7 0.52 0.76 0.69 0.03 0.05 0.11 0.07 0.11 0.61 0.9 0.23 0.13 0.12 0.57 0.81 0.56 1.0
0.39 0.4 0.57 0.59 0.6 0.63 0.73 0.82 0.78 0.79 0.72 0.59 0.38 0.92 0.52 0.74 0.66 0.64 0.62 0.77 0.05 0.62 0.56 0.66 1.0 0.83
0.26 0.49 0.65 0.91 1.0 0.53 0.29 0.31 0.22 0.31 0.43 0.55 0.33 0.3 0.28 0.35 0.42 0.37 0.29 0.48 0.1 0.7 0.34 0.57 0.46 0.81
0.19 0.6 0.79 1.0 0.96 0.67 0.53 0.5 0.36 0.41 0.42 0.46 0.26 0.92 0.63 0.75 0.52 0.51 0.34 0.4 0.05 0.46 0.22 0.27 0.84 0.64
0.39 0.52 0.53 0.58 0.76 0.97 0.66 0.57 0.76 0.83 0.73 0.69 0.38 0.55 0.62 0.48 0.6 0.61 1.0 0.89 0.04 0.58 0.52 0.89 0.76 0.84
0.04 0.2 0.52 0.63 0.8 1.0 0.85 0.64 0.81 0.65 0.55 0.5 0.09 0.57 0.66 0.62 0.8 0.49 0.5 0.65 0.07 0.38 0.42 0.54 0.94 0.69
0.07 0.32 0.53 0.84 1.0 0.67 0.37 0.34 0.26 0.33 0.4 0.39 0.08 0.66 0.31 0.54 0.34 0.32 0.21 0.25 0.1 0.36 0.46 0.24 0.52 0.65
0.04 0.65 0.79 1.0 0.76 0.49 0.34 0.32 0.19 0.08 0.05 0.04 0.07 0.35 0.26 0.25 0.37 0.18 0.15 0.16 0.01 0.34 0.04 0.02 0.8 0.44
0.04 0.23 0.32 0.52 0.76 0.84 0.92 0.58 0.75 0.5 0.62 0.49 0.09 1.0 0.74 0.96 0.55 0.59 0.59 0.5 0.06 0.46 0.07 0.39 0.83 0.47
0.1 0.34 0.46 0.51 0.8 0.88 1.0 0.95 0.85 0.84 0.54 0.38 0.04 0.88 0.54 0.72 0.61 0.44 0.46 0.78 0.02 0.5 0.21 0.3 0.56 0.62
0.24 0.51 0.68 0.75 0.94 1.0 0.73 0.58 0.36 0.34 0.31 0.29 0.25 0.52 0.73 0.84 0.69 0.7 0.59 0.7 0.01 0.17 0.19 0.21 0.44 0.45
0.2 0.49 0.83 0.96 0.99 1.0 0.73 0.85 0.71 0.62 0.7 0.66 0.38 0.18 0.29 0.21 0.48 0.5 0.57 0.58 0.0 0.55 0.2 0.29 0.85 0.41
0.13 0.46 0.93 1.0 0.96 0.96 0.77 0.68 0.51 0.34 0.23 0.2 0.16 0.5 0.51 0.53 0.64 0.59 0.62 0.79 0.03 0.88 0.15 0.18 0.7 0.64
0.08 0.31 0.68 0.72 0.65 1.0 0.73 0.61 0.61 0.38 0.29 0.26 0.1 0.52 0.56 0.48 0.6 0.4 0.6 0.7 0.11 0.39 0.3 0.35 0.28 0.44
0.26 0.35 0.48 1.0 0.99 0.92 0.87 0.97 0.89 0.69 0.67 0.5 0.28 0.26 0.26 0.38 0.32 0.53 0.58 0.66 0.16 0.46 0.4 0.24 0.83 0.58
0.06 0.61 0.9 0.97 1.0 0.92 0.76 0.71 0.62 0.61 0.52 0.5 0.13 0.54 0.53 0.62 0.48 0.8 0.59 0.7 0.03 0.1 0.36 0.18 0.82 0.54
