1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_60 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.38 0.05 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.44 0.47 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.94
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.23 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.36 0.4 0.17 0.49 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.29 0.39 0.0 0.0 0.0 0.23 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.16 0.95 0.76 0.91 0.19 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.41 0.4 0.78 0.0 0.04 0.04 0.13 0.29 0.04 0.33 0.3 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.6 0.4 0.0 0.08 0.0 0.63 0.89 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.14 0.15 0.14 0.14 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.67 0.1 0.0 0.22 0.0 0.62 0.71 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.52
0.18 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.3 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.03 0.21 0.0 0.11 1.0
0.11 0.09 0.12 0.09 0.37 0.12 0.12 0.12 0.18 0.25 0.42 0.32 0.22 0.12 0.07 0.05 0.11 0.21 0.12 0.06 0.18 0.43 0.13 0.0 0.22 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.03 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.48 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.09 0.1 0.0 0.09 0.1 0.0 0.12 0.0 0.09 0.0 0.17 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.09 0.12 0.07 0.0 0.29 0.3 0.08 0.0 0.29 1.0
0.18 0.0 0.0 0.31 0.49 0.07 0.22 0.51 0.67 0.27 1.0 0.31 0.0 0.14 0.0 0.07 0.0 0.05 0.0 0.13 0.15 0.06 0.46 0.1 0.18 0.89
0.53 0.18 0.0 0.0 0.33 0.16 1.0 0.35 0.16 0.46 0.0 0.17 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.1 0.96
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.11 0.25 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.28 0.2 0.18 0.58 0.78 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.21 0.0 0.03 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.35 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76
0.07 0.17 0.09 0.09 0.52 0.0 0.0 0.09 0.49 0.08 0.26 0.0 0.0 0.5 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.44 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.31 0.27 0.0 0.68 0.4 0.37 0.27 0.14 0.13 0.92 0.86 0.49 0.35 0.0 0.5 0.0 0.44 0.1 0.11 0.0 0.0 0.59 0.36 0.51 1.0
0.05 0.36 0.0 0.78 0.11 0.0 0.0 0.38 0.27 0.09 0.05 0.18 0.06 0.08 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.37 0.68 0.9 0.39 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.08 0.31 0.13 0.83 0.03 0.0 0.0 0.16 0.03 0.06 0.35 0.68 1.0
0.0 0.04 0.0 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.04 0.25 0.09 0.48 0.08 0.01 0.0 0.18 0.02 0.09 0.73 0.63 1.0
0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.09 0.4 0.14 0.62 0.03 0.02 0.01 0.13 0.12 0.1 0.68 0.52 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.13 0.06 0.06 0.0 0.06 0.06 0.0 0.39 0.12 0.06 0.0 0.09 0.21 0.0 0.03 0.04 0.04 0.09 0.04 1.0
0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.21 0.47 0.31 0.0 0.19 0.16 1.0
0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.19 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.23 0.1 0.0 0.0 0.0 0.11 0.1 0.14 0.46 0.1 0.0 0.26 0.0 0.0 1.0 0.62 0.08 0.26 0.99 0.96
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.36 0.0 0.0 0.23 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.65 0.94 0.29 0.15 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.69 1.0 0.71 0.89
0.39 0.0 0.47 0.0 0.15 0.0 0.0 0.43 0.0 0.17 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.51 0.33 0.76 0.14 0.14 0.0 0.49 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.38 1.0
0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 1.0 0.0 0.39 0.0 0.11 0.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)