Heatmap: Cluster_38 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0
1.55 0.77 0.82 0.96 1.24 1.06 1.3 1.0 1.22 0.97 2.14 3.37 1.54 1.08 2.21 3.71 1.84 0.41 0.95 1.94 0.25 0.24 0.07 0.08 0.29 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.67 0.41 0.39 0.38 0.12 0.19 0.5 1.14 0.97 1.4 0.82 0.66 0.28 0.16 0.11 0.39 0.05 0.09 0.08 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.03 1.33 2.69 1.13 1.01 1.64 3.19 5.51 6.74 4.49 4.37 3.82 2.79 0.74 0.4 0.93 0.19 1.37 0.97 0.32 0.82 0.31 1.75 1.23 0.17 1.31
0.1 0.17 0.25 0.2 0.18 0.07 0.27 0.23 0.27 0.21 0.19 0.16 0.18 0.15 0.08 0.13 0.3 0.09 0.1 0.29 0.0 0.0 0.09 0.02 0.55 0.11
2.53 2.7 2.58 3.61 2.67 2.55 2.61 2.03 2.43 2.46 3.07 4.1 4.57 1.48 1.71 1.37 0.77 0.49 0.89 1.29 0.01 0.0 0.0 0.29 0.0 0.36
0.2 0.1 0.09 0.24 0.1 0.2 0.22 0.88 0.67 0.51 0.28 0.42 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.1 0.1 0.28 0.1 0.09 0.06 0.07 0.09 0.04 0.24 0.16 0.18 0.01 0.3 0.25 0.11 0.04 0.13 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.09 0.12 0.07 0.12 0.09 0.06 0.17 0.07 0.14 0.04 0.05 0.05 0.0 0.04 0.02 0.02 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.14 0.05 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.02 0.0 0.0 0.02 0.04 0.03 0.04 0.05 0.12 0.13 0.07 0.06 0.01 0.0 0.02 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.15 0.01
0.0 0.1 0.05 0.04 0.0 0.0 0.15 0.09 0.09 0.12 0.0 0.0 0.04 0.11 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.1
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.16 1.33 0.0 0.79 0.0 0.06 0.04 0.04 6.95 0.0 0.05 0.0 1.05 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.31 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 1.87
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.34 0.58 0.87 0.86 0.8 1.98 1.39 1.26 2.0 1.76 2.72 1.9 1.8 0.1 0.29 0.17 0.2 0.19 0.39 0.44 0.21 0.35 0.1 0.03 0.21 0.2
1.0 0.86 1.39 2.19 2.19 2.59 2.49 2.06 3.09 2.66 2.5 3.0 0.92 1.09 0.49 0.75 0.39 0.63 0.83 0.33 0.67 1.08 1.26 1.05 1.97 0.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.2 0.8 0.8 0.95 1.29 0.7 1.08 1.92 0.63 0.91 1.66 2.06 1.51 0.36 0.75 1.16 1.08 0.27 0.07 1.04 0.0 0.12 0.0 0.05 0.55 0.33
3.34 2.62 2.31 3.33 2.77 1.81 3.86 3.89 4.16 4.0 5.5 6.62 5.04 1.7 3.18 4.59 2.17 1.0 0.59 3.04 0.22 0.25 0.05 0.02 0.3 0.33
0.63 0.1 0.19 0.75 0.27 0.0 0.29 0.8 0.28 9.09 0.78 0.19 0.2 0.0 0.16 0.19 0.1 1.06 0.17 0.15 0.51 3.67 2.59 1.33 5.62 0.61
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.35 0.37 0.33 0.31 0.57 0.22 0.66 0.36 0.79 0.49 1.03 0.77 0.46 0.33 0.46 0.3 0.12 0.27 0.29 0.24 0.13 0.03 0.09 0.32 0.07 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.35 1.44 1.84 0.81 0.79 2.12 3.34 4.8 4.81 4.29 3.25 2.55 2.31 0.32 0.22 0.25 0.03 0.53 0.85 0.14 0.0 0.07 0.0 0.0 0.01 0.34
