1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_97 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
-0.29 1.81 -0.3 -2.38 -2.76 0.13 -2.49 1.75 0.59 -2.18 -0.73 0.23 0.59 0.7 1.1 -1.71 -2.29 0.73 -2.65 0.93 -1.87 -2.97 -1.39 0.64 -1.3 -2.82
- - - 3.11 - 3.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.06 - -
0.05 -0.1 -0.1 - -0.79 - -1.63 -1.82 -1.71 -0.35 - -0.14 -0.4 - -1.93 - - -0.09 -2.19 -2.22 2.48 1.1 0.35 0.08 2.26 1.42
- - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - -
0.71 - - - 2.5 2.61 1.22 1.04 - - - 1.12 - - 0.92 - - 1.35 0.66 - - - - - - -
- - - - - - - - - - 2.66 - - - 2.61 3.76 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 2.46 - 3.38 - - - - - - - 3.34 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.8 - - - 3.59 - - - - - - - - - - -
-0.54 -0.9 -1.62 0.04 -1.26 1.02 0.57 -0.2 -0.58 0.29 -0.63 -2.53 - 0.29 0.41 0.22 0.63 0.56 0.74 -0.08 -3.56 -0.94 0.69 -0.43 1.24 0.33
- - - - - 2.81 1.42 - 3.32 1.16 1.22 - - - - - - - - 0.83 - - - - - -
-1.01 0.58 -2.23 -1.38 -1.65 -0.86 - 0.8 -1.47 -1.57 -0.19 -0.36 -0.27 0.43 0.83 0.05 1.01 -0.69 0.08 -1.54 1.38 -1.22 1.11 -0.85 1.57 -0.45
- - - - - - - - - -0.44 -0.38 - - -0.98 -0.64 -0.25 -0.16 -0.93 -0.4 - 2.68 1.32 2.44 - 2.58 -
1.85 - - - - - - - - - 3.14 2.25 2.59 - - - - - - - - - 1.49 - - -
- - - - - - 3.72 - - - 3.68 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.34 - 3.19 - - - - - - - - - 1.13 - 1.11 1.29
- 2.29 - - - - - - - - - - 3.44 - - - 2.02 - - - - - - - - 2.62
-0.45 - - - -0.69 -0.58 1.54 1.15 0.4 0.33 0.38 1.51 1.7 -0.24 -0.67 1.83 -0.39 1.06 - - - 0.02 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.51 - -0.81 -0.13 - -1.73 -0.02 -1.73 0.66 - - -1.78 -0.23 -0.02 0.42 1.08 1.92 0.45 -0.56 1.05 0.01 -0.01 0.76 1.46
0.1 -0.02 -1.04 -1.55 0.66 -0.49 -0.69 -1.08 -0.56 -0.53 0.44 -0.52 -1.57 0.51 -3.71 0.59 -0.01 0.43 0.96 -1.0 1.05 - 0.99 0.32 0.98 -0.14
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.07 - - - - 3.24 - - 3.03 - - - - - - -
-0.26 2.87 0.75 - -0.06 -0.24 1.76 0.77 - 0.63 -0.29 - - - 1.08 - - - - - -1.19 - - - -0.86 1.91
2.4 - - - 1.41 - - - - - 2.67 - - - - - - - 1.63 - - 1.31 2.04 - 1.03 -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.03 - 0.23 - -1.38 - -0.37 0.27 0.85 -1.43 -0.29 0.81 - -0.56 -1.41 -0.17 -0.04 - -1.77 1.46 1.57 1.44 -0.79 1.73 0.2
- - - - - - - - - - 4.02 - - 2.47 - - - - - - 2.07 - - - - -
- - - 2.79 - - - 2.93 - - 2.68 - - - - - - - - 2.34 - - - - - -
0.75 -1.12 -3.14 0.42 -1.89 2.33 -0.47 0.46 -0.77 -1.48 -1.8 -0.95 -0.83 -0.36 -0.5 0.4 0.37 0.47 0.24 -0.04 -0.9 -1.39 0.07 -0.47 -0.31 0.63
