Heatmap: Cluster_78 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.11 0.16 0.23 0.3 0.28 0.26 0.35 0.36 0.35 0.39 0.33 0.3 0.17 0.47 0.32 0.5 0.31 0.51 0.37 0.34 0.48 0.94 1.0 0.62 0.65 0.58
0.28 0.28 0.27 0.4 0.43 0.33 0.41 0.45 0.51 0.53 0.6 0.56 0.34 0.41 0.41 0.41 0.29 0.46 0.36 0.24 0.64 0.77 1.0 0.7 0.53 0.5
0.24 0.27 0.23 0.28 0.37 0.25 0.28 0.31 0.32 0.37 0.42 0.39 0.23 0.37 0.37 0.51 0.22 0.35 0.34 0.21 0.59 0.62 1.0 0.7 0.28 0.41
0.24 0.14 0.1 0.21 0.22 0.14 0.29 0.31 0.3 0.32 0.36 0.29 0.27 0.2 0.12 0.19 0.14 0.19 0.13 0.12 0.56 0.53 1.0 0.5 0.56 0.31
0.12 0.23 0.27 0.28 0.18 0.1 0.11 0.14 0.16 0.23 0.27 0.34 0.17 0.25 0.21 0.24 0.32 0.27 0.18 0.16 0.47 0.72 1.0 0.54 0.59 0.54
0.04 0.07 0.07 0.15 0.15 0.13 0.14 0.17 0.22 0.22 0.25 0.25 0.06 0.12 0.17 0.15 0.1 0.18 0.17 0.09 0.48 0.39 1.0 0.51 0.4 0.36
0.14 0.16 0.14 0.25 0.17 0.2 0.25 0.19 0.38 0.29 0.26 0.23 0.16 0.46 0.37 0.31 0.2 0.45 0.44 0.22 0.45 0.41 1.0 0.55 0.51 0.63
0.07 0.04 0.12 0.19 0.23 0.25 0.23 0.23 0.25 0.32 0.27 0.23 0.11 0.36 0.35 0.44 0.31 0.34 0.37 0.31 0.42 0.59 1.0 0.69 0.5 0.48
0.19 0.18 0.19 0.27 0.26 0.21 0.19 0.21 0.27 0.28 0.32 0.37 0.18 0.31 0.31 0.3 0.15 0.49 0.26 0.12 0.57 0.52 1.0 0.91 0.72 0.4
0.04 0.08 0.19 0.31 0.29 0.21 0.28 0.36 0.35 0.41 0.39 0.32 0.07 0.22 0.39 0.24 0.29 0.46 0.39 0.32 0.54 0.41 1.0 0.63 0.57 0.52
0.03 0.1 0.14 0.32 0.29 0.23 0.27 0.3 0.38 0.41 0.44 0.33 0.04 0.28 0.2 0.3 0.19 0.21 0.25 0.19 0.8 0.42 1.0 0.62 0.42 0.37
0.17 0.25 0.13 0.48 0.31 0.14 0.19 0.36 0.34 0.32 0.38 0.21 0.16 0.21 0.21 0.34 0.11 0.36 0.28 0.05 0.69 0.82 1.0 0.83 0.75 0.51
0.11 0.14 0.12 0.23 0.19 0.11 0.16 0.22 0.2 0.19 0.21 0.15 0.1 0.29 0.27 0.43 0.15 0.35 0.26 0.11 0.74 0.71 1.0 0.6 0.73 0.51
0.15 0.15 0.14 0.27 0.22 0.11 0.12 0.21 0.2 0.25 0.28 0.23 0.08 0.29 0.11 0.23 0.09 0.33 0.16 0.08 0.54 0.3 1.0 0.74 0.47 0.55
0.21 0.12 0.08 0.24 0.28 0.21 0.34 0.36 0.31 0.23 0.33 0.23 0.11 0.28 0.21 0.4 0.28 0.43 0.44 0.28 0.82 0.73 1.0 0.84 0.8 0.74
