1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_221 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
2.83 1.74 1.3 3.51 2.76 2.92 3.11 2.2 2.93 4.17 4.94 5.14 4.39 2.49 1.26 1.36 1.36 2.07 2.23 0.98 0.96 2.98 1.9 2.3 2.08 2.68
0.65 0.6 1.0 0.84 1.26 1.1 1.52 0.89 1.72 1.4 1.55 1.71 0.83 0.73 0.73 0.38 0.44 0.38 0.54 0.4 0.3 0.83 1.05 2.2 0.35 0.66
2.55 2.21 1.65 2.23 2.49 1.81 2.94 2.15 1.98 2.33 3.13 3.34 2.45 2.61 1.11 1.78 0.93 1.12 0.95 1.0 0.47 7.82 3.89 5.31 6.05 3.87
1.8 1.33 1.24 1.56 1.56 1.43 1.77 1.97 2.46 2.5 3.21 2.41 1.95 2.46 1.75 2.26 1.33 3.03 1.54 1.42 1.53 9.18 3.63 3.52 4.15 3.19
0.89 0.74 0.76 0.88 0.42 0.68 0.87 0.82 0.82 0.9 1.04 1.21 1.32 0.65 0.58 0.59 0.64 1.03 0.38 0.34 0.32 2.29 1.32 1.07 2.33 1.25
0.35 0.02 0.04 1.08 0.09 0.0 0.03 0.52 0.02 0.67 0.92 0.07 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.06 3.94 0.4 0.9 2.45 1.06
0.34 0.23 0.18 0.31 0.57 0.48 0.51 0.69 0.7 0.41 0.34 0.65 0.14 0.25 0.12 0.17 0.25 0.15 0.38 0.28 0.0 1.51 0.39 0.88 0.52 0.56
2.98 2.41 2.1 2.06 1.66 1.38 2.99 3.63 2.09 2.64 2.7 2.36 2.09 2.98 2.0 2.56 3.93 3.4 4.02 2.36 4.32 6.99 3.95 3.63 5.29 2.99
1.97 2.15 2.45 1.84 1.64 1.35 2.02 2.85 1.55 2.69 2.11 2.09 1.46 2.67 2.86 2.58 3.96 3.11 3.95 2.76 4.35 8.77 5.78 2.63 7.09 3.81
0.96 0.68 0.65 0.6 0.52 0.53 0.72 0.82 0.54 0.69 0.77 1.01 0.54 1.35 1.19 1.41 1.44 0.82 0.95 0.93 2.04 3.44 1.55 1.13 4.35 1.26
1.36 0.74 0.51 0.87 0.49 0.41 0.59 0.54 0.13 0.56 0.54 1.17 1.63 0.86 0.37 0.36 0.3 0.47 0.59 0.23 0.94 4.18 0.9 2.09 1.14 1.65
0.15 0.37 0.07 0.72 0.83 0.18 0.47 0.06 0.3 0.27 0.28 0.54 0.14 0.25 0.32 0.02 0.38 0.55 0.71 0.23 0.3 2.25 0.6 0.33 1.37 0.33
3.14 1.74 1.97 2.93 2.77 3.25 3.56 3.31 4.38 5.73 8.77 5.7 3.76 3.16 3.18 3.26 3.57 3.8 2.59 1.3 0.58 6.8 2.13 5.51 2.77 3.4
9.94 9.48 6.59 6.86 8.86 8.42 8.38 6.07 10.5 13.9 15.89 22.59 15.02 6.97 7.84 7.24 5.82 8.73 2.76 4.46 0.21 19.7 1.49 4.08 6.16 3.27
1.95 2.61 3.16 3.47 2.94 2.0 3.17 4.6 4.49 6.34 8.27 7.51 1.78 0.74 3.9 1.3 2.69 3.6 2.01 2.18 0.06 7.02 1.76 3.49 2.79 1.98
0.85 0.46 0.46 0.47 0.73 0.47 0.44 0.65 0.42 0.76 0.68 0.49 0.39 1.65 0.99 1.69 0.78 1.7 1.0 0.44 2.63 6.0 3.34 1.36 2.32 1.94
