Heatmap: Cluster_146 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.4 0.42 0.44 0.35 0.46 0.63 0.41 0.36 0.42 0.41 0.41 0.38 0.36 0.91 1.0 0.84 0.88 0.58 0.9 0.77 0.87 0.45 0.5 0.58 0.46 0.65
0.24 0.39 0.46 0.49 0.5 0.46 0.51 0.48 0.49 0.48 0.42 0.37 0.26 0.55 0.57 0.59 0.49 0.79 0.65 0.4 0.67 1.0 0.63 0.35 0.25 0.24
0.1 0.19 0.34 0.52 0.37 0.37 0.74 0.66 0.93 0.72 0.54 0.38 0.07 0.52 0.4 0.68 0.37 1.0 0.46 0.46 0.11 0.06 0.62 0.28 0.41 0.37
0.08 0.04 0.03 0.06 0.12 0.31 0.7 0.48 0.52 0.45 0.28 0.16 0.09 1.0 0.48 0.59 0.36 0.3 0.39 0.22 0.22 0.28 0.9 0.53 0.26 0.26
0.28 0.15 0.23 0.19 0.16 0.24 0.34 0.32 0.69 0.38 0.35 0.35 0.29 0.5 0.91 0.64 0.78 0.64 0.76 0.52 0.54 0.5 1.0 0.65 0.56 0.43
0.52 0.36 0.38 0.51 0.48 0.4 0.69 0.69 0.65 0.53 0.53 0.42 0.49 0.93 0.6 0.94 0.66 0.58 0.38 0.39 0.8 0.62 1.0 0.79 0.7 0.61
0.01 0.02 0.02 0.06 0.21 0.41 0.51 0.34 1.0 0.59 0.43 0.33 0.03 0.82 0.44 0.66 0.47 0.39 0.37 0.19 0.42 0.27 0.9 1.0 0.47 0.46
0.1 0.07 0.2 0.29 0.34 0.52 0.8 0.82 0.86 0.67 0.38 0.29 0.1 0.72 0.37 0.87 0.45 1.0 0.49 0.49 0.62 0.44 0.69 0.27 0.58 0.36
0.25 0.35 0.28 0.31 0.31 0.38 0.56 0.56 0.66 0.63 0.58 0.52 0.31 0.87 0.38 1.0 0.31 0.39 0.41 0.31 0.41 0.55 0.74 0.69 0.58 0.46
0.21 0.27 0.29 0.39 0.41 0.38 0.51 0.56 0.82 0.85 0.89 0.81 0.33 0.95 0.92 1.0 0.43 0.57 0.45 0.33 0.85 0.53 0.9 0.75 0.48 0.57
0.05 0.05 0.1 0.22 0.3 0.42 0.52 0.46 0.77 0.61 0.59 0.29 0.04 0.66 0.46 0.5 0.29 0.29 0.24 0.21 0.79 0.23 1.0 0.35 0.46 0.5
0.09 0.16 0.11 0.2 0.26 0.1 0.64 0.78 0.54 0.81 0.09 0.61 0.0 0.36 0.09 0.73 0.31 0.55 0.07 0.13 1.0 0.19 1.0 0.12 0.34 0.4
0.25 0.37 0.39 0.5 0.47 0.36 0.61 0.59 0.57 0.72 0.76 0.68 0.36 0.65 0.62 1.0 0.36 0.63 0.81 0.41 0.87 0.85 0.95 0.73 0.51 0.57
0.3 0.36 0.42 0.64 0.62 0.65 0.74 0.78 1.0 0.93 0.9 0.76 0.36 0.69 0.53 0.71 0.55 0.86 0.64 0.55 0.55 0.24 0.7 0.65 0.64 0.61
0.17 0.13 0.21 0.25 0.25 0.33 0.44 0.31 0.61 0.37 0.33 0.26 0.19 0.63 0.84 0.67 1.0 0.48 0.39 0.3 0.34 0.32 0.85 0.63 0.49 0.36
0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.05 0.03 0.1 0.04 0.04 0.03 0.02 0.75 1.0 0.36 0.1 0.17 0.18 0.04 0.66 0.1 0.25 0.11 0.17 0.1
0.03 0.01 0.01 0.01 0.03 0.16 0.35 0.15 0.84 0.17 0.1 0.07 0.03 0.79 0.79 0.32 0.32 0.15 0.2 0.12 0.16 0.28 1.0 0.55 0.14 0.19
