1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_96 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.54 0.4 0.21 0.15 0.16 0.3 0.44 0.46 0.47 0.47 0.52 0.62 0.59 0.44 0.22 0.42 0.35 0.41 0.34 0.31 0.34 0.21 1.0 0.73 0.48 0.25
0.65 0.59 0.51 0.45 0.45 0.52 0.62 0.66 0.72 0.69 0.74 0.81 0.64 0.5 0.34 0.59 0.45 0.47 0.35 0.46 0.32 0.33 1.0 0.67 0.41 0.31
0.23 0.21 0.17 0.13 0.13 0.11 0.14 0.18 0.2 0.18 0.2 0.16 0.22 0.08 0.13 0.11 0.18 0.19 0.19 0.21 0.36 0.13 1.0 0.33 0.2 0.18
0.3 0.12 0.1 0.15 0.14 0.14 0.2 0.22 0.23 0.27 0.34 0.38 0.23 0.12 0.09 0.11 0.06 0.12 0.07 0.06 0.49 0.33 1.0 0.55 0.25 0.19
0.34 0.29 0.19 0.14 0.14 0.19 0.17 0.23 0.22 0.23 0.27 0.3 0.27 0.05 0.08 0.08 0.15 0.17 0.18 0.19 0.55 0.08 1.0 0.51 0.23 0.1
0.43 0.53 0.4 0.35 0.31 0.27 0.34 0.35 0.39 0.45 0.47 0.57 0.34 0.27 0.29 0.32 0.42 0.3 0.29 0.38 0.59 0.32 1.0 0.97 0.47 0.32
0.35 0.22 0.21 0.27 0.3 0.24 0.23 0.25 0.32 0.36 0.41 0.43 0.42 0.2 0.11 0.15 0.09 0.15 0.11 0.1 0.61 0.46 1.0 0.75 0.32 0.29
0.37 0.09 0.04 0.03 0.03 0.05 0.13 0.3 0.31 0.41 0.39 0.32 0.32 0.03 0.13 0.04 0.1 0.24 0.21 0.16 0.69 0.03 1.0 0.3 0.04 0.04
0.17 0.06 0.02 0.01 0.01 0.03 0.1 0.15 0.16 0.25 0.2 0.19 0.2 0.04 0.11 0.05 0.1 0.31 0.22 0.14 0.69 0.03 1.0 0.35 0.04 0.04
0.28 0.08 0.05 0.03 0.06 0.1 0.15 0.17 0.19 0.2 0.29 0.29 0.23 0.1 0.05 0.08 0.08 0.09 0.08 0.07 0.08 0.06 1.0 0.37 0.27 0.15
0.79 0.53 0.25 0.1 0.05 0.09 0.23 0.29 0.32 0.35 0.45 0.59 0.72 0.48 0.21 0.26 0.25 0.19 0.21 0.22 0.81 0.1 1.0 0.5 0.47 0.31
0.59 0.36 0.29 0.23 0.2 0.19 0.23 0.31 0.38 0.42 0.54 0.74 0.67 0.12 0.15 0.19 0.17 0.2 0.2 0.21 0.71 0.15 1.0 0.57 0.2 0.12
0.23 0.06 0.01 0.02 0.02 0.06 0.15 0.18 0.24 0.27 0.25 0.31 0.26 0.07 0.06 0.06 0.04 0.08 0.08 0.06 0.2 0.02 1.0 0.47 0.1 0.08
0.47 0.13 0.06 0.04 0.08 0.21 0.51 0.56 0.42 0.46 0.37 0.36 0.45 0.25 0.19 0.21 0.34 0.52 0.32 0.36 0.81 0.28 1.0 0.79 0.47 0.32
0.34 0.45 0.47 0.44 0.31 0.31 0.32 0.37 0.45 0.5 0.57 0.6 0.38 0.21 0.31 0.32 0.31 0.39 0.4 0.4 0.34 0.15 1.0 0.53 0.23 0.26
0.35 0.21 0.12 0.08 0.09 0.19 0.42 0.58 0.62 0.65 0.62 0.58 0.31 0.17 0.17 0.12 0.29 0.33 0.31 0.34 0.93 0.11 1.0 0.82 0.37 0.25
0.39 0.08 0.03 0.02 0.02 0.03 0.11 0.18 0.11 0.17 0.2 0.22 0.36 0.09 0.03 0.05 0.05 0.08 0.06 0.04 0.13 0.05 1.0 0.46 0.22 0.2