0.37 0.16 0.38 0.31 0.3 0.25 0.12 0.24 0.22 0.38 0.43 0.23 0.15 0.73 0.35 1.07 0.14 0.58 0.48 0.23 0.96 2.5 1.16 0.58 0.89 0.72
0.47 0.27 0.17 0.16 0.26 0.34 0.45 0.24 0.11 0.59 0.44 0.16 0.08 0.65 0.61 0.66 0.3 0.86 0.62 0.19 1.54 1.95 1.49 0.41 0.79 1.11
11.02 8.79 9.53 12.57 11.96 8.17 12.05 12.01 8.91 11.77 11.05 9.71 9.09 16.96 10.45 16.12 7.99 10.11 9.79 6.77 11.21 22.69 14.53 7.58 11.72 11.5
0.31 0.24 0.27 0.14 0.23 0.18 0.29 0.24 0.17 0.23 0.17 0.26 0.08 0.45 0.36 0.66 0.38 0.52 0.57 0.15 0.37 1.97 0.5 0.34 0.53 0.67
0.58 0.37 0.32 0.54 0.62 0.24 0.43 0.67 0.7 0.71 0.72 0.58 0.44 0.08 0.12 0.07 0.12 0.18 0.17 0.23 0.01 1.87 0.17 0.83 0.41 0.12
0.48 1.03 0.71 2.54 2.39 1.26 2.04 2.19 2.65 1.85 1.86 1.89 0.36 1.28 0.78 1.26 0.88 1.58 1.16 0.63 1.57 2.91 2.94 3.58 2.53 1.64
0.9 0.95 1.08 1.53 2.04 1.34 2.24 1.51 1.97 2.67 2.54 2.1 0.51 1.76 0.97 1.55 0.91 1.48 1.59 0.82 1.44 4.24 2.43 4.43 2.68 2.66
5.83 4.11 4.46 6.16 7.09 9.83 8.37 7.26 6.69 6.19 5.59 7.1 7.97 2.09 2.81 2.14 1.92 3.45 3.46 2.24 0.47 7.39 4.05 5.65 2.56 3.36
32.43 28.16 26.04 36.07 34.24 36.94 33.83 39.18 42.74 35.38 41.33 38.21 41.57 19.43 18.79 18.59 16.62 12.22 19.62 13.15 3.2 54.05 17.44 23.35 18.53 21.79
0.9 0.76 0.59 0.94 1.34 1.33 0.94 1.02 0.98 1.02 1.37 1.52 1.04 0.52 0.42 0.46 0.37 0.62 0.6 0.28 0.18 2.55 0.62 1.58 0.71 1.13
0.59 0.44 0.37 0.8 0.96 0.66 1.08 0.81 1.29 1.16 1.48 0.91 0.19 0.57 0.43 0.44 0.25 1.3 1.0 0.37 0.74 3.08 2.01 4.19 3.15 2.64
0.38 1.17 0.55 2.6 1.43 2.29 1.15 1.67 0.61 1.07 1.11 1.03 0.7 2.17 0.56 2.07 0.69 2.44 1.32 0.97 2.75 12.84 3.2 5.08 3.21 5.2
0.04 0.05 0.13 0.13 0.18 0.07 0.04 0.08 0.07 0.02 0.08 0.12 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.1 0.03 0.15 0.52 0.14 0.31 0.15 0.15
0.37 0.53 0.61 0.84 0.75 0.91 0.47 0.5 0.59 0.56 1.15 1.57 0.27 0.88 0.54 0.52 0.38 0.27 0.5 0.49 0.24 2.3 1.92 1.06 0.73 1.59
2.65 0.82 0.98 2.68 1.49 0.68 0.98 1.71 1.05 0.8 2.03 1.45 1.83 0.74 0.26 0.31 0.3 0.53 0.44 0.31 4.95 6.22 5.85 6.09 4.86 3.19
1.08 0.94 0.82 1.86 2.51 2.42 2.53 2.14 1.99 1.6 1.45 1.26 0.71 1.33 1.02 1.76 1.05 1.85 1.71 1.13 2.85 4.21 3.66 2.45 4.03 2.23
0.98 0.68 0.54 1.78 1.81 0.6 0.39 0.66 0.64 0.9 1.46 1.66 0.73 0.28 0.53 0.58 0.28 1.83 1.01 0.44 3.22 4.69 6.7 7.4 4.49 3.68
