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Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-3.42 -1.52 -0.67 -0.29 0.25 0.79 0.57 0.4 1.11 0.78 0.34 0.22 -2.63 -0.39 -0.18 -0.15 0.26 0.52 0.29 0.24 -2.86 -0.26 -0.12 -0.58 -0.13 -0.23
-3.38 -1.35 -0.66 -0.07 0.36 0.38 0.84 0.54 0.98 0.74 0.67 0.34 -2.95 -0.14 -0.24 0.09 0.55 0.77 0.11 0.6 -3.79 -0.58 -1.33 -0.39 -1.21 -0.87
-1.98 -0.11 0.12 0.45 0.53 0.56 0.94 0.78 0.81 0.44 0.24 0.01 -1.31 0.16 -0.02 0.17 0.06 0.25 -0.32 -0.31 -4.46 -1.73 -0.94 -0.83 0.12 -0.9
-0.58 -0.03 -0.03 0.0 0.2 0.38 0.39 0.25 0.4 0.51 0.41 0.23 -0.65 -0.19 0.05 -0.29 -0.1 0.35 0.52 0.1 -3.72 -0.95 0.03 -0.39 -0.32 -0.11
-1.9 -0.5 -0.14 0.23 0.66 0.78 0.67 0.58 0.89 0.78 0.45 0.14 -2.28 -0.13 -0.41 0.01 0.16 0.12 0.28 0.37 -5.87 -1.88 -0.67 -0.88 -0.34 -0.56
-3.25 -0.06 -0.28 -0.2 -0.11 -0.13 0.39 0.32 0.54 0.63 0.64 0.34 -3.47 -0.84 -0.49 -0.69 0.38 0.69 0.83 0.75 -4.74 -0.61 -0.04 0.64 -0.55 -0.4
-1.45 -0.43 0.2 0.18 0.67 0.89 0.88 0.54 0.57 0.64 0.53 0.33 -1.62 -0.41 -0.31 -0.45 -0.45 0.14 0.32 0.03 -3.35 -0.52 -0.71 -0.5 -0.4 -0.89
-1.42 -0.22 0.03 0.07 0.05 -0.43 0.24 0.13 0.07 0.33 0.26 -0.1 -1.56 0.35 0.44 0.51 0.24 0.42 0.71 0.51 -6.55 -0.08 -0.82 0.09 -0.29 -0.28
-1.46 -1.1 -0.32 0.02 0.21 0.31 0.46 0.53 0.69 0.85 0.39 -0.06 -1.07 -1.43 -0.2 -1.17 0.13 1.29 0.94 0.65 -4.58 -0.62 -1.29 -0.41 -0.39 -0.66
-0.37 0.08 0.26 0.27 0.57 0.49 0.61 0.54 0.49 0.6 0.42 0.39 -0.43 -0.66 -0.51 -0.58 -0.15 0.27 0.13 -0.02 -2.05 -0.66 -1.07 -0.81 -0.35 -0.54
-0.47 -0.07 -0.04 0.37 0.66 0.69 0.76 0.72 0.66 0.39 0.2 -0.13 -0.53 -0.39 -0.21 -0.2 -0.1 0.16 0.18 -0.01 - -1.75 -1.12 -0.57 0.15 -0.57
-0.36 -0.07 0.4 0.6 0.69 0.31 0.56 0.62 0.35 0.92 0.64 0.32 -0.76 -2.48 -0.91 -2.48 0.05 0.48 0.45 1.03 -6.72 -2.67 -1.6 -1.61 -0.64 -0.31
-2.17 -0.17 0.19 0.53 0.69 0.64 0.61 0.59 1.06 0.85 0.56 0.26 -1.18 -0.48 -0.14 -0.45 -0.25 0.64 0.33 0.16 -7.42 -2.64 -1.45 -1.13 -1.04 -1.02