1.68 1.2 0.84 0.79 0.82 0.47 2.44 2.96 3.39 3.7 2.26 3.07 2.02 0.12 0.02 0.02 0.15 0.43 0.44 0.15 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0
2.17 2.06 1.11 0.67 0.52 1.43 2.73 5.64 5.43 3.66 4.39 3.43 1.9 0.21 0.36 0.06 0.23 0.68 0.13 0.45 0.0 0.11 0.05 0.19 1.0 0.09
0.04 0.12 0.0 0.0 0.0 0.04 0.13 0.0 0.0 0.24 0.0 0.28 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.38 0.5 0.47 0.31 0.35 0.47 1.07 1.75 1.55 1.92 1.84 1.5 1.27 0.01 0.04 0.02 0.0 0.17 0.16 0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.35 0.08 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
1.0 0.77 0.28 0.4 0.0 0.08 0.73 1.21 2.4 1.29 1.56 1.19 1.01 0.0 0.06 0.13 0.0 0.44 0.13 0.16 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.25
0.35 0.11 0.07 0.15 0.15 0.34 0.53 0.6 0.78 0.75 0.51 0.49 0.33 0.12 0.0 0.06 0.07 0.07 0.12 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.12 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.04 0.02 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.02 0.03 0.0 0.02 0.0 0.09 0.03 0.02 0.0 0.0 0.07 0.04 0.01 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.12 0.78 0.53 0.69 0.54 0.42 1.27 2.13 2.41 2.02 2.72 2.81 1.65 0.09 0.04 0.19 0.14 0.23 0.17 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02
0.05 0.02 0.05 0.04 0.0 0.07 0.47 0.62 0.71 0.69 0.43 0.35 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.97 0.5 1.33 0.35 0.12 0.25 0.44 1.11 1.41 2.7 1.84 1.29 1.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.05 0.03 0.02 0.02 0.02 0.1 0.15 0.18 0.1 0.02 0.05 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.7 0.49 0.36 0.35 0.51 2.02 3.01 2.43 3.23 2.77 2.24 1.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.53 0.75 0.37 0.13 0.11 0.07 0.29 0.6 0.86 1.1 1.11 0.77 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.25 0.28 0.18 0.26 0.05 0.03 0.11 0.39 0.51 0.43 0.28 0.4 0.25 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
7.44 12.28 5.37 4.78 5.85 3.71 8.55 3.51 3.4 21.35 2.49 28.49 16.0 0.04 0.0 0.24 8.31 0.66 1.28 0.97 0.0 0.24 0.0 0.02 1.65 3.82
1.28 0.84 0.62 1.29 0.97 1.83 1.89 0.83 1.99 0.96 1.07 0.96 0.76 0.14 0.0 0.15 0.33 0.4 0.12 0.42 0.0 0.0 0.14 0.26 0.25 0.1
0.83 0.57 0.76 0.52 0.49 0.43 0.58 0.38 0.71 0.82 1.11 2.08 1.05 0.35 0.9 0.83 0.5 0.12 0.08 0.59 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.22
0.21 0.12 0.2 0.2 0.18 0.04 0.11 0.16 0.21 0.51 0.42 0.54 0.61 0.04 0.12 0.23 0.37 0.19 0.16 0.22 0.0 0.07 0.0 0.16 0.1 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.05 0.06 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.05 0.09 0.0 0.0 0.0 0.09 0.05 0.09 0.25 0.13 0.19 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.51 0.43 0.28 0.31 0.41 0.41 0.64 1.0 1.04 1.24 0.98 0.7 0.74 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.25 0.0 0.07 0.04 0.06 0.04 0.22 0.67 0.48 0.8 0.51 0.51 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.53 0.32 0.42 0.28 0.12 0.53 1.17 1.32 1.15 1.12 0.97 0.75 0.56 0.0 0.02 0.02 0.0 0.07 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.05 0.1 0.0 0.05 0.0 0.31 0.55 0.09 0.0 0.0 0.09 0.0 0.11 0.05 0.06 0.03 0.04 0.0 0.08 0.18 0.04 0.33 0.0
