Heatmap: Cluster_135 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.41 0.18 0.17 0.4 0.45 0.38 0.55 0.67 0.77 0.79 1.0 0.71 0.36 0.06 0.02 0.02 0.1 0.16 0.1 0.15 0.01 0.13 0.2 0.33 0.41 0.29
0.53 0.33 0.39 0.43 0.46 0.57 0.8 0.91 0.85 1.0 0.94 0.81 0.58 0.06 0.08 0.03 0.11 0.46 0.27 0.52 0.24 0.27 0.47 0.35 0.65 0.52
0.3 0.11 0.21 0.36 0.35 0.26 0.4 0.51 0.52 0.61 1.0 0.96 0.28 0.08 0.04 0.05 0.08 0.25 0.17 0.2 0.01 0.04 0.23 0.38 0.53 0.46
0.29 0.16 0.17 0.09 0.07 0.18 0.37 0.42 0.7 0.86 1.0 0.94 0.31 0.15 0.26 0.13 0.39 0.34 0.32 0.33 0.01 0.14 0.39 0.88 0.28 0.22
0.23 0.02 0.03 0.12 0.1 0.1 0.24 0.27 0.35 0.65 1.0 0.64 0.23 0.27 0.01 0.2 0.06 0.17 0.09 0.05 0.02 0.12 0.42 0.66 0.74 0.36
0.16 0.0 0.05 0.03 0.12 0.11 0.26 0.1 0.46 0.58 1.0 0.57 0.13 0.29 0.12 0.03 0.0 0.12 0.07 0.09 0.0 0.09 0.16 0.13 0.9 0.04
0.44 0.31 0.32 0.49 0.42 0.33 0.37 0.57 0.52 0.75 1.0 0.98 0.6 0.01 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.07 0.03 0.05 0.18 0.04 0.36 0.14
0.6 0.33 0.23 0.48 0.28 0.16 0.27 0.48 0.52 0.79 1.0 0.89 0.68 0.01 0.0 0.03 0.01 0.02 0.01 0.03 0.02 0.08 0.09 0.09 0.25 0.17
0.48 0.33 0.29 0.44 0.35 0.62 0.82 1.0 0.96 0.83 0.71 0.69 0.42 0.22 0.05 0.12 0.15 0.31 0.4 0.39 0.01 0.21 0.21 0.46 0.57 0.59
0.68 0.6 0.17 0.05 0.05 0.15 0.44 0.58 0.66 0.88 0.97 1.0 0.54 0.04 0.11 0.1 0.39 0.56 0.42 0.45 0.3 0.06 0.59 0.66 0.06 0.03
0.28 0.21 0.3 0.56 0.44 0.45 0.65 0.96 0.96 1.0 0.9 0.86 0.36 0.13 0.07 0.15 0.15 0.31 0.24 0.31 0.2 0.31 0.5 0.22 0.52 0.55
0.88 0.26 0.34 0.35 0.24 0.36 0.64 1.0 0.88 0.83 0.84 0.74 0.99 0.05 0.11 0.14 0.29 0.47 0.52 0.62 0.16 0.16 0.19 0.23 0.52 0.53
0.13 0.1 0.12 0.08 0.06 0.08 0.23 0.33 0.44 0.64 0.71 0.75 0.17 0.06 0.13 0.1 0.24 0.61 0.65 0.51 0.1 0.02 0.41 1.0 0.32 0.32
0.52 0.23 0.19 0.25 0.15 0.08 0.23 0.38 0.5 0.74 0.98 1.0 0.76 0.21 0.13 0.19 0.1 0.23 0.16 0.12 0.13 0.35 0.34 0.37 0.41 0.27
0.32 0.35 0.31 0.45 0.42 0.37 0.45 0.62 0.69 0.76 0.88 0.86 0.38 0.12 0.14 0.19 0.18 0.39 0.36 0.25 0.0 0.08 0.27 0.08 1.0 0.45
0.58 0.55 0.43 0.51 0.37 0.2 0.26 0.33 0.49 0.67 1.0 0.93 0.66 0.2 0.07 0.26 0.14 0.09 0.09 0.15 0.08 0.67 0.22 0.35 0.45 0.43
0.6 0.38 0.3 0.55 0.38 0.15 0.24 0.25 0.47 0.68 1.0 0.83 0.62 0.1 0.05 0.14 0.06 0.04 0.09 0.05 0.07 0.39 0.13 0.42 0.31 0.3
0.21 0.31 0.26 0.39 0.36 0.24 0.35 0.39 0.63 0.77 1.0 0.87 0.29 0.2 0.15 0.11 0.14 0.09 0.04 0.09 0.01 0.0 0.05 0.3 0.39 0.31