0.17 0.17 0.13 0.19 0.17 0.18 0.25 0.19 0.23 0.26 0.27 0.34 0.2 0.43 0.25 0.45 0.3 0.43 0.34 0.22 0.43 0.5 1.0 0.55 0.39 0.45
0.09 0.01 0.02 0.1 0.08 0.08 0.21 0.26 0.23 0.23 0.27 0.12 0.08 0.2 0.19 0.25 0.16 0.21 0.25 0.14 0.47 0.44 1.0 0.38 0.83 0.41
0.06 0.0 0.03 0.04 0.11 0.03 0.15 0.21 0.2 0.29 0.19 0.2 0.07 0.08 0.23 0.09 0.1 0.3 0.25 0.15 0.41 0.25 1.0 0.39 0.97 0.47
0.04 0.03 0.05 0.08 0.13 0.19 0.26 0.22 0.27 0.29 0.27 0.23 0.08 0.32 0.29 0.29 0.3 0.32 0.25 0.28 0.43 0.51 1.0 0.65 0.42 0.3
0.21 0.29 0.35 0.46 0.56 0.5 0.44 0.47 0.46 0.44 0.49 0.43 0.24 0.46 0.4 0.42 0.29 0.63 0.54 0.26 0.61 0.67 1.0 0.72 0.59 0.72
0.19 0.24 0.25 0.32 0.33 0.28 0.43 0.4 0.43 0.46 0.46 0.43 0.24 0.35 0.24 0.35 0.22 0.28 0.27 0.21 0.59 0.68 1.0 0.56 0.54 0.47
0.08 0.1 0.09 0.13 0.22 0.0 0.11 0.04 0.05 0.08 0.26 0.28 0.16 0.0 0.0 0.0 0.45 0.08 0.07 0.03 0.52 0.59 1.0 0.41 0.53 0.43
0.11 0.17 0.22 0.34 0.32 0.25 0.3 0.34 0.36 0.44 0.4 0.36 0.1 0.36 0.47 0.42 0.25 0.42 0.46 0.23 0.62 0.5 1.0 0.55 0.44 0.52
0.1 0.09 0.09 0.16 0.16 0.12 0.24 0.24 0.23 0.23 0.24 0.17 0.08 0.21 0.14 0.2 0.19 0.28 0.27 0.21 0.85 0.56 1.0 0.63 0.75 0.45
0.25 0.29 0.26 0.34 0.39 0.37 0.35 0.34 0.43 0.43 0.44 0.49 0.24 0.33 0.28 0.26 0.2 0.3 0.26 0.17 0.52 0.6 1.0 0.67 0.42 0.43
0.1 0.15 0.14 0.26 0.27 0.22 0.29 0.3 0.31 0.34 0.34 0.36 0.09 0.31 0.24 0.36 0.18 0.33 0.27 0.23 0.5 0.67 1.0 0.76 0.75 0.46
0.22 0.3 0.33 0.27 0.22 0.19 0.24 0.26 0.31 0.33 0.35 0.4 0.26 0.25 0.29 0.27 0.24 0.29 0.29 0.26 0.45 0.53 1.0 0.56 0.78 0.55
0.26 0.29 0.27 0.31 0.29 0.25 0.37 0.36 0.41 0.42 0.37 0.32 0.21 0.55 0.37 0.55 0.34 0.53 0.39 0.32 0.46 0.59 1.0 0.68 0.57 0.69
0.1 0.08 0.11 0.15 0.17 0.19 0.12 0.08 0.07 0.08 0.11 0.13 0.1 0.16 0.02 0.08 0.06 0.02 0.02 0.03 0.4 0.39 1.0 0.88 0.21 0.39
0.24 0.19 0.22 0.27 0.37 0.43 0.56 0.48 0.44 0.41 0.4 0.32 0.29 0.43 0.32 0.32 0.23 0.28 0.22 0.21 0.38 0.49 1.0 0.41 0.48 0.42
