Heatmap: Cluster_159 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.6 0.53 0.61 0.74 0.62 0.47 0.78 0.93 0.57 0.77 0.78 0.58 0.38 0.58 0.44 0.62 0.71 0.77 0.62 0.7 0.01 1.0 0.31 0.32 0.82 0.62
0.41 0.56 0.68 0.68 0.62 0.43 0.62 0.57 0.47 0.58 0.54 0.47 0.46 0.88 0.57 0.89 0.82 1.0 0.72 0.6 0.14 0.36 0.79 0.51 0.89 0.66
0.29 0.27 0.32 0.39 0.35 0.3 0.47 0.45 0.35 0.52 0.33 0.26 0.2 0.44 0.45 0.59 0.73 1.0 0.69 0.53 0.03 0.83 0.35 0.29 0.58 0.35
0.83 0.55 0.58 0.58 0.69 0.62 0.62 0.6 0.66 0.67 0.73 0.91 0.92 1.0 0.92 0.97 0.64 0.76 0.74 0.56 0.39 0.95 0.96 0.6 0.7 0.54
0.8 0.6 0.65 0.73 0.83 0.77 0.79 0.76 0.74 0.71 0.8 0.78 0.88 0.89 0.7 0.92 0.69 0.67 0.65 0.59 0.43 1.0 0.75 0.66 0.81 0.81
0.32 0.32 0.45 0.7 0.67 0.49 0.84 0.82 0.69 0.82 0.67 0.57 0.33 0.75 0.58 0.87 0.5 0.93 1.0 0.98 0.11 0.42 0.47 0.35 0.73 0.73
0.24 0.18 0.25 0.43 0.42 0.27 0.46 0.54 0.45 0.55 0.44 0.32 0.17 0.62 0.44 0.78 0.36 1.0 0.77 0.59 0.12 0.47 0.49 0.34 0.74 0.59
0.41 0.36 0.52 0.59 0.64 0.48 0.69 0.9 0.61 0.64 0.77 0.55 0.31 0.44 0.32 0.53 0.53 0.57 0.55 0.33 0.06 1.0 0.94 0.65 0.99 0.62
0.44 0.39 0.38 0.37 0.38 0.29 0.5 0.54 0.44 0.5 0.65 0.66 0.34 0.46 0.36 0.54 0.37 0.62 0.42 0.32 0.13 1.0 0.98 0.69 0.95 0.5
0.68 0.55 0.61 0.67 0.75 0.59 0.91 0.89 0.68 0.88 0.83 0.78 0.67 0.63 0.75 0.85 0.89 0.92 1.0 0.87 0.17 0.69 0.73 0.64 0.76 0.55
0.5 0.67 0.83 0.89 0.81 0.57 0.85 0.82 0.64 0.97 0.96 1.0 0.51 0.6 0.34 0.44 0.89 0.8 0.8 0.9 0.02 0.79 0.3 0.55 0.95 0.91
0.71 0.54 0.51 0.5 0.41 0.32 0.63 0.68 0.49 0.66 0.61 0.52 0.87 0.88 0.69 0.93 1.0 0.84 0.7 0.51 0.18 0.41 0.67 0.55 0.7 0.62
0.4 0.5 0.58 0.68 0.69 0.51 0.76 0.8 0.54 0.72 0.66 0.53 0.34 0.6 0.45 0.58 0.67 1.0 0.68 0.68 0.05 0.75 0.81 0.53 0.94 0.72
0.29 0.38 0.44 0.39 0.39 0.25 0.47 0.44 0.32 0.47 0.37 0.35 0.3 0.49 0.33 0.59 0.6 1.0 0.75 0.56 0.09 0.67 0.35 0.37 0.43 0.46
0.5 0.51 0.55 0.56 0.58 0.45 0.63 0.67 0.53 0.62 0.57 0.53 0.48 0.6 0.59 0.58 0.67 0.82 0.69 0.64 0.22 1.0 0.39 0.35 0.53 0.55