-1.69 -0.44 -0.2 0.29 0.75 0.54 0.37 0.41 0.79 0.85 0.66 0.44 -1.38 -0.78 -0.53 -1.0 0.01 0.34 0.26 0.56 -2.58 -0.81 -0.63 -0.43 -0.61 -0.43
-0.38 -0.01 -0.07 0.06 0.27 0.57 0.21 0.06 0.31 0.3 0.04 0.05 -0.18 -0.75 0.01 -0.15 -0.06 0.29 0.26 -0.01 -2.05 -0.24 0.2 0.11 -0.11 -0.28
-1.82 -0.47 -0.57 -0.24 0.14 0.73 0.85 0.65 0.82 0.36 -0.07 -0.36 -2.02 0.31 0.22 0.17 -0.1 0.47 0.31 0.13 -2.91 -0.02 0.18 -0.82 -0.62 -0.59
-0.41 0.07 0.33 0.5 0.56 0.62 0.63 0.39 0.5 0.2 -0.17 -0.38 -0.88 -0.7 -0.01 0.15 -0.05 0.71 0.73 0.65 -2.91 -1.31 -1.51 -0.81 -1.75 -0.76
-1.68 -0.45 0.01 0.18 0.44 0.34 0.45 0.47 0.6 0.73 0.55 0.26 -1.18 -0.41 0.01 -0.4 -0.11 0.54 0.38 0.17 -4.97 -0.92 -0.4 -0.09 -0.26 -0.43
0.04 0.1 0.19 0.39 0.53 0.57 0.56 0.66 0.67 0.44 0.31 0.11 -0.05 -0.59 0.06 -0.21 -0.16 -0.22 0.04 0.0 -4.03 -0.55 -1.06 -1.07 -0.62 -0.92
-3.51 -2.61 -0.08 0.65 0.99 1.1 1.12 0.93 0.96 0.78 0.25 -0.37 -2.86 -1.55 -0.9 -1.16 0.01 0.53 0.03 0.46 -6.41 -0.67 -0.95 -1.39 -0.21 -0.53
-1.44 0.05 0.35 0.38 0.87 0.9 0.31 0.24 -0.12 0.13 -0.05 -0.21 -1.21 0.09 0.23 0.13 -0.15 0.1 0.37 0.32 -2.19 -3.5 -1.04 -0.28 -0.04 0.27
-0.2 0.61 0.5 0.44 0.56 0.56 0.81 0.83 0.7 0.63 0.32 -0.06 -0.24 -1.2 -0.37 -0.53 -0.17 0.42 0.29 0.11 -6.85 -1.18 -2.45 -1.84 -1.2 -1.59
-3.34 -0.18 0.78 1.15 0.9 0.82 0.85 0.93 0.9 0.63 0.37 -0.03 -2.83 -1.09 -0.74 -1.0 -0.58 0.17 -0.08 -0.21 -1.39 -1.41 -0.79 -1.96 -0.99 -0.67
-4.7 -3.54 -1.13 -0.16 0.43 0.7 0.78 0.07 1.01 0.74 0.35 -0.19 -4.32 -0.08 -0.21 -0.15 0.35 0.61 -0.02 0.74 -2.92 -1.26 0.1 -0.36 0.13 0.32
-1.31 -1.36 -0.06 0.59 1.14 1.49 1.31 1.09 0.76 0.85 0.65 0.14 -0.73 -2.89 -1.74 -2.85 -0.06 -0.2 -0.13 0.67 -6.85 -2.36 -2.27 -1.85 -1.18 -1.62
-2.45 -1.92 -1.19 -0.48 0.12 0.59 0.84 0.51 1.27 0.77 0.56 0.13 -2.02 -0.49 0.45 -0.26 0.06 0.58 0.54 0.23 -4.01 -2.17 0.14 -0.02 -0.28 -1.38
-0.65 -0.25 0.31 0.27 0.41 0.87 0.89 0.75 0.56 0.13 -0.12 -0.2 -1.12 -0.25 0.29 -0.4 0.01 0.33 0.29 0.34 -4.06 -2.18 -1.0 -0.66 -0.72 -0.06
-1.04 -0.23 -0.06 0.18 0.48 0.74 0.79 0.68 0.52 0.48 0.2 -0.17 -0.98 -1.14 -0.37 -1.08 -0.07 0.71 0.44 0.56 -3.74 -0.67 -0.34 -0.73 -0.05 -0.69