0.41 0.27 0.2 0.26 0.32 0.28 0.31 0.29 0.29 0.37 0.45 0.46 0.45 0.55 0.38 1.0 0.27 0.65 0.51 0.28 0.37 0.48 0.8 0.68 0.31 0.36
0.22 0.18 0.2 0.25 0.21 0.23 0.53 0.37 0.27 0.36 0.21 0.29 0.15 0.63 0.25 0.49 0.31 0.22 0.27 0.31 0.5 0.33 1.0 0.7 0.41 0.44
0.26 0.21 0.24 0.34 0.41 0.32 0.48 0.6 0.47 0.56 0.68 0.6 0.25 0.64 0.36 0.57 0.41 0.39 0.38 0.4 0.7 0.85 1.0 0.46 0.58 0.54
0.14 0.17 0.21 0.3 0.34 0.21 0.42 0.49 0.34 0.41 0.45 0.37 0.24 0.54 0.27 0.58 0.43 0.3 0.32 0.31 0.63 0.52 1.0 0.54 0.45 0.39
0.08 0.14 0.0 0.17 0.12 0.18 0.18 0.3 0.2 0.32 0.28 0.22 0.13 0.3 0.15 0.43 0.3 0.14 0.21 0.23 0.54 0.8 1.0 0.4 0.66 0.45
0.17 0.36 0.39 0.46 0.6 0.58 0.7 0.7 0.79 0.7 0.65 0.56 0.18 0.42 0.44 0.48 0.39 0.57 0.46 0.48 0.87 0.4 1.0 0.54 0.45 0.4
0.22 0.29 0.31 0.37 0.44 0.36 0.45 0.39 0.41 0.53 0.54 0.53 0.18 0.31 0.24 0.96 0.23 0.45 0.4 0.16 0.81 1.0 0.55 0.31 0.72 0.54
0.53 0.53 0.52 0.46 0.53 0.69 0.54 0.49 0.56 0.58 0.53 0.52 0.47 1.0 0.89 0.81 0.85 0.44 0.72 0.73 0.71 0.37 0.51 0.5 0.41 0.45
0.22 0.31 0.32 0.45 0.53 0.51 0.65 0.63 0.81 0.64 0.62 0.51 0.19 0.42 0.4 0.46 0.35 0.68 0.49 0.38 1.0 0.66 0.86 0.64 0.68 0.33
0.05 0.03 0.19 0.41 0.47 0.53 0.88 0.7 0.94 0.66 0.67 0.36 0.07 0.82 0.37 0.55 0.44 0.75 0.44 0.37 0.64 0.17 1.0 0.76 0.53 0.55
0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.08 0.14 0.1 0.3 0.07 0.05 0.02 0.01 0.74 1.0 0.58 0.22 0.21 0.17 0.08 0.84 0.05 0.98 0.15 0.17 0.19
0.16 0.17 0.21 0.29 0.23 0.23 0.4 0.37 0.35 0.3 0.36 0.37 0.22 0.56 0.65 0.84 0.53 0.37 0.29 0.35 0.29 0.05 1.0 0.65 0.43 0.57
0.31 0.2 0.36 0.41 0.51 0.29 0.51 0.48 0.43 0.57 0.7 0.62 0.37 0.72 0.89 0.95 0.52 0.4 0.39 0.36 0.4 0.11 1.0 0.93 0.63 0.76
0.05 0.02 0.04 0.06 0.08 0.31 0.28 0.11 0.36 0.14 0.15 0.16 0.05 0.88 0.62 0.84 0.29 0.19 0.18 0.1 0.22 0.14 1.0 0.72 0.18 0.32
0.24 0.33 0.36 0.44 0.51 0.49 0.49 0.56 0.67 0.72 0.69 0.62 0.31 0.7 0.85 0.82 0.43 0.72 0.58 0.35 0.64 0.94 1.0 0.56 0.37 0.45
0.29 0.35 0.34 0.43 0.62 0.61 0.6 0.6 0.62 0.61 0.56 0.57 0.35 0.39 0.44 0.62 0.41 0.68 0.52 0.41 0.76 0.77 1.0 0.72 0.52 0.55
0.5 0.22 0.21 0.23 0.18 0.16 0.18 0.29 0.26 0.32 0.31 0.31 0.35 1.0 0.43 0.93 0.26 0.38 0.52 0.36 0.12 0.02 0.86 0.62 0.47 0.39