1.91 1.32 1.1 2.77 3.25 2.7 2.32 2.98 3.72 3.57 3.48 2.24 1.18 1.79 1.72 1.27 1.38 1.54 1.67 1.27 2.95 5.43 5.27 4.2 4.5 2.8
0.21 0.63 0.25 1.07 1.61 1.06 0.8 0.98 0.87 1.24 0.91 1.0 0.62 0.33 0.22 0.41 0.37 1.2 0.91 0.18 4.84 4.27 1.25 1.66 4.3 2.53
0.94 0.61 0.61 1.08 1.0 0.46 0.85 0.88 0.89 0.78 0.9 0.63 0.39 0.52 0.46 0.58 0.54 0.95 0.9 0.47 2.61 2.34 1.78 2.87 1.59 1.53
3.22 1.82 1.55 2.64 2.19 2.27 1.81 2.09 2.38 1.78 2.7 1.82 2.13 1.28 1.38 1.09 0.85 1.03 1.11 0.75 5.04 6.12 4.86 3.48 6.33 3.14
1.06 1.45 1.53 1.57 1.91 1.82 1.62 1.92 1.95 1.81 2.31 1.59 0.76 0.78 1.05 1.08 1.1 2.2 1.29 1.03 0.45 9.65 3.88 5.1 4.87 2.95
0.6 0.78 1.04 1.03 1.16 0.93 1.06 1.24 1.25 1.46 1.69 1.19 0.7 0.86 0.69 1.22 0.74 1.35 0.74 0.84 0.31 1.59 1.21 2.14 0.91 1.39
0.44 0.18 0.24 0.32 0.4 0.11 0.06 0.34 0.46 0.19 0.34 0.21 0.25 0.14 0.13 0.17 0.03 0.34 0.24 0.1 1.32 4.55 1.0 0.7 2.3 1.11
0.32 0.02 0.26 0.52 0.25 0.51 0.71 0.48 0.56 0.43 0.64 0.82 0.18 0.34 0.08 0.09 0.21 0.23 0.34 0.19 0.07 1.11 0.53 0.63 1.26 0.24
4.14 2.18 1.82 2.32 2.59 2.03 3.72 4.64 3.05 5.6 5.39 4.35 4.57 3.83 1.93 3.82 1.85 3.21 1.34 2.6 2.82 15.41 8.08 12.5 11.35 7.11
2.11 0.97 0.39 1.01 0.59 0.31 0.58 0.68 0.98 0.8 1.01 1.33 1.95 0.51 0.31 0.29 0.15 0.75 0.25 0.18 0.13 2.28 1.14 1.33 2.25 0.76
1.01 1.74 1.59 1.41 1.85 1.26 1.09 1.4 1.55 2.05 2.83 2.92 1.94 2.93 1.23 1.38 1.02 2.77 1.08 1.05 17.88 24.38 8.2 19.22 22.98 9.51
0.32 1.28 1.41 1.03 1.72 1.38 1.05 1.21 1.48 1.32 1.14 1.47 0.29 0.95 1.16 1.05 0.88 1.03 1.64 1.08 0.37 1.74 0.62 1.0 1.73 1.12
2.89 4.32 5.29 6.92 7.25 6.92 7.03 7.26 7.45 7.68 7.59 6.5 3.83 6.21 6.89 6.51 5.13 12.22 6.93 4.61 12.61 44.82 22.71 18.78 24.18 14.74
0.05 0.06 0.05 0.57 0.31 0.0 0.0 0.43 0.46 0.29 0.56 0.14 0.03 0.04 0.1 0.07 0.08 0.47 0.14 0.07 5.15 10.96 8.04 4.16 4.23 2.65
2.7 1.38 1.76 2.06 2.34 1.97 2.49 2.49 3.03 3.14 3.75 4.25 2.36 2.73 2.41 2.87 1.94 2.48 1.63 1.54 3.66 9.44 5.52 7.43 6.75 4.42
7.76 4.74 4.3 6.59 4.61 2.6 4.77 6.64 5.79 7.81 11.25 9.32 8.83 4.55 3.2 5.26 3.52 6.92 5.32 2.6 11.93 19.52 13.2 11.71 20.17 9.67
2.19 2.19 1.64 2.33 2.49 2.11 2.96 2.79 1.35 1.52 1.66 2.52 2.06 1.2 1.32 0.85 0.44 1.67 2.4 1.54 2.98 10.61 9.97 5.46 6.27 8.16