-0.2 0.37 0.4 0.36 0.5 0.46 0.56 0.54 0.39 0.37 0.12 -0.04 -0.22 -0.65 -0.1 -0.33 0.16 0.41 0.46 0.42 -3.6 -0.85 -1.84 -1.12 -0.78 -0.97
-0.18 -0.02 -0.03 0.07 0.26 0.26 0.08 0.09 0.27 0.28 0.49 0.34 -0.12 -0.84 -0.39 -0.59 -0.34 0.46 0.26 0.02 -1.23 -0.55 0.07 0.18 -0.0 -0.12
-1.12 -0.44 -0.32 -0.09 0.47 0.78 0.8 0.59 0.56 0.38 -0.0 -0.49 -1.31 -0.1 0.24 -0.12 0.26 0.35 0.35 0.5 -4.13 -0.88 -0.44 -0.6 -0.26 -0.34
0.17 0.03 0.31 0.42 0.41 0.33 0.61 0.73 0.27 0.3 0.08 -0.11 0.05 -0.71 -0.25 -0.65 0.04 0.51 0.35 0.52 -6.02 -0.44 -1.39 -1.55 -0.55 -0.67
-0.84 -0.3 -0.09 -0.03 0.31 0.5 0.72 0.69 0.87 0.94 0.75 0.35 -0.96 -0.81 -0.3 -0.57 -0.24 0.45 0.19 0.34 -4.72 -2.95 -0.03 -0.31 -1.12 -1.04
-0.75 -0.19 0.03 0.05 0.11 -0.14 -0.0 0.09 -0.02 0.23 0.14 0.08 -0.68 0.2 -0.0 0.48 0.06 0.54 0.56 0.47 -2.18 -0.67 -0.54 0.19 -0.21 0.08
-4.02 -4.82 -2.79 -2.07 0.2 0.96 1.32 0.8 1.06 0.58 -0.39 -1.09 -4.42 0.67 -0.09 0.53 0.02 0.76 0.57 0.44 -4.26 -1.13 0.69 -1.03 -0.73 -0.79
-0.18 -0.03 0.15 0.31 0.2 0.2 0.12 0.21 0.29 0.17 0.21 0.1 -0.08 -0.48 -0.01 0.12 -0.0 0.14 0.02 0.03 -1.03 0.09 -0.24 -0.16 -0.31 -0.54
-3.95 -0.19 0.39 0.98 0.89 0.7 0.9 0.85 0.53 0.19 0.24 -0.15 -3.59 -0.18 -0.25 -0.1 0.05 0.42 0.06 -0.4 -10.03 -3.19 -1.2 -0.92 0.39 -0.58
-0.67 -0.26 0.01 -0.09 0.3 0.32 0.48 0.54 0.33 0.24 0.2 -0.14 -0.67 0.62 -0.48 0.57 -0.36 0.37 0.67 0.39 -4.1 0.33 -1.28 -1.41 -0.45 -0.77
-0.75 -0.78 -0.12 -0.02 -0.01 -0.31 0.47 0.4 -0.02 0.27 0.03 -0.11 -0.92 0.88 -0.29 0.83 -0.11 0.77 0.83 0.47 -4.1 -0.01 -1.29 -1.18 -0.12 -0.53
-1.25 -0.21 0.07 0.21 0.57 0.94 0.89 0.76 0.56 0.26 -0.04 -0.41 -1.53 -0.43 -0.44 -0.52 0.26 0.69 0.31 0.76 -6.28 -0.36 -2.28 -1.51 -0.38 -0.39
-3.8 -0.92 -0.22 0.12 0.61 0.88 0.72 0.64 0.79 0.68 0.51 0.47 -4.47 -0.07 -0.26 -0.14 -0.16 -0.08 -0.29 -0.13 -4.97 -0.69 -0.36 0.04 -0.29 0.19
-1.33 -0.48 0.3 0.47 0.78 1.05 0.82 0.62 0.78 0.58 0.38 -0.02 -1.04 -1.44 -0.63 -0.67 -0.54 0.3 -0.0 0.35 -4.01 -1.43 -0.35 -0.21 -0.42 -0.98