0.27 0.24 0.2 0.23 0.11 0.1 0.16 0.26 0.31 0.26 0.38 0.31 0.24 0.17 0.17 0.18 0.15 0.21 0.2 0.12 0.54 0.2 1.0 0.65 0.41 0.27
0.64 0.35 0.23 0.18 0.14 0.1 0.26 0.38 0.4 0.41 0.46 0.5 0.6 0.24 0.22 0.25 0.24 0.26 0.28 0.22 0.26 0.23 1.0 0.42 0.37 0.32
0.7 0.11 0.08 0.07 0.06 0.07 0.12 0.18 0.17 0.22 0.38 0.79 1.0 0.09 0.05 0.09 0.06 0.1 0.06 0.1 0.99 0.14 0.83 0.48 0.1 0.13
0.37 0.27 0.22 0.22 0.17 0.14 0.17 0.21 0.25 0.25 0.32 0.37 0.32 0.13 0.06 0.19 0.11 0.17 0.13 0.16 0.88 0.41 1.0 0.6 0.51 0.27
0.42 0.12 0.03 0.04 0.08 0.18 0.26 0.27 0.2 0.17 0.15 0.2 0.39 0.12 0.08 0.14 0.1 0.14 0.11 0.11 0.59 0.08 1.0 0.32 0.2 0.11
0.33 0.05 0.07 0.06 0.07 0.13 0.2 0.33 0.42 0.68 0.82 0.95 0.4 0.01 0.05 0.04 0.09 0.22 0.17 0.26 1.0 0.03 0.92 0.93 0.08 0.09
0.26 0.24 0.16 0.22 0.16 0.11 0.13 0.22 0.18 0.22 0.31 0.31 0.28 0.07 0.04 0.07 0.06 0.09 0.1 0.06 0.48 0.19 1.0 0.26 0.3 0.24
0.07 0.01 0.01 0.02 0.02 0.06 0.09 0.11 0.24 0.43 0.42 0.36 0.11 0.02 0.03 0.01 0.06 0.09 0.07 0.07 0.41 0.04 1.0 0.86 0.14 0.25
0.39 0.37 0.29 0.28 0.22 0.2 0.21 0.3 0.32 0.37 0.44 0.51 0.3 0.26 0.15 0.33 0.19 0.29 0.25 0.25 0.59 0.26 1.0 0.56 0.3 0.18
0.18 0.09 0.05 0.07 0.08 0.13 0.19 0.2 0.26 0.31 0.31 0.28 0.14 0.07 0.09 0.08 0.11 0.19 0.14 0.12 0.54 0.22 1.0 0.5 0.3 0.23
0.6 0.49 0.43 0.35 0.3 0.38 0.45 0.47 0.61 0.58 0.65 0.73 0.7 0.23 0.24 0.24 0.47 0.35 0.33 0.39 0.52 0.19 1.0 0.6 0.39 0.31
0.41 0.26 0.21 0.23 0.22 0.16 0.23 0.28 0.3 0.32 0.44 0.52 0.4 0.22 0.15 0.2 0.14 0.23 0.23 0.16 0.69 0.26 1.0 0.84 0.41 0.36
0.47 0.34 0.28 0.25 0.21 0.18 0.3 0.29 0.34 0.32 0.4 0.54 0.57 0.22 0.24 0.26 0.21 0.29 0.22 0.22 0.54 0.15 1.0 0.62 0.26 0.21
0.28 0.17 0.1 0.07 0.05 0.08 0.14 0.18 0.21 0.23 0.3 0.36 0.27 0.08 0.1 0.12 0.11 0.15 0.14 0.11 0.64 0.06 1.0 0.52 0.1 0.07
0.19 0.13 0.09 0.2 0.17 0.11 0.12 0.16 0.26 0.22 0.4 0.24 0.19 0.13 0.11 0.12 0.06 0.13 0.08 0.07 0.5 0.32 1.0 0.35 0.32 0.29
0.21 0.13 0.08 0.07 0.07 0.08 0.1 0.15 0.2 0.25 0.32 0.35 0.19 0.13 0.11 0.14 0.12 0.15 0.13 0.09 0.44 0.23 1.0 0.6 0.29 0.21
0.41 0.43 0.28 0.17 0.14 0.24 0.31 0.32 0.36 0.43 0.46 0.53 0.38 0.14 0.1 0.08 0.2 0.23 0.2 0.21 0.57 0.28 1.0 0.65 0.44 0.23
0.31 0.23 0.14 0.1 0.08 0.11 0.19 0.24 0.27 0.31 0.38 0.44 0.3 0.1 0.19 0.28 0.18 0.24 0.23 0.18 0.81 0.18 1.0 0.6 0.13 0.09
