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Heatmap: Cluster_82 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.58 0.12 0.08 0.66 0.78 -0.25 -0.28 -0.06 -0.92 -0.79 -0.2 -0.1 1.15 -1.04 -1.09 -1.45 -0.28 -0.15 -1.1 -1.88 -2.73 -0.76 0.4 -0.75 1.72 0.65
1.22 0.7 0.25 0.75 0.12 -0.22 0.25 0.42 -0.79 -1.28 -1.61 -2.18 0.7 -0.38 -0.82 0.19 -1.74 -0.61 -0.33 -0.43 -2.6 0.81 -2.21 -2.03 0.8 1.29
1.0 0.83 0.83 0.69 0.04 -0.62 -0.2 0.45 -0.12 -0.53 -0.32 -0.18 0.56 -1.36 -1.18 -1.29 -0.93 -0.29 -0.58 0.14 -3.63 -1.17 -0.54 -0.68 1.03 0.95
0.93 0.26 0.35 1.21 0.28 -0.74 -0.64 0.5 -1.03 -0.89 -0.42 -0.4 0.48 -2.43 -2.39 -2.44 -2.32 -1.5 -1.59 -1.11 -1.9 -0.23 0.19 0.15 1.7 1.56
0.49 0.48 0.37 0.34 0.62 0.12 -0.24 -0.13 -0.43 -0.7 -0.52 -0.42 0.18 0.36 0.12 -0.05 0.09 -0.42 -0.44 -0.32 -5.07 -0.33 -0.4 -0.49 0.92 0.53
1.67 0.31 0.01 -0.04 -0.53 -0.41 0.21 0.94 0.01 0.04 -0.08 -0.09 1.24 -1.1 -1.22 -1.7 -1.12 -0.87 -0.85 -0.31 -6.39 -4.94 -2.94 -1.89 1.14 1.36
1.05 0.35 0.65 0.71 -0.25 -1.07 -0.22 0.24 -0.61 -0.57 -0.11 -0.13 0.97 -0.53 -1.28 -0.11 -1.6 -1.3 -1.48 -1.02 -1.22 0.32 -1.14 -0.4 1.27 1.03
0.77 0.61 1.06 1.08 -0.31 -1.7 -0.85 0.46 -1.16 -0.46 0.07 -0.07 1.18 0.17 -0.42 -1.9 -1.36 -1.75 -1.83 -2.65 -2.48 -2.78 -4.47 -1.88 1.42 1.81
0.27 0.74 0.76 1.06 0.69 0.26 -0.03 0.47 0.39 -0.33 -0.37 -0.12 0.42 -1.91 -1.22 -1.87 -1.3 -0.75 -0.84 -0.27 -1.49 -0.14 -1.06 -0.83 0.81 0.68
-0.17 0.66 1.45 1.09 0.31 -1.72 -1.57 0.09 - 0.24 0.08 0.88 -0.85 -0.97 -2.93 1.15 -2.48 - - -0.42 -2.35 -2.93 -2.19 -0.29 0.37 2.21
0.68 0.65 0.88 1.0 0.35 -0.13 0.03 -0.02 -0.29 -0.05 0.3 0.28 0.4 -0.93 -0.62 -1.74 -0.82 -0.67 -0.67 0.1 -4.88 -0.08 -1.58 -1.24 0.25 0.97
0.83 0.18 -0.01 0.0 -0.25 -0.04 0.17 0.1 -0.0 -0.22 0.3 0.19 0.62 0.07 -0.21 0.7 -0.51 -0.34 -0.39 -0.87 -4.0 -0.22 -0.6 -0.49 0.65 0.16
0.79 -0.03 0.15 0.64 0.39 0.08 0.29 0.29 -0.07 -0.14 -0.14 -0.18 1.05 0.22 -0.85 -0.5 -1.34 -1.07 -1.06 -1.04 -3.41 -0.61 -0.47 -1.19 0.88 1.04
0.85 0.48 0.23 0.43 -0.27 -0.46 0.23 0.37 0.12 -0.13 -0.1 -0.2 0.34 -0.48 -0.78 -0.29 -1.12 -0.37 -0.47 -0.55 -3.6 -0.68 -0.98 0.18 1.3 0.7
-0.95 -1.4 -1.76 -0.35 -0.68 -0.41 -0.95 -1.25 -0.44 0.21 0.31 0.34 -1.9 0.52 -0.26 0.4 -1.29 0.07 0.06 -0.79 -0.19 0.79 -0.12 1.14 0.57 1.65
0.61 0.33 0.66 0.6 -0.05 -0.24 0.14 0.68 -0.27 -0.4 -0.4 -0.34 0.27 -0.62 -0.57 -0.56 -0.46 -0.27 -0.35 0.02 -3.54 -1.18 -1.02 -0.72 1.13 1.06