-4.76 -0.96 -0.44 -0.15 0.43 0.52 0.48 0.28 1.18 0.8 0.67 0.25 -3.54 -0.43 0.03 0.09 -0.47 0.39 0.33 0.45 -3.41 -1.21 -0.6 0.1 -0.63 0.23
-2.1 -0.19 0.37 0.9 1.57 1.32 0.88 0.93 1.12 0.69 0.01 -0.62 -3.58 -4.37 -1.87 -4.27 -0.96 0.72 0.37 0.31 -2.73 -3.3 -0.94 -1.16 -1.02 -2.3
-0.72 0.09 0.19 0.39 0.46 0.65 0.56 0.55 0.53 0.34 0.1 -0.16 -0.8 -0.9 -0.33 -0.46 -0.15 0.72 0.55 0.36 -1.92 -0.29 -1.36 -0.61 -0.58 -0.78
-0.59 -0.05 0.28 0.8 0.84 0.68 0.84 1.04 0.7 0.75 0.53 -0.13 -1.47 -1.98 -0.78 -1.47 -0.05 0.3 0.03 0.6 -5.08 -3.24 -1.84 -1.94 -0.15 -0.62
-2.29 -1.04 -0.09 0.33 0.46 0.66 0.96 0.77 0.71 0.65 0.06 -0.52 -1.83 0.18 0.24 0.29 -0.06 0.53 -0.21 -0.09 -2.52 -0.03 -0.49 -1.23 -0.53 -0.87
-3.39 -4.76 -2.98 -1.34 0.25 0.79 1.17 0.45 0.91 0.68 0.25 -0.3 -2.26 0.34 0.47 0.06 0.23 0.34 0.39 0.44 -1.78 -0.66 0.13 -0.13 -0.54 -0.51
-1.99 -0.75 -0.46 -0.12 0.61 1.07 1.29 1.02 0.7 0.44 -0.35 -1.06 -1.96 -0.7 -0.23 -1.04 0.36 0.85 0.55 0.67 -3.99 -0.85 -1.34 -0.95 -0.51 -0.84
-0.22 0.01 -0.33 -0.37 -0.13 0.27 0.6 0.67 0.7 0.6 0.38 0.29 -0.32 -0.47 0.36 -0.4 0.06 0.71 0.56 0.22 -4.03 -1.4 -0.46 -0.78 -0.74 -1.17
-1.03 0.13 0.08 0.24 0.47 0.67 0.56 0.68 0.51 0.43 0.32 0.18 -1.38 -1.4 -0.46 -0.96 -0.0 0.65 0.74 0.38 -4.75 -1.1 -0.07 -0.74 -0.47 -0.63
-3.39 -0.35 0.26 0.79 1.09 0.69 0.94 0.82 0.56 0.67 0.53 0.09 -3.33 -1.94 -0.79 -1.71 -0.49 0.63 0.66 0.19 -6.46 -0.87 -1.6 -1.03 -0.22 -0.43
-0.35 -0.05 -0.15 -0.19 0.18 0.57 0.85 0.68 0.83 0.78 0.62 0.35 -0.47 -0.8 -0.16 -0.42 -0.09 0.3 0.13 0.32 -5.84 -1.63 -0.82 -0.74 -0.77 -0.75
-1.91 -0.16 -0.21 -0.1 0.22 0.34 0.76 0.48 0.85 0.61 0.42 0.22 -2.2 -0.65 0.3 -0.4 0.02 0.95 0.92 0.02 -5.65 -1.22 -0.89 -0.36 -0.4 -1.06
-0.56 -0.08 0.06 0.08 0.39 0.41 0.55 0.46 0.28 0.36 0.27 0.2 -0.35 -0.31 0.25 0.21 0.27 0.8 0.53 0.41 -7.12 -1.4 -1.46 -1.07 -0.96 -0.81
-2.01 -0.53 -0.17 -0.0 0.55 0.78 0.69 0.38 0.6 0.5 0.31 0.07 -1.63 -0.4 -0.01 -0.7 -0.2 0.31 0.4 0.28 -3.82 0.23 0.11 -0.76 -0.12 -0.55