0.24 1.12 0.59 0.32 -0.97 -0.13 0.58 1.08 -1.97 -2.13 1.02 0.88 -0.15 -1.28 -0.78 -0.07 0.36 -2.56 0.84 0.08 - - - 0.2 - 1.15
0.29 -0.74 - 1.06 0.2 0.14 - - - -1.04 -1.03 0.7 - -0.16 - -0.85 - 0.77 0.0 - 2.22 -1.39 1.16 -1.09 1.54 1.28
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -1.41 - -0.91 -1.29 - - - - 0.9 - 0.7 - - - - -0.79 1.45 2.2 - - -1.24 1.88 0.3 1.2 2.5
- - - - - 3.53 - - - - - - - 2.93 - - - 2.77 - - - - - - - -
- - - - - 3.75 - - - - - - - - 3.65 - - - - - - - - - - -
- - - - - - 0.68 0.44 - - 0.2 - - 0.07 - 2.62 0.2 - 2.94 -0.09 - 1.94 - 0.13 - -
0.65 2.84 - -0.26 - 1.25 1.99 -0.13 - 1.56 2.44 - - - - - - - - - -0.28 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 1.48 3.2 - 2.27 1.48 - - - - - 2.68 - -
- - - - - 3.44 - - - - 2.44 - - - - - - - - - 2.49 2.03 - - - -
-0.03 - 0.51 - -0.02 - - - - - 1.84 1.95 - 0.11 1.77 2.0 - -0.26 - 0.19 1.91 - -0.1 - - -
- - - - - - - - - - 3.02 - - - - - - 3.87 - 1.68 - - - - - -
1.3 - 0.45 2.47 1.5 - 0.46 - - 0.37 0.42 - - - 0.37 - 0.68 0.71 1.68 - - - - - - 1.03
- 1.38 -0.64 -0.68 - -0.39 - -0.42 -0.65 -0.75 - -0.54 -0.74 - 2.08 -0.49 -0.44 - - -0.72 -1.08 0.55 1.53 2.29 -0.28 0.37
- - 1.97 - 1.67 - - - - - 2.93 - - 1.38 - - - 2.43 - - - 1.71 - - - -
2.09 - - - - - - 2.42 - - - - - - 3.62 - - - - - - - 2.02 - - -
0.39 2.12 - 0.65 - - - 0.91 - - 2.98 - - 0.11 - - - 0.11 - 0.37 - - 2.48 - - -
- - - - - 3.16 - - - - 4.09 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.6 -0.1 1.12 -0.28 -1.4 0.46 0.93 0.78 1.7 0.21 0.78 1.19 - 0.31 - 0.27 - -1.84 -0.65 0.98 - - -0.96 0.3 -1.91 -0.72
0.57 - -0.41 -1.57 0.98 -1.63 0.06 0.54 0.1 -0.06 - -0.43 1.49 - -0.7 1.12 -1.56 1.93 -0.73 0.11 -1.97 - - 1.68 -2.2 -0.42
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.28 - - - 0.71 - 0.72 - 1.61 2.98 - - 3.06 0.44 - - - - - -0.24 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.28 - 1.65 - 0.13 2.76 0.43 - 2.05 - - 0.52 0.86 0.77 - - - 1.09 - - - - - - - -
- - - - - 2.81 3.25 - - - - - - - - - - 2.05 - - - 2.41 - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 0.14 - - - 0.15 - 0.33 - - 2.46 - - 1.23 2.55 -0.09 - - - - 2.98 -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.86 - - - - - - - - 3.52 - - - - - -
- - - 1.97 - - 1.9 - - - - - - - - - - - 3.47 - - - - - 2.86 -
1.7 - - - - - - 0.31 0.41 1.34 2.4 - - - - - - - 0.35 - 1.57 0.03 2.08 1.03 -0.25 -
- - 1.25 - - - - 2.31 - - - - 2.97 - 2.97 - - - - - - - 0.59 - 0.58 -
1.36 - -1.31 - 1.33 0.44 - -0.36 0.28 -0.4 0.97 0.78 0.1 -0.9 - 0.25 - 1.15 -1.39 -1.69 1.38 -1.57 0.61 -0.02 0.36 -1.89
