Heatmap: Cluster_111 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.06 0.06 0.03 0.08 0.06 0.08 0.09 0.11 0.18 0.18 0.35 0.29 0.1 0.25 0.14 0.2 0.1 0.34 0.3 0.07 0.76 0.09 1.0 0.3 0.44 0.38
0.36 0.33 0.33 0.5 0.35 0.32 0.48 0.52 0.41 0.29 0.35 0.29 0.21 0.41 0.51 0.47 0.37 0.62 0.63 0.35 0.7 0.84 0.92 0.76 1.0 0.82
0.47 0.46 0.36 0.44 0.51 0.38 0.52 0.57 0.58 0.62 0.68 0.57 0.47 0.57 0.38 0.42 0.29 0.44 0.41 0.27 1.0 0.94 0.75 0.84 0.9 0.9
0.41 0.41 0.4 0.46 0.43 0.37 0.42 0.48 0.5 0.49 0.48 0.53 0.52 0.7 0.4 0.61 0.5 0.74 0.42 0.38 0.96 0.94 0.84 0.95 1.0 0.91
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.29 0.22 0.16 0.24 0.21 0.23 0.27 0.15 0.03 0.6 1.0 0.33 0.63
0.31 0.2 0.19 0.29 0.23 0.17 0.3 0.35 0.32 0.37 0.39 0.33 0.33 0.42 0.29 0.33 0.24 0.33 0.3 0.19 0.94 0.97 0.7 0.63 0.84 1.0
0.08 0.06 0.03 0.04 0.05 0.03 0.06 0.05 0.07 0.07 0.08 0.09 0.03 0.6 0.47 0.33 0.26 0.54 0.48 0.48 0.26 0.12 0.22 0.49 0.74 1.0
0.53 0.53 0.45 0.49 0.43 0.27 0.78 0.73 0.52 0.7 0.6 0.53 0.44 0.61 0.47 0.55 0.84 0.8 0.94 0.54 0.89 1.0 0.93 0.65 1.0 0.61
0.31 0.31 0.34 0.19 0.17 0.16 0.4 0.38 0.24 0.27 0.32 0.23 0.17 0.38 0.31 0.4 0.42 0.38 0.43 0.24 0.82 0.79 0.92 0.21 1.0 0.65
0.33 0.19 0.14 0.28 0.21 0.07 0.11 0.31 0.18 0.4 0.68 0.71 0.32 0.38 0.31 0.25 0.25 0.23 0.17 0.12 1.0 0.4 0.78 0.64 0.76 0.71
0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.06 0.07 0.15 0.11 0.09 0.1 0.24 0.14 0.13 0.43 0.4 0.25 0.4 0.19 0.39 0.15 0.39 0.4 0.42 0.4 0.39 0.31 1.0 0.94 0.49
0.1 0.0 0.12 0.11 0.13 0.2 0.06 0.03 0.06 0.22 0.08 0.09 0.0 0.23 0.05 0.06 0.06 0.52 0.37 0.12 1.0 0.31 0.43 0.26 0.6 0.66
0.32 0.21 0.29 0.45 0.43 0.34 0.5 0.49 0.51 0.62 0.67 0.6 0.46 0.65 0.31 0.49 0.37 0.3 0.27 0.24 0.63 1.0 0.59 0.89 0.7 0.7
0.05 0.03 0.13 0.22 0.22 0.18 0.09 0.09 0.14 0.15 0.13 0.14 0.03 0.68 0.33 0.49 0.38 0.42 0.39 0.4 0.87 0.07 1.0 0.5 0.77 0.87
0.32 0.26 0.25 0.32 0.36 0.27 0.4 0.45 0.31 0.38 0.4 0.32 0.3 0.49 0.37 0.48 0.36 0.5 0.42 0.4 0.58 0.5 1.0 0.57 0.63 0.55
0.14 0.16 0.18 0.33 0.25 0.35 0.38 0.36 0.39 0.31 0.24 0.23 0.11 0.26 0.18 0.32 0.22 0.4 0.24 0.2 0.55 0.45 1.0 0.3 0.56 0.36
0.27 0.22 0.18 0.24 0.22 0.23 0.19 0.16 0.26 0.32 0.34 0.46 0.26 0.52 0.62 0.7 0.32 0.69 0.52 0.57 0.53 0.3 1.0 0.79 0.73 0.88
0.11 0.05 0.15 0.01 0.11 0.2 0.05 0.2 0.09 0.12 0.14 0.08 0.07 0.79 0.53 0.56 0.45 0.67 0.51 0.53 0.69 0.65 0.63 0.34 1.0 0.68
0.25 0.21 0.18 0.2 0.3 0.33 0.29 0.32 0.32 0.24 0.35 0.45 0.13 0.3 0.17 0.32 0.23 0.47 0.5 0.29 0.93 0.54 1.0 0.76 0.86 0.66