0.71 0.51 0.87 0.83 0.01 -0.83 -0.55 0.11 -1.21 -1.05 -0.97 -0.79 0.36 -0.31 -0.92 -0.39 -1.43 -0.54 -0.77 -0.04 -0.89 0.29 0.08 -1.06 1.15 1.31
0.79 0.41 0.92 1.01 0.57 -0.09 -0.09 0.42 -0.48 -0.87 -0.18 -0.07 0.43 -1.05 -0.75 -0.8 -0.71 -0.61 -0.98 -0.42 -1.97 -2.9 -0.71 -0.82 0.78 1.29
0.69 -0.42 0.36 0.79 0.02 -0.19 -0.24 0.22 -0.72 -0.84 -0.56 -0.58 0.22 0.39 -0.71 -0.84 -1.25 -1.23 -1.35 -1.08 -2.68 0.46 -0.65 -0.12 1.42 1.63
0.99 0.35 0.27 1.34 0.54 -0.11 0.04 0.39 -0.61 -0.96 -0.78 -1.12 0.51 -2.23 -2.01 -2.59 -3.27 -1.43 -1.94 -1.44 -2.03 0.76 -0.96 -0.11 1.36 1.57
0.69 0.55 0.55 0.4 0.14 0.08 -0.08 -0.01 -0.51 -0.57 -0.58 -0.48 0.35 0.04 -0.5 0.41 -0.28 -0.09 -0.47 -0.09 -2.16 0.02 -0.95 -0.67 0.67 0.63
0.85 0.08 0.25 1.06 0.35 -0.49 -0.06 0.51 -0.54 -0.73 -0.33 -0.41 0.58 -0.41 -0.81 -0.56 -0.68 -0.9 -0.86 -0.81 -3.47 0.74 -1.53 -0.39 0.94 1.06
1.28 -0.04 -0.09 -0.17 -0.76 -0.89 -0.24 0.51 -0.2 -0.51 -0.16 -0.04 0.99 -0.26 -0.8 -0.74 -1.22 -0.8 -1.26 -1.11 -3.17 -0.97 -0.02 -0.57 1.5 1.55
0.04 -0.65 -0.07 0.79 -0.38 -1.56 -1.05 0.2 -0.97 -1.39 -0.97 -1.53 -0.32 -0.06 0.52 0.89 -0.77 -0.12 -0.04 -0.85 -0.98 0.42 -1.18 -0.51 1.37 1.81
1.0 0.45 0.67 1.1 0.61 -0.09 0.02 0.68 -0.88 -0.83 -0.59 -0.64 1.03 -1.3 -1.81 -1.63 -1.74 -1.54 -1.81 -0.99 -2.87 0.44 -1.49 -0.76 1.38 0.9
0.32 0.55 0.67 1.29 0.66 0.04 0.42 0.76 0.12 -0.09 -0.07 -0.42 0.08 -1.77 -2.25 -1.53 -1.3 -0.81 -1.11 -0.36 -2.7 -0.71 -0.73 -0.19 0.34 1.18
0.71 0.27 0.36 0.65 -0.05 -1.57 -0.84 0.29 -0.58 -0.47 -0.05 -0.23 -0.11 -0.8 -1.13 -1.71 -0.71 -0.58 -0.82 -0.66 -8.22 1.22 -2.14 -1.07 1.85 1.39
0.82 0.66 0.79 0.9 0.22 -0.74 -0.25 0.44 -0.21 -0.07 0.18 0.3 0.74 -1.04 -1.23 -1.75 -1.17 -0.86 -0.82 -0.49 -6.57 0.17 -2.7 -1.59 0.93 1.16
0.16 0.82 0.82 0.7 -0.11 -0.47 0.01 0.28 -0.93 -0.59 -0.42 -0.12 0.49 -1.53 -1.05 -1.4 -1.01 0.0 -0.14 -0.13 -3.63 -1.08 -0.88 0.06 1.37 1.24
0.74 0.77 1.02 0.84 0.13 -0.59 -0.33 0.26 -0.21 -0.35 -0.35 -0.17 0.51 -1.21 -1.02 -1.38 -0.94 -0.1 -0.35 -0.1 -3.75 -0.44 -0.65 -0.44 0.77 0.95
1.1 0.15 0.39 1.62 0.9 -0.78 -0.79 -0.01 -3.84 -2.72 -0.66 -0.83 0.88 -1.77 -2.63 -1.87 -2.73 -2.03 -2.51 -2.18 -2.36 -0.86 -1.13 -2.2 2.4 1.51
0.91 0.22 -0.02 0.42 -0.5 -1.3 -0.04 0.51 -1.16 -0.85 -0.12 0.21 1.3 -1.31 -1.53 -1.37 -1.44 -0.72 -1.26 -0.97 0.0 0.27 -0.43 -0.57 1.58 0.95
