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Heatmap: Cluster_181 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.4 -0.7 -0.68 -0.38 -0.47 -1.22 -0.3 -0.35 -0.15 0.31 0.1 0.17 -0.44 0.14 -0.14 0.48 0.15 -0.11 -0.42 -0.24 -0.31 0.41 0.74 0.8 0.47 0.53
-0.22 -0.79 -0.66 -0.32 -0.51 -0.93 -0.09 -0.15 0.3 0.37 0.5 0.26 -0.45 -0.2 -0.3 0.2 -0.19 -0.32 -0.57 -0.38 -0.18 0.61 0.53 0.39 0.68 0.56
-0.08 -0.22 -0.4 -0.06 -0.21 -0.4 -0.16 0.04 0.05 0.22 0.4 0.28 0.13 0.15 -0.08 -0.05 -0.46 -0.17 -0.58 -0.26 -0.46 0.83 0.21 0.05 0.15 0.21
0.52 0.31 -0.4 -0.11 -0.66 -0.91 -0.34 -0.32 -0.32 -0.1 0.06 0.14 0.62 -0.5 -1.06 1.17 -0.75 0.06 -0.74 -1.14 -2.94 0.25 0.49 -0.47 1.29 0.53
0.08 -0.77 -0.59 -0.2 -0.24 -0.67 -0.19 -0.06 -0.42 -0.26 -0.02 -0.01 0.19 0.38 -0.53 1.21 -0.37 -0.01 -0.58 -0.86 -0.8 1.22 -0.06 0.06 0.58 0.15
-2.32 -1.87 -1.35 -0.62 -0.39 -0.44 0.05 0.13 0.26 0.4 0.48 0.25 -1.79 0.17 -0.82 -0.14 -0.55 -0.45 -0.66 -0.91 0.23 1.12 1.5 0.56 0.52 0.27
0.2 -0.57 -0.89 -0.8 -0.65 -0.72 -0.02 0.1 0.18 0.25 0.49 0.12 0.19 0.19 -0.73 -0.05 -0.73 0.14 -0.4 -0.78 -0.92 0.68 1.06 0.28 0.51 0.28
0.09 -0.48 -0.39 0.24 0.23 -0.21 0.2 0.01 -0.49 -0.65 -0.63 -0.6 0.04 -0.22 -0.54 1.43 -0.01 0.1 -0.37 -0.33 -1.62 0.74 0.14 -0.42 0.66 0.12
-0.21 -0.38 -0.65 -0.17 -0.19 -0.55 -0.14 -0.07 -0.1 0.19 0.37 0.3 0.01 0.29 -0.22 0.18 -0.42 -0.21 -0.3 -0.96 -0.51 0.55 0.69 0.3 0.59 0.18
-0.65 -0.51 -0.43 -0.05 0.02 -0.28 0.12 0.23 0.07 0.08 0.23 0.15 -0.36 0.24 -0.22 0.12 -0.19 -0.07 -0.41 -0.7 -0.59 0.67 0.44 0.02 0.59 0.31
-0.97 -1.04 -0.86 -0.2 -0.16 -0.25 0.02 -0.12 0.29 0.13 0.1 0.07 -1.11 0.1 -0.44 0.11 -0.18 0.12 -0.34 -0.59 -0.08 0.95 0.91 0.34 0.56 0.26
-0.02 -0.51 -0.43 -0.18 -0.12 -0.4 -0.01 0.1 -0.08 -0.08 0.12 0.06 0.11 0.01 0.03 0.48 -0.53 0.27 -0.3 -0.72 -0.42 0.49 0.7 0.23 0.12 0.1
-0.26 -0.87 -0.37 -0.28 -0.25 -0.45 0.09 0.07 0.17 0.23 0.56 0.73 0.12 0.08 -0.89 0.2 -0.54 -0.2 -0.58 -0.11 -1.45 0.44 0.6 0.2 0.37 0.32
-0.2 -0.84 -0.79 -0.36 -1.37 -1.14 -0.22 -1.07 -0.39 -0.91 -0.76 -0.91 -1.48 0.77 -0.49 -0.07 -0.28 -0.22 -0.25 -1.23 0.02 -0.7 2.3 0.2 0.78 1.32
-0.1 -0.4 -0.21 0.02 -0.02 -0.13 -0.1 -0.03 0.07 0.18 0.33 0.41 -0.17 -0.74 -0.88 0.93 -0.63 -0.32 -0.9 -0.79 -1.57 1.23 0.1 0.18 0.37 0.21
-0.53 -0.78 -0.6 -0.18 -0.01 -0.25 0.41 0.55 0.14 0.31 0.32 0.2 0.04 -0.1 -0.38 0.25 -0.44 -0.36 -0.42 -0.71 -1.92 1.08 0.64 -0.47 0.46 -0.0
