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Heatmap: Cluster_4 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-1.05 0.07 -0.03 0.05 0.54 0.59 0.22 0.05 -0.75 -0.4 -0.59 -0.59 -1.35 -0.17 0.33 0.24 0.4 0.89 0.68 0.72 -0.24 -2.08 -0.08 -0.11 -0.51 -0.29
-3.76 -3.8 -2.92 -1.23 -1.14 -1.25 -1.71 -1.67 -1.86 -1.57 -1.73 -1.74 -3.2 0.42 0.64 1.4 -0.67 1.89 0.63 0.27 1.65 -1.16 1.35 0.89 -0.06 -0.13
-2.98 -3.16 -2.93 -3.12 -3.1 -2.93 -2.45 -3.23 -1.74 -1.86 -1.79 -2.52 -3.76 0.47 2.03 0.86 1.55 1.87 1.92 1.88 -2.75 -2.89 -1.38 -1.23 -0.43 -0.52
-1.25 -0.17 -2.77 -0.37 -1.04 -0.14 -1.29 -0.23 0.26 -0.19 -0.07 -0.26 -1.05 0.4 0.91 1.2 0.86 1.47 -0.31 0.61 -0.15 -1.71 0.75 -1.67 -1.28 -0.46
-1.53 -0.75 -0.9 -1.49 -0.81 -1.21 -1.0 -1.25 -0.52 -0.02 -0.26 -0.37 -1.38 0.45 0.75 0.85 0.46 1.26 0.54 0.78 0.63 0.24 0.9 -1.13 -0.27 -0.18
-1.76 -0.74 -1.1 -1.44 -1.33 -1.22 -0.95 -0.92 -0.68 -0.27 -0.1 -0.49 -1.24 0.52 0.59 0.59 0.51 1.27 0.5 0.53 0.66 -0.03 1.2 0.21 -0.21 -0.19
-1.17 -0.78 -1.08 -1.11 -0.97 -0.84 -0.7 -1.03 -0.37 -0.08 -0.16 -0.38 -1.18 0.73 0.92 0.63 0.63 1.15 0.78 0.77 0.31 -0.73 0.71 -0.44 -0.58 -0.2
-1.27 -0.45 -0.33 -0.33 -0.16 -0.4 -0.09 -0.31 -0.39 -0.09 -0.55 -0.61 -1.61 0.22 0.49 0.21 0.2 1.04 0.92 0.43 0.73 -1.3 -0.25 -0.3 -0.04 0.7
-1.28 -0.52 -0.25 -0.29 -0.2 -0.11 -0.18 -0.5 -0.51 -0.42 -0.59 -0.58 -1.36 0.73 0.12 0.38 0.12 0.28 0.36 0.17 0.41 -0.16 0.04 0.43 0.2 1.11
-3.25 -2.64 -2.76 -2.9 -2.59 -1.89 -1.27 -1.17 -0.78 -0.67 -1.01 -1.54 -3.15 0.78 2.19 0.42 1.04 0.06 0.51 0.18 0.11 -4.04 0.38 1.61 0.4 0.92
-0.14 -0.02 0.11 0.04 0.31 0.29 0.27 0.18 -0.35 -0.93 -1.27 -1.53 -0.85 -0.31 0.22 0.23 0.28 0.9 0.88 0.48 -0.54 -0.35 -0.19 -0.51 0.24 -0.2
-2.93 -3.51 -4.98 -4.77 -3.76 -3.34 -3.21 -3.0 -3.28 -2.11 -2.46 -2.45 -3.06 1.62 1.56 1.35 1.18 1.2 1.26 1.14 0.33 -0.89 -1.38 0.78 0.57 0.44
-0.34 -0.53 -0.73 -0.86 -0.75 -0.36 -0.41 -0.46 -0.03 0.18 0.44 0.53 -0.03 1.0 0.56 0.75 0.69 -0.53 -0.45 -0.09 -0.32 -0.9 0.4 0.26 -0.54 -0.12
- - - - - -1.4 - - - - -1.45 - - 1.86 1.89 1.38 1.37 1.54 2.27 1.83 -1.1 - -1.79 -0.51 - -
-1.43 -0.49 -0.27 -0.33 -0.14 -0.15 -0.05 -0.23 -0.3 -0.29 -0.52 -0.61 -1.3 0.52 -0.31 0.63 -0.25 0.66 0.57 0.11 0.79 -0.84 0.56 0.36 -0.19 0.66
