1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_19 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - - - - - - - - - 2.43 2.34 - - 3.96 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - -0.08 - - - 1.31 - 1.99 3.63 - 1.76 - -0.48 - - -0.14 0.35 -
- 2.44 - 2.38 - - - - - - - - - - 1.21 - - - - - - - - - 3.71 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.45 - 3.91 -
2.3 - - - - - - - - 2.2 - - - 1.73 - - 2.51 - - 1.93 1.87 - - - - -
- - 2.18 0.56 - -1.61 - - - - - -0.42 - - - - - - - - -0.92 -0.91 - - 3.31 2.99
- - - - - - 1.34 1.02 2.15 1.09 - - - - 1.04 - 1.11 0.99 - 1.76 1.97 - - - 0.46 -
1.27 - - - - 2.09 1.14 1.02 1.18 - - - - - - - 1.36 0.98 - 2.34 1.69 - - - - -
- 0.79 - - - - 1.42 - - - 1.14 - - - 1.12 3.17 3.03 - - - - - - - - -
- - 0.78 - 0.25 0.8 - 0.44 - - - - - - 0.46 - 2.78 1.81 - 0.17 0.58 - 2.49 - - -
1.94 - - - - - - - - - - 2.33 - 1.66 - - - - 2.23 - - - - - 2.57 1.74
- - - - - 2.34 - - - - 3.34 - - - - 2.31 2.56 - - - - - - - - -
- - - -0.97 -1.02 -0.91 0.53 1.0 -0.93 1.0 -0.99 0.19 - 1.52 -0.09 -0.78 0.87 -1.67 0.61 1.62 1.12 - 1.32 - -0.6 -1.42
- - - - 1.99 - - - - - 2.29 - - - - - 4.1 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.95 0.19 - - - 1.21 - -1.62 - - -2.17 - - - -2.18 - - - -1.84 1.58 0.6 3.25 1.86
-0.9 - -0.89 - - - - -1.0 - - 0.66 - - - - - - - -0.96 -1.21 - 0.3 2.7 2.03 2.91 1.37
-1.44 - -1.2 -0.35 0.99 0.21 1.4 0.04 0.59 1.3 0.89 0.66 - - - -1.54 - - - -0.63 - 1.83 -1.81 - 2.43 -
- - - - - - - - - - - - - 3.17 - - - - - - - - - - 4.09 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.02 -2.87 -0.94 1.05 -1.23 0.6 -2.8 -0.31 -2.01 -3.09 -1.04 -0.91 -0.44 0.35 -0.28 - -1.22 -2.59 -0.11 - - -2.4 -1.88 0.46 3.1 1.68
1.27 -0.95 -0.62 -0.49 0.16 -1.11 0.82 -0.68 -0.52 -0.15 0.2 0.95 0.73 0.82 -0.19 0.12 -0.82 -0.15 -0.75 -2.48 -0.37 0.74 -0.3 -0.36 -0.14 -1.08
0.97 1.63 0.84 - 1.32 0.63 - - - 0.59 2.13 0.84 - - -0.52 - 1.75 -1.08 - - -0.3 - -1.59 - -2.29 0.61
- - - - - - - - - - - - - 3.63 - - - - - - 3.77 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.93 3.43 - - - - - - - - - - -
- - 0.33 - 0.23 - - - 0.37 1.81 0.26 0.44 0.76 - - - - - - - -0.11 0.93 2.22 0.93 1.24 1.47
-0.48 - -1.17 -1.1 - 0.47 - 0.71 -1.05 -1.22 - - 0.66 -1.34 - 1.45 3.63 - - 1.1 -1.62 - - - -1.79 -0.75
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.36 0.9 - 2.13 - - - - - 3.13 0.4 - 0.88 - - - 1.8 - - - 1.01 0.15
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- - - 1.32 - - - - - - - - - 3.78 - - - 2.88 - - - - - 1.27 - -
- - -0.99 - 1.21 1.39 1.92 -0.78 - 1.41 - 0.12 - - -1.24 -1.01 2.73 0.64 - 1.15 - 0.2 - - - -
0.82 -0.76 -0.22 0.85 0.67 0.64 -1.33 1.09 - - -1.38 -0.23 - 0.52 -0.43 0.33 2.8 0.34 -1.69 -0.72 - -0.66 - -0.74 -1.96 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.84 - 3.54 -
- 1.94 2.04 - - - - - 1.79 - - - - 1.22 - - - - - - - 1.55 - - 2.13 2.3
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.62 2.36 - 4.15 -
-2.74 -0.44 0.32 -1.21 -1.35 -2.63 1.26 0.68 -0.28 0.05 -0.59 -1.79 0.53 0.47 -0.52 0.05 -2.91 -0.02 -0.64 -3.25 -2.23 -0.22 0.19 - 2.07 1.69
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.72 - - - - - - - - - - - - - - 4.39 2.12 - - - - - - - -