0.63 0.31 0.35 0.5 0.54 0.38 0.58 0.62 0.47 0.54 0.65 0.59 0.66 0.93 0.63 0.82 0.63 0.95 0.66 0.68 0.48 0.91 1.0 0.74 0.91 0.65
0.69 0.41 0.46 0.59 0.61 0.57 0.67 0.68 0.59 0.58 0.67 0.72 0.77 0.89 0.76 0.78 0.64 0.76 0.77 0.71 0.44 0.78 1.0 0.64 0.76 0.66
0.53 0.35 0.46 0.64 0.68 0.6 0.92 0.82 0.73 0.94 1.0 0.91 0.53 0.92 0.6 0.89 0.62 0.53 0.6 0.51 0.2 0.64 0.81 0.55 0.59 0.54
0.31 0.31 0.4 0.6 0.59 0.65 1.0 0.95 0.57 0.41 0.34 0.21 0.17 0.26 0.39 0.87 0.57 0.83 0.74 0.5 0.07 0.31 0.48 0.24 0.68 0.36
0.73 0.65 0.75 0.81 0.81 0.63 0.81 0.77 0.69 0.7 0.73 0.68 0.79 0.91 0.6 0.79 0.53 0.74 0.62 0.47 0.35 0.81 1.0 0.54 0.84 0.82
0.75 0.72 0.67 0.75 0.94 0.91 1.0 0.95 0.64 0.63 0.58 0.46 0.62 0.54 0.61 0.66 0.7 0.89 0.92 0.79 0.19 0.45 0.87 0.74 0.9 0.57
0.61 0.34 0.41 0.5 0.56 0.42 0.68 0.69 0.55 0.55 0.51 0.45 0.56 0.45 0.53 0.47 0.5 0.73 0.65 0.46 0.12 1.0 0.49 0.63 0.51 0.59
0.36 0.28 0.25 0.25 0.3 0.26 0.32 0.3 0.2 0.24 0.2 0.21 0.16 0.43 0.27 0.45 0.28 0.3 0.37 0.21 0.16 1.0 0.45 0.16 0.41 0.33
0.3 0.27 0.25 0.21 0.32 0.21 0.23 0.22 0.18 0.22 0.19 0.19 0.12 0.5 0.37 0.56 0.42 0.49 0.46 0.26 0.17 1.0 0.45 0.18 0.61 0.33
0.51 0.48 0.57 0.58 0.59 0.47 0.83 0.91 0.71 1.0 1.0 0.86 0.52 0.85 0.62 0.8 0.81 0.73 0.68 0.62 0.1 0.43 0.61 0.57 0.72 0.61
0.17 0.0 0.06 0.2 0.28 0.06 0.2 0.06 0.13 0.06 0.0 0.14 0.0 0.23 0.22 0.37 0.14 0.33 0.18 0.16 0.08 1.0 0.41 0.1 0.55 0.43
0.88 0.62 0.59 0.68 0.77 0.74 0.82 0.76 0.74 0.72 0.77 0.83 0.98 0.72 0.6 0.75 0.59 0.59 0.51 0.48 0.5 1.0 0.98 0.8 0.8 0.73
0.27 0.28 0.39 0.47 0.49 0.47 1.0 0.92 0.57 0.42 0.32 0.23 0.12 0.25 0.36 0.46 0.57 0.62 0.52 0.58 0.02 0.09 0.35 0.31 0.32 0.29
0.31 0.53 0.45 0.74 0.74 0.54 0.72 0.83 0.76 0.71 0.91 0.8 0.21 0.77 0.88 0.56 0.4 0.46 0.46 0.32 0.1 0.95 0.94 0.8 1.0 0.6
0.52 0.38 0.33 0.68 0.76 0.65 0.62 0.63 0.41 0.38 0.42 0.29 0.48 0.45 0.42 0.77 0.35 0.71 0.46 0.36 0.09 0.42 0.73 0.55 1.0 0.52
0.39 0.41 0.48 0.65 0.53 0.52 0.66 0.9 0.63 0.77 1.0 0.77 0.32 0.5 0.61 0.5 0.5 0.61 0.54 0.56 0.05 0.64 0.78 0.4 0.66 0.53
