Heatmap: Cluster_214 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.64 0.53 0.45 0.63 0.68 0.57 0.79 0.77 0.73 0.62 0.57 0.42 0.52 0.44 0.41 0.45 0.47 0.64 0.49 0.39 0.14 0.73 1.0 0.53 0.94 0.52
0.39 0.42 0.34 0.47 0.47 0.51 0.49 0.48 0.5 0.47 0.53 0.44 0.34 0.45 0.4 0.41 0.39 0.67 0.52 0.35 0.09 1.0 0.87 0.87 0.92 0.85
0.46 0.43 0.37 0.5 0.52 0.46 0.49 0.5 0.59 0.54 0.75 0.51 0.31 0.27 0.28 0.23 0.27 0.37 0.35 0.3 0.06 0.67 1.0 0.79 0.91 0.55
0.15 0.36 0.39 0.72 0.67 0.53 0.58 0.72 0.78 0.7 0.88 0.7 0.11 0.26 0.34 0.25 0.38 0.86 0.56 0.39 0.04 1.0 0.95 0.52 0.72 0.67
0.07 0.04 0.05 0.17 0.16 0.07 0.13 0.14 0.3 0.39 0.45 0.26 0.12 0.06 0.05 0.1 0.03 0.2 0.13 0.12 0.1 0.67 1.0 0.68 0.45 0.5
0.35 0.29 0.29 0.44 0.52 0.47 0.53 0.58 0.58 0.56 0.66 0.51 0.28 0.29 0.23 0.29 0.3 0.47 0.41 0.28 0.21 0.93 1.0 0.54 0.65 0.45
0.43 0.31 0.27 0.41 0.39 0.33 0.54 0.66 0.68 0.71 0.84 0.58 0.38 0.19 0.27 0.45 0.3 0.54 0.46 0.29 0.17 0.95 1.0 0.64 0.82 0.52
0.77 0.5 0.36 0.36 0.28 0.29 0.55 0.7 0.77 0.75 0.76 0.67 0.69 0.37 0.33 0.43 0.35 0.42 0.43 0.37 0.2 0.91 1.0 0.74 0.94 0.68
0.29 0.44 0.38 0.55 0.52 0.49 0.59 0.7 0.91 0.93 1.0 0.78 0.36 0.18 0.18 0.12 0.29 0.49 0.39 0.33 0.01 0.55 0.55 0.34 0.57 0.29
0.34 0.12 0.14 0.42 0.38 0.24 0.41 0.55 0.66 0.8 1.0 0.71 0.36 0.17 0.09 0.15 0.12 0.33 0.17 0.16 0.01 0.92 0.64 0.69 0.81 0.52
0.36 0.2 0.16 0.34 0.35 0.21 0.34 0.36 0.41 0.41 0.65 0.47 0.21 0.18 0.26 0.27 0.28 0.27 0.2 0.19 0.19 0.79 0.63 1.0 0.69 0.45
0.04 0.09 0.22 0.63 0.68 0.44 0.5 0.64 0.86 0.82 1.0 0.72 0.06 0.19 0.17 0.19 0.17 0.17 0.19 0.15 0.1 0.8 0.73 0.82 0.95 0.54
0.44 0.43 0.51 0.55 0.6 0.47 0.48 0.58 0.6 0.63 0.78 0.6 0.58 0.37 0.29 0.23 0.33 0.4 0.38 0.42 0.12 0.73 0.9 0.66 1.0 0.72
0.25 0.22 0.17 0.48 0.51 0.32 0.41 0.58 0.45 0.45 0.52 0.33 0.14 0.22 0.16 0.18 0.24 0.38 0.28 0.24 0.11 1.0 0.83 0.75 0.99 0.52
0.62 0.47 0.49 0.63 0.77 0.76 0.82 0.9 0.72 0.8 0.82 0.72 0.62 0.48 0.34 0.46 0.39 0.68 0.58 0.53 0.18 0.84 1.0 0.73 0.87 0.75