0.08 0.17 0.5 0.94 0.64 0.36 -0.16 0.24 -1.08 -1.26 -1.03 -1.06 0.47 -0.26 -1.13 -0.28 -1.56 -1.1 -1.39 -0.93 0.6 -0.69 -0.62 -0.41 1.21 1.39
0.53 -0.1 0.27 0.4 0.09 -0.09 0.07 0.21 -0.1 -0.1 0.04 0.16 0.76 -0.19 -0.56 -0.26 -0.52 -0.47 -0.89 -0.44 -1.57 0.46 -0.5 -0.35 0.47 0.6
1.07 0.63 0.68 0.78 0.17 -0.41 0.15 0.5 -0.8 -0.95 -0.8 -0.77 0.92 -0.67 -0.41 -1.03 -0.47 0.11 -0.44 -0.08 -3.61 -0.34 -2.16 -1.21 0.76 0.94
0.33 -0.18 -0.24 0.35 -0.07 -1.61 -1.07 -0.24 -1.96 -1.11 -0.77 -0.5 0.15 -0.92 -1.49 -2.08 -1.3 0.49 -0.23 0.77 - 0.3 -1.55 -1.31 1.78 2.35
-0.46 -1.28 -0.43 0.34 0.02 0.15 -0.17 0.13 -0.11 0.27 0.2 0.07 -0.68 -0.88 -1.77 0.21 -3.21 -1.4 -1.41 -0.12 -3.69 -0.92 -1.2 -2.87 1.89 2.36
0.46 -0.41 0.39 0.2 -0.83 -1.64 -0.52 0.39 -1.56 -0.86 -1.3 -1.4 0.26 -0.12 -1.14 -1.21 -0.39 -0.77 -0.7 -0.86 -2.44 -0.47 -0.62 -0.59 2.54 1.73
0.02 -0.06 0.05 0.38 0.31 -0.43 -0.17 -0.23 -0.21 -0.08 0.13 0.2 -0.34 0.45 -0.1 0.14 -0.36 -0.57 -0.31 -0.67 -2.52 -0.39 0.24 0.38 1.17 0.2
-1.07 -0.74 0.46 0.96 0.67 0.16 0.08 0.59 -0.08 -0.23 -0.32 -0.32 -1.02 -1.06 -1.53 -1.32 -1.24 -0.61 -1.18 -0.26 0.31 0.66 -1.26 -0.45 1.02 1.52
0.11 0.3 0.46 0.81 0.17 -0.12 -0.29 0.23 -0.02 0.09 0.09 0.33 -0.34 -0.29 -0.28 0.75 -0.89 -0.07 -0.67 -0.56 -4.51 -1.02 0.15 -1.17 0.78 0.52
0.95 0.44 0.8 1.14 0.38 0.07 0.4 0.8 -0.61 -0.71 -0.58 -0.38 0.52 -1.17 -1.22 -1.32 -1.55 -0.79 -1.02 -0.74 -3.66 -0.07 -1.23 -1.43 0.98 1.1
-2.42 -1.03 0.88 0.75 0.06 -0.37 -1.39 -0.08 -2.45 -5.34 -6.12 -6.85 -3.88 -6.98 -4.71 -5.25 -1.07 -7.01 -6.69 -0.81 -1.68 -0.95 -3.13 -0.94 2.67 3.23
-1.22 -0.36 0.38 0.5 0.2 -0.37 -0.53 -0.02 -2.72 -2.3 -2.55 -2.77 -1.69 -0.34 -0.52 0.19 -0.03 -0.23 -0.15 0.9 0.37 -0.33 0.1 0.55 1.34 1.64
0.15 0.93 1.25 1.16 0.45 -0.06 -0.29 -0.01 -0.74 -1.02 -0.79 -1.02 -0.22 -0.37 -1.77 -0.05 -2.69 -0.31 -1.16 -0.4 -3.43 -0.1 -1.9 -0.88 1.23 1.49
1.28 0.67 0.53 0.78 0.06 -1.19 -0.57 0.41 -0.93 -0.35 -0.04 0.38 1.41 -1.91 -0.83 -2.24 -1.62 -1.47 -1.76 -0.8 -2.14 0.74 -1.89 -0.48 0.79 0.91
1.13 0.87 0.67 0.86 0.0 -1.04 -0.52 0.44 -0.07 -0.51 -0.09 -0.1 0.75 -1.46 -1.95 -0.75 -1.61 -0.65 -0.86 -0.38 -3.34 -0.06 -0.49 -0.93 1.03 0.98
0.65 0.85 1.07 1.22 0.68 0.03 0.25 0.49 -1.48 -1.27 -1.34 -1.36 0.82 -1.76 -1.37 -1.76 -1.28 -0.52 -0.79 -0.16 -2.94 0.7 -2.26 -1.51 0.9 0.93
