1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_140 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
3.64 - - - 3.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.08 - -1.62 -0.04 1.76 1.21 1.15 0.45 0.74 -0.12 -0.06 0.06 0.8 0.88 - - -0.65 -1.19 -1.97 - -1.01 -2.02 -1.28 0.6 -1.23 -0.51
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 3.42 - - 3.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.2 2.09 - 0.59 2.21 - - - 2.08 - 0.47 - - - - - 0.74 1.94 1.74 - - - - - - -
2.78 1.23 - - - 1.66 - 1.67 1.77 - - - 2.81 - - - - - - - - - - - - -
- - - - 3.83 - - - - - - - - - - - - - 3.56 - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.26 - - - - - - - - 4.04 - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.92 0.01 1.9 2.04 - 0.46 - - -0.1 - 1.43 - 1.57 1.57 - 1.57 -0.73 - - - -0.38 - - - -
3.38 - - - - - - 2.14 - 1.84 - - - - - - - - - 2.92 - - - - - -
- - - - 4.68 - - -1.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 3.59 2.2 - - - - - - - - - 2.44 - - - 1.98 - - - - - -
2.27 - - - - 0.57 0.76 1.67 0.54 0.47 0.56 1.66 0.45 -0.03 0.47 - - - 0.2 - 0.61 - -0.11 - - -
1.19 1.22 0.06 - - 0.31 0.07 1.08 0.1 1.99 - 0.17 1.45 - - 0.04 - 0.31 0.7 - - 0.66 - - - 0.64
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.18 - -0.99 - - - 2.89 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.55 0.58 -2.29 1.72 0.97 -1.03 -1.54 -0.46 -0.7 0.55 1.47 -0.15 1.56 -0.63 -1.69 -2.39 - -0.7 - -2.76 -1.56 - -0.85 - -4.09 -3.99
- - - - - - - 3.94 - - - - - - - - - - - 3.41 - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.3 - - 2.81 - 2.51 - - - - - - - 1.85 - 2.27 - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.76 - - - - 3.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.58 -0.19 - 0.06 0.46 -1.55 - -0.54 0.86 0.34 -0.63 0.11 2.09 -2.15 -0.07 0.54 -0.36 1.17 -1.64 -1.89 - 1.42 -1.94 -1.66 -2.24 0.48
2.27 - - - 3.28 - - 2.79 - - - - - - - - - - - - - 2.18 - - - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.74 -0.67 -0.85 -0.81 1.22 1.0 -0.71 -0.17 -0.34 0.06 1.23 0.25 -0.45 -0.63 -0.02 -2.45 0.36 0.65 0.94 -1.66 -1.11 -2.69 -0.65 1.08 -0.77 -0.27
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.17 - - - - - - - - - 3.0 - - - - - - - - - - - - - - -
-1.51 0.54 -1.2 -0.19 1.79 -0.12 - 0.27 0.48 -1.32 0.31 - 1.23 - 2.2 - -1.0 1.01 0.74 -0.4 0.13 - -1.58 -1.3 -0.85 -
3.58 - - 1.65 2.99 - - - - - - - - - - - - - 1.56 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.1 1.85 2.1 0.59 1.06 -1.06 - 1.96 -0.95 - 0.44 - 0.34 - 0.84 - -0.84 - - -1.4 - - - - - -
3.82 - - - - - - - - - - - - - - 3.57 - - - - - - - - - -
- - - - 3.31 - - - - - - - 4.01 - - - - - - - - - - - - -
1.67 - 1.53 - - - - - - 3.03 - - - 1.88 - - - - - - - - 0.87 - 0.92 2.11
3.04 - - - 3.09 - - - 1.36 - - - - - - - 2.29 - - - 0.87 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.15 0.98 -0.02 -1.61 1.32 -0.32 0.32 -1.21 - -0.44 -0.72 -2.6 - 0.49 1.41 0.67 1.22 1.68 -0.34 0.96 - -0.23 - -1.17 -3.3 -1.11
3.0 - 1.1 - - - 1.3 1.12 1.23 - - - - - 1.01 0.99 - - - 0.72 - - - - - 1.68
- - - - 1.91 - - 2.1 - 2.12 - - - - 3.04 - - - - - 1.22 - - - 1.6 -
2.18 0.62 1.55 - 0.48 1.11 1.49 - -0.58 1.32 - 0.52 2.36 -0.74 - - - - - - -1.51 - - - - -
0.51 0.3 -1.38 0.06 1.35 -0.01 0.84 - 0.99 -1.65 1.68 0.81 0.43 - -1.69 -1.62 0.93 0.58 0.99 -1.98 - -1.0 - - -2.28 -0.03
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 3.84 - - - - - - - - 3.55 - - - - - - - - - - - -
4.56 - - - - - - - 1.3 - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.79 - - 3.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.21 - - - 3.21 2.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.41 - -
3.78 - - - - - - - - - - - - - - - 3.62 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.47 - 1.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.12 0.58 1.28 -3.03 2.25 0.88 - -2.22 0.71 0.86 0.91 1.58 -1.67 -2.0 1.92 - -1.39 -3.26 -3.46 -3.2 -4.1 -1.15 - - -1.79 -3.61
2.41 - 1.78 - - - - 1.23 - 1.04 0.08 2.21 - -0.48 2.35 - - - - - - - 0.45 - - -
-0.16 1.21 -2.2 0.53 0.31 -2.3 - -1.25 -0.37 0.43 0.34 -0.3 -1.81 -2.37 -1.13 - -0.19 1.43 1.28 -0.19 -0.73 1.58 -0.41 -0.28 -1.56 0.81
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.39 - - 0.01 1.44 - 1.46 1.72 -0.08 1.17 1.18 1.36 - - - -0.09 - 0.26 - - 1.78 - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.