0.26 0.46 0.23 0.11 0.29 0.27 0.16 0.27 0.32 0.41 0.53 0.66 0.44 0.12 0.22 0.28 0.21 0.9 0.23 0.08 2.26 5.69 2.58 3.3 2.81 0.98
0.07 0.0 0.02 0.08 0.29 0.09 0.07 0.17 0.07 0.31 0.23 0.61 0.14 0.04 0.0 0.02 0.05 0.0 0.02 0.0 0.14 1.57 0.37 1.2 0.53 0.33
2.75 4.3 3.08 3.12 4.61 2.62 2.62 2.16 2.81 3.18 3.35 3.51 1.88 4.19 2.79 3.24 2.69 2.54 1.83 2.24 0.05 9.28 0.42 1.39 6.39 4.43
2.97 3.36 3.11 3.55 2.95 3.41 4.66 3.0 2.94 2.66 4.23 3.86 2.62 4.61 3.48 3.86 0.97 2.53 2.63 2.24 0.15 5.31 0.64 1.13 3.54 4.02
1.38 0.36 0.44 1.26 0.78 1.22 1.16 1.21 1.19 0.41 0.6 0.3 0.46 0.19 0.06 0.65 0.37 0.62 0.46 0.24 0.88 3.47 0.81 1.35 1.33 1.15
9.75 5.0 3.38 6.65 4.23 2.59 6.33 8.0 7.93 7.38 7.07 5.49 8.47 3.62 2.69 4.13 4.93 7.03 4.44 3.15 8.46 15.39 11.21 11.28 20.12 7.85
0.9 1.15 1.1 1.45 1.7 1.13 0.87 1.33 0.58 0.79 1.33 0.63 1.24 0.72 0.63 0.41 0.47 0.76 0.72 0.43 4.71 6.53 4.11 2.74 5.91 3.23
0.77 1.0 0.36 2.76 0.71 0.87 0.55 1.16 0.45 0.82 0.86 0.75 0.58 0.65 0.48 0.18 0.09 0.44 0.49 0.27 7.86 7.96 7.23 6.69 7.35 5.19
1.18 0.62 0.46 1.12 0.84 0.47 0.77 0.81 0.8 0.66 1.05 0.61 0.67 0.52 0.38 0.43 0.41 0.89 0.72 0.34 5.42 7.44 2.69 3.68 7.25 2.73
0.32 0.09 0.09 0.5 0.29 0.18 0.34 0.25 0.27 0.53 0.5 0.37 0.43 0.12 0.1 0.05 0.08 0.31 0.32 0.18 1.67 3.18 3.52 2.74 2.35 1.91
6.23 5.47 5.29 7.32 7.81 5.53 6.72 7.61 6.23 6.6 7.54 7.31 5.67 6.27 5.95 4.99 5.13 8.64 8.11 5.42 2.01 26.7 13.14 20.76 17.97 11.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.05 0.01 0.07 0.03 0.06
0.77 0.38 0.16 0.92 0.66 0.13 0.55 0.71 1.55 0.99 2.21 0.84 0.39 0.33 0.16 0.29 0.11 0.3 0.23 0.09 1.36 9.14 3.63 6.33 5.38 2.55
4.59 3.86 2.52 3.75 3.47 3.98 4.02 4.03 3.64 4.15 4.8 5.96 3.95 5.57 2.78 4.68 3.04 5.05 4.04 2.84 3.19 12.54 8.18 10.14 10.57 7.85
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.04 0.0 0.0 0.75 0.94 1.06 0.85 1.0 1.16 0.88 0.96 3.41 1.14 0.86 4.25 1.57
1.87 2.2 1.4 1.4 0.66 0.19 0.5 0.79 0.72 1.72 1.79 1.78 1.63 0.89 0.35 0.6 0.3 0.7 0.59 0.46 1.13 3.72 0.57 0.66 3.02 1.09
10.42 7.56 8.18 7.41 8.35 5.17 8.49 10.17 7.11 5.87 6.42 6.1 8.62 11.92 10.72 12.57 12.43 14.99 14.32 10.64 2.91 21.37 9.99 6.01 26.19 14.93