0.86 0.32 0.31 0.39 0.27 0.09 0.17 0.33 0.35 0.51 0.88 0.98 1.0 0.15 0.09 0.17 0.08 0.1 0.07 0.1 0.17 0.27 0.23 0.37 0.41 0.32
0.47 0.28 0.18 0.16 0.13 0.13 0.23 0.3 0.43 0.7 0.93 1.0 0.75 0.13 0.15 0.14 0.14 0.21 0.18 0.2 0.03 0.24 0.32 0.31 0.53 0.3
1.0 0.48 0.34 0.26 0.15 0.12 0.29 0.47 0.46 0.7 0.89 0.93 0.99 0.24 0.18 0.14 0.21 0.26 0.22 0.23 0.14 0.32 0.26 0.48 0.43 0.46
0.31 0.22 0.13 0.22 0.15 0.09 0.24 0.39 0.75 0.88 1.0 0.65 0.27 0.14 0.11 0.16 0.1 0.38 0.31 0.17 0.07 0.65 0.63 0.64 0.82 0.29
0.76 0.59 0.25 0.06 0.02 0.02 0.12 0.42 0.59 0.77 1.0 0.96 0.63 0.05 0.22 0.06 0.17 0.49 0.41 0.25 0.26 0.06 0.48 0.82 0.22 0.07
0.03 0.07 0.21 0.44 0.57 0.36 0.37 0.42 0.6 0.77 0.86 0.77 0.1 0.36 0.4 0.37 0.44 0.33 0.3 0.17 0.04 0.08 0.29 0.39 1.0 0.37
0.33 0.21 0.2 0.28 0.16 0.13 0.22 0.57 0.8 0.96 1.0 0.63 0.35 0.19 0.18 0.21 0.15 0.27 0.24 0.19 0.03 0.54 0.3 0.33 0.38 0.49
0.09 0.07 0.09 0.11 0.14 0.17 0.27 0.3 0.75 1.0 0.94 0.59 0.06 0.1 0.09 0.07 0.19 0.28 0.16 0.29 0.03 0.31 0.27 0.21 0.26 0.34
0.45 0.62 0.51 0.5 0.25 0.25 0.47 0.66 0.63 0.7 0.94 1.0 0.73 0.17 0.13 0.21 0.36 0.14 0.19 0.17 0.05 0.4 0.5 0.4 0.56 0.36
0.53 0.28 0.27 0.37 0.46 0.5 0.72 0.77 0.75 0.97 1.0 0.87 0.92 0.73 0.38 0.37 0.34 0.39 0.3 0.27 0.34 0.54 0.8 0.78 0.82 0.49
0.08 0.09 0.11 0.17 0.19 0.17 0.24 0.33 0.55 0.72 1.0 0.77 0.13 0.15 0.09 0.15 0.18 0.16 0.15 0.15 0.02 0.09 0.24 0.37 0.33 0.33
0.46 0.21 0.18 0.31 0.25 0.23 0.4 0.58 0.65 0.85 1.0 0.8 0.55 0.13 0.07 0.11 0.1 0.13 0.13 0.2 0.03 0.61 0.41 0.37 0.59 0.39
0.32 0.21 0.25 0.46 0.44 0.35 0.57 0.54 0.63 0.62 0.77 1.0 0.34 0.22 0.16 0.18 0.19 0.43 0.38 0.2 0.12 0.52 0.62 0.68 0.7 0.35
0.38 0.19 0.19 0.38 0.29 0.17 0.47 0.48 0.9 0.99 1.0 0.87 0.4 0.17 0.17 0.25 0.13 0.22 0.18 0.22 0.02 0.25 0.49 0.28 0.46 0.34
0.76 0.5 0.28 0.59 0.65 0.73 0.86 0.87 0.89 1.0 0.86 0.75 0.7 0.12 0.24 0.1 0.21 0.56 0.49 0.28 0.12 0.09 0.51 0.51 0.69 0.45
0.33 0.28 0.27 0.62 0.51 0.27 0.46 0.65 0.64 0.84 1.0 0.63 0.32 0.27 0.15 0.31 0.04 0.4 0.12 0.03 0.03 0.12 0.06 0.6 0.31 0.29
0.32 0.2 0.17 0.46 0.28 0.16 0.42 0.48 0.8 0.65 1.0 0.56 0.38 0.21 0.27 0.32 0.09 0.31 0.12 0.18 0.04 0.02 0.05 0.05 0.19 0.33
0.11 0.13 0.14 0.12 0.2 0.24 0.62 0.59 0.92 1.0 0.84 0.56 0.14 0.19 0.16 0.2 0.33 0.23 0.22 0.32 0.03 0.29 0.25 0.33 0.34 0.49
0.87 0.51 0.44 0.53 0.43 0.29 0.47 0.62 0.67 0.75 1.0 0.91 0.86 0.18 0.21 0.21 0.25 0.38 0.27 0.26 0.01 0.34 0.33 0.32 0.48 0.27