0.54 0.28 0.14 0.06 0.02 0.03 0.13 0.24 0.3 0.4 0.51 0.58 0.55 0.12 0.17 0.11 0.2 0.19 0.15 0.16 0.38 0.1 1.0 0.87 0.32 0.28
0.46 0.28 0.22 0.2 0.16 0.18 0.27 0.33 0.32 0.3 0.35 0.42 0.4 0.19 0.12 0.23 0.16 0.18 0.15 0.17 0.68 0.19 1.0 0.48 0.36 0.31
0.19 0.28 0.3 0.4 0.51 0.47 0.41 0.32 0.33 0.33 0.34 0.33 0.19 0.29 0.24 0.49 0.34 0.29 0.28 0.3 0.17 0.51 1.0 0.64 0.33 0.23
0.19 0.26 0.25 0.25 0.27 0.29 0.23 0.2 0.25 0.3 0.37 0.47 0.21 0.26 0.25 0.38 0.23 0.21 0.23 0.23 0.15 0.34 1.0 0.78 0.24 0.29
0.39 0.33 0.2 0.16 0.17 0.21 0.26 0.27 0.35 0.37 0.44 0.51 0.32 0.25 0.24 0.53 0.29 0.21 0.22 0.23 0.4 0.22 1.0 0.6 0.26 0.16
0.24 0.14 0.08 0.07 0.08 0.11 0.15 0.16 0.2 0.27 0.37 0.47 0.29 0.06 0.06 0.1 0.11 0.09 0.07 0.08 0.57 0.11 1.0 0.59 0.14 0.1
0.14 0.11 0.09 0.1 0.08 0.11 0.19 0.21 0.24 0.19 0.28 0.3 0.17 0.07 0.06 0.05 0.06 0.07 0.06 0.09 0.51 0.1 1.0 0.36 0.35 0.25
0.33 0.24 0.16 0.15 0.11 0.11 0.13 0.18 0.14 0.15 0.16 0.21 0.28 0.08 0.08 0.08 0.1 0.18 0.15 0.14 0.56 0.16 1.0 0.36 0.29 0.27
0.45 0.43 0.26 0.13 0.11 0.13 0.26 0.31 0.39 0.42 0.43 0.45 0.35 0.12 0.16 0.11 0.24 0.26 0.24 0.28 0.35 0.09 1.0 0.48 0.26 0.2
0.31 0.17 0.11 0.08 0.05 0.05 0.1 0.16 0.16 0.16 0.21 0.24 0.28 0.08 0.08 0.08 0.11 0.17 0.16 0.16 0.34 0.12 1.0 0.36 0.22 0.18
0.06 0.07 0.07 0.07 0.1 0.11 0.08 0.07 0.13 0.19 0.24 0.29 0.06 0.18 0.15 0.42 0.21 0.13 0.15 0.13 0.26 0.23 1.0 0.75 0.12 0.11
0.48 0.34 0.22 0.23 0.19 0.16 0.27 0.41 0.43 0.42 0.55 0.65 0.56 0.12 0.13 0.12 0.19 0.25 0.25 0.2 0.5 0.2 1.0 0.62 0.59 0.3
0.32 0.12 0.03 0.03 0.04 0.09 0.2 0.24 0.26 0.26 0.22 0.21 0.22 0.07 0.1 0.06 0.11 0.17 0.17 0.13 0.28 0.01 1.0 0.43 0.24 0.17
0.35 0.11 0.02 0.04 0.01 0.09 0.16 0.22 0.25 0.29 0.38 0.35 0.24 0.02 0.03 0.02 0.1 0.18 0.17 0.1 0.51 0.02 1.0 0.69 0.14 0.07
0.34 0.16 0.09 0.09 0.11 0.12 0.17 0.19 0.27 0.26 0.37 0.38 0.41 0.1 0.13 0.15 0.13 0.11 0.09 0.08 0.38 0.2 1.0 0.61 0.38 0.1
0.45 0.35 0.32 0.27 0.2 0.14 0.16 0.2 0.21 0.25 0.35 0.42 0.39 0.12 0.12 0.17 0.18 0.2 0.15 0.14 0.72 0.3 1.0 0.54 0.25 0.21
0.23 0.17 0.17 0.27 0.39 0.31 0.2 0.16 0.19 0.23 0.34 0.3 0.27 0.11 0.06 0.15 0.06 0.08 0.09 0.07 0.5 0.45 1.0 0.41 0.37 0.33
0.3 0.29 0.25 0.19 0.14 0.15 0.19 0.19 0.19 0.25 0.29 0.31 0.29 0.09 0.17 0.12 0.15 0.17 0.13 0.12 0.86 0.11 1.0 0.31 0.2 0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)