0.37 0.24 0.22 0.28 0.26 0.3 0.63 0.61 0.57 0.5 0.42 0.32 0.33 0.54 0.39 0.57 0.51 1.0 0.56 0.5 0.09 0.91 0.65 0.46 0.66 0.46
0.56 0.32 0.32 0.51 0.62 0.43 0.52 0.63 0.52 0.47 0.72 0.69 0.29 0.75 0.56 0.5 0.21 0.47 0.36 0.25 0.27 0.91 1.0 0.44 1.0 0.5
0.65 0.57 0.62 0.67 0.72 0.56 0.78 0.77 0.64 0.61 0.69 0.63 0.66 0.75 0.69 0.76 0.68 0.7 0.73 0.57 0.44 0.84 1.0 0.65 0.77 0.66
0.66 0.55 0.43 0.54 0.59 0.42 0.58 0.59 0.55 0.5 0.61 0.5 0.78 0.72 0.64 0.82 0.7 1.0 0.62 0.53 0.08 0.49 0.58 0.7 0.84 0.64
0.51 0.51 0.56 0.68 0.56 0.42 0.84 0.86 0.52 0.58 0.57 0.46 0.33 0.68 0.49 0.93 0.78 0.91 0.59 0.6 0.08 1.0 0.67 0.42 0.85 0.59
0.45 0.4 0.38 0.52 0.64 0.53 0.79 0.8 0.79 0.85 0.87 0.72 0.57 0.92 0.72 0.81 0.65 1.0 0.8 0.59 0.42 0.7 0.76 0.63 0.58 0.67
0.58 0.5 0.55 0.54 0.51 0.45 0.65 0.64 0.44 0.51 0.43 0.42 0.56 0.77 0.76 0.84 0.78 0.94 0.84 0.63 0.11 1.0 0.47 0.42 0.68 0.6
0.58 0.56 0.57 0.68 0.7 0.47 0.75 0.77 0.58 0.65 0.53 0.43 0.41 0.64 0.49 0.72 0.61 1.0 0.56 0.55 0.05 0.69 0.46 0.39 0.79 0.54
0.29 0.32 0.34 0.38 0.39 0.32 0.53 0.54 0.38 0.52 0.37 0.31 0.23 0.41 0.52 0.51 0.8 1.0 0.73 0.68 0.04 0.65 0.36 0.29 0.46 0.32
0.33 0.07 0.16 0.45 0.62 0.51 0.8 0.75 0.6 0.58 0.51 0.57 0.36 0.8 0.47 0.66 0.5 0.54 0.45 0.37 0.18 0.5 0.74 0.76 1.0 0.66
0.4 0.43 0.41 0.48 0.63 0.73 1.0 0.75 0.54 0.41 0.38 0.33 0.38 0.56 0.57 0.71 0.61 0.78 0.79 0.66 0.11 0.5 0.71 0.35 0.62 0.4
0.24 0.38 0.42 0.49 0.47 0.42 0.62 0.48 0.39 0.46 0.32 0.33 0.24 0.66 0.63 0.86 0.66 1.0 0.67 0.6 0.08 0.83 0.4 0.24 0.51 0.47
0.77 0.56 0.59 0.66 0.68 0.67 0.76 0.73 0.78 0.73 0.77 0.87 1.0 0.99 0.91 0.9 0.53 0.53 0.58 0.43 0.34 0.63 0.99 0.78 0.84 0.85
0.67 0.5 0.54 0.49 0.39 0.28 0.59 0.61 0.5 0.68 0.63 0.62 0.66 0.9 0.79 0.95 1.0 0.91 0.7 0.78 0.23 0.39 0.43 0.35 0.5 0.48
0.89 0.73 0.85 0.84 0.82 0.7 0.89 0.86 0.67 0.92 0.71 0.69 0.8 0.74 0.81 0.75 0.88 1.0 0.93 0.87 0.11 0.8 0.4 0.43 0.7 0.7
0.24 0.38 0.36 0.39 0.46 0.38 0.51 0.45 0.37 0.46 0.32 0.22 0.22 0.33 0.57 0.53 0.62 1.0 0.62 0.68 0.11 0.9 0.34 0.24 0.46 0.3
