1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_80 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.35 0.19 0.25 0.38 0.61 0.49 0.87 1.0 0.56 0.82 0.94 0.65 0.38 0.54 0.27 0.71 0.63 0.32 0.21 0.15 0.13 0.13 0.29 0.21 0.26 0.17
0.35 0.18 0.28 0.38 0.53 0.57 0.98 1.0 0.72 0.93 0.93 0.7 0.49 0.56 0.41 0.8 0.62 0.24 0.29 0.22 0.09 0.08 0.18 0.12 0.22 0.14
0.84 0.23 0.08 0.14 0.22 0.47 0.68 0.78 0.72 0.91 1.0 0.72 0.91 0.21 0.06 0.16 0.1 0.41 0.18 0.16 0.29 0.12 0.86 0.39 0.22 0.17
0.72 0.16 0.09 0.13 0.19 0.52 0.63 0.72 0.76 0.82 0.89 0.68 1.0 0.15 0.08 0.07 0.05 0.3 0.14 0.09 0.35 0.06 0.77 0.27 0.11 0.09
0.12 0.17 0.25 0.2 0.38 0.41 0.6 0.55 0.61 0.7 0.66 0.96 0.59 0.06 0.13 0.11 0.16 0.24 0.2 0.16 0.04 0.03 1.0 0.08 0.26 0.34
0.39 0.38 0.52 0.6 0.63 0.69 0.84 0.85 1.0 0.84 0.69 0.62 0.55 0.73 0.52 0.77 0.46 0.78 0.5 0.48 0.07 0.92 0.4 0.34 0.46 0.59
0.78 0.34 0.38 0.58 0.21 0.35 0.28 0.4 0.3 0.29 0.6 0.6 0.53 0.22 0.08 0.19 0.07 0.13 0.19 0.25 0.22 0.02 0.45 0.35 1.0 0.49
0.79 0.74 0.77 0.82 0.8 0.8 0.96 1.0 0.92 0.91 0.88 0.88 0.9 0.83 0.79 0.94 0.76 0.68 0.7 0.75 0.2 0.58 0.26 0.43 0.5 0.48
0.76 0.68 0.55 0.55 0.64 0.56 0.73 0.81 0.98 0.87 1.0 0.95 0.82 0.75 0.84 0.71 0.34 0.46 0.41 0.35 0.09 0.27 0.4 0.66 0.63 0.53
0.06 0.0 0.0 0.29 0.0 0.15 0.46 0.27 0.45 0.95 1.0 0.54 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.09 0.06 0.22 0.0 0.18 0.06 0.2 0.24 0.05
0.5 0.22 0.22 0.19 0.43 0.66 0.78 0.92 0.62 1.0 0.9 0.92 0.87 0.39 0.25 0.21 0.28 0.31 0.25 0.23 0.01 0.06 0.82 0.33 0.59 0.34
0.52 0.48 0.71 0.67 0.97 0.72 0.87 0.81 1.0 0.91 0.95 0.94 0.69 0.78 0.47 0.91 0.51 0.6 0.51 0.48 0.05 0.45 0.47 0.22 0.17 0.52
0.86 0.54 0.42 0.37 0.44 0.34 0.41 0.45 0.52 0.53 0.48 0.81 0.9 0.4 0.23 0.27 0.24 0.39 0.4 0.31 0.1 0.06 0.38 0.52 1.0 0.45
0.55 0.3 0.25 0.4 0.47 0.47 0.74 0.57 0.91 0.82 0.99 1.0 0.69 0.34 0.38 0.42 0.38 0.45 0.3 0.18 0.07 0.51 0.5 0.38 0.64 0.49
0.52 0.5 0.55 0.51 0.64 0.65 0.76 0.77 0.88 0.99 0.94 1.0 0.63 0.83 0.69 0.7 0.57 0.57 0.44 0.6 0.27 0.54 0.64 0.43 0.71 0.6
