1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_22 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.03 0.01 0.04 0.11 0.18 0.38 0.49 0.31 0.9 0.33 0.24 0.17 0.04 0.76 1.0 0.98 0.42 0.34 0.36 0.28 0.01 0.37 0.31 0.14 0.33 0.26
0.03 0.03 0.04 0.05 0.07 0.21 0.29 0.17 0.66 0.34 0.26 0.18 0.02 1.0 0.78 0.63 0.28 0.23 0.21 0.25 0.03 0.08 0.65 0.31 0.29 0.37
0.01 0.01 0.04 0.13 0.25 0.41 0.6 0.48 0.86 0.57 0.5 0.32 0.02 0.66 1.0 0.48 0.34 0.37 0.32 0.19 0.03 0.25 0.5 0.3 0.37 0.22
0.07 0.14 0.18 0.31 0.4 0.48 0.63 0.4 0.9 0.34 0.25 0.21 0.08 0.83 1.0 0.73 0.53 0.5 0.43 0.26 0.07 0.65 0.78 0.34 0.49 0.43
0.14 0.3 0.32 0.36 0.47 0.58 0.57 0.4 0.45 0.26 0.19 0.15 0.13 0.83 1.0 0.69 0.48 0.54 0.44 0.3 0.12 0.42 0.25 0.15 0.28 0.22
0.0 0.0 0.01 0.02 0.05 0.23 0.35 0.19 0.41 0.24 0.15 0.07 0.0 1.0 0.87 0.75 0.42 0.26 0.21 0.13 0.01 0.18 0.07 0.07 0.2 0.15
0.01 0.01 0.02 0.03 0.08 0.17 0.26 0.16 0.41 0.18 0.13 0.08 0.01 0.87 1.0 0.49 0.35 0.32 0.27 0.15 0.16 0.2 0.27 0.19 0.25 0.17
0.2 0.21 0.22 0.28 0.35 0.41 0.46 0.32 0.5 0.31 0.32 0.31 0.18 1.0 0.95 0.58 0.44 0.42 0.31 0.28 0.15 0.17 0.46 0.33 0.48 0.41
0.01 0.03 0.04 0.07 0.09 0.16 0.25 0.21 0.25 0.25 0.23 0.15 0.03 0.79 1.0 0.45 0.16 0.13 0.12 0.08 0.03 0.33 0.36 0.18 0.25 0.15
0.27 0.22 0.22 0.17 0.16 0.23 0.33 0.31 0.34 0.38 0.3 0.33 0.26 1.0 0.79 0.71 0.41 0.36 0.44 0.4 0.14 0.08 0.25 0.2 0.35 0.52
0.05 0.1 0.12 0.12 0.13 0.14 0.21 0.2 0.41 0.26 0.26 0.2 0.05 0.62 1.0 0.62 0.54 0.51 0.34 0.29 0.05 0.03 0.53 0.4 0.24 0.29
0.03 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.12 0.11 0.11 0.09 0.1 0.06 0.06 0.91 1.0 0.41 0.31 0.21 0.13 0.06 0.01 0.08 0.26 0.05 0.14 0.08
0.04 0.0 0.01 0.07 0.15 0.23 0.38 0.35 0.51 0.5 0.37 0.25 0.06 0.7 1.0 0.31 0.37 0.26 0.21 0.3 0.02 0.18 0.38 0.36 0.46 0.46
0.04 0.04 0.04 0.05 0.07 0.12 0.19 0.11 0.28 0.07 0.05 0.04 0.04 0.64 1.0 0.55 0.24 0.15 0.15 0.09 0.07 0.12 0.07 0.07 0.15 0.09
0.35 0.43 0.33 0.24 0.12 0.12 0.29 0.34 1.0 0.64 0.54 0.45 0.34 0.49 0.89 0.87 0.67 0.98 0.94 0.55 0.09 0.23 0.64 0.57 0.69 0.43
