Heatmap: Cluster_130 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.1 0.09 0.09 0.15 0.34 0.24 0.15 0.1 0.07 0.07 0.07 0.07 0.09 0.14 0.08 0.2 0.06 0.08 0.09 0.07 0.96 0.73 1.0 0.23 0.16 0.18
0.01 0.04 0.23 0.16 0.18 0.4 0.21 0.28 0.19 0.25 0.16 0.14 0.04 0.23 0.2 0.06 0.15 0.17 0.22 0.05 0.96 1.0 0.3 0.14 0.21 0.21
0.03 0.03 0.02 0.05 0.07 0.04 0.05 0.06 0.06 0.05 0.06 0.04 0.02 0.06 0.05 0.11 0.02 0.08 0.07 0.02 1.0 0.83 0.22 0.23 0.15 0.17
0.02 0.04 0.06 0.08 0.08 0.07 0.07 0.08 0.08 0.07 0.07 0.06 0.03 0.13 0.12 0.06 0.04 0.11 0.11 0.06 0.62 1.0 0.38 0.17 0.1 0.11
0.0 0.11 0.0 0.0 0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.14 0.0 0.08 0.0 0.0 1.0 0.82 0.73 0.0 0.1 0.1
0.15 0.1 0.11 0.18 0.36 0.26 0.14 0.11 0.1 0.08 0.09 0.09 0.12 0.13 0.06 0.22 0.04 0.07 0.07 0.05 1.0 0.62 0.83 0.2 0.16 0.14
0.31 0.19 0.15 0.5 0.6 0.54 0.28 0.29 0.24 0.24 0.4 0.31 0.4 0.11 0.04 0.1 0.04 0.07 0.05 0.07 0.98 0.94 1.0 0.22 0.39 0.35
0.08 0.09 0.12 0.14 0.15 0.12 0.14 0.17 0.17 0.21 0.22 0.19 0.08 0.11 0.11 0.16 0.09 0.13 0.1 0.11 0.54 1.0 0.68 0.35 0.24 0.23
0.18 0.12 0.1 0.34 0.18 0.22 0.28 0.2 0.26 0.36 0.28 0.19 0.13 0.15 0.15 0.14 0.16 0.19 0.14 0.11 0.24 0.87 1.0 0.29 0.59 0.39
0.08 0.12 0.1 0.13 0.15 0.13 0.19 0.23 0.21 0.22 0.19 0.16 0.11 0.16 0.31 0.15 0.15 0.45 0.32 0.23 0.75 1.0 0.39 0.43 0.46 0.46
0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.07 0.03 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.04 0.79 1.0 0.63 0.12 0.17 0.18
0.28 0.18 0.18 0.3 0.28 0.21 0.29 0.35 0.28 0.3 0.35 0.37 0.36 0.24 0.21 0.33 0.15 0.3 0.19 0.13 0.72 1.0 0.58 0.49 0.4 0.41
0.17 0.19 0.2 0.23 0.31 0.33 0.42 0.34 0.28 0.23 0.18 0.15 0.16 0.5 0.42 0.49 0.47 0.52 0.54 0.41 0.84 1.0 0.33 0.34 0.41 0.46
0.16 0.1 0.09 0.12 0.13 0.1 0.15 0.17 0.12 0.12 0.11 0.08 0.14 0.08 0.07 0.07 0.09 0.13 0.12 0.09 0.94 1.0 0.22 0.15 0.2 0.17
0.31 0.28 0.31 0.47 0.32 0.18 0.17 0.22 0.15 0.16 0.2 0.18 0.3 0.22 0.18 0.27 0.13 0.16 0.15 0.1 0.67 1.0 0.21 0.22 0.15 0.19
0.17 0.12 0.13 0.21 0.18 0.09 0.08 0.11 0.09 0.08 0.11 0.1 0.16 0.08 0.05 0.07 0.04 0.05 0.04 0.03 0.55 1.0 0.19 0.19 0.16 0.13
0.08 0.07 0.05 0.09 0.09 0.05 0.07 0.1 0.09 0.08 0.1 0.08 0.1 0.14 0.15 0.21 0.07 0.23 0.14 0.05 0.53 1.0 0.62 0.14 0.11 0.11
0.22 0.19 0.21 0.24 0.27 0.25 0.26 0.27 0.28 0.26 0.27 0.3 0.28 0.38 0.47 0.44 0.28 0.36 0.3 0.22 0.84 1.0 0.38 0.34 0.33 0.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.09 0.32 0.08 0.04 0.1 0.09 0.57 1.0 0.08 0.06 0.16 0.15
0.03 0.03 0.12 0.24 0.28 0.35 0.41 0.21 0.36 0.47 0.53 0.44 0.0 0.11 0.04 0.09 0.29 0.21 0.06 0.07 0.19 1.0 0.9 0.48 0.57 0.61
