Heatmap: Cluster_133 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
1.0 0.61 0.36 0.5 0.58 0.73 0.93 0.65 0.6 0.4 0.68 0.86 0.86 0.21 0.36 0.26 0.41 0.59 0.68 0.42 0.64 0.51 0.77 0.04 0.63 0.44
1.0 0.68 0.07 0.66 0.54 0.55 0.35 0.53 0.62 0.68 0.51 0.37 0.87 0.1 0.0 0.17 0.03 0.24 0.12 0.03 0.27 0.06 0.44 0.08 0.31 0.14
0.01 0.17 0.21 0.28 0.26 0.27 0.44 0.75 1.0 0.84 0.61 0.54 0.06 0.1 0.11 0.12 0.2 0.78 0.41 0.49 0.73 0.21 0.38 0.74 0.47 0.43
0.63 0.64 0.65 0.36 0.27 0.35 0.45 0.65 0.6 0.71 0.58 0.54 0.77 1.0 0.91 0.86 0.39 0.55 0.68 0.65 0.29 0.14 0.58 0.96 0.63 0.84
0.52 0.45 0.79 0.43 0.15 0.07 0.5 0.7 0.47 0.71 0.71 0.43 0.49 1.0 0.74 0.98 0.65 0.74 0.59 0.78 0.6 0.1 0.93 0.56 0.48 0.99
1.0 0.47 0.24 0.17 0.18 0.3 0.38 0.42 0.28 0.28 0.23 0.24 0.87 0.47 0.61 0.38 0.38 0.49 0.54 0.36 0.32 0.32 0.44 0.25 0.56 0.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.84 0.51 0.42 0.43 0.26 0.17 0.34 0.45 0.43 0.47 0.52 0.52 0.7 0.7 0.67 0.67 0.51 0.9 0.75 0.47 0.66 0.29 1.0 0.46 0.62 0.73
0.34 0.08 0.05 0.05 0.14 0.53 0.78 0.78 1.0 0.86 0.69 0.61 0.34 0.1 0.11 0.17 0.14 0.32 0.18 0.09 0.8 0.09 0.91 0.32 0.69 0.26
0.5 0.44 0.33 0.25 0.25 0.24 0.34 0.36 0.3 0.26 0.23 0.21 0.43 0.27 0.55 0.25 0.41 0.55 1.0 0.31 0.21 0.12 0.37 0.13 0.12 0.12
0.93 0.45 0.33 0.28 0.11 0.04 0.06 0.09 0.01 0.03 0.07 0.24 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.06 0.52 0.32 0.02 0.07 0.1 0.14
0.74 0.47 0.47 0.45 0.4 0.3 0.42 0.58 0.56 0.63 0.68 0.68 0.83 0.52 0.62 0.55 0.26 0.48 0.44 0.4 0.58 0.54 1.0 0.92 0.81 0.63
0.64 0.54 0.43 0.4 0.32 0.22 0.32 0.33 0.28 0.3 0.4 0.47 0.62 0.33 0.36 0.38 0.44 0.51 0.44 0.32 0.74 0.22 0.29 0.41 1.0 0.52
0.76 0.4 0.28 0.3 0.32 0.46 0.48 0.45 0.44 0.5 0.58 0.84 0.92 0.69 0.56 0.74 0.42 0.5 0.6 0.39 0.72 0.71 1.0 0.77 0.58 0.39
0.83 0.86 0.3 0.25 0.5 0.3 0.26 0.97 0.26 0.96 1.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.13 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0
1.0 0.78 0.59 0.46 0.44 0.45 0.61 0.68 0.47 0.46 0.38 0.33 0.79 0.26 0.57 0.41 0.54 1.0 0.91 0.69 0.18 0.43 0.84 0.28 0.4 0.26
0.9 0.61 0.56 0.41 0.3 0.34 0.38 0.48 0.42 0.5 0.64 0.73 1.0 0.51 0.62 0.57 0.35 0.98 0.93 0.51 0.58 0.26 0.85 0.66 0.62 0.75