0.56 0.24 0.17 0.26 0.43 0.08 0.45 0.37 0.54 0.49 0.8 0.42 0.34 0.09 0.09 0.13 0.05 0.31 0.15 0.09 0.12 0.8 0.98 0.87 1.0 0.49
0.46 0.29 0.27 0.6 0.37 0.36 0.44 0.48 0.45 0.5 0.56 0.44 0.18 0.26 0.25 0.26 0.22 0.27 0.26 0.26 0.2 0.54 1.0 0.6 0.67 0.34
0.2 0.32 0.32 0.52 0.7 0.47 0.6 0.68 0.66 0.54 0.61 0.46 0.05 0.29 0.35 0.25 0.31 0.65 0.53 0.42 0.19 0.93 1.0 0.65 0.86 0.63
0.38 0.24 0.23 0.33 0.23 0.16 0.29 0.38 0.41 0.44 0.64 0.47 0.29 0.16 0.11 0.15 0.14 0.28 0.15 0.13 0.06 0.87 1.0 0.76 0.73 0.56
0.53 0.4 0.41 0.7 0.55 0.3 0.53 0.74 0.7 0.74 1.0 0.78 0.52 0.36 0.4 0.35 0.39 0.48 0.44 0.34 0.07 0.55 0.7 0.57 0.68 0.64
0.36 0.26 0.29 0.54 0.53 0.45 0.8 0.61 0.91 0.83 1.0 0.7 0.27 0.25 0.18 0.35 0.25 0.26 0.2 0.24 0.06 0.78 0.42 0.49 0.5 0.36
0.36 0.22 0.24 0.51 0.59 0.37 0.48 0.6 0.65 0.68 0.68 0.43 0.32 0.21 0.23 0.24 0.18 0.28 0.28 0.22 0.09 1.0 0.83 0.99 0.81 0.53
0.26 0.21 0.19 0.32 0.35 0.29 0.25 0.23 0.29 0.31 0.38 0.33 0.19 0.17 0.12 0.2 0.11 0.27 0.18 0.17 0.03 0.46 1.0 0.37 0.77 0.41
0.25 0.25 0.27 0.4 0.48 0.41 0.47 0.46 0.54 0.46 0.47 0.44 0.26 0.45 0.37 0.43 0.3 0.49 0.3 0.28 0.11 1.0 0.77 0.65 0.87 0.53
0.36 0.46 0.43 0.51 0.5 0.61 0.61 0.67 0.74 0.6 0.52 0.47 0.25 0.22 0.29 0.27 0.32 0.8 0.59 0.45 0.05 1.0 0.76 0.49 0.72 0.66
0.33 0.15 0.08 0.31 0.21 0.13 0.25 0.3 0.37 0.39 0.54 0.37 0.28 0.2 0.16 0.21 0.13 0.17 0.13 0.11 0.2 0.63 1.0 0.66 0.91 0.39
0.46 0.35 0.38 0.55 0.45 0.35 0.47 0.6 0.54 0.56 0.73 0.57 0.41 0.27 0.25 0.21 0.3 0.62 0.38 0.29 0.11 1.0 0.96 0.62 0.9 0.58
0.6 0.28 0.21 0.61 0.51 0.31 0.41 0.44 0.41 0.4 0.58 0.46 0.5 0.1 0.16 0.15 0.16 0.29 0.16 0.17 0.04 0.93 1.0 0.67 0.91 0.4
0.35 0.38 0.37 0.54 0.57 0.44 0.66 0.77 0.86 0.98 1.0 0.8 0.28 0.19 0.17 0.19 0.23 0.35 0.28 0.27 0.05 0.82 0.6 0.6 0.59 0.46
0.37 0.37 0.3 0.54 0.57 0.57 0.61 0.63 0.87 0.82 1.0 0.8 0.36 0.39 0.32 0.31 0.3 0.45 0.39 0.32 0.04 0.64 0.64 0.54 0.62 0.57
0.27 0.26 0.21 0.32 0.35 0.22 0.41 0.56 0.69 0.61 0.81 0.61 0.16 0.15 0.16 0.14 0.13 0.38 0.21 0.19 0.01 1.0 0.51 0.76 0.7 0.52