0.27 0.13 0.1 0.35 0.44 0.44 0.51 0.48 0.29 0.75 0.85 0.7 0.37 0.12 0.0 0.09 0.0 0.04 0.05 0.08 0.02 0.02 1.0 0.04 0.06 0.1
0.37 0.16 0.14 0.25 0.33 0.37 0.31 0.46 0.37 0.95 1.0 0.85 0.17 0.31 0.04 0.05 0.0 0.07 0.07 0.04 0.03 0.0 0.65 0.03 0.0 0.03
0.38 0.09 0.18 0.34 0.44 0.52 0.59 0.55 0.41 0.7 1.0 0.63 0.43 0.14 0.03 0.04 0.01 0.06 0.05 0.15 0.0 0.55 0.58 0.05 0.03 0.11
0.41 0.11 0.26 0.31 0.5 0.43 0.61 0.47 0.38 0.84 1.0 0.72 0.33 0.17 0.01 0.08 0.01 0.07 0.08 0.12 0.0 0.03 0.7 0.06 0.05 0.13
0.61 0.81 0.96 0.89 0.79 0.74 0.88 1.0 0.93 0.84 0.71 0.61 0.74 0.73 0.63 0.7 0.72 0.46 0.53 0.62 0.03 0.37 0.14 0.16 0.42 0.25
0.62 0.32 0.21 0.34 0.63 0.24 0.43 0.51 0.6 0.9 1.0 0.75 0.67 0.07 0.17 0.21 0.18 0.26 0.47 0.25 0.08 0.23 0.43 0.43 0.3 0.24
0.83 0.96 0.74 0.77 0.62 0.66 0.83 1.0 0.94 0.88 0.94 0.78 0.97 0.54 0.4 0.55 0.48 0.59 0.53 0.38 0.04 0.62 0.53 0.37 0.52 0.48
0.63 0.43 0.33 0.45 0.42 0.41 0.6 0.63 0.73 0.92 1.0 0.72 0.76 0.79 0.39 0.52 0.3 0.28 0.48 0.34 0.02 0.32 0.14 0.32 0.54 0.4
0.62 0.45 0.2 0.22 0.4 0.47 0.7 0.87 0.6 0.76 1.0 0.81 0.78 0.4 0.27 0.22 0.28 0.38 0.25 0.11 0.04 0.07 0.44 0.21 0.32 0.36
0.72 0.36 0.62 0.54 0.74 0.44 0.5 0.56 0.65 0.78 0.91 1.0 0.79 0.66 0.44 0.61 0.48 0.48 0.46 0.46 0.15 0.38 0.41 0.34 0.12 0.59
0.75 0.77 0.74 0.83 0.84 0.87 0.99 1.0 0.96 0.91 0.82 0.82 0.85 0.81 0.81 0.95 0.76 0.68 0.72 0.75 0.26 0.83 0.28 0.44 0.61 0.49
0.74 0.72 0.76 0.78 0.8 0.79 0.94 1.0 0.95 0.91 0.87 0.84 0.84 0.76 0.74 0.87 0.71 0.59 0.76 0.66 0.19 0.56 0.22 0.43 0.45 0.48
0.22 0.53 0.77 0.92 0.59 0.42 0.45 0.7 0.49 0.71 1.0 0.8 0.5 0.79 0.33 0.45 0.43 0.12 0.25 0.34 0.02 0.03 0.04 0.18 0.84 0.48
0.46 0.68 0.65 0.76 0.84 0.66 0.78 0.87 1.0 1.0 0.87 0.77 0.6 0.91 0.45 0.68 0.64 0.6 0.45 0.57 0.12 0.14 0.11 0.28 0.68 0.46
0.28 0.31 0.57 0.42 0.4 0.29 0.39 0.23 0.41 0.59 1.0 0.82 0.3 0.53 0.13 0.09 0.02 0.0 0.05 0.0 0.1 0.53 0.55 0.2 0.37 0.4
0.54 0.56 0.73 0.9 1.0 0.94 0.83 0.72 0.76 0.78 0.85 0.82 0.66 0.87 0.59 0.8 0.5 0.45 0.46 0.68 0.0 0.33 0.14 0.17 0.51 0.75