0.92 0.47 0.28 0.68 0.61 0.73 0.78 0.87 0.38 0.97 0.75 0.48 0.88 0.29 0.13 0.23 0.15 1.0 0.25 0.61 0.1 0.33 0.58 0.15 0.2 0.06
0.92 0.37 0.2 0.15 0.24 0.51 0.86 1.0 0.69 0.4 0.4 0.48 0.75 0.21 0.28 0.19 0.33 0.9 0.54 0.25 0.41 0.08 0.98 0.34 0.71 0.42
0.45 0.07 0.0 0.23 0.17 0.09 0.05 0.24 0.09 0.24 0.24 0.05 0.06 0.04 0.08 0.0 0.1 0.25 0.44 0.03 0.15 0.03 1.0 0.12 0.06 0.0
0.87 1.0 0.67 0.67 0.48 0.27 0.28 0.3 0.17 0.13 0.15 0.16 0.7 0.37 0.1 0.49 0.08 0.32 0.31 0.15 0.96 0.24 0.24 0.27 0.85 0.72
1.0 0.91 0.63 0.97 0.59 0.29 0.15 0.3 0.12 0.18 0.17 0.18 0.71 0.2 0.08 0.53 0.06 0.26 0.23 0.17 0.83 0.1 0.33 0.17 0.64 0.56
0.92 0.24 0.11 0.09 0.16 0.46 0.97 1.0 0.79 0.84 0.77 0.69 0.88 0.4 0.38 0.33 0.55 0.58 0.6 0.56 0.73 0.27 0.92 0.6 0.52 0.33
0.87 0.55 0.52 0.51 0.55 0.66 0.71 0.67 0.7 0.61 0.62 0.61 1.0 0.4 0.52 0.43 0.49 0.85 0.64 0.55 0.41 0.23 0.53 0.44 0.71 0.46
0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.19 0.58 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 1.0 0.31 0.0 0.13
1.0 0.31 0.08 0.24 0.49 0.16 0.35 0.42 0.45 0.29 0.25 0.38 0.76 0.11 0.18 0.14 0.08 0.19 0.2 0.04 0.25 0.18 0.25 0.08 0.23 0.16
1.0 0.51 0.47 0.52 0.4 0.25 0.36 0.47 0.37 0.41 0.4 0.34 0.76 0.08 0.1 0.1 0.14 0.29 0.18 0.26 0.4 0.38 0.31 0.39 0.46 0.48
0.3 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.17 0.0 0.36 0.37 0.2 0.0 0.12 0.0 0.21 0.0 0.11 0.19 0.0 0.19 0.0 1.0 0.17 0.0 0.13
0.67 0.29 0.22 0.24 0.16 0.12 0.28 0.28 0.32 0.36 0.48 0.47 0.75 0.35 0.24 0.26 0.29 0.31 0.2 0.25 0.94 0.11 1.0 0.42 0.7 0.28
0.7 0.54 0.65 0.9 0.68 0.45 0.58 0.74 0.67 0.77 0.81 0.92 0.73 0.55 0.95 0.56 0.59 0.67 0.49 0.53 0.81 0.69 1.0 0.91 0.65 0.64
1.0 0.26 0.14 0.35 0.05 0.02 0.08 0.16 0.07 0.1 0.1 0.13 0.61 0.12 0.12 0.23 0.06 0.18 0.09 0.09 0.18 0.05 0.06 0.51 0.35 0.7
0.77 0.71 0.39 0.64 0.61 0.44 0.42 0.51 0.48 0.47 0.63 0.61 0.58 0.28 0.25 0.16 0.25 0.36 0.21 0.26 0.61 1.0 0.5 0.85 0.85 0.63
1.0 0.45 0.07 0.12 0.33 0.58 0.76 0.72 0.65 0.6 0.43 0.3 0.82 0.1 0.12 0.04 0.43 0.49 0.56 0.36 0.46 0.15 0.11 0.19 0.23 0.18
1.0 0.37 0.43 0.61 0.7 0.89 0.74 0.62 0.59 0.46 0.51 0.79 0.89 0.87 0.45 0.75 0.54 0.58 0.53 0.45 0.59 0.25 0.79 0.7 0.52 0.65
