Heatmap: Cluster_178 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.6 -0.05 -0.22 0.17 0.63 0.33 0.44 0.46 0.26 0.17 0.08 -0.06 0.63 -0.49 -0.21 0.15 -0.1 -0.02 -0.13 -0.15 -4.31 -1.19 0.13 -0.64 -0.6 -0.31
0.17 -0.12 0.2 0.39 0.49 0.56 0.48 0.47 0.58 0.48 0.34 0.22 0.22 -1.35 -1.01 -0.77 -0.71 -0.26 -0.34 -0.29 -1.07 -0.19 0.16 -0.26 -0.45 -0.38
-0.98 0.04 0.41 0.6 0.74 0.52 0.1 0.33 0.51 0.03 0.32 0.27 -1.27 -0.63 -0.9 -0.47 -0.65 -0.6 -0.64 -0.27 -1.26 -1.21 1.06 0.38 0.04 -0.09
0.71 0.23 -0.05 0.0 0.18 0.45 0.38 0.48 0.2 0.17 0.33 0.67 0.69 -0.76 -0.52 -0.64 -0.38 -0.11 0.02 0.13 -5.3 -1.17 -0.15 -0.47 -0.47 -0.43
0.28 0.12 -0.0 -0.08 0.14 0.68 0.68 0.69 0.78 0.64 0.53 0.28 0.13 -0.59 -0.29 -0.9 -0.44 -0.48 -0.19 -0.07 -4.73 -0.99 -0.16 -0.75 -0.29 -0.58
1.08 0.32 0.13 0.25 0.68 0.61 1.27 1.3 1.1 1.33 1.24 1.45 1.05 -4.69 -4.92 - -3.15 -4.44 -4.88 -3.75 -4.02 -3.92 -4.63 - -4.87 -
0.26 0.05 -0.26 -0.34 -0.09 0.68 0.71 0.72 0.87 0.69 0.71 0.67 -0.05 -1.11 -0.85 -1.4 -0.67 -0.39 -0.83 -0.16 -2.62 -1.01 0.1 -0.16 0.11 -0.43
0.5 0.0 0.07 0.52 0.38 0.16 0.28 0.32 0.46 0.23 0.6 0.3 0.19 -0.38 -0.34 -0.52 -0.62 -0.23 -0.27 -0.46 -2.58 -1.43 0.2 0.32 -0.18 -0.62
0.09 0.04 0.22 0.06 0.44 0.38 0.32 0.3 0.69 0.51 0.33 0.48 0.23 -0.46 -0.67 -0.47 -0.57 0.28 0.47 -0.03 -3.02 0.24 -0.42 -1.54 -1.06 -1.03
0.58 -0.12 -0.12 -0.09 0.73 0.59 0.24 0.48 0.56 0.52 0.25 1.08 0.86 -0.51 -1.81 -2.35 -1.13 -0.23 -0.67 -1.78 -1.91 0.02 0.66 -1.23 -0.94 -0.45
0.39 0.39 0.23 0.37 0.28 0.58 0.47 0.61 0.72 0.4 0.32 0.22 0.55 -0.92 -0.88 -0.71 -0.65 0.38 0.43 0.29 -5.71 -0.59 -1.64 -1.59 -1.02 -1.22
0.26 -0.14 -0.07 0.23 0.44 0.58 0.6 0.51 0.59 0.29 0.17 -0.07 0.15 -0.27 -0.38 -0.13 -0.2 -0.21 -0.26 -0.22 -3.49 -1.06 0.63 -0.86 -0.19 -0.75
0.28 0.25 0.02 -0.02 0.06 0.51 0.86 0.61 0.6 0.3 0.13 -0.04 0.47 -0.67 -0.79 -0.41 -0.53 0.05 -0.18 -0.09 -3.84 -0.9 -0.06 -0.23 -0.53 -0.06
-0.09 -0.09 0.08 0.33 0.49 0.56 0.58 0.59 0.7 0.3 0.36 0.24 -0.13 -1.02 -0.83 -0.79 -0.47 -0.21 -0.51 -0.37 -1.6 -0.08 0.57 -0.18 -0.39 -0.76
0.3 0.51 0.26 0.06 0.24 0.57 0.55 0.47 0.4 0.25 0.04 0.09 0.16 -0.86 -0.17 -0.41 0.05 0.29 0.29 0.17 -1.95 -1.35 -0.36 -0.46 -1.05 -1.12