0.06 0.06 0.01 0.09 0.11 0.03 0.09 0.05 0.29 0.74 1.0 0.57 0.15 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.11 0.31 0.29 0.6 0.23
0.36 0.48 0.39 0.36 0.22 0.15 0.52 0.6 0.73 0.83 0.96 1.0 0.39 0.17 0.25 0.2 0.34 0.54 0.38 0.33 0.01 0.27 0.26 0.48 0.67 0.3
0.34 0.29 0.25 0.28 0.13 0.08 0.33 0.53 0.61 0.61 1.0 0.81 0.4 0.14 0.17 0.12 0.2 0.27 0.29 0.16 0.02 0.24 0.35 0.56 0.64 0.29
0.14 0.18 0.07 0.2 0.22 0.18 0.39 0.47 0.79 0.73 1.0 0.55 0.16 0.06 0.01 0.03 0.05 0.05 0.06 0.07 0.0 0.04 0.28 0.23 0.57 0.14
0.2 0.41 0.44 0.51 0.5 0.35 0.61 0.73 0.8 0.94 1.0 0.82 0.25 0.23 0.24 0.33 0.13 0.16 0.09 0.22 0.06 0.02 0.08 0.19 0.49 0.33
0.23 0.28 0.2 0.2 0.24 0.24 0.24 0.25 0.43 0.57 0.87 0.89 0.13 0.04 0.11 0.06 0.17 0.34 0.19 0.3 0.0 0.06 0.26 1.0 0.25 0.24
0.6 0.46 0.44 0.36 0.26 0.23 0.5 0.55 0.56 0.69 0.75 0.76 1.0 0.28 0.13 0.3 0.09 0.14 0.08 0.22 0.03 0.45 0.19 0.45 0.31 0.42
0.62 0.37 0.2 0.14 0.13 0.2 0.39 0.45 0.58 0.77 0.89 1.0 0.66 0.08 0.07 0.17 0.22 0.24 0.21 0.18 0.04 0.04 0.17 0.23 0.09 0.05
0.55 0.37 0.29 0.17 0.11 0.13 0.31 0.55 0.68 0.91 0.99 1.0 0.64 0.03 0.14 0.09 0.28 0.35 0.27 0.41 0.19 0.05 0.33 0.49 0.15 0.1
0.59 0.44 0.45 0.6 0.45 0.46 0.68 0.83 0.75 0.71 1.0 0.85 0.47 0.21 0.28 0.3 0.24 0.48 0.44 0.33 0.06 0.29 0.31 0.54 0.88 0.47
0.49 0.44 0.3 0.44 0.65 0.38 0.6 0.68 0.82 0.85 1.0 0.81 0.44 0.39 0.25 0.3 0.29 0.39 0.22 0.11 0.03 0.06 0.4 0.53 0.48 0.31
0.24 0.02 0.04 0.07 0.06 0.07 0.37 0.46 0.67 1.0 0.97 0.49 0.33 0.06 0.06 0.1 0.07 0.25 0.15 0.26 0.01 0.01 0.12 0.12 0.13 0.19
0.74 0.26 0.08 0.04 0.09 0.23 0.7 0.89 0.79 1.0 0.88 0.85 0.75 0.03 0.08 0.03 0.15 0.39 0.26 0.46 0.03 0.01 0.32 0.38 0.11 0.08
0.57 0.33 0.21 0.27 0.34 0.38 0.64 0.71 0.79 0.96 1.0 0.75 0.49 0.07 0.03 0.04 0.16 0.29 0.18 0.27 0.1 0.38 0.38 0.39 0.63 0.47
0.25 0.27 0.26 0.48 0.43 0.37 0.55 0.52 0.78 0.75 1.0 0.8 0.34 0.21 0.24 0.07 0.24 0.34 0.38 0.49 0.01 0.09 0.37 0.52 0.26 0.41
0.27 0.09 0.13 0.23 0.26 0.16 0.3 0.36 0.55 0.7 1.0 0.71 0.22 0.24 0.11 0.13 0.08 0.15 0.19 0.16 0.04 0.16 0.27 0.37 0.49 0.34
0.7 0.41 0.41 0.43 0.38 0.24 0.41 0.5 0.52 0.75 1.0 0.96 0.94 0.16 0.12 0.12 0.21 0.2 0.21 0.24 0.03 0.3 0.31 0.49 0.64 0.44
0.7 0.41 0.39 0.6 0.62 0.66 0.65 0.75 0.8 0.85 1.0 0.92 0.67 0.2 0.13 0.16 0.17 0.25 0.24 0.29 0.07 0.4 0.16 0.37 0.58 0.54
0.96 0.48 0.42 0.46 0.45 0.45 0.49 0.59 0.73 0.78 1.0 0.99 0.91 0.24 0.21 0.22 0.3 0.2 0.4 0.34 0.09 0.3 0.33 0.62 0.59 0.68

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)