0.08 0.04 0.04 0.06 0.06 0.14 0.25 0.25 0.28 0.35 0.25 0.14 0.09 0.83 0.92 0.37 0.52 0.35 0.24 0.21 0.04 0.24 1.0 0.3 0.46 0.41
0.02 0.07 0.08 0.13 0.25 0.38 0.3 0.14 0.21 0.05 0.03 0.02 0.02 0.56 1.0 0.87 0.73 0.52 0.42 0.26 0.0 0.36 0.05 0.05 0.17 0.13
0.04 0.03 0.01 0.01 0.03 0.03 0.03 0.03 0.02 0.02 0.01 0.01 0.03 0.43 1.0 0.57 0.05 0.13 0.11 0.04 0.02 0.15 0.02 0.01 0.05 0.03
0.04 0.04 0.03 0.08 0.16 0.32 0.4 0.21 0.92 0.55 0.37 0.23 0.02 1.0 0.93 0.98 0.8 0.78 0.84 0.49 0.06 0.09 0.74 0.28 0.27 0.3
0.32 0.18 0.07 0.08 0.06 0.11 0.3 0.34 0.37 0.33 0.32 0.19 0.32 0.75 1.0 0.47 0.21 0.22 0.24 0.12 0.04 0.13 0.13 0.07 0.37 0.21
0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.11 0.18 0.08 0.33 0.07 0.04 0.01 0.0 0.59 1.0 0.32 0.2 0.11 0.1 0.05 0.01 0.02 0.06 0.06 0.06 0.04
0.31 0.48 0.46 0.5 0.5 0.38 0.61 0.5 0.94 0.55 0.53 0.44 0.3 0.74 0.74 0.61 0.73 0.62 0.66 0.44 0.16 1.0 0.58 0.58 0.42 0.36
0.01 0.03 0.08 0.11 0.24 0.38 0.37 0.16 0.2 0.26 0.12 0.1 0.01 0.89 1.0 0.74 0.53 0.33 0.31 0.32 0.05 0.01 0.28 0.17 0.16 0.31
0.01 0.0 0.12 0.18 0.17 0.24 0.49 0.44 0.47 0.28 0.27 0.17 0.0 0.59 1.0 0.71 0.52 0.41 0.43 0.35 0.0 0.21 0.27 0.03 0.29 0.38
0.04 0.06 0.06 0.08 0.17 0.29 0.31 0.2 0.52 0.29 0.22 0.16 0.05 1.0 0.73 0.7 0.44 0.44 0.28 0.23 0.09 0.44 0.29 0.23 0.35 0.32
0.03 0.04 0.04 0.04 0.02 0.06 0.15 0.08 0.29 0.08 0.07 0.05 0.08 0.47 1.0 0.21 0.25 0.07 0.07 0.05 0.04 0.07 0.17 0.07 0.08 0.07
0.03 0.05 0.11 0.13 0.35 0.76 0.54 0.26 0.53 0.25 0.18 0.16 0.03 0.67 1.0 0.83 0.42 0.47 0.47 0.23 0.13 0.33 0.46 0.48 0.24 0.29
0.05 0.23 0.5 0.55 0.56 0.59 0.72 0.64 0.8 0.68 0.6 0.44 0.04 0.88 1.0 0.84 0.63 0.87 0.69 0.56 0.12 0.62 0.57 0.48 0.44 0.59
0.27 0.17 0.19 0.21 0.25 0.29 0.47 0.45 0.52 0.45 0.38 0.36 0.31 0.96 1.0 0.92 0.44 0.47 0.35 0.33 0.23 0.76 0.53 0.34 0.38 0.33
0.22 0.18 0.22 0.26 0.32 0.33 0.57 0.4 0.79 0.52 0.4 0.29 0.17 1.0 0.94 0.9 0.57 0.71 0.58 0.42 0.4 0.3 0.59 0.46 0.33 0.52
0.28 0.2 0.23 0.31 0.42 0.55 0.66 0.47 0.93 0.53 0.44 0.37 0.19 0.99 1.0 0.92 0.5 0.67 0.64 0.43 0.41 0.18 0.54 0.54 0.32 0.47