0.07 0.05 0.1 0.17 0.15 0.16 0.2 0.15 0.24 0.21 0.29 0.28 0.12 0.29 0.2 0.21 0.2 0.15 0.19 0.17 0.47 0.45 1.0 0.44 0.43 0.47
0.03 0.03 0.04 0.07 0.12 0.31 0.52 0.42 0.41 0.25 0.2 0.1 0.02 0.27 0.24 0.27 0.18 0.22 0.22 0.14 0.29 0.41 1.0 0.29 0.39 0.37
0.24 0.19 0.19 0.28 0.3 0.21 0.39 0.39 0.41 0.35 0.36 0.24 0.15 0.36 0.27 0.35 0.27 0.53 0.36 0.25 0.63 0.74 1.0 0.72 0.8 0.59
0.37 0.38 0.36 0.36 0.33 0.32 0.43 0.36 0.47 0.45 0.43 0.44 0.33 0.41 0.36 0.35 0.34 0.51 0.44 0.33 0.53 0.55 1.0 0.76 0.7 0.57
0.09 0.05 0.05 0.13 0.13 0.08 0.09 0.09 0.11 0.12 0.12 0.09 0.07 0.11 0.31 0.24 0.14 0.24 0.26 0.14 0.66 0.42 1.0 0.63 0.58 0.34
0.13 0.1 0.13 0.21 0.25 0.21 0.29 0.29 0.38 0.29 0.33 0.25 0.1 0.28 0.23 0.24 0.1 0.39 0.35 0.08 0.68 0.55 0.99 1.0 0.82 0.52
0.03 0.08 0.05 0.09 0.12 0.03 0.04 0.04 0.1 0.14 0.1 0.11 0.04 0.05 0.11 0.04 0.0 0.11 0.08 0.01 0.65 0.62 1.0 0.37 0.62 0.3
0.26 0.08 0.05 0.1 0.16 0.04 0.08 0.16 0.06 0.04 0.06 0.09 0.09 0.11 0.1 0.12 0.1 0.09 0.2 0.15 0.97 0.4 1.0 0.19 0.5 0.17
0.17 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.11 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.49 0.26 1.0 0.16 0.21 0.44
0.06 0.01 0.02 0.08 0.06 0.02 0.05 0.01 0.03 0.07 0.07 0.07 0.04 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.35 0.43 1.0 0.42 0.52 0.29
0.14 0.11 0.11 0.03 0.05 0.06 0.06 0.11 0.1 0.18 0.21 0.22 0.1 0.39 0.17 0.26 0.24 0.4 0.24 0.16 0.9 0.39 1.0 0.37 0.43 0.35
0.08 0.05 0.04 0.02 0.03 0.03 0.03 0.04 0.04 0.06 0.1 0.1 0.05 0.16 0.08 0.07 0.08 0.19 0.08 0.03 0.5 0.42 1.0 0.25 0.22 0.19
0.19 0.08 0.05 0.04 0.06 0.04 0.05 0.1 0.07 0.14 0.13 0.15 0.06 0.23 0.16 0.11 0.14 0.28 0.2 0.06 0.69 0.23 1.0 0.17 0.37 0.27
0.36 0.24 0.17 0.18 0.15 0.11 0.22 0.25 0.21 0.32 0.34 0.33 0.26 0.29 0.2 0.17 0.19 0.25 0.28 0.12 0.66 0.28 1.0 0.29 0.26 0.28
0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.2 0.14 0.29 0.28 0.2 0.18 0.15 0.52 0.54 1.0 0.35 0.22 0.28
0.01 0.06 0.11 0.23 0.12 0.18 0.23 0.21 0.33 0.35 0.22 0.23 0.06 0.18 0.17 0.2 0.19 0.37 0.16 0.12 0.4 0.5 1.0 0.65 0.57 0.23