0.65 0.43 0.26 0.63 0.61 0.38 0.59 0.73 0.73 0.8 0.82 0.64 0.64 0.31 0.25 0.46 0.25 0.57 0.4 0.38 0.71 0.19 1.0 0.43 0.82 0.56
0.44 0.51 0.24 0.33 0.48 0.51 0.7 0.69 1.0 0.75 0.82 0.57 0.41 0.22 0.27 0.2 0.3 0.8 0.33 0.35 0.77 0.05 0.61 0.34 0.86 0.43
0.78 0.83 0.79 0.68 0.78 0.76 0.79 0.84 0.87 0.98 0.96 1.0 0.72 0.48 0.48 0.56 0.58 0.84 0.72 0.63 0.91 0.67 0.73 0.54 0.58 0.56
0.69 0.73 0.66 0.65 0.79 0.79 0.92 0.84 0.92 1.0 0.93 0.78 0.69 0.53 0.72 0.67 0.56 0.99 0.73 0.7 0.75 0.77 0.87 0.81 1.0 0.73
1.0 0.36 0.1 0.07 0.07 0.07 0.26 0.33 0.12 0.27 0.27 0.21 0.94 0.21 0.16 0.08 0.1 0.23 0.35 0.19 0.3 0.14 0.44 0.31 0.31 0.3
1.0 0.58 0.34 0.3 0.42 0.54 0.67 0.57 0.49 0.52 0.45 0.47 0.85 0.5 0.67 0.49 0.67 0.75 0.87 0.68 0.75 0.6 0.62 0.47 0.42 0.45
1.0 0.64 0.39 0.31 0.48 0.72 0.75 0.57 0.51 0.55 0.4 0.43 0.83 0.69 0.91 0.62 0.85 0.81 0.96 0.87 0.69 0.51 0.58 0.47 0.42 0.52
0.51 0.3 0.1 0.09 0.22 0.43 0.56 0.44 0.33 0.22 0.23 0.19 0.43 0.35 0.28 0.15 0.46 0.29 0.36 0.25 0.41 0.08 1.0 0.38 0.29 0.3
1.0 0.66 0.68 0.74 0.46 0.28 0.4 0.52 0.37 0.5 0.59 0.69 0.84 0.22 0.17 0.27 0.23 0.26 0.26 0.25 0.55 0.06 0.16 0.31 0.72 0.89
0.83 0.7 0.53 0.54 0.49 0.4 0.69 0.71 0.77 0.87 0.93 1.0 0.77 0.32 0.43 0.34 0.49 0.73 0.67 0.41 0.65 0.25 0.44 0.64 0.91 0.57
1.0 0.57 0.44 0.35 0.33 0.31 0.58 0.68 0.57 0.63 0.6 0.65 0.92 0.31 0.36 0.3 0.47 0.67 0.51 0.48 0.53 0.32 0.42 0.43 0.55 0.44
1.0 0.5 0.42 0.76 0.47 0.3 0.56 0.39 0.32 0.3 0.51 0.44 0.77 0.16 0.23 0.18 0.12 0.34 0.26 0.17 0.59 0.11 0.75 0.17 0.55 0.39
1.0 0.79 0.47 0.38 0.39 0.46 0.77 0.85 0.66 0.68 0.58 0.49 0.74 0.45 0.44 0.37 0.57 0.78 0.68 0.54 0.6 0.95 0.6 0.47 0.73 0.58
1.0 0.49 0.32 0.38 0.23 0.12 0.29 0.55 0.33 0.47 0.63 0.41 0.56 0.12 0.11 0.07 0.22 0.37 0.35 0.31 0.59 0.16 0.15 0.25 0.39 0.41
1.0 0.73 0.41 0.29 0.29 0.39 0.59 0.57 0.48 0.5 0.41 0.38 0.77 0.33 0.39 0.25 0.55 0.8 0.71 0.6 0.88 0.4 0.64 0.49 0.37 0.3
1.0 0.37 0.29 0.52 0.13 0.3 0.11 0.45 0.18 0.17 0.78 0.25 0.44 0.04 0.05 0.21 0.0 0.3 0.48 0.26 0.4 0.12 0.15 0.12 0.23 0.44
0.42 0.0 0.31 0.0 0.6 0.0 0.0 0.27 0.57 1.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0