-0.08 -0.46 -0.4 -0.18 -0.23 -0.2 0.14 0.06 -0.15 -0.07 -0.14 -0.1 -0.21 0.23 -0.14 0.19 -0.2 0.32 0.17 -0.17 -0.09 -0.07 -0.26 0.46 0.25 0.69
-2.24 -2.44 -2.31 -2.38 -2.33 -1.9 -1.72 -1.82 -0.94 -0.24 -0.3 -0.51 -1.7 0.68 1.57 0.75 1.63 1.64 1.39 0.88 -1.57 -1.19 -1.07 0.54 -0.65 -0.53
-1.38 -1.3 -1.06 -0.3 0.13 -0.17 -0.64 -0.56 -0.4 -0.14 0.09 -0.0 -1.1 0.7 0.5 0.56 0.07 0.6 0.34 0.29 -1.25 0.54 -0.77 0.73 0.7 0.17
-5.2 -2.62 -2.01 -2.23 -2.2 -2.08 -3.48 -4.04 -2.13 -0.99 -0.9 -1.2 -5.81 1.62 1.28 1.58 1.69 0.98 0.91 1.08 -0.85 -1.08 -1.21 0.83 -0.13 0.28
0.04 -0.16 -0.05 0.0 0.04 -0.21 0.19 0.07 -0.14 -0.27 -0.33 -0.39 0.09 -0.02 0.62 0.29 0.09 1.07 0.52 0.0 -0.78 -0.56 -0.18 -0.74 -0.31 -0.36
-0.02 0.01 0.3 0.16 0.11 0.02 0.29 0.3 -0.14 -0.36 -0.7 -0.93 -0.27 -0.57 -0.06 0.13 0.01 0.67 0.33 0.17 0.04 -0.17 -0.25 -0.77 0.46 0.02
-9.84 -8.37 -8.53 -8.46 -9.83 -8.63 -8.08 -9.65 -9.55 -6.12 -7.57 - - 1.23 1.9 1.05 0.8 0.5 0.31 0.35 0.9 0.98 0.4 1.59 1.1 0.88
-1.42 -1.51 -1.21 -1.22 -1.05 -1.74 -1.15 -1.31 -0.93 -0.58 -0.54 -0.4 -0.94 0.33 -0.18 0.54 0.53 0.28 -0.25 -0.11 1.5 0.31 1.37 0.75 1.11 0.11
-4.51 -4.29 -4.04 -4.09 -4.6 -4.19 -4.61 -3.74 -4.62 -2.83 -3.41 -3.59 -4.54 1.38 2.08 1.14 1.2 0.65 1.24 1.29 -0.23 -0.43 0.02 1.01 0.34 0.66
-4.54 -4.94 -4.2 -4.33 -5.2 -6.08 -5.02 -3.77 -4.95 -2.68 -3.66 -4.08 -4.94 1.4 1.99 1.2 1.26 0.95 1.15 1.28 -0.18 -0.3 0.14 0.81 0.48 0.55
-5.54 -6.33 -5.32 -5.16 -6.97 - -6.21 -5.24 -5.79 -3.72 -5.27 -4.89 -8.16 0.85 1.33 0.6 0.77 0.76 0.66 0.76 0.45 0.75 1.21 1.74 1.31 1.02
-4.44 -5.84 -4.87 -4.26 -5.43 -6.93 -5.13 -3.68 -4.85 -2.83 -3.87 -4.71 -5.62 1.25 1.66 1.13 1.19 1.24 0.93 1.2 0.06 0.02 0.53 0.93 0.75 0.79
-4.42 -6.01 -4.86 -4.66 -6.45 -8.04 -5.18 -4.27 -4.94 -2.96 -4.54 -4.99 -6.02 1.29 1.6 1.21 1.23 1.08 0.79 1.12 0.09 0.29 0.66 1.17 0.83 0.56
-1.34 -0.72 -0.45 -0.55 -0.29 0.02 -0.04 -0.19 -0.13 -0.2 -0.65 -0.73 -1.44 0.53 0.52 0.53 0.36 1.02 0.67 0.42 -0.33 -1.21 -0.37 0.43 0.34 0.42
-0.07 -0.71 -0.25 -0.36 -0.17 -0.21 -0.28 -0.31 -0.47 -0.47 -0.85 -0.9 -0.37 0.57 0.58 0.36 0.09 0.62 1.09 0.27 -0.91 -0.89 -0.13 -0.21 0.09 1.0
