Heatmap: Cluster_81 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - 2.24 - - - - 3.71 - - 2.25 - - - - - - - - - 1.79 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.26 - - - - 3.15 - - - - - - - - - - 2.91 - - - - - - -
- - - - - 3.87 - 3.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.77 -0.08 - 1.29 - - - - - - - 1.43 0.73 - - - - 0.59 - - 2.16 - 1.96 - 0.66 -
- - 2.66 - - 2.91 - - - - - - - 3.01 - - - - - - - - - - 2.05 -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.7 -0.71 -0.29 - - -0.38 -0.28 -0.4 -0.3 -0.4 0.68 -0.18 -0.39 - 1.55 - 1.92 1.46 -0.64 -0.37 -0.27 - - -0.39 1.07 0.29
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.09 0.42 - - 0.29 - - - - 1.16 - 2.22 2.02 - 0.32 1.43 - - - 2.1 -
- - - - - - - 3.98 - - - - - - - - - 3.35 - - - - - - - -
-2.37 -0.46 -0.7 -1.34 -2.46 -0.03 - -0.44 -1.3 - -0.07 1.2 -1.93 - -1.53 - -2.13 1.49 0.59 -0.52 1.99 1.44 -0.2 -0.88 1.95 -0.51
- - - - - - - 3.3 - - - 3.51 - 2.25 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 1.49 1.46 - - - - - 1.38 - 1.7 1.8 - - - 3.22 - - 0.86 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 2.75 - - 3.06 - - - 3.45 -
- - - - - - - 4.16 - - - - - - - 3.03 - - - - - - - - - -
-0.3 -0.41 - 2.65 - - - - - - -0.03 - 1.42 - 1.34 - - 1.85 - - 2.25 - 1.22 - 0.36 -
- - - 2.73 - - - - 2.63 - - - - - - - - - 2.29 - - - - - 2.03 2.07
- - - - - - - 3.0 - - - - - - - - - 2.36 - - - 2.86 - - 2.49 -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.6 - - - - - - 3.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.71 - - - 2.62 - - - - - - 2.75 -
-2.14 -0.29 -2.07 0.8 -0.09 -0.83 1.3 -0.91 -2.06 -3.16 0.04 -2.98 -0.76 - -2.24 -2.93 -0.3 1.81 0.61 -1.45 1.79 -0.4 -0.7 -0.89 1.39 0.86
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 3.64 - - 3.76 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.09 - 1.59 3.01 1.38 - - - - - 1.14 - - - 2.03 - - - - - - 1.97
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -1.16 -1.4 1.83 -1.22 - 0.19 0.52 0.96 -1.49 -0.44 - - - - - - 1.76 1.05 -0.2 -0.26 -1.66 0.15 -0.51 1.68 1.62
- - - - - 1.7 2.0 4.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.22
- - - - 0.94 - - 4.26 - - 0.76 - - - - - - - 1.68 - - - - - - -
- - - - - - - 4.08 - - - - - - - - - - 3.18 - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.72 -0.15 0.94 1.29 1.21 - - -0.84 - 0.23 - - 1.81 - - - - -0.47 - -0.05 1.92 0.51 0.76 -0.83 0.61 -0.23
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.09 - - - 3.16 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.