-2.78 -0.65 -0.31 -0.05 0.34 0.43 0.63 0.47 0.57 0.68 0.47 0.19 -2.89 -0.41 -0.35 -0.54 0.43 0.64 0.43 0.75 -4.19 -0.51 -0.85 -0.09 -0.38 -0.06
-2.14 -1.39 -0.55 -0.58 -0.17 0.64 1.02 0.76 0.91 0.52 0.14 -0.21 -2.37 0.02 0.07 0.15 0.24 0.9 0.45 0.41 -3.33 -1.71 -0.11 -0.36 -0.24 -0.91
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-0.3 0.12 0.22 0.26 0.39 0.32 0.36 0.36 0.57 0.44 0.34 0.21 -0.29 -0.41 -0.04 -0.1 -0.29 0.39 0.2 0.13 -2.07 -0.48 -0.53 -0.37 -0.79 -0.99
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-2.66 -3.95 -2.64 -1.06 0.57 1.12 0.87 0.61 0.78 0.92 0.24 -0.81 -2.23 -0.71 0.02 -1.21 0.08 1.43 1.07 1.32 -4.87 -0.88 -1.42 -1.74 -0.89 -1.52
-0.28 0.29 0.17 0.05 0.68 0.82 0.35 0.38 0.15 0.1 -0.23 -0.12 -0.48 -0.13 0.27 0.07 0.19 0.22 0.48 0.24 -4.11 -3.74 -0.09 -0.25 -0.83 -0.61
-0.17 0.17 0.28 0.4 0.46 0.73 0.49 0.58 0.64 0.32 -0.05 -0.26 -0.54 -0.51 -0.71 -0.65 -0.65 0.48 0.54 0.14 -4.17 -0.54 -0.53 -0.81 -0.64 0.07
-0.52 0.45 0.54 0.44 0.56 0.78 0.61 0.52 0.5 0.2 0.02 -0.4 -0.85 -0.97 0.33 -0.43 0.12 0.5 0.75 0.53 -5.96 -1.44 -1.93 -1.49 -1.08 -1.06
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-1.0 -0.17 0.24 0.05 0.09 0.09 0.21 0.08 0.55 0.63 0.39 0.35 -0.73 -0.24 0.04 -0.23 0.0 0.22 0.51 0.32 -5.56 -0.17 -0.32 -0.31 -0.13 -0.22
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-0.32 0.18 0.16 0.15 0.35 0.14 0.47 0.38 0.28 0.4 0.28 0.12 -0.84 -0.37 0.1 -0.27 0.3 0.62 0.42 0.62 -6.11 -1.47 -0.64 -0.49 -0.56 -0.64
-1.77 -1.71 -0.36 0.61 0.87 1.24 0.89 0.57 0.47 0.31 -0.07 -0.49 -1.4 -0.42 -0.35 -0.31 0.17 0.37 0.14 0.1 -3.62 0.1 -1.13 -0.96 -0.0 -0.24
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-1.43 -0.51 -0.51 0.18 0.35 0.28 0.3 0.14 0.37 0.35 0.38 0.25 -1.39 -0.53 -0.2 -0.4 -0.44 0.57 0.13 0.01 -1.86 -0.07 0.72 0.39 -0.04 0.08
-3.43 -1.32 -0.22 0.18 0.09 0.22 0.53 0.55 0.77 0.96 0.74 0.34 -2.72 -1.36 -0.6 -1.12 0.09 0.71 0.8 0.64 -4.09 -1.48 -0.24 0.05 -0.09 -0.16