0.21 0.2 0.29 0.28 0.25 0.27 0.31 0.32 0.55 0.53 0.46 0.41 0.28 0.65 1.0 0.86 0.51 0.67 0.6 0.49 0.17 0.78 0.28 0.24 0.34 0.38
0.41 0.25 0.29 0.32 0.24 0.22 0.47 0.63 0.46 0.51 0.49 0.41 0.4 0.79 1.0 0.4 0.42 0.32 0.2 0.4 0.15 0.1 0.27 0.24 0.55 0.48
0.3 0.2 0.24 0.25 0.19 0.18 0.39 0.5 0.34 0.42 0.36 0.31 0.28 0.81 1.0 0.38 0.43 0.48 0.22 0.43 0.14 0.05 0.23 0.2 0.49 0.55
0.09 0.22 0.29 0.32 0.38 0.45 0.53 0.46 0.64 0.43 0.35 0.28 0.13 0.66 1.0 0.62 0.57 0.68 0.6 0.41 0.17 0.35 0.47 0.33 0.36 0.25
0.08 0.12 0.1 0.09 0.13 0.23 0.36 0.27 0.38 0.2 0.12 0.08 0.06 0.69 1.0 0.52 0.44 0.65 0.45 0.32 0.01 0.1 0.11 0.09 0.19 0.12
0.03 0.1 0.14 0.15 0.18 0.26 0.38 0.36 0.36 0.23 0.11 0.06 0.03 0.51 1.0 0.38 0.33 0.39 0.34 0.33 0.01 0.08 0.08 0.04 0.12 0.07
0.01 0.03 0.0 0.16 0.36 0.9 0.71 0.11 0.65 0.42 0.25 0.19 0.01 0.73 1.0 0.97 0.59 0.41 0.35 0.19 0.18 0.11 0.59 0.77 0.45 0.16
0.02 0.1 0.18 0.19 0.23 0.32 0.43 0.3 0.36 0.14 0.06 0.03 0.02 0.57 1.0 0.45 0.4 0.44 0.39 0.37 0.06 0.14 0.07 0.03 0.12 0.09
0.44 0.36 0.45 0.53 0.45 0.37 0.57 0.73 0.47 0.54 0.54 0.49 0.47 1.0 0.98 0.71 0.48 0.55 0.41 0.49 0.31 0.32 0.24 0.3 0.72 0.65
0.15 0.13 0.11 0.11 0.14 0.15 0.22 0.2 0.23 0.22 0.2 0.18 0.19 0.63 1.0 0.34 0.22 0.2 0.15 0.13 0.02 0.12 0.19 0.14 0.32 0.15
0.08 0.19 0.23 0.42 0.58 0.73 0.82 0.55 0.66 0.37 0.27 0.18 0.04 1.0 0.81 0.9 0.53 0.57 0.62 0.44 0.03 0.26 0.44 0.32 0.34 0.42
0.01 0.03 0.07 0.1 0.13 0.27 0.37 0.2 0.4 0.12 0.09 0.06 0.01 1.0 0.8 0.72 0.35 0.17 0.17 0.14 0.01 0.04 0.09 0.05 0.19 0.18
0.04 0.17 0.15 0.19 0.32 0.41 0.36 0.16 0.2 0.08 0.06 0.04 0.03 0.81 1.0 0.68 0.63 0.68 0.6 0.36 0.0 0.19 0.09 0.06 0.19 0.16
0.05 0.18 0.18 0.24 0.33 0.38 0.45 0.17 0.22 0.1 0.06 0.04 0.03 1.0 0.98 0.79 0.76 1.0 0.58 0.37 0.0 0.25 0.16 0.09 0.29 0.13
0.35 0.36 0.31 0.36 0.43 0.53 0.67 0.53 0.63 0.42 0.35 0.29 0.3 1.0 0.96 0.8 0.85 0.78 0.66 0.57 0.08 0.77 0.43 0.44 0.53 0.35
0.2 0.17 0.17 0.18 0.19 0.23 0.27 0.27 0.35 0.36 0.33 0.29 0.18 1.0 0.72 0.79 0.48 0.38 0.43 0.36 0.23 0.26 0.59 0.33 0.23 0.33
0.12 0.2 0.33 0.45 0.53 0.49 0.57 0.46 0.47 0.46 0.32 0.24 0.14 0.6 1.0 0.74 0.5 0.68 0.54 0.52 0.05 0.44 0.23 0.21 0.38 0.27