0.36 0.38 0.47 0.65 0.65 0.56 0.84 0.92 0.55 0.79 0.67 0.47 0.4 0.51 0.54 0.63 0.75 0.74 0.76 0.67 0.05 1.0 0.42 0.28 0.57 0.49
0.54 0.5 0.57 0.73 0.79 0.63 0.85 0.81 0.58 0.64 0.6 0.57 0.62 0.83 0.52 0.78 0.7 0.73 0.53 0.5 0.16 0.74 0.85 0.69 1.0 0.72
0.39 0.46 0.52 0.56 0.56 0.48 0.73 0.68 0.71 0.67 0.6 0.5 0.43 0.61 0.47 0.68 0.52 1.0 0.58 0.5 0.31 0.8 0.65 0.48 0.58 0.54
0.69 0.7 0.67 0.74 0.77 0.67 0.96 0.88 0.73 0.8 0.62 0.56 0.64 0.65 0.5 0.8 0.7 1.0 0.62 0.67 0.1 0.53 0.44 0.52 0.63 0.54
0.48 0.34 0.39 0.55 0.77 0.77 1.0 0.88 0.68 0.61 0.55 0.41 0.45 0.85 0.48 0.8 0.57 0.66 0.69 0.63 0.19 0.34 0.61 0.28 0.53 0.43
0.63 0.49 0.58 0.85 0.94 0.6 0.84 0.91 0.8 0.94 1.0 0.99 0.7 0.65 0.45 0.5 0.42 0.64 0.79 0.66 0.32 0.43 0.67 0.71 0.8 0.61
0.53 0.37 0.48 0.67 0.74 0.42 0.63 0.76 0.57 0.85 0.78 0.72 0.46 0.79 0.46 0.66 0.58 0.98 0.93 0.76 0.42 0.53 0.84 0.69 1.0 0.69
0.42 0.49 0.49 0.52 0.48 0.45 1.0 0.9 0.64 0.52 0.49 0.38 0.39 0.52 0.53 0.82 0.9 0.93 0.78 0.79 0.16 0.81 0.67 0.4 0.84 0.56
0.7 0.74 0.85 0.9 0.83 0.61 0.99 0.99 0.83 0.85 0.74 0.64 0.53 1.0 0.69 1.0 0.8 0.96 0.79 0.82 0.25 0.71 0.64 0.58 0.9 0.8
0.23 0.21 0.33 0.4 0.54 0.38 0.5 0.58 0.39 0.45 0.58 0.44 0.23 0.74 0.49 0.86 0.6 0.83 0.59 0.36 0.53 1.0 0.89 0.48 0.79 0.51
0.27 0.21 0.29 0.49 0.48 0.31 0.55 0.6 0.44 0.49 0.49 0.38 0.18 0.77 0.6 0.83 0.65 0.56 0.64 0.41 0.5 1.0 0.95 0.57 0.92 0.61
0.24 0.46 0.55 0.67 0.59 0.42 0.59 0.66 0.52 0.57 0.7 0.49 0.19 0.64 0.74 0.8 0.66 0.87 0.54 0.53 0.18 0.59 0.83 0.88 1.0 0.88
0.74 0.48 0.48 0.57 0.63 0.53 0.89 0.91 0.83 0.93 0.99 1.0 0.83 0.98 0.66 0.94 0.62 0.66 0.57 0.47 0.11 0.74 0.75 0.47 0.85 0.59
0.39 0.57 0.44 0.71 0.63 0.61 0.73 0.65 0.79 0.63 0.89 0.64 0.37 0.66 0.49 0.54 0.5 0.74 0.45 0.45 0.13 0.77 1.0 0.71 0.8 0.68
0.55 0.41 0.6 0.61 0.64 0.59 1.0 1.0 0.61 0.5 0.39 0.34 0.48 0.45 0.39 0.62 0.62 0.82 0.54 0.57 0.09 0.61 0.4 0.24 0.77 0.53
0.37 0.62 0.71 0.82 0.69 0.46 0.82 0.84 0.74 0.95 0.87 0.67 0.4 0.37 0.56 0.37 1.0 0.99 0.94 0.96 0.01 0.84 0.32 0.4 0.96 0.58
0.58 0.56 0.43 0.57 0.58 0.43 0.52 0.65 0.62 0.65 0.74 0.71 0.65 0.66 0.73 0.8 0.54 1.0 0.79 0.44 0.2 0.8 0.55 0.85 0.83 0.8