0.43 0.89 0.89 0.81 0.77 0.72 0.93 1.0 0.88 0.66 0.5 0.37 0.48 0.63 0.41 0.7 0.29 0.44 0.5 0.52 0.1 0.37 0.16 0.17 0.25 0.24
0.58 0.39 0.53 0.61 0.64 0.61 0.8 0.79 0.88 0.87 1.0 0.92 0.76 0.79 0.54 0.7 0.51 0.53 0.46 0.41 0.12 0.48 0.48 0.49 0.43 0.41
0.67 0.52 0.56 0.65 0.62 0.71 0.57 0.62 0.81 0.88 0.89 0.92 1.0 0.85 0.58 0.7 0.38 0.61 0.57 0.37 0.09 0.13 0.33 0.42 0.45 0.64
0.42 0.27 0.24 0.27 0.31 0.14 0.31 0.19 0.72 0.83 1.0 0.77 0.32 0.4 0.13 0.33 0.05 0.03 0.03 0.05 0.26 0.13 0.65 0.64 0.15 0.38
0.76 0.49 0.22 0.31 0.39 0.52 0.98 1.0 0.69 0.87 0.97 0.81 0.94 0.49 0.18 0.27 0.3 0.36 0.3 0.26 0.1 0.18 0.95 0.51 0.67 0.36
0.34 0.24 0.36 0.36 0.27 0.44 0.68 0.72 1.0 0.85 0.98 0.78 0.53 0.45 0.37 0.34 0.29 0.2 0.37 0.21 0.09 0.15 0.38 0.51 0.41 0.26
0.74 0.74 0.76 0.82 0.79 0.77 0.93 1.0 0.93 0.91 0.92 0.93 0.87 0.85 0.75 0.89 0.66 0.54 0.56 0.67 0.18 0.55 0.34 0.46 0.5 0.47
0.6 0.82 0.75 0.87 0.88 0.7 0.94 0.95 0.88 0.97 1.0 0.93 0.61 0.53 0.62 0.71 0.4 0.7 0.72 0.55 0.21 0.67 0.62 0.84 0.56 0.51
0.65 0.41 0.31 0.48 0.47 0.29 0.4 0.53 0.67 0.84 1.0 0.83 0.69 0.45 0.45 0.39 0.38 0.41 0.45 0.37 0.14 0.07 0.38 0.32 0.2 0.33
0.5 0.56 0.66 0.6 0.79 0.68 0.93 0.86 0.75 0.79 0.82 0.75 0.64 1.0 0.72 0.85 0.54 0.35 0.48 0.39 0.1 0.54 0.43 0.27 0.4 0.38
0.87 0.51 0.53 0.52 0.54 0.61 0.77 0.74 0.91 0.85 0.89 0.94 1.0 0.74 0.44 0.55 0.37 0.43 0.36 0.47 0.24 0.44 0.53 0.52 0.45 0.61
0.57 0.46 0.45 0.51 0.56 0.59 0.89 0.83 0.93 1.0 0.98 1.0 0.75 0.69 0.64 0.62 0.53 0.71 0.58 0.59 0.08 0.81 0.44 0.41 0.58 0.61
0.77 0.36 0.48 0.5 0.52 0.54 0.62 0.75 0.8 1.0 0.87 0.96 0.97 0.62 0.48 0.62 0.51 0.6 0.4 0.55 0.03 0.12 0.48 0.29 0.32 0.36
0.33 0.36 0.51 0.53 0.62 0.52 0.64 0.64 0.63 0.7 0.7 0.69 0.49 0.39 0.43 1.0 0.45 0.54 0.4 0.43 0.05 0.28 0.83 0.63 0.42 0.43
0.74 0.61 0.57 0.65 0.7 0.65 0.72 0.86 1.0 1.0 0.93 0.74 0.66 0.68 0.79 0.93 0.53 0.87 0.61 0.4 0.2 0.51 0.51 0.53 0.32 0.31
0.58 0.41 0.39 0.43 0.33 0.4 0.39 0.48 0.43 0.59 0.47 0.5 0.5 0.39 0.23 0.29 0.18 0.47 0.33 0.19 0.08 0.09 0.45 0.31 1.0 0.44