0.27 0.05 0.13 0.27 0.17 0.18 0.16 0.18 0.2 0.14 0.17 0.3 0.23 0.18 0.08 0.2 0.07 0.17 0.17 0.04 0.23 1.27 0.43 0.76 0.6 0.35
0.0 0.0 0.0 0.05 0.07 0.0 0.0 0.06 0.0 0.04 0.11 0.09 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.02 0.09 0.88 0.33 0.55 0.76 0.25
1.02 0.55 0.58 1.17 0.56 0.34 1.23 1.5 1.53 1.4 2.28 1.31 0.56 1.35 0.61 0.89 0.39 1.75 0.84 0.58 1.14 5.57 2.2 3.13 3.76 2.15
5.65 2.69 2.87 5.16 5.45 4.1 3.73 4.96 4.15 3.68 4.95 4.55 4.11 3.1 2.18 3.1 3.32 5.09 2.83 3.37 4.76 15.24 4.84 6.41 10.65 6.88
0.57 0.3 0.38 0.47 0.64 0.59 0.81 0.77 0.97 0.87 0.88 0.51 0.25 0.48 0.34 0.5 0.31 0.86 0.75 0.47 0.49 5.12 3.53 4.57 3.63 2.36
0.56 0.44 0.93 0.94 1.19 1.92 1.47 1.88 2.43 1.52 0.98 0.65 0.43 0.12 0.45 0.36 0.49 0.73 1.26 0.74 0.03 2.34 0.42 0.53 1.19 1.39
0.04 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.04 0.04 0.04 0.04 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.08 0.0 0.04 1.01 0.21 0.4 0.57 0.18
0.62 1.71 0.57 0.86 1.1 1.43 1.35 1.6 1.76 1.89 1.57 2.05 0.68 0.54 0.56 1.07 0.62 0.87 0.59 0.61 1.25 4.49 2.04 1.38 2.41 1.01
0.07 0.07 0.12 0.06 0.12 0.04 0.02 0.02 0.09 0.02 0.23 0.12 0.0 0.64 1.94 0.27 0.81 0.27 0.53 0.37 5.49 9.54 5.71 11.08 12.97 8.53
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.04 0.0 0.09 0.02 0.04 0.13 0.16 0.27 0.07 0.07 0.07
0.16 0.02 0.0 0.13 0.14 0.03 0.1 0.13 0.17 0.1 0.2 0.09 0.0 0.08 0.02 0.05 0.02 0.03 0.03 0.06 0.09 0.9 0.19 0.55 0.57 0.24
3.79 2.73 3.7 3.39 3.64 4.27 3.75 3.57 3.47 3.39 3.11 3.04 3.17 3.43 3.35 3.41 1.98 1.88 3.1 1.83 0.54 5.65 2.57 1.16 3.35 3.29
0.02 0.07 0.15 0.51 0.32 0.31 0.23 0.16 0.11 0.08 0.23 0.23 0.05 0.06 0.02 0.0 0.04 0.29 0.04 0.14 0.75 1.3 1.28 0.98 0.46 0.28
0.0 0.0 0.12 0.26 0.28 0.11 0.14 0.16 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.14 0.0 0.09 0.09 0.02 0.14 0.45 0.21 0.08 0.07 0.06
0.04 0.0 0.0 0.07 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.08 0.15 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.27 0.0 0.03 0.08 0.03
0.62 0.1 0.09 1.07 0.6 0.2 0.15 0.38 0.44 0.49 0.95 0.42 0.3 0.04 0.04 0.02 0.15 0.16 0.07 0.07 2.05 3.57 2.9 3.51 2.39 0.77

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)