-0.63 -0.92 -1.21 -0.21 -0.15 -0.41 -0.52 -0.18 -0.49 -0.31 -0.43 -0.6 -1.79 -0.01 -0.29 0.61 0.41 0.68 0.57 -0.07 -1.58 -0.92 1.46 0.57 0.74 0.67
1.03 0.53 0.2 0.12 -1.25 -1.39 -0.68 -0.33 -1.2 -1.25 -0.55 -0.4 0.33 0.36 -0.73 0.92 -0.87 0.07 -0.38 -1.73 -3.55 -0.64 0.45 -1.11 1.97 0.67
1.0 1.02 0.56 0.66 -1.13 -1.39 -1.72 0.31 -0.89 -0.43 -0.73 0.03 1.18 -0.15 -3.37 0.92 -1.28 -0.73 -1.89 -2.25 -4.76 -0.9 0.39 -1.52 1.81 0.3
0.34 -0.55 -0.51 0.13 -0.54 -1.0 -0.34 -0.89 0.12 -0.86 -0.56 -0.36 0.18 1.18 0.09 0.68 -1.53 -0.54 -0.35 -0.88 -0.83 0.15 1.24 0.05 0.72 0.57
-0.24 -0.47 -0.55 -0.2 -0.2 -0.46 -0.16 -0.16 -0.44 -0.26 -0.14 -0.21 0.04 0.51 0.22 0.54 -0.59 0.08 0.0 -0.92 -0.42 0.02 1.18 0.34 0.57 0.04
-1.24 -1.46 -1.12 -0.52 -0.3 -0.71 -0.33 -0.05 -0.49 -0.08 0.28 0.16 -0.95 0.71 -0.31 0.46 -0.2 -0.31 -0.74 -1.08 -0.39 0.93 0.97 0.4 1.13 0.73
-0.57 -0.98 -1.46 -0.74 -1.75 -2.5 -1.49 -0.93 -0.75 -0.32 0.36 -0.0 -0.44 1.4 -0.35 0.24 -0.6 -0.42 -0.75 -1.21 -0.53 0.94 1.61 0.33 1.49 0.41
-0.09 -0.48 -0.36 -0.15 -0.22 -0.45 0.16 0.24 0.26 0.14 0.28 0.24 -0.18 0.41 -0.32 0.1 -0.5 -0.16 -0.44 -0.62 -0.92 0.75 0.58 0.15 -0.01 0.25
-0.45 -0.77 -0.61 -0.15 -0.14 -0.32 0.06 0.13 0.08 0.24 0.34 0.47 -0.05 0.46 -0.35 0.22 -0.2 0.06 -0.49 -0.55 -0.72 1.08 -0.27 0.17 0.12 0.05
-0.99 -0.93 -0.89 -0.26 -0.12 -0.3 -0.18 -0.14 0.02 0.07 0.1 -0.14 -1.08 0.23 0.07 0.14 -0.45 -0.28 -0.52 -0.76 -1.15 1.16 1.21 0.51 0.7 0.42
0.33 -0.18 -0.61 -0.64 -0.79 -0.66 -0.28 0.07 0.0 0.11 -0.27 -0.23 -0.21 0.36 -0.68 0.02 0.14 0.3 0.14 -0.09 -0.97 -0.62 1.27 -0.19 0.83 0.42
-0.72 -0.43 -0.39 -0.66 -0.74 -1.42 -0.49 -0.77 -0.99 -0.03 -0.08 -0.14 -0.43 0.74 0.02 0.07 -0.23 -0.26 -0.2 -0.29 -0.13 0.27 1.69 -0.17 0.71 0.96
-0.79 -0.73 -1.1 -0.32 -0.35 -0.79 -0.17 -0.05 -0.08 0.25 0.32 0.5 -0.72 0.15 -0.52 0.04 -0.48 -0.07 -0.48 -0.71 -0.07 0.58 1.02 0.58 0.68 0.6
0.22 -0.18 -0.11 0.16 -0.12 -0.5 0.01 0.25 -0.09 -0.11 -0.07 -0.15 0.35 -0.01 -0.5 1.24 -0.74 -0.4 -0.71 -0.97 -1.99 0.78 -0.28 -0.59 0.87 0.35
-0.36 -0.23 -0.19 -0.28 -0.58 -1.05 -0.42 -0.5 -0.91 -0.35 -1.13 -0.8 -0.23 0.22 -0.33 1.57 -0.46 0.75 -0.9 -1.14 -1.02 1.19 -0.16 -0.41 1.31 0.73
-1.02 -1.19 -1.11 -0.56 -0.26 -0.4 -0.13 -0.13 0.23 0.27 0.33 0.24 -0.56 0.06 -0.31 -0.16 -0.43 -0.49 -0.47 -0.69 -0.46 1.09 1.0 0.97 0.53 0.28
-1.34 -1.37 -1.43 -0.67 -0.23 -0.24 0.29 0.11 0.47 0.25 0.37 0.17 -1.2 -0.07 -0.55 0.05 -0.4 0.13 -0.31 -0.39 0.29 1.08 0.84 0.32 0.37 0.05