-1.55 -0.97 -0.21 0.11 0.57 0.54 0.61 0.55 0.69 0.73 0.72 0.19 -1.4 -0.61 -0.12 -0.43 -0.57 0.02 0.2 -0.21 -4.53 -0.64 0.56 -0.11 0.04 -0.5
-0.5 0.14 0.26 0.58 0.3 0.15 0.28 0.52 0.41 0.41 0.41 0.22 -0.44 -0.66 -0.85 -0.49 -0.6 -0.14 -0.47 -0.54 -1.32 -0.45 0.58 -0.29 0.61 -0.41
0.06 0.53 0.53 0.36 0.46 0.23 0.45 0.61 0.47 0.31 0.27 0.07 -0.73 -0.64 0.05 -0.93 -0.25 0.53 0.57 0.32 -6.38 -1.85 -0.46 -1.08 -0.74 -0.85
-0.27 0.06 0.13 0.03 0.33 0.85 0.6 0.51 0.58 0.43 0.39 0.21 -0.15 -0.8 -0.33 -0.37 -0.14 -0.39 -0.16 0.0 -3.53 -0.43 -0.15 0.04 -0.25 -1.04
0.75 0.46 0.16 0.05 0.41 0.84 0.76 0.69 0.86 0.52 0.51 0.4 0.61 -0.79 -1.01 -0.95 -0.69 -0.76 -0.83 -0.59 -2.82 -0.85 -1.04 -1.31 -0.55 -0.86
-0.25 -0.18 0.54 0.68 0.47 0.96 0.6 0.77 0.95 0.09 0.14 -0.14 -0.35 -0.23 -0.39 -0.34 -0.51 -0.36 -0.05 -0.51 -2.66 -1.4 0.03 -1.48 -0.56 -0.51
0.21 0.4 0.28 0.18 0.43 0.67 0.97 0.83 0.84 0.62 0.46 0.39 0.17 -2.9 -1.32 -2.28 -0.15 0.48 0.13 0.53 -5.34 -3.16 -1.48 -1.22 -0.9 -1.52
0.29 0.63 0.28 0.17 0.49 0.81 0.69 0.63 0.66 0.33 0.25 0.13 0.13 -1.95 -0.81 -1.24 -0.73 0.18 0.01 -0.29 -3.48 -0.49 -0.63 -0.43 -0.19 -1.11
0.28 0.12 0.01 0.16 0.65 0.83 0.77 0.65 0.34 0.06 -0.1 -0.43 0.0 -0.9 -0.16 -0.66 0.11 0.34 0.24 0.3 -2.06 -0.58 -1.14 -1.18 -0.45 -0.66
0.02 0.66 0.48 1.08 1.09 0.63 0.28 0.17 0.23 -0.04 0.3 0.24 -0.64 -1.66 -1.78 -1.29 -1.39 -1.15 -0.54 -1.36 -3.61 -1.0 1.7 -0.8 -0.16 -1.13
0.25 0.65 0.39 0.44 0.73 0.65 0.58 0.62 0.69 0.47 0.53 0.19 0.21 -1.83 -0.9 -1.18 -0.58 -0.05 -0.02 -0.26 -3.37 -0.08 -1.74 -0.71 -0.93 -1.37
0.21 0.14 0.04 0.16 0.6 0.95 0.81 0.81 0.46 0.34 0.08 -0.19 -0.18 -1.63 -0.6 -0.94 -0.28 0.31 0.57 0.35 -5.11 -0.34 -1.32 -1.13 -0.41 -1.17
0.24 0.09 -0.06 0.01 0.21 0.85 0.7 0.65 0.74 0.42 0.28 0.5 0.14 -0.67 -0.82 -0.36 -0.71 -0.56 -0.15 -0.45 -3.16 -1.48 0.31 -0.34 -0.39 -0.43
0.16 0.4 0.02 0.24 0.6 0.56 0.54 0.36 0.57 0.59 0.81 0.61 0.13 -0.72 -0.45 -0.93 -0.24 -0.67 -0.16 -0.11 -3.71 -1.91 -0.84 -0.23 -0.35 -0.8
-0.63 0.2 0.06 0.48 0.48 0.78 0.59 0.72 0.92 0.33 0.58 0.26 -1.24 -0.49 -0.03 -0.69 -0.06 -0.42 0.21 0.35 -6.37 -2.18 -1.17 -1.22 -0.2 -0.31