0.06 0.75 0.65 1.0 0.98 0.74 0.66 0.5 0.35 0.18 0.12 0.12 0.11 0.21 0.21 0.24 0.32 0.27 0.26 0.31 0.0 0.12 0.28 0.08 0.83 0.43
0.07 0.44 0.66 0.89 0.97 0.99 0.99 1.0 0.89 0.8 0.69 0.65 0.07 0.81 0.72 0.94 0.83 0.96 0.86 0.73 0.07 0.13 0.61 0.34 0.6 0.52
0.39 0.51 0.53 0.68 0.62 1.0 0.56 0.57 0.83 0.54 0.63 0.5 0.17 0.34 0.31 0.26 0.55 0.73 0.85 0.47 0.12 0.32 0.62 0.81 0.66 0.8
0.55 0.79 0.74 1.0 0.91 0.72 0.71 0.82 0.52 0.63 0.68 0.6 0.7 0.56 0.45 0.43 0.29 1.0 0.5 0.48 0.18 0.82 0.16 0.53 0.88 0.83
0.01 0.03 0.2 0.63 0.57 0.45 0.32 0.24 0.24 0.18 0.13 0.11 0.02 1.0 0.21 0.63 0.15 0.25 0.42 0.19 0.08 0.18 0.09 0.05 0.62 0.33
0.01 0.1 0.36 0.52 0.39 0.34 0.76 0.74 0.46 0.41 0.41 0.21 0.03 1.0 0.51 0.89 0.66 0.76 0.75 0.6 0.04 0.14 0.24 0.28 0.6 0.65
0.02 0.27 0.48 0.61 0.87 1.0 0.76 0.53 0.6 0.36 0.28 0.28 0.01 0.19 0.16 0.15 0.17 0.25 0.22 0.34 0.16 0.05 0.19 0.08 0.58 0.66
0.11 0.28 0.64 0.67 0.7 0.68 0.8 0.78 0.7 0.69 0.52 0.46 0.07 0.75 0.44 0.66 0.6 0.72 0.58 1.0 0.1 0.64 0.45 0.42 0.9 0.91
0.2 0.27 0.58 0.68 0.79 0.78 0.95 0.81 0.69 0.56 0.5 0.56 0.23 0.69 0.99 1.0 0.62 0.75 0.88 0.58 0.1 0.59 0.32 0.26 0.41 0.46
0.56 0.58 0.53 0.63 0.68 0.77 0.64 0.58 0.63 0.58 0.52 0.62 0.58 0.56 0.82 0.76 0.69 0.72 1.0 0.79 0.1 0.78 0.43 0.84 0.77 0.8
0.2 0.55 0.71 0.87 0.95 0.68 0.76 0.77 0.8 0.51 0.57 0.37 0.21 0.7 0.91 0.78 0.67 0.88 0.98 0.53 0.05 0.56 0.35 0.23 1.0 0.58
0.12 0.32 0.63 1.0 0.96 0.64 0.45 0.44 0.28 0.3 0.32 0.33 0.13 0.17 0.42 0.24 0.18 0.17 0.14 0.21 0.13 0.29 0.32 0.45 0.58 0.81
0.25 0.77 0.97 0.95 1.0 0.98 0.75 0.62 0.67 0.59 0.59 0.64 0.21 0.54 0.23 0.4 0.35 0.46 0.53 0.57 0.04 0.38 0.13 0.3 0.61 0.51
0.27 0.36 0.5 0.52 0.52 0.45 0.59 0.66 0.69 0.53 0.6 0.46 0.25 0.73 0.77 0.67 0.44 0.64 0.57 0.61 0.05 0.89 0.37 0.78 1.0 0.87
0.18 0.21 0.57 0.82 1.0 0.93 0.83 0.71 0.64 0.59 0.53 0.52 0.25 0.76 0.8 0.8 0.65 0.69 0.71 0.57 0.05 0.37 0.27 0.22 0.73 0.45
0.21 0.77 0.76 1.0 0.9 0.71 0.66 0.49 0.36 0.27 0.25 0.31 0.26 0.36 0.36 0.42 0.38 0.46 0.3 0.32 0.03 0.11 0.59 0.25 0.94 0.94