0.06 0.08 0.11 0.11 0.05 0.02 0.07 0.12 0.18 0.16 0.13 0.09 0.08 0.32 0.44 0.28 0.16 0.63 0.39 0.32 0.32 0.13 0.7 0.63 1.0 0.97
0.1 0.11 0.13 0.13 0.09 0.06 0.11 0.17 0.23 0.19 0.18 0.1 0.09 0.4 0.59 0.36 0.19 0.58 0.46 0.39 0.27 0.15 0.52 0.5 0.66 1.0
0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.03 0.03 0.01 0.0 0.89 0.29 1.0 0.54 0.32 0.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.12 0.87 0.12 0.07 0.0 0.0 0.71 0.2 0.93 1.0 0.54 0.57
0.22 0.23 0.26 0.26 0.28 0.29 0.38 0.28 0.25 0.27 0.2 0.23 0.16 0.52 0.41 0.43 0.35 0.37 0.33 0.37 0.72 1.0 0.82 0.27 0.68 0.44
0.22 0.21 0.27 0.26 0.27 0.24 0.34 0.27 0.2 0.26 0.2 0.19 0.14 0.51 0.41 0.48 0.37 0.37 0.34 0.36 0.78 0.98 1.0 0.52 0.69 0.47
0.23 0.15 0.1 0.24 0.19 0.19 0.33 0.4 0.4 0.33 0.36 0.35 0.16 0.27 0.34 0.31 0.17 0.4 0.26 0.23 0.77 0.27 1.0 0.28 0.73 0.54
0.15 0.1 0.23 0.23 0.2 0.2 0.41 0.37 0.25 0.39 0.39 0.34 0.21 0.51 0.31 0.33 0.37 0.15 0.23 0.18 0.58 0.75 0.64 1.0 0.41 0.41
0.1 0.13 0.17 0.19 0.26 0.18 0.19 0.17 0.13 0.23 0.22 0.19 0.16 0.68 0.28 0.66 0.32 0.37 0.38 0.43 0.87 0.48 0.99 1.0 0.96 0.91
0.45 0.37 0.32 0.53 0.33 0.24 0.33 0.45 0.32 0.3 0.35 0.24 0.33 0.24 0.31 0.26 0.22 0.61 0.46 0.24 0.43 0.66 0.65 0.26 1.0 0.52
0.38 0.33 0.36 0.49 0.51 0.37 0.43 0.45 0.38 0.36 0.42 0.33 0.3 0.56 0.33 0.45 0.35 0.5 0.6 0.37 0.57 0.69 0.73 0.69 1.0 0.98
0.44 0.5 0.47 0.45 0.48 0.41 0.55 0.5 0.57 0.57 0.6 0.6 0.4 0.67 0.65 0.59 0.64 0.9 0.78 0.57 0.74 1.0 0.65 0.73 0.89 0.89
0.79 0.7 0.05 0.19 0.45 0.48 0.4 0.45 0.52 0.49 1.0 0.75 0.39 0.04 0.13 0.05 0.05 0.59 0.21 0.11 0.63 0.04 0.0 0.2 0.55 0.39
0.06 0.05 0.12 0.29 0.29 0.2 0.2 0.15 0.31 0.29 0.4 0.32 0.08 0.36 0.19 0.3 0.17 0.23 0.19 0.09 0.79 0.63 0.63 1.0 0.68 0.61
0.18 0.26 0.35 0.56 0.38 0.3 0.42 0.55 0.36 0.48 0.38 0.29 0.36 1.0 0.55 0.67 0.71 0.9 0.69 0.85 0.16 0.16 0.43 0.28 0.97 0.95
0.47 0.36 0.28 0.23 0.22 0.15 0.27 0.32 0.24 0.33 0.31 0.31 0.23 0.49 0.43 0.54 0.7 0.65 0.6 0.42 1.0 0.63 0.79 0.34 0.71 0.42
0.39 0.37 0.27 0.28 0.23 0.21 0.27 0.4 0.35 0.34 0.44 0.38 0.23 0.31 0.23 0.37 0.44 0.39 0.5 0.27 1.0 0.42 0.43 0.25 0.45 0.29
0.48 0.43 0.35 0.32 0.24 0.2 0.41 0.38 0.35 0.38 0.36 0.37 0.3 0.38 0.35 0.44 0.53 0.39 0.48 0.36 0.89 0.68 1.0 0.49 0.77 0.42
0.5 0.5 0.42 0.4 0.26 0.19 0.41 0.4 0.41 0.49 0.44 0.46 0.34 0.41 0.34 0.41 0.45 0.52 0.6 0.32 1.0 0.82 0.72 0.31 0.91 0.44
1.0 0.94 0.85 0.67 0.45 0.2 0.63 0.82 0.9 0.81 0.94 0.87 0.49 0.35 0.49 0.79 0.73 0.81 0.52 0.55 0.84 0.34 0.34 0.2 0.58 0.39