- - - - - - - - - - 3.32 - - - - 2.35 - 2.8 - 1.99 - - - - - -
- -0.47 - - - - 3.09 0.52 0.46 - 2.36 -0.51 -0.17 -0.25 1.63 - - - - - - -0.86 - - -1.28 1.22
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.88 -1.6 -0.9 -1.51 -0.47 1.88 -0.22 0.39 -0.97 -0.72 -2.85 -2.7 -3.41 -0.08 0.21 -0.34 0.33 1.4 1.42 0.75 -3.75 -1.82 -0.28 -1.39 1.14 0.32
- - - - 1.18 1.24 2.1 - - 0.9 1.95 - - - - - 2.1 1.32 1.64 - 0.55 - - - - -
1.27 - - 3.49 - - - - - - 2.1 - - - - - - - - - - - 0.48 2.74 - -
- 3.22 - 3.04 - - - - - - - - - - - - - - 3.08 - - - - - - -
- - - - - 3.12 - - - - 3.03 3.19 - - - - - - - - - - - - - -
0.0 - - - - 1.43 -0.13 1.93 - 0.77 -0.17 1.54 2.26 -0.3 - - - 0.78 1.34 -0.22 -0.57 - -0.51 - - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.36 - - - - - - - - - 2.44 - - - - -
- - 1.25 - 1.21 - - - - - - 1.13 3.42 - 0.93 - - - - - - - - - 2.36 0.44
1.1 - - - 1.3 1.41 - - - - - - - - - - - 0.65 - - 2.54 1.15 2.32 1.3 0.73 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.68 - - - - 2.37 - - 2.88 - - - - 2.82 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.61 -1.2 - - 0.25 0.56 0.33 2.28 -0.65 - -0.77 - - -0.14 0.97 - 1.24 -0.13 1.15 0.9 - - - - -1.39 0.93
- - - - 1.13 -0.2 -0.44 - - -0.56 0.7 -0.36 -0.55 - 2.33 2.83 - - -0.46 1.39 -0.16 - -1.11 - 0.66 -
-0.1 -0.51 1.14 - - - - - 0.04 1.41 1.88 - - - 2.14 - 1.11 -0.63 - 0.59 1.83 - -0.75 - -0.7 0.41
0.77 1.33 1.08 - - - 1.28 - 2.14 1.99 2.02 - - - - - - - - - 1.11 - - - 1.4 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.12 - 3.24 - - - - - - - - 2.97 - - - - - - - -
1.29 0.89 -0.21 1.33 1.39 -1.58 -0.17 -0.67 0.16 0.78 1.83 -1.62 -0.87 -1.37 -0.3 - - -0.5 - -0.94 -0.21 -2.97 -2.09 0.7 -0.36 -0.92
1.07 1.24 - -0.74 - 2.49 0.77 - -0.78 - - 0.27 0.57 2.5 - - - 2.23 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 3.75 - - - - - - - - 3.65 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - -
- -1.25 0.75 - 0.52 - - 0.19 0.78 -0.88 1.7 -0.74 0.6 0.67 0.61 - 0.89 1.38 -0.91 1.25 - -1.23 -0.34 0.35 -1.45 -1.41
1.93 - - - - - 2.9 1.26 1.36 - - - 1.67 - 2.73 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.84 - - - - 3.54 -
- - - - - - - - - - 3.61 - - - - 3.79 - - - - - - - - - -
- 2.51 - 2.33 - 2.38 - - - - 2.3 - - - - - - - 2.36 - - - - - - -
-0.18 - - - - 0.85 2.8 - 1.89 - 0.8 0.92 -0.27 0.25 - - 0.03 - 1.99 - 0.48 - - - -0.78 -
2.66 - - 2.5 - 1.45 1.0 - 0.59 - - - 0.94 - - 0.69 - - - - - - - 0.96 1.2 -
- - - - - - - - - - 2.39 - - - 3.78 - - - - - - - 2.82 - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.