- - - - - 2.76 - - - - - - - - 2.67 - 2.98 - - - 2.31 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.9 - 3.92 1.77
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- -2.21 -0.02 0.49 0.34 -0.21 0.83 0.79 -1.33 -1.39 -0.76 -0.25 - -0.36 - -0.07 - -0.16 0.86 -0.5 1.0 -1.6 -1.13 - 2.51 0.94
-0.14 -0.56 -1.48 0.88 0.76 1.04 0.26 2.2 -1.46 -1.56 -1.53 -0.79 -2.04 -0.56 -2.73 -0.43 - -0.52 - -0.51 -0.38 -0.51 -2.85 - 2.41 -0.16
- - - - - - - - - - 3.49 - - - - - - - - - - - - - 3.88 -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 1.71 - - - 4.51 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- - - - - 2.39 - - - - - - - - - - 3.54 1.09 1.23 0.92 - 1.25 - - - -1.66
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 2.39 3.18 2.94 1.01 0.99 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.75 - - - - - - - - - - - 4.6 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.04 - - 2.94 - - 3.34 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
1.19 - -0.09 - -0.19 - - - -0.05 - - - 0.34 1.84 - - - 1.92 - - -0.53 1.51 - - 2.23 2.02
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
0.89 - - 1.28 - - - - - - - - - 2.61 - 1.09 1.43 1.05 0.84 1.82 1.76 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.9 - 3.47 - - - - - - -
- 1.06 - -0.93 -0.99 - -0.44 -1.0 - - -0.96 - -0.45 - -0.98 - -0.92 - 1.34 - 0.71 -1.28 2.7 1.1 2.53 -1.47
0.22 0.55 -0.94 -0.72 -0.8 -2.32 -1.06 -1.98 -1.56 -1.63 -2.03 -1.15 0.23 -1.53 -2.12 -1.52 -0.97 -0.55 0.01 -0.78 0.32 -3.96 1.6 1.33 2.54 0.86
- 2.9 - - - - - - - 2.65 - - - - - - 2.97 - - - - - - - 2.15 -
- -0.68 - - - - - - - - - -0.17 - - - - 0.71 0.7 0.66 -0.59 -0.2 0.34 1.53 - 2.65 2.95
-0.29 - -1.28 -0.26 - - - -1.07 - -1.4 - - - 0.69 0.16 1.09 0.45 - -0.35 -0.6 1.81 1.36 -0.66 0.91 1.88 1.66
- - 1.11 - 0.81 1.36 - - - - - - - 1.46 1.02 1.09 2.93 - - - - - 2.32 - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.23 - - 4.05 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 1.57 0.97 1.37 3.04 1.68 1.15 - - 1.43 1.08 - - -
- - 2.34 - - - 1.55 - - - - - - - - 1.49 1.31 - - - - - - - 3.67 -
-0.57 - - - - - 1.53 - - - - - 1.22 2.84 2.86 - 2.52 - - - - - - - - -
- 0.66 1.29 1.05 - -0.28 -0.52 -0.51 - -0.58 - - 1.33 1.08 - - - - -0.54 - 0.47 - 0.5 - 1.8 2.44
- - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - -
- 1.77 - 2.27 - - - - - - - - 2.63 - - - - - - - - - - - 3.53 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.47 0.62 0.71 - - 0.73 - - - 0.39 - - - 0.83 0.23 - 2.45 - 1.63 - - 1.82 - 1.78 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 -
- - - - - - - - - - - - 3.39 3.37 - - - - - - - - - - - 2.38
- - - - - 2.48 - - - - 2.54 - - 2.99 - 2.72 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.78 - - - - - 0.62 - - - - - - 0.97 - - - - - - - 3.97 -
- - - - - - - - - - - - 1.75 0.76 - - - 0.76 1.0 - - - 1.97 - 3.28 1.85
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.8 - 1.51 -
- - - - - - - - - - - - - - - - 0.73 0.17 - - 1.32 0.37 - 1.37 3.44 2.58
- - - - - - - - - - - - - 4.38 2.39 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 3.34 - - - - - 2.69 - - - 1.74 - - - - - - 2.6 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.83 1.57 2.83 3.14 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.