0.21 0.21 0.22 0.2 0.2 0.2 0.21 0.19 0.19 0.2 0.21 0.28 0.18 0.19 0.18 0.17 0.22 0.22 0.22 0.21 0.43 0.55 1.0 0.77 0.44 0.44
0.03 0.1 0.11 0.11 0.07 0.03 0.14 0.12 0.14 0.12 0.1 0.02 0.14 0.14 0.21 0.17 0.19 0.25 0.16 0.19 0.66 0.46 1.0 0.25 0.85 0.38
0.06 0.04 0.12 0.22 0.32 0.39 0.35 0.28 0.39 0.4 0.4 0.4 0.09 0.51 0.21 0.5 0.22 0.31 0.27 0.25 0.64 0.65 1.0 0.53 0.6 0.67
0.25 0.22 0.19 0.23 0.22 0.18 0.31 0.29 0.33 0.32 0.31 0.33 0.27 0.45 0.37 0.43 0.32 0.55 0.38 0.31 0.46 0.61 1.0 0.61 0.61 0.61
0.35 0.28 0.23 0.36 0.35 0.28 0.35 0.43 0.46 0.52 0.59 0.57 0.46 0.58 0.51 0.52 0.23 0.39 0.33 0.17 0.81 0.76 1.0 0.69 0.57 0.41
0.18 0.18 0.16 0.21 0.29 0.33 0.28 0.25 0.27 0.27 0.23 0.2 0.11 0.43 0.3 0.34 0.28 0.35 0.25 0.27 0.36 0.28 1.0 0.41 0.39 0.32
0.07 0.08 0.05 0.09 0.09 0.08 0.12 0.09 0.07 0.14 0.09 0.12 0.08 0.22 0.2 0.27 0.21 0.31 0.32 0.18 0.46 0.65 1.0 0.49 0.45 0.34
0.1 0.13 0.14 0.2 0.22 0.22 0.25 0.25 0.28 0.34 0.38 0.35 0.12 0.51 0.34 0.4 0.28 0.42 0.29 0.21 0.48 0.84 1.0 0.63 0.49 0.57
0.1 0.07 0.07 0.08 0.1 0.15 0.19 0.16 0.16 0.15 0.14 0.13 0.11 0.24 0.18 0.16 0.13 0.2 0.18 0.1 0.68 0.61 1.0 0.75 0.58 0.64
0.03 0.0 0.03 0.04 0.08 0.03 0.11 0.14 0.11 0.19 0.11 0.09 0.06 0.14 0.1 0.12 0.16 0.15 0.03 0.1 0.42 0.47 1.0 0.38 0.55 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.15 0.15 0.14 0.22 0.18 0.13 0.45 0.41 1.0 0.34 0.43 0.45
0.17 0.25 0.29 0.32 0.37 0.41 0.42 0.38 0.26 0.26 0.21 0.21 0.11 0.42 0.33 0.46 0.35 0.43 0.34 0.4 0.47 0.28 1.0 0.44 0.47 0.34
0.01 0.02 0.02 0.06 0.08 0.13 0.29 0.32 0.3 0.23 0.25 0.15 0.01 0.09 0.08 0.07 0.07 0.07 0.06 0.05 0.56 0.42 1.0 0.36 0.35 0.23
0.26 0.15 0.13 0.14 0.24 0.32 0.51 0.44 0.43 0.36 0.35 0.31 0.27 0.38 0.33 0.3 0.37 0.48 0.41 0.32 0.47 0.41 1.0 0.52 0.39 0.38
0.08 0.14 0.3 0.39 0.39 0.29 0.37 0.44 0.45 0.48 0.47 0.44 0.09 0.26 0.38 0.34 0.29 0.48 0.4 0.22 0.67 0.75 1.0 0.81 0.59 0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)