-0.96 -1.86 -1.05 -0.74 -0.87 -1.43 -0.35 -0.08 -0.04 0.12 0.15 0.23 -1.58 0.18 -0.63 -0.13 -0.19 0.04 -0.23 -0.43 -0.78 1.57 1.18 0.99 0.59 0.36
-1.19 -0.54 -0.5 -0.05 0.0 -0.55 -0.0 -0.03 -0.0 0.15 0.37 0.17 -1.21 -0.06 -0.63 -0.09 -0.49 -0.11 -0.14 -0.29 -1.47 1.15 1.24 0.22 0.46 0.24
-0.72 -1.16 -1.13 -0.48 -0.45 -0.43 -0.23 -0.22 -0.17 -0.13 -0.12 0.34 -0.31 0.81 0.02 0.56 -0.35 0.13 -0.5 -0.51 0.21 0.36 1.28 -0.22 0.42 0.25
-0.57 -1.08 -0.66 -0.47 -0.24 -0.55 0.06 0.0 0.32 0.21 0.16 0.54 -0.33 0.41 -0.55 0.1 -0.69 -0.03 -0.62 -0.96 -0.48 0.68 0.69 0.19 0.71 0.67
-0.4 -0.91 -0.67 -0.21 -0.19 -0.48 -0.19 -0.24 -0.2 0.05 0.12 0.06 -0.32 0.49 -0.23 0.32 -0.15 -0.08 -0.44 -0.36 -0.59 0.9 0.71 0.56 0.44 0.27
0.04 -0.5 -0.4 -0.26 -0.38 -0.9 -0.06 0.24 -0.23 0.08 0.22 0.33 0.28 0.18 -0.23 0.42 -0.23 -0.3 -0.55 -0.26 -0.96 1.02 0.29 0.19 0.36 -0.05
0.13 -0.38 -0.35 -0.15 -0.35 -0.76 -0.21 -0.01 -0.2 -0.04 0.13 0.18 0.26 0.29 -0.23 0.25 -0.32 -0.06 -0.27 -0.5 -0.81 0.75 0.62 0.19 0.31 0.29
-0.35 -0.8 -0.81 -0.34 -0.1 -0.46 -0.13 -0.09 -0.03 0.3 0.48 0.49 -0.06 0.03 -0.3 0.24 0.13 -0.56 -0.93 -0.91 -0.75 1.14 0.49 0.51 0.29 0.15
0.02 -0.76 -0.96 -0.61 -0.41 -1.66 -0.87 -0.42 -0.46 -0.2 -0.25 -0.55 -0.52 1.28 -0.49 0.67 -0.62 0.31 0.23 -0.33 0.28 -0.15 1.42 0.35 0.2 0.31
-1.11 -0.65 -0.35 0.02 -0.11 -0.76 -0.19 -0.03 -0.15 0.09 0.18 0.06 -1.36 0.19 -0.04 0.1 -0.54 -0.07 -0.63 -0.64 -0.32 0.9 0.96 0.51 0.82 0.34
-1.05 -0.47 -0.34 0.06 0.01 -0.3 -0.02 -0.04 0.14 0.18 0.3 0.12 -1.29 0.15 -0.07 -0.04 -0.67 -0.36 -0.75 -0.98 -0.38 0.9 1.07 0.36 0.55 0.26
-0.15 -0.49 -0.24 0.09 -0.11 -0.28 0.3 0.39 0.11 0.28 0.41 0.1 0.02 0.12 -0.32 -0.44 -0.1 -0.47 -0.71 -0.42 -0.9 1.06 0.39 -0.3 0.03 0.08
-1.06 -0.68 -0.77 -0.54 -0.3 -0.2 -0.24 -0.25 0.25 0.25 0.41 0.34 -0.97 -0.03 -0.53 -0.45 -0.71 -0.15 -0.52 -0.93 -0.95 0.96 1.31 0.76 0.76 0.38
-1.12 -1.2 -1.13 -1.02 -1.27 -1.2 -0.55 -0.74 -0.42 0.27 0.3 0.32 -0.92 0.61 0.31 0.54 -0.61 0.0 -0.19 -0.51 -0.82 1.27 0.98 0.81 0.89 0.08
-4.53 -1.49 -0.86 -0.25 0.16 -0.09 -0.29 -0.61 -0.14 0.07 0.07 0.07 -4.16 0.44 -0.15 0.04 -0.03 -0.37 -1.02 -0.59 -0.64 1.5 1.17 0.85 0.26 0.73
0.14 -1.84 -2.23 -1.69 -0.86 -1.17 -0.77 -0.65 -0.45 -0.05 0.31 0.07 0.01 1.04 -0.69 0.16 -0.85 -0.21 -0.55 -1.19 -1.23 1.08 1.39 0.01 1.37 0.82

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.