-0.56 0.01 0.1 0.13 0.04 -0.25 0.29 0.2 0.37 0.49 0.22 -0.01 -0.58 0.08 -0.17 0.17 0.15 0.6 0.57 0.74 -4.27 -0.21 -0.96 -0.94 -0.34 -0.31
-0.0 0.05 0.18 0.05 0.38 0.62 0.48 0.41 0.64 0.45 0.4 0.3 0.11 -0.35 0.06 -0.12 -0.04 0.25 0.28 0.28 -4.42 -1.24 -1.3 -1.09 -0.97 -0.99
-0.11 0.07 -0.11 -0.2 0.09 0.2 0.34 0.25 0.39 0.22 0.12 0.03 -0.5 0.14 0.1 0.18 0.3 0.45 0.54 0.39 -3.46 -0.55 -0.43 -0.17 -0.64 -0.81
-3.0 -0.93 -0.17 -0.03 0.68 1.0 0.69 0.52 0.85 0.88 0.76 0.45 -1.93 -0.27 -0.49 -0.14 -0.15 -0.01 -0.07 0.28 -4.35 -2.42 -0.23 -0.05 -0.67 -0.58
-0.86 0.28 -0.04 0.44 0.74 0.44 0.57 0.54 0.51 0.34 0.15 -0.36 -0.92 -0.23 0.08 -0.4 -0.25 0.46 0.44 0.33 -5.47 -0.85 -1.31 -0.7 0.04 -0.46
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-3.57 -0.97 -0.01 0.32 0.75 0.67 0.94 0.48 0.85 0.82 0.35 0.0 -4.01 -1.22 -0.6 -0.64 0.11 1.1 0.67 0.74 -1.32 -0.9 -0.74 -1.24 -1.9 -2.14
-0.14 -0.47 -0.37 0.36 0.78 1.22 1.52 1.33 1.08 0.03 -0.58 -1.19 -1.11 -2.28 -1.65 -2.05 0.07 0.26 0.13 0.33 -1.93 -1.6 -1.2 -3.23 0.21 -0.88
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-1.18 0.01 0.18 0.38 0.52 0.54 0.55 0.68 0.68 0.65 0.31 0.0 -1.27 -0.53 0.04 -0.56 -0.24 0.28 0.51 0.21 -5.02 -1.94 -0.29 -0.87 -0.38 -0.19
-3.02 -4.24 -0.41 0.26 0.39 0.62 0.78 0.74 1.05 0.89 0.75 0.5 -1.92 -0.07 -0.25 -0.14 -0.05 -0.05 0.0 0.12 -3.08 -0.26 -0.92 -0.45 -0.7 -0.29
-0.38 -0.05 0.04 0.09 0.36 0.66 0.57 0.42 0.63 0.37 0.12 -0.05 -0.57 -0.62 0.06 -0.35 0.17 0.4 0.46 0.46 -4.67 -0.18 -1.62 -1.0 -0.46 -0.39
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-1.19 0.25 0.44 0.2 0.15 0.17 0.29 0.42 0.36 0.7 0.41 0.2 -1.14 -1.33 -0.49 -0.9 0.01 1.08 0.66 0.65 -4.89 -1.59 -1.17 -0.64 -0.15 -0.05
-1.08 0.32 0.53 0.24 0.03 -0.15 0.49 0.56 0.36 0.69 0.4 0.24 -1.35 -1.15 -0.57 -0.78 0.13 0.87 0.33 0.86 -6.02 -1.6 -0.8 -0.27 -0.26 -0.36
-0.62 -0.43 0.02 -0.01 0.14 -0.08 0.38 0.41 0.52 0.49 0.52 0.34 -1.47 -0.03 0.15 0.08 0.4 0.18 0.2 0.24 -2.65 -0.94 0.03 -0.12 -0.51 -0.39

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.