0.62 0.47 0.42 0.71 1.0 0.85 0.85 0.83 0.54 0.66 0.62 0.53 0.57 0.44 0.41 0.44 0.66 0.74 0.71 0.73 0.29 0.55 0.7 0.49 0.59 0.58
0.95 0.7 0.72 0.81 0.88 0.89 0.87 0.79 0.78 0.8 0.81 0.87 0.98 1.0 0.87 0.89 0.65 0.91 0.81 0.64 0.42 0.89 0.87 0.85 1.0 0.95
0.44 0.28 0.24 0.37 0.43 0.51 0.62 0.63 0.69 0.65 0.68 0.62 0.51 0.36 0.59 0.82 0.58 0.5 0.39 0.32 0.17 0.61 0.74 0.58 1.0 0.69
0.79 0.57 0.61 0.62 0.71 0.72 0.68 0.57 0.59 0.57 0.58 0.7 0.75 0.82 0.87 0.84 0.57 0.69 0.58 0.67 0.3 0.71 0.7 0.73 0.89 1.0
0.34 0.42 0.47 0.65 0.63 0.48 0.76 0.68 0.71 0.67 0.69 0.62 0.4 0.77 0.65 0.81 0.49 1.0 0.62 0.46 0.23 0.53 0.65 0.81 0.6 0.6
0.36 0.4 0.47 0.71 0.69 0.47 0.6 0.71 0.55 0.6 0.66 0.59 0.32 0.59 0.64 0.67 0.48 0.66 0.59 0.33 0.36 1.0 0.79 0.58 0.86 0.64
0.2 0.21 0.43 0.52 0.47 0.58 0.93 0.86 0.42 0.49 0.33 0.28 0.14 0.5 0.69 0.75 0.89 1.0 0.99 0.78 0.05 0.92 0.68 0.44 0.84 0.59
0.3 0.3 0.32 0.36 0.38 0.3 0.38 0.44 0.31 0.38 0.46 0.29 0.26 0.64 0.35 0.91 0.68 0.93 0.52 0.46 0.17 1.0 0.88 0.57 0.71 0.41
0.34 0.39 0.34 0.87 1.0 0.69 0.54 0.5 0.24 0.25 0.48 0.28 0.3 0.19 0.21 0.28 0.34 0.59 0.36 0.32 0.02 0.27 0.86 0.94 0.86 0.73
0.63 0.55 0.62 0.82 0.89 0.83 1.0 0.98 0.56 0.67 0.68 0.67 0.63 0.67 0.67 0.77 0.74 0.78 0.82 0.7 0.21 0.38 0.57 0.42 0.75 0.56
0.52 0.47 0.52 0.66 0.75 0.7 0.89 1.0 0.64 0.78 0.73 0.57 0.43 0.49 0.46 0.49 0.62 0.63 0.68 0.61 0.09 0.44 0.68 0.41 0.6 0.45
0.59 0.63 0.63 0.69 0.67 0.51 0.81 0.81 0.59 0.67 0.72 0.63 0.43 0.68 0.71 0.82 0.74 0.76 0.78 0.6 0.08 0.82 0.91 0.62 1.0 0.58
0.41 0.47 0.57 0.66 0.78 0.73 0.88 0.8 0.55 0.5 0.53 0.44 0.39 0.86 0.48 0.83 0.63 0.66 0.47 0.44 0.26 0.81 0.77 0.69 1.0 0.59
0.47 0.23 0.24 0.44 0.64 0.56 0.64 0.59 0.65 0.56 0.67 0.61 0.64 0.84 0.6 0.86 0.45 0.46 0.32 0.26 0.09 0.71 0.82 0.58 1.0 0.71
0.89 0.52 0.46 0.45 0.55 0.51 0.92 0.91 0.56 0.63 0.55 0.49 0.85 0.62 0.63 0.64 0.74 1.0 0.91 0.6 0.08 0.85 0.46 0.45 0.66 0.44

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)