0.54 0.42 0.32 0.29 0.19 0.18 0.31 0.35 0.28 0.37 0.31 0.36 0.24 0.47 0.49 0.62 0.72 0.63 0.68 0.47 1.0 0.58 0.82 0.33 0.73 0.47
0.81 0.56 0.42 0.25 0.34 0.17 0.54 0.53 0.31 0.51 0.48 0.4 0.29 0.54 0.25 0.59 0.65 0.79 0.77 0.48 1.0 0.43 0.61 0.17 0.61 0.27
0.31 0.34 0.29 0.21 0.16 0.13 0.29 0.29 0.26 0.33 0.3 0.26 0.15 0.32 0.24 0.36 0.39 0.41 0.41 0.29 1.0 0.47 0.79 0.54 0.73 0.44
0.57 0.41 0.43 0.37 0.22 0.19 0.45 0.46 0.4 0.4 0.38 0.36 0.33 0.45 0.46 0.6 0.67 0.63 0.57 0.44 1.0 0.79 0.93 0.6 0.81 0.45
0.27 0.2 0.27 0.41 0.37 0.32 0.57 0.55 0.46 0.34 0.26 0.2 0.2 0.33 0.32 0.41 0.44 0.44 0.42 0.38 0.57 0.52 0.88 0.41 1.0 0.57
0.24 0.09 0.04 0.02 0.03 0.04 0.04 0.02 0.2 0.24 0.18 0.31 0.15 0.19 0.14 0.09 0.14 0.2 0.15 0.08 1.0 0.12 0.71 0.44 0.21 0.05
0.39 0.43 0.37 0.41 0.41 0.31 0.44 0.53 0.51 0.57 0.58 0.55 0.27 0.65 0.42 0.42 0.45 0.49 0.51 0.35 0.78 0.73 0.93 0.78 1.0 0.87
0.17 0.08 0.13 0.42 0.27 0.32 0.49 0.39 0.55 0.61 0.74 0.71 0.22 0.48 0.37 0.53 0.4 0.31 0.22 0.25 1.0 0.94 0.43 0.86 0.88 0.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.04 0.2 0.04 0.14 0.11 0.04 0.0 0.24 0.06 0.33 0.11 0.23 0.06 0.15 0.79 0.47 1.0 0.28 0.45 0.77
0.12 0.19 0.25 0.35 0.49 0.62 0.59 0.48 0.37 0.24 0.23 0.21 0.08 0.48 0.3 0.65 0.41 0.71 0.57 0.4 0.73 0.78 0.53 0.62 1.0 0.9
0.32 0.28 0.29 0.33 0.39 0.34 0.38 0.37 0.38 0.46 0.53 0.54 0.45 0.45 0.25 0.31 0.24 0.36 0.27 0.22 0.62 0.95 0.53 1.0 0.79 0.62
0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.11 0.31 0.36 0.49 0.26 0.03 0.1 0.03 0.08 0.05 0.05 0.14 0.06 0.5 0.1 1.0 0.43 0.57 0.2
0.1 0.11 0.09 0.05 0.06 0.03 0.03 0.1 0.07 0.04 0.02 0.03 0.05 0.5 0.44 0.41 0.36 0.38 0.42 0.72 0.14 0.78 0.27 0.24 0.75 1.0
0.4 0.29 0.16 0.24 0.28 0.07 0.14 0.25 0.18 0.52 0.52 0.6 0.36 0.36 0.23 0.15 0.17 0.12 0.25 0.22 1.0 0.49 0.64 0.48 0.43 0.9
0.35 0.15 0.16 0.2 0.18 0.07 0.1 0.17 0.18 0.38 0.42 0.4 0.24 0.38 0.16 0.24 0.19 0.21 0.23 0.19 1.0 0.51 0.6 0.79 0.62 0.73
0.1 0.12 0.14 0.2 0.23 0.19 0.15 0.14 0.13 0.24 0.31 0.3 0.15 0.45 0.13 0.34 0.19 0.12 0.16 0.18 0.39 1.0 0.42 0.62 0.76 0.55
0.06 0.08 0.09 0.1 0.16 0.11 0.08 0.09 0.06 0.13 0.2 0.17 0.09 0.31 0.09 0.27 0.13 0.13 0.13 0.14 0.37 1.0 0.43 0.42 0.72 0.49
0.22 0.29 0.25 0.41 0.44 0.35 0.39 0.43 0.56 0.36 0.39 0.28 0.17 0.64 0.31 0.38 0.36 0.65 0.56 0.43 0.56 0.45 0.54 0.43 0.73 1.0
0.04 0.04 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.82 0.41 0.43 0.28 0.21 0.34 0.39 0.33 0.57 0.52 0.29 0.71 1.0