0.77 0.19 0.2 0.31 -0.07 -0.06 0.06 0.22 -0.33 -0.05 -0.1 -0.0 0.58 -0.82 -1.05 -0.95 -0.9 -0.15 -0.25 -0.63 -2.66 0.12 -0.7 0.06 1.34 0.64
-1.1 -0.58 0.17 0.27 -0.56 -1.37 -1.35 -0.91 -0.91 -0.05 0.15 -0.17 -0.89 0.3 0.0 -0.11 -2.18 -0.32 -0.83 -0.03 -1.33 0.68 -0.39 0.43 1.09 2.18
0.86 0.87 1.3 1.12 0.3 -0.68 -0.65 0.38 -0.23 -1.29 -1.11 -1.07 0.79 -1.23 -0.43 -1.19 -1.11 -0.31 -0.43 0.24 -2.76 -0.53 -2.4 -1.43 0.86 1.0
0.33 0.87 0.93 0.91 0.05 -0.71 0.05 0.4 -1.18 -0.72 -0.46 -0.06 0.91 -0.86 -0.95 -0.92 -1.1 -0.13 -0.61 0.01 -1.08 -0.57 -1.78 -0.77 0.67 1.18
0.06 -0.16 0.17 -0.0 0.01 -0.04 -0.02 0.03 -0.41 -0.1 -0.17 0.15 0.15 -0.35 -0.05 -0.24 -0.38 0.32 0.31 -0.06 -0.53 -0.14 -0.15 -0.12 0.39 0.69
0.72 0.69 0.81 1.0 0.52 0.05 -0.3 0.35 -0.27 -0.51 -0.19 -0.03 0.49 -1.54 -1.07 -1.12 -1.11 -0.76 -1.0 -0.3 -0.58 -0.46 -0.78 -0.27 0.64 0.69
1.2 0.58 0.9 1.1 0.37 -0.15 -0.35 0.58 -0.43 -0.83 -0.4 -0.24 0.99 -1.64 -1.05 -1.36 -1.5 -1.08 -1.32 -0.84 -1.86 -0.7 -0.27 -0.8 0.85 0.81
0.85 0.43 0.43 0.66 0.25 -0.42 0.05 0.5 0.2 -0.23 0.01 -0.05 0.52 -1.06 -1.24 -0.76 -0.89 -0.36 -0.65 -0.25 -1.16 -0.21 -0.65 -0.01 0.53 0.55
1.49 0.37 -0.13 0.9 -0.7 -3.0 -1.19 0.54 -1.45 -0.48 -0.08 -0.09 1.28 -1.53 -1.77 -1.59 -2.6 -0.74 -1.53 -2.04 -0.52 0.13 -0.87 -0.22 1.42 1.54
0.89 0.71 0.96 1.09 -0.23 -0.86 -1.05 -0.43 -1.44 -1.37 -1.36 -0.88 0.5 -1.52 0.49 -1.17 -1.74 -0.43 -2.15 -1.13 -1.71 -0.87 -0.36 -0.74 1.84 1.56
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0.55 0.36 0.08 0.7 0.18 -0.13 0.08 0.28 0.01 -0.27 -0.13 -0.64 -0.21 -0.53 -0.77 -0.61 -0.67 0.02 -0.35 -0.49 -0.8 0.16 -1.15 -0.41 1.36 0.54
1.18 0.78 0.88 1.23 0.24 -1.02 -0.95 0.15 -1.77 -1.36 -0.6 -0.12 0.99 -1.48 -2.06 -1.97 -1.71 -1.22 -1.48 -0.58 -2.27 -0.8 -0.81 -0.36 1.33 1.59
1.12 0.84 0.22 0.62 -0.08 -0.63 -0.03 0.61 -0.25 -0.56 -0.23 -0.41 0.63 -1.45 -1.21 -1.62 -0.78 -0.01 -0.63 -0.4 -4.38 -0.05 -0.5 -0.68 1.28 0.75
0.23 0.38 0.92 1.3 0.92 0.37 0.17 0.37 -0.41 -1.38 -1.43 -1.0 0.19 -1.59 -1.33 -1.45 -0.59 -0.87 -1.19 -0.28 -1.83 0.68 -1.05 -1.45 1.38 0.61
0.8 -0.25 -0.81 0.66 -0.31 -1.33 -0.23 0.53 -0.48 -0.53 -0.09 -0.45 0.26 -0.8 1.28 -0.34 -2.52 -0.61 -3.07 -1.84 -3.06 -0.23 -1.55 -1.2 1.89 1.6
0.53 0.1 0.27 0.76 0.1 -0.56 -0.08 0.32 -0.86 -0.97 -0.55 -0.56 0.57 -0.73 -0.66 1.17 -0.81 -0.23 -0.72 -0.93 -1.69 -0.77 -1.11 -0.34 1.3 1.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.