1.0 0.52 0.33 0.22 0.23 0.18 0.37 0.49 0.24 0.2 0.31 0.4 0.98 0.42 0.36 0.23 0.34 0.66 0.62 0.21 0.41 0.2 0.72 0.42 0.57 0.36
0.73 0.49 0.36 0.85 0.53 0.42 0.54 0.68 0.46 0.57 0.58 0.5 0.64 0.21 0.16 0.17 0.15 0.32 0.28 0.19 0.5 0.29 1.0 0.5 0.61 0.47
0.72 0.32 0.33 0.5 0.45 0.27 0.38 0.51 0.49 0.49 0.61 0.66 0.76 0.73 0.31 0.26 0.2 0.34 0.47 0.25 0.58 0.31 1.0 0.28 0.65 0.39
0.83 0.29 0.3 0.39 0.55 0.83 0.89 0.83 0.62 0.52 0.64 0.55 1.0 0.15 0.22 0.26 0.43 0.61 0.62 0.51 0.24 0.14 0.3 0.14 0.67 0.37
1.0 0.64 0.54 0.58 0.69 0.87 0.89 0.86 0.75 0.75 0.7 0.76 0.9 0.97 0.41 0.73 0.67 0.84 0.7 0.68 0.87 0.33 0.72 0.64 0.91 0.62
1.0 0.45 0.08 0.67 0.4 0.08 0.11 0.32 0.4 0.18 0.47 0.36 0.67 0.06 0.03 0.06 0.07 0.06 0.04 0.02 0.56 0.29 0.2 0.12 0.65 0.46
1.0 0.0 0.23 0.23 0.0 0.0 0.16 0.11 0.0 0.11 0.0 0.12 0.78 0.0 0.11 0.0 0.0 0.39 0.09 0.0 0.24 0.0 0.29 0.0 0.22 0.16
0.91 0.32 0.3 0.62 0.76 0.4 0.65 0.85 0.59 0.38 0.48 0.25 1.0 0.06 0.3 0.24 0.05 0.29 0.33 0.13 0.34 0.36 0.23 0.23 0.57 0.3
0.92 0.39 0.43 0.52 0.61 0.41 0.51 0.48 0.5 0.42 0.46 0.43 1.0 0.27 0.26 0.27 0.3 0.34 0.35 0.3 0.46 0.27 0.58 0.51 0.54 0.36
0.89 0.52 0.42 0.71 0.8 0.7 0.8 0.72 0.77 0.73 0.77 0.8 1.0 0.4 0.34 0.95 0.49 0.79 0.65 0.62 0.32 0.35 0.66 0.49 0.56 0.58
0.06 0.05 0.24 0.22 0.19 0.15 0.3 0.35 0.54 0.6 0.65 1.0 0.09 0.14 0.19 0.07 0.19 0.47 0.35 0.28 0.53 0.15 0.46 0.63 0.66 0.45
0.63 0.63 0.39 0.57 0.62 0.3 0.16 0.26 0.06 0.22 0.17 0.23 0.17 0.12 0.11 0.06 0.08 0.05 0.26 0.09 0.63 0.02 1.0 0.48 0.1 0.07
0.54 0.33 0.3 0.48 0.45 0.25 0.5 0.34 0.38 0.51 0.46 0.39 0.49 0.17 0.13 0.16 0.13 0.26 0.39 0.09 0.3 0.17 1.0 0.35 0.33 0.2
0.84 0.64 0.5 0.68 0.56 0.36 0.47 0.62 0.63 0.78 0.9 1.0 0.52 0.17 0.36 0.26 0.39 0.53 0.7 0.74 0.42 0.29 0.36 0.54 0.42 0.39
1.0 0.37 0.22 0.23 0.39 0.41 0.73 0.73 0.56 0.65 0.52 0.46 0.93 0.51 0.34 0.31 0.5 0.75 0.7 0.54 0.54 0.17 0.99 0.84 0.51 0.67
0.28 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 1.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.64 0.62 0.66 0.44 0.22 0.17 0.23 0.03 0.06 0.12 0.27 1.0 0.02 0.03 0.02 0.02 0.04 0.04 0.14 0.46 0.42 0.04 0.18 0.34 0.39