0.12 0.17 0.12 0.2 0.22 0.18 0.25 0.3 0.38 0.37 0.37 0.27 0.1 0.34 0.22 0.2 0.2 0.38 0.32 0.18 1.0 0.77 0.84 0.69 0.74 0.78
0.33 0.23 0.27 0.32 0.31 0.22 0.24 0.27 0.3 0.35 0.41 0.39 0.36 0.61 0.45 0.34 0.29 0.22 0.31 0.2 0.68 0.83 0.9 1.0 0.56 0.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.37 0.47 0.33 0.57 0.46 0.46 0.72 0.7 0.35 0.53 1.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.42 0.62 0.38 0.58 0.52 0.65 0.51 0.45 0.3 0.45 0.59 1.0
0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.28 0.24 0.25 0.22 0.33 0.27 0.26 0.66 0.52 0.33 0.56 0.61 1.0
0.2 0.21 0.23 0.28 0.23 0.18 0.26 0.26 0.26 0.23 0.28 0.35 0.3 0.33 0.19 0.21 0.14 0.29 0.26 0.14 0.51 1.0 0.59 0.67 0.9 0.5
0.29 0.46 0.51 0.69 0.77 0.69 0.69 0.62 0.61 0.69 0.64 0.53 0.26 0.76 0.63 0.76 0.63 1.0 0.86 0.61 0.97 0.85 0.92 0.7 1.0 0.93
0.25 0.22 0.27 0.4 0.31 0.37 0.59 0.35 0.38 0.42 0.25 0.15 0.28 0.54 0.42 0.35 0.56 0.68 0.49 0.54 0.66 0.53 0.81 0.42 1.0 0.89
0.16 0.18 0.19 0.32 0.39 0.44 0.55 0.45 0.38 0.25 0.25 0.18 0.11 0.3 0.35 0.39 0.35 0.48 0.38 0.28 0.82 0.42 1.0 0.45 0.79 0.59
0.43 0.18 0.21 0.47 0.45 0.32 0.51 0.46 0.39 0.38 0.52 0.38 0.27 0.35 0.23 0.35 0.23 0.43 0.42 0.2 0.54 0.77 0.86 0.85 1.0 0.76
0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.04 0.03 0.03 0.02 0.79 0.44 0.58 0.28 0.33 0.37 0.32 0.92 0.61 0.33 0.66 1.0 0.92
0.05 0.05 0.08 0.12 0.12 0.08 0.16 0.17 0.19 0.21 0.18 0.14 0.05 0.64 0.35 0.57 0.31 0.49 0.32 0.31 1.0 0.68 0.53 0.68 0.92 0.85
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.09 0.03 0.06 0.0 0.0 0.04 0.0 0.12 0.0 0.06 0.0 0.0 1.0 0.35 0.86 0.2 0.42 0.6
0.22 0.15 0.06 0.28 0.27 0.09 0.2 0.21 0.19 0.31 0.38 0.31 0.28 0.65 0.27 0.32 0.19 0.23 0.26 0.19 0.72 0.93 0.69 1.0 0.92 0.75
0.21 0.25 0.39 0.44 0.29 0.29 0.46 0.44 0.31 0.37 0.21 0.21 0.12 0.37 0.55 0.52 0.43 0.91 0.53 0.56 0.39 0.55 0.62 0.34 1.0 1.0
0.0 0.01 0.0 0.03 0.03 0.09 0.0 0.06 0.02 0.05 0.02 0.04 0.0 0.23 0.38 0.3 0.49 0.49 0.49 0.19 0.45 0.11 0.65 0.84 0.53 1.0
0.18 0.14 0.15 0.28 0.2 0.15 0.29 0.27 0.2 0.28 0.29 0.33 0.13 0.3 0.31 0.24 0.15 0.29 0.38 0.16 0.41 0.77 0.52 1.0 0.73 0.4
0.43 0.26 0.25 0.33 0.39 0.28 0.35 0.3 0.35 0.32 0.37 0.34 0.4 0.3 0.24 0.28 0.2 0.35 0.35 0.22 0.63 0.45 0.7 0.7 1.0 0.59
0.19 0.16 0.16 0.23 0.19 0.13 0.19 0.22 0.15 0.2 0.16 0.19 0.18 0.36 0.27 0.41 0.2 0.48 0.3 0.32 0.41 0.29 0.39 0.85 1.0 0.92
0.23 0.15 0.2 0.16 0.25 0.23 0.24 0.17 0.26 0.17 0.13 0.28 0.12 0.48 0.4 0.73 0.35 0.54 0.43 0.48 0.54 0.26 0.63 0.74 0.75 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)