0.05 0.03 0.12 0.34 0.39 0.22 0.26 0.42 0.4 0.3 0.68 0.26 0.03 0.04 0.09 0.06 0.0 0.27 0.13 0.08 0.04 0.98 0.7 1.0 0.74 0.45
0.49 0.46 0.34 0.44 0.54 0.41 0.58 0.57 0.53 0.54 0.49 0.36 0.28 0.33 0.34 0.37 0.38 0.48 0.42 0.38 0.06 1.0 0.93 0.56 0.93 0.56
0.41 0.45 0.32 0.42 0.53 0.41 0.49 0.48 0.59 0.51 0.53 0.54 0.29 0.31 0.33 0.29 0.33 0.43 0.45 0.3 0.15 0.76 1.0 0.46 0.75 0.42
0.1 0.24 0.26 0.51 0.55 0.4 0.52 0.6 0.66 0.59 0.68 0.45 0.09 0.25 0.28 0.26 0.28 0.46 0.39 0.29 0.06 1.0 0.93 0.57 0.82 0.57
0.34 0.26 0.3 0.44 0.56 0.34 0.38 0.44 0.53 0.47 0.5 0.44 0.32 0.26 0.26 0.39 0.21 0.46 0.39 0.36 0.23 1.0 0.76 0.73 0.99 0.63
0.37 0.2 0.18 0.33 0.37 0.35 0.59 0.76 0.84 0.78 1.0 0.7 0.33 0.35 0.28 0.36 0.24 0.42 0.33 0.22 0.07 0.92 0.88 0.55 0.83 0.47
0.2 0.18 0.22 0.4 0.46 0.32 0.5 0.49 0.45 0.43 0.47 0.39 0.18 0.16 0.16 0.17 0.16 0.34 0.22 0.23 0.05 1.0 0.79 0.67 0.75 0.51
0.24 0.22 0.19 0.33 0.42 0.33 0.28 0.34 0.37 0.29 0.29 0.33 0.22 0.23 0.2 0.19 0.13 0.28 0.16 0.1 0.16 0.55 1.0 0.26 0.6 0.4
0.24 0.13 0.17 0.36 0.46 0.32 0.52 0.53 0.61 0.55 0.67 0.53 0.29 0.16 0.14 0.14 0.15 0.27 0.2 0.13 0.08 1.0 0.8 0.59 0.86 0.48
0.33 0.15 0.24 0.35 0.28 0.18 0.12 0.23 0.3 0.31 0.49 0.45 0.26 0.11 0.09 0.14 0.06 0.26 0.05 0.07 0.15 0.46 1.0 0.56 0.9 0.54
0.48 0.46 0.56 0.68 0.63 0.62 0.69 0.63 0.61 0.55 0.56 0.53 0.35 0.45 0.46 0.43 0.41 0.49 0.44 0.48 0.11 1.0 0.87 0.64 0.92 0.78
0.51 0.52 0.46 0.63 0.67 0.5 0.71 0.82 0.75 0.63 0.59 0.45 0.49 0.31 0.27 0.28 0.34 0.44 0.34 0.34 0.08 1.0 0.95 0.6 0.82 0.67
0.77 0.46 0.41 0.51 0.4 0.23 0.43 0.53 0.45 0.48 0.59 0.61 0.76 0.29 0.25 0.38 0.27 0.36 0.3 0.28 0.12 0.85 1.0 0.64 0.8 0.78
0.3 0.31 0.33 0.48 0.51 0.52 0.58 0.59 0.43 0.33 0.37 0.38 0.19 0.2 0.21 0.28 0.23 0.43 0.34 0.31 0.08 0.91 1.0 0.45 0.74 0.66
0.52 0.35 0.31 0.45 0.44 0.39 0.48 0.5 0.48 0.48 0.52 0.47 0.48 0.34 0.29 0.33 0.38 0.35 0.32 0.31 0.1 0.6 1.0 0.39 0.64 0.47

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)