0.8 0.5 0.46 0.41 0.43 0.49 0.65 0.6 0.58 0.67 0.62 0.71 1.0 0.41 0.42 0.47 0.38 0.67 0.42 0.46 0.29 0.23 0.51 0.4 0.5 0.39
0.72 0.57 0.38 0.37 0.23 0.46 0.29 0.21 0.3 0.39 0.49 0.49 1.0 0.46 0.34 0.28 0.32 0.56 0.78 0.42 0.39 0.15 0.28 0.4 0.49 0.64
0.89 0.31 0.12 0.08 0.17 0.43 0.63 0.54 0.52 0.5 0.47 0.52 0.85 0.5 0.47 0.38 0.5 0.48 0.51 0.33 0.67 0.28 1.0 0.74 0.38 0.24
1.0 0.68 0.24 0.13 0.1 0.13 0.3 0.44 0.23 0.26 0.34 0.26 0.91 0.26 0.21 0.14 0.3 0.44 0.34 0.2 0.61 0.03 0.34 0.4 0.73 0.27
1.0 0.76 0.4 0.58 0.44 0.25 0.31 0.4 0.39 0.31 0.46 0.39 0.91 0.13 0.09 0.18 0.14 0.37 0.16 0.16 0.51 0.55 0.67 0.53 0.67 0.45
0.72 0.6 0.54 0.63 0.43 0.43 0.7 0.65 0.61 0.7 0.65 0.76 0.89 0.45 0.64 0.49 0.6 0.98 0.92 0.7 0.48 0.49 0.87 0.65 1.0 0.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.72 0.09 0.05 0.07 0.07 0.11 0.21 0.15 0.1 0.08 0.16 0.14 0.83 0.29 0.29 0.22 0.2 0.45 0.22 0.16 0.32 0.05 1.0 0.21 0.66 0.21
0.99 0.58 0.32 0.49 0.57 0.31 0.32 0.41 0.28 0.36 0.43 0.56 1.0 0.31 0.17 0.23 0.15 0.16 0.4 0.08 0.42 0.78 0.39 0.29 0.58 0.47
0.91 0.61 0.69 0.64 0.56 0.66 0.82 0.92 0.72 0.68 0.71 0.94 1.0 0.36 0.36 0.4 0.46 0.73 0.49 0.6 0.67 0.47 0.4 0.37 0.33 0.46
0.71 0.33 0.28 0.49 0.3 0.26 0.36 0.4 0.33 0.34 0.44 0.61 1.0 0.09 0.08 0.06 0.1 0.23 0.15 0.24 0.61 0.01 0.69 0.44 0.57 0.53
0.68 0.31 0.2 0.18 0.22 0.32 0.8 0.8 1.0 0.93 0.86 0.57 0.67 0.47 0.31 0.4 0.43 0.49 0.45 0.44 0.74 0.26 0.97 0.49 0.57 0.46
0.3 0.39 0.48 0.52 0.41 0.38 0.54 0.66 0.8 0.8 1.0 0.95 0.43 0.34 0.37 0.26 0.65 0.74 0.41 0.32 0.72 0.41 0.99 0.5 0.59 0.45
1.0 0.83 0.46 0.31 0.3 0.37 0.67 0.73 0.58 0.57 0.45 0.38 0.79 0.41 0.67 0.43 0.54 0.88 0.73 0.54 0.39 0.51 0.71 0.44 0.45 0.37
1.0 0.64 0.59 0.57 0.44 0.38 0.53 0.64 0.53 0.57 0.6 0.64 1.0 0.34 0.39 0.39 0.43 0.57 0.52 0.49 0.43 0.62 0.36 0.41 0.73 0.5
0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.27 1.0
0.84 0.31 0.22 0.44 0.68 0.53 0.4 0.3 0.42 0.31 0.5 0.34 0.56 0.86 0.33 0.6 0.16 0.5 0.44 0.14 0.73 0.39 1.0 0.23 0.91 0.49
0.65 0.95 0.72 0.69 0.42 0.56 0.36 0.28 0.4 0.5 0.74 0.84 0.73 0.41 0.46 0.31 0.41 0.39 0.54 0.6 0.48 0.31 1.0 0.56 0.42 0.29

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)