-0.01 -0.63 -0.28 -0.33 -0.16 -0.81 0.03 -0.14 -0.47 -0.36 -0.59 -0.77 -0.04 0.56 0.58 0.43 0.09 0.66 0.93 0.37 -1.27 -0.87 -0.32 -0.23 -0.08 0.93
-0.32 -0.24 -0.26 -0.43 -0.31 -0.18 -0.32 -0.49 -0.31 -0.28 -0.43 -0.38 -0.53 0.19 0.32 0.37 0.35 0.12 0.4 0.15 0.46 0.03 0.31 0.39 0.02 0.4
-0.98 -0.21 0.12 0.03 -0.28 0.15 -0.3 -0.04 0.13 0.52 0.39 0.11 -0.89 -0.3 -0.01 0.06 -0.53 0.35 0.78 0.59 -0.51 -2.11 0.01 -0.09 -0.8 0.87
-0.86 -1.09 -1.03 -0.81 -0.56 -0.3 -0.35 -0.51 -0.14 0.09 -0.09 -0.22 -0.8 -0.07 0.33 0.91 0.29 0.34 0.66 0.67 0.39 -0.29 1.06 -0.17 -0.35 -0.07
-0.71 -0.65 -0.68 -0.78 -0.33 -0.03 -0.5 -0.64 -0.9 -0.54 -0.7 -0.49 -0.83 0.7 0.33 0.38 0.06 0.33 0.43 -0.01 0.89 0.24 0.57 0.13 0.31 0.71
-0.06 -0.8 -0.22 -0.06 0.1 0.23 -0.12 -0.22 -0.13 -0.22 0.03 0.2 0.02 0.64 0.17 0.26 -0.04 -0.16 0.08 -0.32 0.29 -0.5 -0.13 0.34 -0.33 0.2
-0.29 -0.57 -0.53 -0.49 -0.47 -0.77 -0.58 -0.71 -0.59 -0.09 -0.12 0.12 -0.14 0.67 0.71 0.51 0.15 0.6 0.53 0.05 -0.24 -0.5 -0.39 0.72 -0.35 0.57
-0.64 -0.18 -0.31 -0.26 -0.03 -0.78 -0.15 -0.76 -0.1 -0.13 0.1 -0.41 -0.7 0.38 0.39 0.52 0.1 0.83 0.56 0.15 1.11 -1.4 -1.02 0.89 -1.66 -0.34
-0.23 -0.59 -0.43 -0.48 -0.54 -0.11 -0.07 0.07 0.2 0.04 0.27 0.46 0.22 0.08 0.15 0.15 -0.06 -0.73 -0.18 -0.05 0.33 -0.96 0.32 1.04 -0.43 -0.03
-0.57 -0.25 -0.27 -0.38 -0.31 -0.55 -0.32 -0.62 -0.71 -0.38 -0.81 -0.93 -1.07 0.17 0.24 0.52 0.07 0.95 1.01 0.59 0.74 -2.2 0.79 0.1 -0.49 0.46
-1.14 -1.54 -1.46 -1.45 -1.27 -1.1 -0.93 -1.11 -0.81 -0.44 -0.57 -0.5 -1.19 0.73 1.42 0.75 0.56 0.92 1.15 0.72 0.16 -1.04 0.41 0.19 -0.42 0.52
-3.08 -1.44 -0.14 0.11 0.01 0.24 0.7 0.63 0.6 0.08 -0.3 -0.55 -3.58 -0.46 -0.1 0.46 -0.1 0.54 0.21 0.54 0.82 -0.51 -0.04 -0.23 -0.45 -0.05
-0.55 -0.5 -0.63 -0.72 -0.79 -0.77 -0.39 -0.64 -0.71 -0.48 -0.63 -0.58 -0.61 1.22 0.28 0.84 0.49 0.45 0.79 0.18 0.16 -0.37 -1.27 0.38 -0.1 1.0
- - - - - -0.82 - - - - -2.41 -2.33 - 1.34 0.88 0.72 0.07 1.38 2.01 0.39 1.26 -1.09 -2.8 1.38 0.52 1.58
-1.99 -4.33 -2.57 -5.2 -2.91 -2.22 -3.12 -2.42 -1.95 -3.38 -3.3 -1.86 -2.14 -1.04 1.09 1.08 -0.9 2.21 1.45 -2.16 1.83 -2.41 2.28 0.49 -1.57 -0.53
-7.4 -4.65 -3.99 -3.37 -3.61 -4.63 -4.92 -3.6 -2.85 -1.74 -1.76 -2.25 -5.05 1.48 1.36 1.47 1.22 1.41 0.65 0.76 -0.56 -5.79 0.72 1.46 0.78 0.46