0.16 0.27 0.67 1.0 0.96 0.96 0.79 0.92 0.86 0.63 0.62 0.44 0.19 0.66 0.61 0.82 0.53 0.56 0.6 0.63 0.07 0.36 0.2 0.3 0.55 0.64
0.31 0.63 0.63 0.66 0.74 0.81 0.78 0.64 0.67 0.46 0.34 0.3 0.29 0.53 1.0 0.64 0.58 0.6 0.48 0.51 0.01 0.57 0.16 0.18 0.71 0.4
0.29 0.69 0.94 1.0 0.8 0.54 0.52 0.58 0.45 0.4 0.42 0.38 0.21 0.33 0.22 0.27 0.18 0.19 0.22 0.35 0.01 0.2 0.13 0.2 0.45 0.75
0.66 0.85 0.72 0.92 1.0 1.0 0.99 0.94 0.87 0.72 0.65 0.55 0.61 0.56 0.56 0.6 0.51 0.66 0.64 0.67 0.22 0.7 0.54 0.59 0.85 0.74
0.35 0.56 0.91 1.0 0.93 0.84 0.55 0.5 0.46 0.51 0.45 0.51 0.38 0.52 0.55 0.63 0.4 0.63 0.57 0.49 0.15 0.25 0.56 0.53 0.98 1.0
0.19 0.3 0.69 1.0 0.97 0.88 0.87 0.97 0.93 0.81 0.68 0.53 0.21 0.28 0.4 0.31 0.48 0.64 0.49 0.77 0.09 0.77 0.36 0.49 0.72 0.73
0.16 0.14 0.52 0.79 1.0 0.96 0.78 0.68 0.67 0.82 0.71 0.54 0.24 0.15 0.25 0.16 0.32 0.48 0.68 0.79 0.11 0.28 0.38 0.28 0.4 0.48
0.36 0.58 0.79 0.9 0.84 0.87 1.0 0.88 0.45 0.45 0.45 0.38 0.27 0.36 0.19 0.37 0.3 0.6 0.58 0.44 0.08 0.69 0.22 0.42 0.75 0.82
0.38 0.74 0.95 0.91 0.82 0.72 0.55 0.51 0.48 0.43 0.38 0.39 0.38 0.11 0.19 0.17 0.26 0.35 0.36 0.53 0.06 1.0 0.26 0.37 0.49 0.54
0.25 0.52 0.61 0.6 0.85 0.93 0.82 0.7 0.79 0.53 0.53 0.39 0.29 0.84 0.77 1.0 0.7 0.63 0.8 0.73 0.1 0.27 0.56 0.39 0.43 0.76
0.23 0.52 0.82 0.9 0.99 1.0 0.86 0.86 0.64 0.6 0.52 0.51 0.27 0.6 0.62 0.68 0.56 0.71 0.75 0.76 0.09 0.35 0.61 0.58 0.86 0.88
0.31 0.56 0.76 1.0 0.99 0.84 0.67 0.67 0.59 0.52 0.49 0.41 0.29 0.37 0.27 0.33 0.35 0.68 0.43 0.52 0.02 0.69 0.1 0.29 0.7 0.72
0.04 0.05 0.32 0.67 0.79 0.63 0.43 0.52 0.51 0.41 0.37 0.18 0.03 0.26 0.05 0.4 0.14 0.07 0.14 0.15 0.03 0.14 0.37 0.32 0.4 1.0
0.66 0.8 0.94 0.96 0.99 1.0 0.85 0.9 0.82 0.79 0.69 0.68 0.62 0.31 0.33 0.31 0.58 0.75 0.71 0.88 0.04 0.18 0.45 0.44 0.53 0.6
0.35 0.45 0.62 0.64 0.8 1.0 0.8 0.7 0.87 0.83 0.77 0.74 0.31 0.47 0.43 0.4 0.66 0.56 0.64 0.67 0.03 0.63 0.39 0.68 0.74 0.78
0.34 0.53 0.63 0.7 0.87 0.97 1.0 0.83 0.9 0.95 0.79 0.61 0.43 0.75 0.53 0.85 0.79 0.74 0.8 0.75 0.02 0.8 0.22 0.33 0.76 0.62