0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.02 0.03 0.0 0.02 0.13 0.08 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.03 0.02 1.0 0.66 0.42 0.18 0.16 0.07
0.03 0.05 0.02 0.02 0.06 0.06 0.09 0.21 0.14 0.1 0.06 0.19 0.08 0.05 0.04 0.0 0.04 0.1 0.03 0.16 0.8 0.7 1.0 0.11 0.24 0.04
0.0 0.01 0.03 0.09 0.23 0.31 0.27 0.16 0.14 0.07 0.05 0.02 0.0 0.09 0.09 0.09 0.07 0.08 0.07 0.06 0.49 1.0 0.89 0.12 0.18 0.15
0.09 0.03 0.02 0.05 0.05 0.04 0.08 0.03 0.06 0.02 0.04 0.03 0.03 0.09 0.08 0.04 0.02 0.12 0.18 0.08 0.6 1.0 0.26 0.02 0.1 0.2
0.05 0.1 0.08 0.13 0.16 0.16 0.17 0.18 0.13 0.13 0.11 0.06 0.05 0.11 0.1 0.16 0.06 0.2 0.19 0.12 0.63 1.0 0.13 0.16 0.27 0.22
0.28 0.23 0.26 0.3 0.22 0.26 0.24 0.08 0.2 0.11 0.19 0.08 0.36 0.19 0.19 0.09 0.02 0.24 0.14 0.06 1.0 0.44 0.34 0.11 0.25 0.2
0.07 0.08 0.08 0.07 0.08 0.09 0.09 0.08 0.07 0.07 0.05 0.05 0.06 0.13 0.38 0.22 0.14 0.24 0.35 0.14 1.0 0.84 0.24 0.21 0.2 0.21
0.06 0.12 0.17 0.18 0.19 0.14 0.19 0.17 0.22 0.27 0.24 0.22 0.04 0.27 0.49 0.25 0.27 0.58 0.42 0.28 0.71 1.0 0.44 0.37 0.31 0.4
0.05 0.16 0.22 0.23 0.27 0.28 0.27 0.26 0.29 0.3 0.31 0.29 0.03 0.37 0.54 0.34 0.35 0.62 0.58 0.3 0.84 1.0 0.38 0.35 0.34 0.54
0.39 0.53 0.58 0.54 0.46 0.28 0.22 0.23 0.16 0.18 0.18 0.18 0.44 0.31 0.42 0.43 0.32 0.49 0.41 0.23 0.83 1.0 0.57 0.26 0.28 0.36
0.0 0.0 0.1 0.15 0.36 0.37 0.31 0.16 0.34 0.18 0.23 0.19 0.01 0.05 0.12 0.03 0.11 0.23 0.11 0.06 0.19 1.0 0.76 0.19 0.41 0.12
0.24 0.05 0.04 0.1 0.11 0.12 0.15 0.15 0.24 0.23 0.29 0.31 0.24 0.14 0.13 0.15 0.19 0.2 0.14 0.11 0.68 1.0 0.41 0.31 0.55 0.28
0.24 0.21 0.23 0.22 0.23 0.32 0.18 0.17 0.16 0.15 0.13 0.11 0.21 0.43 0.49 0.48 0.32 0.56 0.7 0.3 0.87 1.0 0.48 0.42 0.59 0.67
0.6 0.4 0.28 0.28 0.23 0.2 0.28 0.32 0.31 0.29 0.31 0.34 0.69 0.25 0.51 0.37 0.25 0.55 0.41 0.2 0.87 1.0 0.4 0.34 0.34 0.3
0.09 0.11 0.17 0.42 0.13 0.05 0.07 0.1 0.05 0.05 0.04 0.05 0.08 0.08 0.05 0.07 0.03 0.05 0.05 0.04 1.0 0.9 0.47 0.13 0.24 0.26
0.07 0.05 0.05 0.07 0.07 0.06 0.08 0.07 0.05 0.09 0.08 0.1 0.07 0.09 0.06 0.07 0.05 0.15 0.09 0.06 0.94 1.0 0.28 0.43 0.54 0.33
0.09 0.18 0.15 0.19 0.13 0.1 0.12 0.18 0.16 0.12 0.2 0.18 0.13 0.19 0.19 0.2 0.06 0.35 0.36 0.1 0.33 1.0 0.35 0.14 0.35 0.26
0.09 0.1 0.12 0.14 0.32 0.26 0.13 0.1 0.08 0.06 0.09 0.07 0.12 0.11 0.09 0.27 0.04 0.05 0.09 0.07 1.0 0.56 0.69 0.08 0.08 0.19
0.05 0.06 0.05 0.05 0.05 0.06 0.07 0.09 0.1 0.12 0.13 0.11 0.07 0.07 0.06 0.06 0.08 0.1 0.07 0.07 0.41 1.0 0.75 0.33 0.07 0.09
0.1 0.07 0.14 0.27 0.1 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.09 0.06 0.0 0.0 0.0 1.0 0.54 0.46 0.07 0.12 0.23
