1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_94 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.87 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.22 - - - - - - - -
- 3.2 - - - - 0.16 0.04 - 1.04 0.09 0.25 2.84 - - 0.14 - - 1.08 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 1.31 0.88 - 0.93 2.01 3.25 - 1.27 - 0.3 - 0.29 0.46
- - - - - - - - - - - - - - 3.33 - - 2.88 - 3.1 - - - - - -
- - - - - 3.16 - - - - - - - - - - - 3.31 - - - 2.01 - - 1.65 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.45 3.92 - - - - - - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- 2.11 - - 3.1 - - - 0.9 0.8 - - - - - - 0.88 - - - -0.03 - 0.77 - 0.24 1.92
0.97 0.68 0.53 -0.51 -1.21 - -1.97 -0.25 -0.55 -2.22 -1.19 - -1.78 0.45 1.18 -0.17 -0.94 2.47 2.09 -1.37 -0.58 -2.57 -0.62 - -1.26 -
- 3.4 - - - - - 2.17 - - - - - - - - 2.12 - - - - 1.89 - - 1.53 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 2.69 - 4.29 - - - - - - - -
-1.61 2.68 1.19 -2.66 - - 0.44 - -2.75 2.26 -2.73 - 2.42 - - -2.76 -2.77 -0.96 - -3.12 - 1.99 - -2.84 - -
- - - - 3.69 - 3.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 0.39 - - 0.89 0.33 0.43 0.35 - 0.53 - 0.27 - - - 2.71 - 0.12 2.48 - 1.65 - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.14 - - - - - - 2.94 2.21 - 1.4 - 1.15 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- 4.21 - - - - - - - - 2.9 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 3.49 - 1.92 - - 1.63 - 1.81 - - - - - 1.13 - - - - - - - 1.14
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.36 - 3.97 - - -
0.17 -0.86 - - 0.65 1.61 0.1 0.5 1.27 -1.22 0.41 0.57 - 1.12 -1.36 - 0.0 2.31 0.25 -1.48 - - -1.77 - 0.26 -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.35 - 1.95 1.63 2.74 0.07 - 0.25 0.55 - - - - -0.59 - -0.22 2.55 - - - - -
- - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.24 - - - - - - - - - - - 2.82 - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 1.77 - 1.75 - - - - - - - - 3.8 - - - - - 1.66 1.09 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.23 - - - - - - - - - - - - 2.85 - - - -
1.81 0.67 -0.2 -0.77 -0.69 0.58 0.5 0.09 -0.27 0.45 -2.37 0.38 0.04 -2.96 -1.43 0.53 -1.51 0.8 0.71 0.14 -3.24 -2.63 1.45 - -1.48 -
- - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 3.69 - - 1.78 - - - - - 2.73 - - - - - 1.59 - -
- - - - 3.4 - 3.41 - - - - - - - - - - - - - 2.27 - - - - -
- -2.78 - - - -2.46 - -2.15 -2.37 - -2.35 - - -0.12 -2.44 -2.22 0.2 2.86 2.54 -1.58 -1.21 -2.61 -2.73 - - 3.08
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.05 3.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.25 - 0.06 1.3 - - - - 0.99 1.68 0.2 - 0.75 - 0.09 0.34 -0.43 0.1 0.02 - -0.14 - - - 2.59
- 2.96 - - - - 1.33 - - 2.03 2.1 - 1.02 - - - - - - 1.04 - - - - - 1.71
- - - - 3.58 - - - - - 2.4 - - - - - - - - - 2.45 - - - 1.72 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- 0.14 - - 0.08 -0.09 - 0.11 -0.06 - - - 0.29 0.24 1.23 - 0.09 2.7 2.14 -0.48 0.49 -0.36 - - -0.78 -0.61
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.61 - - - - - 3.2 2.19 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.02 - 0.72 - - 0.97 - - - 1.76 0.86 - 1.12 - - 1.0 3.04 - - - - - 0.67 - 0.27
1.0 0.0 0.14 1.47 1.91 -0.54 -1.02 0.47 -0.4 -1.63 0.65 0.17 0.24 -2.34 -5.26 -4.19 - -2.52 -1.72 -2.03 -2.5 1.07 -1.77 1.0 -0.32 0.55
2.96 - - - - - - - 3.25 - - - - - - - - - - - - - 3.12 - - -
- - - - - - - - 2.57 - - - - - - - - 3.97 - - - - 2.14 - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - -0.01 2.64 - 3.09 3.06 - - - - - - 0.9 -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.4 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.29 - - - - - - -
1.51 2.77 - - - - - 2.54 1.64 - - - - 1.35 - - - - - - - 1.12 - 1.42 - -
- - - - - - - - - - 2.48 - - - - - - 3.92 2.39 - - - - - - -
- 4.04 - - - - - - - - - - - - - - - 3.25 - - - - - - - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.27 - - - - - - - - 2.74 - - - - - - - -
-2.47 - -2.16 0.09 0.14 1.73 0.89 0.18 0.49 1.76 -2.23 0.27 1.0 -1.0 -0.56 0.37 -0.87 0.07 0.34 -1.51 -1.29 -2.42 - - -0.65 1.01
-1.98 -1.87 -0.67 - -1.07 - -1.91 - - - - - -1.68 -0.25 0.88 0.29 1.3 1.71 3.05 0.01 0.91 -2.51 1.05 -2.22 - -0.96
- - - - - - - - - - - - - 3.3 - - - 2.92 3.11 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.0 -0.26 0.18 0.62 - -1.39 -0.95 -1.38 - 0.12 0.11 - - 0.89 1.83 -0.51 - 1.95 - 1.85 - -0.72 -0.78 0.82 -1.05 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.14 - - - - - - - - - - - - 1.7 3.48 - - - - 2.85 - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.48 - - - - -1.68 - 0.22 - - - -0.7 2.23 1.05 -1.47 1.89 2.11 0.44 0.2 -1.95 1.31 -1.1 0.24 -1.12
- - - - 1.91 2.45 - - 3.78 - - - - 1.62 - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 2.35 - - 2.69 - - - 3.38 - 2.02 - - - - - -
- - - - - - - 2.65 - - - - - 3.27 2.54 - - 2.09 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.77 - - 1.72 1.43 - - 1.65 2.46 - 1.64 - - - - 1.5 - - - - - - - - 1.02
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- 3.08 - - - - - - - - - - 2.73 - - 2.73 - 2.09 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
- 3.26 1.41 - - 0.2 - - 1.35 1.83 - 1.99 0.69 - - - - - - - - - -0.08 - - -
- 3.03 - - - 1.68 2.23 - - - - - - - - - - 1.24 - 2.4 - - - - - 1.2
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - -
-1.89 -0.84 0.4 -1.11 -1.86 -2.51 -0.71 0.96 -1.0 -0.56 -1.42 -1.22 -1.47 1.66 0.38 0.36 0.83 1.13 -0.42 1.28 0.02 -0.96 -0.7 -1.06 -1.02 1.02
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.6 3.79 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.42 - - - - - - - - - - - - - - - 2.18 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.34 - - 3.26 2.45 - - - - - - - 2.55 - - - - - - - - - - - -
- 1.4 - - - - - - - - - - - - - - - 3.27 - - 1.38 - - - 3.47 -
- - - - - 2.75 - - - - - 2.6 - - - 2.44 - 2.96 - - - - - - - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.85 - - - - - - - - 2.44 - - - - - 2.63 - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.