0.29 0.75 1.0 1.0 0.65 0.38 0.43 0.44 0.39 0.35 0.37 0.54 0.31 0.33 0.29 0.39 0.25 0.32 0.32 0.33 0.01 0.23 0.14 0.16 0.55 0.41
0.42 0.54 0.54 0.58 0.75 1.0 0.77 0.62 0.66 0.62 0.55 0.42 0.29 0.38 0.55 0.4 0.55 0.72 0.77 0.78 0.04 0.4 0.45 0.65 0.54 0.62
0.2 0.47 0.7 0.91 1.0 0.96 0.77 0.68 0.72 0.59 0.62 0.68 0.25 0.3 0.22 0.32 0.36 0.63 0.35 0.42 0.04 0.74 0.29 0.36 0.71 0.6
0.23 0.42 0.71 0.87 0.9 1.0 0.97 0.84 0.86 0.69 0.54 0.43 0.24 0.86 0.6 0.58 0.6 0.58 0.56 0.76 0.02 0.46 0.3 0.29 0.79 0.65
0.06 0.4 0.64 0.92 0.97 0.93 0.72 0.56 0.65 0.6 0.66 0.66 0.11 0.8 0.51 0.65 0.3 0.39 0.42 0.37 0.18 0.57 0.63 1.0 0.76 0.61
0.16 0.28 0.51 0.66 0.79 0.92 1.0 0.87 0.7 0.55 0.35 0.26 0.15 0.45 0.92 0.68 0.51 0.54 0.43 0.55 0.03 0.74 0.26 0.22 0.63 0.55
0.36 0.15 0.38 0.43 0.5 0.79 1.0 0.89 0.68 0.35 0.24 0.2 0.26 0.07 0.18 0.12 0.3 0.32 0.27 0.42 0.06 0.06 0.42 0.26 0.47 0.3
0.25 0.6 0.74 0.81 0.82 0.82 0.67 0.54 0.46 0.47 0.44 0.45 0.29 0.92 0.79 0.78 0.85 0.67 0.76 0.67 0.04 0.37 0.4 0.45 1.0 0.94
0.32 0.46 0.68 0.81 0.81 0.63 0.55 0.54 0.58 0.6 0.64 0.62 0.34 0.65 0.43 0.55 0.57 0.54 0.37 0.5 0.21 0.54 0.4 0.51 0.62 1.0
0.31 0.56 0.96 1.0 0.87 0.8 0.71 0.82 0.6 0.47 0.42 0.43 0.21 0.45 0.66 0.48 0.59 0.5 0.62 0.69 0.06 0.31 0.66 0.33 0.7 0.71
0.47 0.76 1.0 0.85 0.73 0.63 0.67 0.76 0.71 0.52 0.44 0.39 0.42 0.28 0.64 0.39 0.55 0.72 0.77 0.82 0.14 0.41 0.7 0.45 0.55 0.4
0.26 0.47 0.61 0.71 0.87 1.0 0.81 0.7 0.65 0.47 0.51 0.41 0.28 0.51 0.37 0.55 0.4 0.52 0.54 0.44 0.05 0.53 0.41 0.32 0.64 0.63
0.14 0.42 0.6 0.63 0.68 0.76 0.77 0.68 0.74 0.55 0.56 0.52 0.08 0.93 1.0 0.9 0.77 0.81 0.69 0.73 0.01 0.2 0.5 0.28 0.88 0.65
0.09 0.26 0.34 0.39 0.5 0.54 0.54 0.45 0.41 0.31 0.26 0.21 0.12 0.62 0.68 1.0 0.44 0.44 0.42 0.34 0.01 0.13 0.15 0.11 0.56 0.26
0.12 0.7 0.95 0.97 1.0 0.89 0.54 0.54 0.45 0.42 0.43 0.38 0.1 0.24 0.34 0.28 0.35 0.37 0.45 0.64 0.07 0.57 0.19 0.29 0.5 0.6

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)