0.27 -0.14 0.06 0.24 0.43 0.25 0.26 0.21 0.14 0.02 0.2 0.01 -0.01 -0.45 -0.11 -0.16 0.07 0.15 -0.02 -0.22 -1.31 -0.6 0.54 -0.77 -0.0 -0.25
-0.97 0.1 0.33 0.5 0.62 0.81 0.42 0.31 0.45 0.18 0.18 0.22 -1.09 -0.3 -0.39 -0.39 -0.48 -0.23 0.26 -0.23 -6.48 -0.54 0.7 -0.54 -0.14 -0.41
0.17 0.14 0.04 0.09 0.43 0.62 0.47 0.49 0.54 0.12 0.26 0.24 -0.16 -0.42 -0.38 -0.05 -0.33 -0.04 0.02 0.06 -2.93 -1.06 -0.35 0.16 -0.9 -0.26
-0.61 -0.06 0.13 0.4 0.51 0.28 0.38 0.53 0.58 0.6 0.59 0.47 -0.78 -0.26 -0.34 -0.48 -0.27 -0.15 -0.12 -0.24 -5.19 -1.44 0.38 -0.1 -0.2 -0.42
-0.28 0.1 -0.2 0.11 0.2 0.13 0.24 0.37 0.19 0.22 0.79 0.58 -0.21 -1.22 -0.4 -0.55 -0.86 -0.2 -0.2 -0.69 -4.14 0.46 0.88 -0.09 0.34 -0.33
-0.6 0.19 0.27 0.18 0.43 0.67 0.64 0.56 0.83 0.59 0.65 0.46 -1.24 -1.9 -0.76 -1.13 -0.44 -0.18 0.06 -0.06 -2.99 0.01 -0.12 0.33 -1.06 -1.03
0.34 -0.01 -0.03 0.47 0.53 0.52 0.61 0.47 0.44 0.11 -0.01 -0.37 -0.02 -0.97 -0.95 -0.78 -0.38 -0.09 0.04 -0.19 -2.54 -0.67 0.95 -0.51 -0.04 -0.37
0.49 -0.14 -0.07 -0.03 0.19 0.41 0.42 0.38 0.43 0.48 0.58 0.76 1.05 -0.36 -0.7 -0.27 -0.27 0.13 -0.1 0.05 -4.31 -1.72 -1.17 -0.94 -0.59 -0.85
-0.27 0.27 0.33 0.25 0.53 0.39 0.66 0.69 0.54 0.06 -0.03 -0.09 -0.37 -1.13 0.18 -0.58 0.04 0.38 0.95 0.15 -4.12 -2.51 -1.28 -0.16 -0.57 -0.9
0.27 -0.5 -0.81 -0.39 0.25 0.78 1.21 1.3 1.48 0.59 0.48 0.04 -0.46 -1.97 -2.21 -2.58 -1.14 -0.27 -0.15 -0.4 -4.05 -1.42 -0.34 0.14 0.43 -1.39
-0.61 0.25 0.45 0.59 0.48 0.57 0.46 0.63 0.45 -0.13 -0.02 -0.31 -1.21 -1.18 -1.43 -0.54 -0.34 -0.09 -0.3 0.07 -3.12 -0.48 1.14 -0.89 0.39 0.03
-0.74 0.3 0.45 0.5 0.54 0.53 0.31 0.48 0.11 0.12 0.12 0.07 -1.28 -0.81 -0.35 -0.48 -0.39 -0.09 -0.13 -0.18 -1.38 -0.27 1.04 -0.41 -0.26 -0.53
-0.29 0.57 0.5 0.63 0.5 0.25 0.55 0.67 0.39 0.5 0.31 0.21 -0.35 -1.4 -1.08 -1.48 -0.76 -0.02 -0.02 -0.11 -2.6 -0.91 0.66 -1.06 0.1 -0.66
-0.22 -0.11 -0.33 -0.07 0.28 0.62 0.8 0.67 0.87 0.53 0.2 -0.41 -0.38 -1.67 -0.48 -0.8 -0.57 -0.16 0.04 -0.01 -2.2 -1.02 1.17 -0.33 -0.15 -0.75
0.16 -0.27 -0.2 -0.06 0.32 0.75 0.84 0.7 0.7 0.26 0.45 0.24 0.21 -1.11 -0.83 -0.95 -0.02 -0.16 -0.47 0.04 -4.1 -2.99 -0.32 0.25 0.14 -0.16