0.29 0.27 0.23 0.25 0.32 0.45 0.59 0.48 0.6 0.41 0.37 0.35 0.25 0.67 0.71 0.75 0.69 0.54 0.46 0.4 0.65 0.36 1.0 0.63 0.32 0.3
0.36 0.21 0.22 0.23 0.25 0.18 0.31 0.29 0.37 0.38 0.47 0.4 0.28 0.23 0.19 0.25 0.29 0.33 0.33 0.29 0.41 1.0 0.95 0.46 0.68 0.65
0.16 0.24 0.34 0.4 0.44 0.46 0.67 0.59 0.68 0.64 0.43 0.35 0.14 0.87 0.66 1.0 0.67 0.86 0.6 0.64 0.56 0.7 0.43 0.3 0.51 0.44
0.2 0.15 0.11 0.23 0.28 0.19 0.23 0.27 0.34 0.43 0.44 0.32 0.26 0.48 0.42 0.64 0.23 0.65 0.32 0.23 0.34 0.8 1.0 0.52 0.29 0.24
0.06 0.15 0.36 0.38 0.57 0.55 0.55 0.48 0.75 0.6 0.79 0.94 0.12 0.44 0.65 0.53 0.57 1.0 0.68 0.5 0.37 0.23 0.97 0.78 0.43 0.56
0.17 0.19 0.2 0.36 0.44 0.33 0.39 0.39 0.32 0.4 0.48 0.37 0.15 0.44 0.23 1.0 0.21 0.31 0.19 0.11 0.77 0.49 0.66 0.34 0.56 0.43
0.52 0.53 0.56 0.49 0.61 0.62 0.58 0.54 0.58 0.67 0.65 0.66 0.6 0.99 1.0 0.94 0.82 0.51 0.78 0.69 0.71 0.45 0.55 0.61 0.35 0.5
0.05 0.01 0.01 0.0 0.07 0.4 0.63 0.25 1.0 0.38 0.29 0.35 0.03 0.71 0.69 0.54 0.38 0.33 0.13 0.16 0.52 0.05 0.91 0.18 0.6 0.33
0.25 0.35 0.35 0.47 0.53 0.51 0.52 0.56 0.77 0.72 0.82 0.69 0.22 0.51 0.52 0.75 0.36 0.67 0.61 0.33 0.5 0.48 0.76 1.0 0.48 0.54
0.44 0.41 0.54 0.59 0.61 0.55 0.85 0.79 0.97 0.86 0.73 0.73 0.4 1.0 0.74 0.95 0.62 0.78 0.56 0.62 0.93 0.9 0.69 0.59 0.77 0.78
0.04 0.15 0.26 0.31 0.43 0.29 0.46 0.39 0.47 0.39 0.41 0.26 0.03 0.37 0.3 0.51 0.39 0.75 0.42 0.39 0.54 0.35 0.79 1.0 0.27 0.35
0.16 0.06 0.09 0.19 0.31 0.39 0.52 0.65 0.71 0.82 0.66 0.6 0.24 0.98 0.39 0.58 0.51 0.64 0.43 0.32 0.31 0.53 0.82 1.0 0.51 0.55
0.02 0.0 0.01 0.02 0.12 0.28 0.33 0.13 0.67 0.49 0.47 0.49 0.03 0.82 0.57 0.39 0.36 0.25 0.16 0.19 0.56 0.7 1.0 0.7 0.32 0.38
0.33 0.45 0.5 0.61 0.56 0.53 0.76 0.72 0.69 0.71 0.57 0.69 0.38 0.67 0.47 0.71 0.38 0.85 0.28 0.33 0.47 0.51 0.67 0.49 1.0 0.68
0.48 0.53 0.47 0.63 0.52 0.28 0.63 0.8 0.6 0.6 0.59 0.46 0.42 0.7 0.67 0.84 0.58 1.0 0.58 0.5 0.89 0.71 0.77 0.89 0.93 0.68
0.39 0.41 0.44 0.36 0.41 0.43 0.4 0.33 0.37 0.45 0.38 0.37 0.35 0.91 1.0 0.74 0.86 0.49 0.76 0.64 0.72 0.34 0.5 0.58 0.39 0.61
0.21 0.14 0.17 0.19 0.21 0.22 0.33 0.33 0.3 0.36 0.39 0.35 0.22 0.77 0.34 1.0 0.26 0.26 0.29 0.26 0.23 0.28 0.93 0.54 0.42 0.41