0.38 0.15 0.09 0.05 0.17 0.21 0.51 0.38 0.65 0.74 0.62 0.47 0.46 0.09 0.02 0.15 0.15 0.03 0.15 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.28 0.31 0.62 0.37 0.35 0.44 0.45 0.36 0.39 0.74 1.17 0.77 0.17 0.16 0.36 0.24 0.03 0.03 0.22 0.05 0.03 0.06 0.0 0.06 0.17
0.08 0.12 0.0 0.09 0.1 0.14 0.09 0.11 0.16 0.12 0.08 0.23 0.23 0.03 0.02 0.17 0.13 0.0 0.02 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.24 0.03
0.06 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.02 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.32 0.18 0.23 0.23 0.27 0.17 0.12 0.14 0.18 0.55 0.34 0.45 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.02 0.19 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.07 0.01 0.07
0.52 0.59 0.33 0.82 0.32 0.36 0.37 0.77 0.66 0.59 1.71 1.76 1.24 0.07 0.12 0.47 0.0 0.27 0.0 0.36 0.15 0.03 0.0 0.0 0.11 0.03
1.7 1.08 0.68 1.9 1.39 0.67 1.37 1.79 1.52 1.7 2.25 3.09 2.19 1.1 1.69 2.67 1.64 0.53 0.25 1.63 0.05 0.09 0.0 0.0 0.04 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 4.07 0.0 0.0 3.74 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.1 0.0 0.0
0.27 0.3 0.09 0.38 0.09 0.1 0.28 0.46 0.32 1.32 1.36 0.7 0.66 0.11 0.04 0.37 0.0 0.07 0.19 0.1 0.0 0.07 0.0 0.0 0.07 0.2
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.08 0.02 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
0.33 0.2 0.29 0.47 0.47 0.43 0.15 0.44 0.34 0.43 0.63 1.0 0.69 0.04 0.06 0.02 0.1 0.16 0.08 0.12 0.03 0.0 0.1 0.02 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.53 0.45 0.19 0.37 0.31 0.17 0.24 0.57 0.6 0.96 0.66 0.91 0.96 0.0 0.02 0.09 0.12 0.08 0.09 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08
0.26 0.17 0.0 0.09 0.04 0.05 0.39 0.2 0.25 0.39 0.57 0.16 0.22 0.07 0.0 0.0 0.04 0.06 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.2 0.07 0.0 0.02 0.02 0.03 0.0 0.02 0.29 0.0 0.07 0.0 0.03 0.0 0.02 0.03 0.15 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.1
0.0 0.05 0.04 0.04 0.02 0.02 0.0 0.11 0.15 0.18 0.11 0.09 0.1 0.03 0.04 0.09 0.0 0.01 0.07 0.0 0.03 0.05 0.04 0.02 0.1 0.17
0.27 0.3 0.15 0.09 0.16 0.18 0.49 0.68 1.0 1.8 1.28 0.86 0.56 0.0 0.06 0.0 0.0 0.09 0.05 0.05 0.0 0.02 0.02 0.0 1.31 0.0
0.33 0.05 0.0 0.05 0.38 0.0 0.13 0.09 0.15 0.16 0.41 0.4 0.22 0.03 0.08 0.0 0.05 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.27 0.23 0.24 0.37 0.36 0.37 0.19 0.47 0.28 0.28 0.4 0.14 0.2 0.02 0.11 0.1 0.02 0.04 0.02 0.01 0.0 0.11 0.06 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.0 0.13 0.0 0.0 0.21 0.08 0.13 0.27 0.49 0.44 0.42 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)