0.36 0.37 0.51 0.44 0.38 0.51 0.71 0.81 0.96 0.69 0.64 0.69 0.42 0.71 0.62 0.72 0.55 1.0 0.59 0.5 0.08 0.77 0.57 0.4 0.43 0.55
0.72 0.45 0.43 0.41 0.39 0.42 0.6 0.69 0.68 0.78 0.9 0.66 0.67 0.63 0.31 0.56 0.39 0.52 0.45 0.46 0.27 0.14 1.0 0.81 0.66 0.8
0.69 0.47 0.36 0.7 0.58 0.61 0.81 0.74 0.79 0.7 0.86 1.0 0.98 0.84 0.61 0.89 0.43 0.67 0.4 0.56 0.08 0.04 0.43 0.31 0.2 0.4
0.37 0.44 0.54 0.77 0.87 0.77 0.91 0.82 0.78 0.84 1.0 0.99 0.68 0.42 0.37 0.99 0.37 0.52 0.35 0.38 0.06 0.54 0.54 0.37 0.5 0.39
0.59 0.47 0.48 0.58 0.72 0.78 0.84 0.9 0.9 0.8 0.9 0.95 0.71 1.0 0.49 0.73 0.51 0.57 0.41 0.38 0.2 0.57 0.86 0.56 0.6 0.63
0.6 0.4 0.4 0.57 0.6 0.55 0.79 0.73 0.86 0.83 0.91 1.0 0.88 0.71 0.45 0.72 0.4 0.63 0.46 0.34 0.18 0.73 0.56 0.73 0.58 0.58
0.41 0.47 0.57 0.79 0.74 0.7 0.81 0.86 0.84 0.76 0.8 0.91 0.53 0.44 0.4 1.0 0.42 0.57 0.39 0.36 0.07 0.65 0.68 0.73 0.47 0.45
0.61 0.44 0.51 0.63 0.72 0.86 0.84 0.89 1.0 0.85 0.92 0.93 0.79 0.89 0.46 0.64 0.4 0.51 0.43 0.35 0.19 0.51 0.76 0.6 0.59 0.57
0.36 0.4 0.44 0.48 0.5 0.41 0.53 0.66 0.54 0.91 1.0 0.8 0.54 0.54 0.58 0.28 0.17 0.64 0.25 0.45 0.0 0.09 0.03 0.18 0.62 0.38
0.33 0.35 0.36 0.42 0.47 0.28 0.42 0.54 0.36 0.77 0.8 0.64 0.39 0.7 0.63 0.34 0.27 1.0 0.34 0.6 0.0 0.11 0.03 0.14 0.81 0.44
1.0 0.59 0.17 0.63 0.31 0.22 0.29 0.4 0.19 0.19 0.5 0.17 0.45 0.46 0.29 0.46 0.25 0.17 0.17 0.32 0.09 0.03 0.25 0.31 0.55 0.26
0.65 0.38 0.56 0.49 0.6 0.45 0.53 0.51 0.57 0.69 0.76 1.0 0.78 0.65 0.4 0.73 0.35 0.51 0.6 0.46 0.19 0.13 0.31 0.38 0.66 0.57
0.4 0.33 0.39 0.41 0.53 0.63 0.79 0.77 0.79 1.0 0.9 0.85 0.6 0.72 0.27 0.36 0.54 0.54 0.53 0.69 0.27 0.2 0.54 0.58 0.55 0.74
0.93 0.42 0.42 0.51 0.39 0.26 0.38 0.41 0.5 0.63 0.59 0.69 1.0 0.5 0.42 0.51 0.39 0.55 0.61 0.45 0.06 0.16 0.55 0.51 0.67 0.32
0.55 0.5 0.65 0.62 0.66 0.69 0.85 0.85 0.86 0.83 0.77 0.68 0.72 0.76 0.77 1.0 0.56 0.42 0.47 0.68 0.08 0.57 0.24 0.23 0.39 0.38
0.44 0.39 0.4 0.47 0.57 0.66 0.71 0.69 0.9 1.0 0.85 0.91 0.63 0.71 0.54 0.64 0.47 0.46 0.39 0.57 0.16 0.31 0.44 0.5 0.56 0.58

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)