0.1 0.33 0.44 0.5 0.64 0.68 0.69 0.68 0.83 0.73 0.71 0.64 0.15 0.77 0.72 0.84 0.53 0.74 0.65 0.42 0.75 1.0 0.78 0.65 0.5 0.5
0.03 0.01 0.02 0.02 0.02 0.08 0.21 0.06 0.7 0.33 0.39 0.24 0.04 0.42 0.41 0.21 0.14 0.04 0.04 0.02 0.22 0.56 1.0 0.52 0.17 0.05
0.02 0.01 0.04 0.05 0.09 0.18 0.25 0.16 0.39 0.34 0.36 0.33 0.02 0.77 0.75 0.83 0.55 0.46 0.27 0.27 0.55 0.31 1.0 0.69 0.51 0.5
0.15 0.26 0.25 0.42 0.42 0.35 0.51 0.47 0.51 0.53 0.52 0.5 0.15 0.67 0.45 0.75 0.47 0.49 0.55 0.34 0.82 0.58 1.0 0.86 0.68 0.53
0.19 0.28 0.33 0.49 0.53 0.54 0.68 0.71 0.66 0.8 0.8 0.67 0.19 0.83 0.41 0.95 0.51 0.66 0.41 0.38 1.0 0.76 0.96 0.68 0.8 0.6
0.13 0.24 0.08 0.47 0.53 0.24 0.6 0.63 0.74 0.81 0.74 0.51 0.09 0.72 0.29 0.96 0.44 0.81 0.32 0.4 0.74 0.31 0.96 0.43 1.0 0.56
0.11 0.36 0.31 0.34 0.46 0.43 0.58 0.53 0.64 0.56 0.46 0.41 0.13 0.27 0.66 0.34 0.4 1.0 0.87 0.47 0.74 0.59 0.41 0.61 0.37 0.4
0.19 0.36 0.38 0.5 0.54 0.48 0.59 0.53 0.73 0.75 0.81 0.78 0.28 0.89 0.58 0.86 0.44 0.5 0.43 0.43 0.89 0.33 1.0 0.76 0.71 0.67
0.24 0.26 0.24 0.28 0.35 0.32 0.42 0.4 0.49 0.54 0.57 0.53 0.35 1.0 0.52 0.7 0.38 0.45 0.47 0.45 0.14 0.23 0.99 0.76 0.43 0.5
0.13 0.26 0.38 0.51 0.5 0.46 0.9 0.73 0.8 0.86 0.65 0.55 0.18 0.88 0.62 0.98 0.64 1.0 0.63 0.63 0.42 0.6 0.55 0.62 0.74 0.48
0.57 0.52 0.49 0.43 0.47 0.46 0.53 0.56 0.63 0.78 0.81 0.82 0.68 1.0 0.83 0.76 0.83 0.52 0.52 0.56 0.81 0.48 0.66 0.6 0.46 0.47
0.15 0.19 0.27 0.29 0.25 0.37 0.31 0.44 0.33 0.34 0.35 0.3 0.1 0.28 0.63 0.24 0.24 0.97 0.66 0.24 0.73 1.0 0.39 0.37 0.27 0.5
0.16 0.38 0.38 0.5 0.59 0.57 0.47 0.48 0.57 0.51 0.52 0.46 0.16 0.46 0.81 0.61 0.4 0.93 0.72 0.42 0.74 1.0 0.62 0.73 0.47 0.42
0.15 0.27 0.36 0.45 0.49 0.44 0.71 0.75 0.76 0.77 0.64 0.57 0.17 0.93 0.57 1.0 0.63 0.86 0.55 0.5 0.69 0.82 0.67 0.57 0.57 0.53
0.16 0.21 0.34 0.55 0.62 0.52 0.81 0.81 0.92 0.93 0.7 0.56 0.17 0.7 0.53 0.74 0.61 1.0 0.61 0.59 0.51 0.36 0.63 0.51 0.65 0.55
0.49 0.36 0.39 0.38 0.31 0.3 0.51 0.51 0.48 0.58 0.68 0.53 0.39 0.44 0.3 0.44 0.47 0.62 0.41 0.31 0.59 0.82 0.78 1.0 0.71 0.62
0.07 0.0 0.0 0.0 0.14 0.16 0.22 0.26 0.04 0.49 0.36 0.04 0.0 0.0 0.07 0.28 0.05 0.1 0.08 0.1 0.52 0.61 0.78 0.74 1.0 0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)