0.1 0.08 0.07 0.06 0.07 0.1 0.15 0.13 0.17 0.15 0.13 0.12 0.13 0.77 1.0 0.96 0.27 0.59 0.31 0.16 0.03 0.51 0.21 0.16 0.23 0.18
0.02 0.08 0.14 0.14 0.25 0.31 0.38 0.29 0.41 0.31 0.24 0.22 0.02 1.0 0.82 0.77 0.5 0.55 0.38 0.29 0.06 0.09 0.4 0.25 0.39 0.36
0.02 0.04 0.06 0.13 0.26 0.42 0.51 0.39 0.68 0.41 0.33 0.27 0.02 0.56 1.0 0.61 0.4 0.42 0.29 0.26 0.08 0.26 0.39 0.33 0.25 0.23
0.03 0.02 0.05 0.09 0.18 0.36 0.6 0.46 0.75 0.53 0.4 0.29 0.06 0.56 1.0 0.66 0.4 0.35 0.26 0.26 0.06 0.33 0.28 0.29 0.28 0.2
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.03 0.04 0.06 0.06 0.04 0.01 0.42 1.0 0.47 0.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.06 0.03 0.02 0.06 0.01
0.01 0.03 0.07 0.08 0.11 0.14 0.16 0.13 0.37 0.31 0.26 0.19 0.02 0.53 1.0 0.4 0.42 0.24 0.2 0.18 0.08 0.18 0.19 0.16 0.29 0.24
0.03 0.04 0.07 0.08 0.09 0.18 0.26 0.16 0.27 0.07 0.04 0.03 0.02 1.0 0.96 0.43 0.2 0.13 0.16 0.12 0.0 0.08 0.03 0.02 0.08 0.06
0.17 0.2 0.17 0.18 0.15 0.13 0.27 0.22 0.28 0.14 0.11 0.11 0.12 0.94 1.0 0.56 0.29 0.34 0.35 0.16 0.06 0.17 0.52 0.23 0.38 0.4
0.12 0.14 0.14 0.15 0.18 0.32 0.54 0.39 1.0 0.4 0.33 0.27 0.11 0.53 0.92 0.61 0.59 0.69 0.62 0.38 0.05 0.28 0.64 0.37 0.37 0.23
0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.08 0.14 0.07 0.44 0.1 0.07 0.05 0.0 0.64 1.0 0.29 0.31 0.49 0.29 0.06 0.11 0.05 0.63 0.13 0.04 0.02
0.02 0.08 0.12 0.12 0.06 0.13 0.25 0.15 0.87 0.36 0.23 0.25 0.01 0.72 1.0 0.54 0.52 0.43 0.33 0.16 0.04 0.27 0.22 0.15 0.39 0.44
0.01 0.01 0.01 0.03 0.07 0.17 0.36 0.17 0.41 0.1 0.05 0.03 0.01 1.0 0.94 0.48 0.26 0.14 0.18 0.09 0.0 0.07 0.03 0.02 0.06 0.02
0.01 0.01 0.01 0.03 0.06 0.13 0.32 0.16 0.35 0.1 0.05 0.02 0.01 1.0 0.84 0.51 0.27 0.13 0.15 0.09 0.0 0.05 0.03 0.02 0.04 0.02
0.09 0.11 0.11 0.13 0.16 0.19 0.15 0.1 0.12 0.14 0.17 0.17 0.13 0.55 1.0 0.86 0.68 0.24 0.27 0.29 0.05 0.1 0.09 0.28 0.21 0.23
0.03 0.01 0.02 0.04 0.04 0.11 0.31 0.18 0.97 0.51 0.44 0.32 0.04 1.0 1.0 0.55 0.45 0.44 0.38 0.31 0.06 0.2 0.79 0.38 0.39 0.34

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)