-0.91 -1.03 -0.95 -0.65 -0.47 -0.96 -0.66 -0.6 -0.28 0.19 0.14 0.06 -0.76 0.1 0.46 0.59 -0.21 0.77 0.93 0.17 0.8 -2.88 1.47 -0.27 -0.95 0.07
-0.65 -1.0 -0.8 -0.76 -0.66 -0.97 -0.37 -0.63 -0.7 -0.26 -0.58 -0.66 -0.96 0.46 0.64 0.72 0.54 1.18 1.24 0.53 0.65 -2.76 -0.47 0.18 -0.4 0.52
-0.63 -0.87 -0.81 -0.72 -0.62 -1.2 -0.31 -0.4 -0.57 -0.14 -0.23 -0.56 -0.88 0.21 0.46 0.79 0.41 1.03 0.95 0.3 0.85 -2.58 0.18 0.6 -0.6 0.31
-1.13 -1.42 -1.21 -0.93 -1.38 -1.84 -0.95 -1.26 -1.12 -0.6 -0.84 -0.89 -1.32 0.88 0.59 1.26 0.39 0.87 0.88 0.3 1.03 -0.25 0.16 0.64 0.09 0.51
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-1.48 -0.61 -0.53 -0.19 0.3 0.41 0.17 -0.17 -0.87 -0.97 -1.42 -1.64 -1.85 -0.12 0.53 0.18 0.22 1.07 1.28 0.38 0.02 -0.86 0.38 0.11 -0.22 0.6
-1.02 -0.89 -0.58 -0.36 -0.16 -0.09 0.19 0.09 0.0 -0.21 -0.34 -0.15 -0.96 0.1 -0.11 0.31 0.13 0.61 0.31 0.13 -0.21 0.53 0.06 0.25 0.26 0.55
-0.24 -0.67 -0.4 -0.72 -0.89 -0.84 -0.03 -0.08 -0.06 0.23 -0.11 -0.17 -0.14 1.03 0.22 0.78 0.46 0.93 0.56 0.23 -0.2 -0.61 -0.38 -1.14 -0.5 -0.04
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-1.23 -1.03 -0.72 -0.51 -0.15 0.01 -0.41 -0.43 -0.26 -0.27 -0.3 -0.33 -1.17 0.34 0.51 0.69 0.17 0.9 0.89 0.05 0.57 -0.14 0.74 -0.0 -0.69 -0.33
-0.84 -1.07 -1.15 -0.75 -0.53 -0.82 -0.26 -0.18 -0.45 -0.11 -0.18 -0.4 -0.49 0.66 0.36 1.0 0.3 0.71 0.58 0.24 0.96 0.17 -0.53 -0.21 0.13 -0.29
-0.17 -1.29 -1.03 -0.98 -2.16 -0.97 -0.81 -0.53 -0.46 -0.48 -0.64 -1.14 -1.0 1.36 0.81 1.54 0.41 1.04 1.23 0.24 -0.15 -1.11 -1.68 -1.12 -0.33 0.67
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-2.68 -2.01 -1.46 -0.89 -0.08 0.32 0.15 -0.26 0.18 -0.2 -0.71 -1.17 -1.83 1.4 0.71 0.92 0.67 1.21 0.85 0.69 0.2 -0.78 -0.79 -1.3 -0.98 -0.99
-1.24 -0.67 -0.43 -0.35 -0.33 0.16 -0.06 -0.27 -0.46 -0.54 -0.82 -0.81 -1.25 0.31 0.04 0.59 -0.03 1.25 1.02 0.1 -0.1 -0.12 -0.34 0.13 0.45 0.51
-0.42 -1.26 -0.78 -0.42 -0.75 -0.35 -0.11 -0.46 -0.34 -0.17 -0.1 -0.11 -0.69 0.85 -0.41 0.44 -0.22 0.19 0.24 -0.14 0.58 -0.34 0.12 0.91 0.29 0.87
-1.18 -0.67 -0.73 -0.63 -1.02 -1.84 -0.82 -0.86 -0.4 0.08 0.14 0.22 -0.92 0.73 0.33 0.41 0.91 0.93 0.76 0.27 -0.35 -1.63 1.23 0.43 -0.52 -0.38
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.