0.15 0.13 0.11 0.16 0.19 0.11 0.18 0.15 0.13 0.22 0.2 0.17 0.14 0.21 0.09 0.15 0.2 0.23 0.23 0.1 0.53 1.0 0.37 0.21 0.48 0.31
0.17 0.21 0.22 0.23 0.24 0.24 0.14 0.25 0.22 0.17 0.22 0.19 0.14 0.2 0.16 0.21 0.22 0.25 0.23 0.12 0.4 0.73 1.0 0.21 0.24 0.25
0.29 0.26 0.24 0.28 0.26 0.33 0.27 0.3 0.35 0.34 0.37 0.39 0.31 0.27 0.29 0.35 0.24 0.42 0.33 0.26 0.42 1.0 0.28 0.54 0.26 0.24
0.25 0.17 0.14 0.12 0.07 0.05 0.09 0.15 0.15 0.16 0.21 0.22 0.27 0.25 0.35 0.32 0.22 0.41 0.29 0.15 0.75 1.0 0.5 0.38 0.4 0.34
0.18 0.1 0.1 0.23 0.3 0.15 0.13 0.11 0.09 0.07 0.09 0.09 0.16 0.19 0.1 0.28 0.06 0.09 0.09 0.06 1.0 0.76 0.42 0.23 0.16 0.19
0.07 0.1 0.16 0.28 0.26 0.16 0.2 0.23 0.2 0.23 0.29 0.31 0.08 0.18 0.15 0.17 0.11 0.16 0.11 0.1 0.68 1.0 0.38 0.37 0.41 0.41
0.13 0.17 0.18 0.22 0.3 0.29 0.33 0.29 0.29 0.25 0.26 0.21 0.13 0.23 0.15 0.2 0.16 0.55 0.46 0.18 0.81 1.0 0.25 0.23 0.43 0.34
0.05 0.02 0.03 0.07 0.1 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.03 0.02 0.04 0.09 0.04 0.07 0.01 0.03 0.04 0.02 0.72 1.0 0.2 0.35 0.25 0.2
0.11 0.06 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.1 0.06 0.06 0.03 0.02 0.02 0.03 0.01 0.87 1.0 0.08 0.01 0.03 0.07
0.14 0.04 0.03 0.05 0.01 0.04 0.04 0.02 0.06 0.01 0.06 0.03 0.05 0.01 0.01 0.02 0.0 0.06 0.03 0.01 0.78 1.0 0.22 0.04 0.23 0.23
0.07 0.23 0.35 0.27 0.09 0.09 0.04 0.04 0.0 0.0 0.04 0.09 0.1 0.08 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 1.0 0.68 0.25 0.0 0.03 0.12
0.01 0.03 0.05 0.05 0.05 0.05 0.01 0.06 0.0 0.03 0.04 0.01 0.02 0.08 0.07 0.05 0.06 0.13 0.14 0.01 1.0 0.85 0.41 0.07 0.05 0.07
0.08 0.13 0.13 0.17 0.16 0.15 0.16 0.15 0.2 0.2 0.23 0.18 0.08 0.23 0.2 0.23 0.1 0.17 0.21 0.07 0.79 1.0 0.48 0.43 0.24 0.27
0.08 0.14 0.12 0.15 0.16 0.09 0.1 0.11 0.12 0.09 0.09 0.1 0.1 0.23 0.26 0.23 0.18 0.35 0.26 0.13 0.48 1.0 0.27 0.18 0.29 0.26
0.14 0.13 0.13 0.2 0.42 0.31 0.18 0.12 0.07 0.09 0.09 0.09 0.15 0.16 0.08 0.31 0.06 0.07 0.09 0.07 0.88 1.0 0.74 0.2 0.14 0.18
0.14 0.11 0.12 0.11 0.13 0.14 0.12 0.11 0.17 0.14 0.13 0.24 0.11 0.17 0.19 0.11 0.13 0.28 0.22 0.1 0.49 1.0 0.43 0.2 0.28 0.22
0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.05 0.04 0.03 0.04 0.03 0.03 0.03 0.01 0.07 0.06 0.06 0.04 0.11 0.12 0.04 0.27 1.0 0.19 0.2 0.1 0.15
0.07 0.05 0.05 0.1 0.13 0.11 0.14 0.12 0.11 0.1 0.1 0.09 0.06 0.11 0.1 0.25 0.05 0.15 0.12 0.06 0.73 1.0 0.23 0.24 0.28 0.22
0.08 0.09 0.13 0.11 0.1 0.13 0.17 0.14 0.16 0.26 0.09 0.18 0.07 0.06 0.08 0.04 0.09 0.12 0.16 0.12 0.57 1.0 0.21 0.23 0.07 0.19
0.13 0.1 0.09 0.17 0.37 0.25 0.15 0.1 0.07 0.06 0.08 0.09 0.14 0.13 0.07 0.2 0.05 0.08 0.09 0.05 0.75 1.0 0.73 0.22 0.17 0.18

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)