0.59 0.09 -0.26 -0.09 0.32 0.78 0.99 0.89 0.83 0.63 0.34 0.05 0.38 -0.98 -0.72 -0.97 -0.76 0.09 -0.24 -0.86 -3.73 -1.09 -0.43 -0.7 -0.53 -0.66
-1.58 0.25 0.07 0.61 0.73 0.64 0.7 0.73 0.63 0.82 0.6 0.13 -1.56 -1.58 -0.84 -1.6 -0.76 -0.28 -0.09 -0.33 -3.99 -1.07 0.87 -0.08 -0.27 -0.73
0.41 0.05 0.17 0.22 0.39 0.53 0.45 0.46 0.34 0.21 0.17 0.05 0.6 -0.47 -0.42 -0.51 -0.24 -0.04 -0.14 -0.15 -5.31 -1.02 0.22 -0.33 -0.33 -0.55
0.34 0.09 -0.22 0.05 0.48 0.5 0.7 0.61 0.42 0.14 -0.09 -0.39 -0.19 -0.93 -0.24 -0.41 0.1 0.53 0.61 0.52 -5.9 -1.47 -0.59 -0.97 -0.04 -0.57
-0.0 -0.06 0.04 0.63 0.58 0.26 0.55 0.67 0.45 0.38 0.26 -0.22 -0.27 -1.54 -0.74 -0.72 -0.27 0.38 -0.17 -0.07 -3.24 -0.14 0.49 -0.6 -0.05 -0.75
0.5 0.57 0.0 -0.14 0.17 0.58 0.8 0.73 0.68 0.52 0.26 0.09 0.15 -2.15 -1.21 -1.26 -0.18 0.38 0.05 0.38 -4.1 -1.22 -0.07 -0.91 -0.39 -1.17
-0.12 0.5 0.32 0.0 0.14 0.45 0.62 0.65 0.66 0.37 0.15 -0.11 -0.19 -0.22 -0.9 -0.61 -0.43 -0.23 -0.49 -0.2 -2.91 -0.34 -0.02 -0.18 0.26 -0.27
0.28 0.2 -0.03 0.32 0.35 0.37 0.3 0.28 0.59 0.42 0.46 0.54 0.44 -0.52 -0.42 -0.68 -0.44 -0.34 -0.12 -0.23 -5.62 -0.82 0.26 -0.35 -0.66 -0.33
0.41 0.01 0.26 0.12 -0.05 0.37 0.26 0.51 0.74 0.76 0.85 0.68 0.55 -1.59 -1.03 -2.51 -0.89 -0.73 -0.68 -0.09 -2.27 -0.54 0.34 -0.42 -0.33 -0.19
0.16 0.19 -0.19 0.14 0.42 0.41 0.53 0.68 0.79 0.61 0.55 0.57 0.24 -1.16 -0.58 -0.38 -1.06 -0.2 -0.42 -0.39 -4.2 -0.54 -0.47 -0.62 0.09 -0.4
-0.05 0.75 0.49 0.32 0.4 0.58 0.52 0.43 0.39 0.01 0.02 0.08 -0.17 -0.7 -0.59 -0.4 -0.16 0.18 0.57 -0.12 -2.79 -0.97 -0.08 -0.67 -0.95 -0.74
0.1 -0.03 -0.29 -0.27 0.42 0.92 0.61 0.5 0.4 0.14 0.08 0.13 -0.07 -0.7 -0.54 -0.48 -0.44 -0.32 -0.17 -0.46 -1.7 -1.51 1.21 0.24 -0.56 -0.78
-0.81 0.18 0.32 0.37 0.19 0.26 0.24 0.4 0.66 0.55 0.58 0.55 -0.25 -1.1 -0.95 -0.94 -0.55 -0.22 -0.04 -0.49 -2.29 0.14 0.76 -0.14 -0.46 -0.52
0.81 -0.1 -1.07 -0.68 -0.26 0.37 1.09 0.71 0.6 0.16 -0.2 -0.36 0.7 -0.21 -0.37 -0.31 -0.03 0.88 0.35 -0.14 -4.68 -1.02 -0.95 -1.15 -0.05 -0.97
0.48 -0.41 -0.72 -0.23 0.14 0.69 0.75 0.73 0.76 0.43 0.45 0.39 0.5 -1.07 -0.81 -0.61 -0.73 0.66 0.24 -0.12 -2.1 -1.02 -0.52 -1.05 -0.39 -0.88

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.