Heatmap: Cluster_220 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.67 0.6 0.55 0.74 1.0 0.93 0.83 0.76 0.68 0.55 0.54 0.5 0.52 0.29 0.32 0.37 0.4 0.45 0.5 0.4 0.04 0.75 0.33 0.34 0.65 0.58
0.33 0.46 0.51 0.77 0.7 0.53 0.65 0.83 0.65 0.38 0.44 0.41 0.26 0.34 0.38 0.4 0.3 0.7 0.44 0.3 0.03 1.0 0.34 0.29 0.75 0.66
0.2 0.24 0.49 0.7 0.65 0.61 1.0 0.93 0.85 0.53 0.35 0.27 0.15 0.42 0.49 0.73 0.62 0.8 0.63 0.48 0.1 0.67 0.49 0.52 0.83 0.61
0.03 0.09 0.08 0.48 0.7 1.0 0.8 0.75 0.72 0.52 0.48 0.34 0.11 0.48 0.24 0.59 0.28 0.66 0.51 0.32 0.05 0.33 0.49 0.27 0.54 0.38
0.78 0.82 0.83 0.83 0.67 0.56 0.57 0.67 0.56 0.58 0.64 0.82 0.78 0.31 0.46 0.41 0.36 0.49 0.35 0.36 0.05 0.51 0.68 0.43 1.0 0.78
0.03 0.26 0.32 0.48 0.57 0.33 0.37 0.41 0.56 0.62 0.7 0.48 0.03 0.32 0.2 0.26 0.44 0.34 0.33 0.35 0.03 0.77 0.39 0.57 1.0 0.72
0.15 0.23 0.27 0.58 0.64 0.51 0.68 0.58 0.49 0.32 0.26 0.19 0.05 0.15 0.21 0.26 0.22 0.36 0.27 0.25 0.06 1.0 0.12 0.23 0.66 0.38
0.15 0.3 0.5 0.66 0.69 0.69 1.0 0.81 0.77 0.53 0.47 0.39 0.11 0.51 0.56 0.6 0.5 0.79 0.58 0.43 0.12 0.89 0.69 0.48 0.99 0.81
0.32 0.44 0.51 0.88 0.82 0.57 0.72 0.77 0.72 0.64 0.61 0.49 0.27 0.32 0.43 0.38 0.6 0.63 0.53 0.48 0.03 0.78 0.33 0.38 1.0 0.58
0.34 0.61 0.53 0.82 0.88 0.68 0.88 0.98 0.86 0.74 0.67 0.54 0.26 0.37 0.46 0.41 0.59 0.81 0.76 0.64 0.03 1.0 0.56 0.29 1.0 0.56
0.27 0.62 0.73 0.86 0.87 0.75 0.85 0.91 0.94 0.7 0.65 0.57 0.14 0.26 0.48 0.35 0.65 0.95 0.68 0.99 0.0 1.0 0.75 0.46 0.87 0.67
0.55 0.49 0.46 0.59 0.7 0.59 0.65 0.64 0.53 0.61 0.6 0.58 0.59 0.41 0.39 0.71 0.3 0.62 0.5 0.3 0.17 1.0 0.33 0.51 0.81 0.61
0.45 0.41 0.46 0.55 0.7 0.72 1.0 0.91 0.88 0.69 0.65 0.52 0.34 0.54 0.49 0.59 0.52 0.75 0.7 0.55 0.05 0.71 0.61 0.57 0.86 0.6
0.48 0.36 0.27 0.51 0.46 0.45 0.61 0.72 0.65 0.5 0.43 0.29 0.24 0.27 0.2 0.3 0.23 0.43 0.33 0.31 0.09 1.0 0.3 0.32 0.58 0.49
0.5 0.55 0.5 0.8 0.89 0.67 0.77 0.69 0.9 0.82 1.0 0.67 0.24 0.49 0.59 0.49 0.6 0.89 0.95 0.64 0.01 0.91 0.42 0.72 0.81 0.72
0.03 0.16 0.2 0.43 0.72 0.73 1.0 0.83 0.92 0.56 0.43 0.38 0.04 0.27 0.34 0.33 0.47 0.57 0.54 0.62 0.09 0.64 0.74 0.61 0.55 0.34
0.26 0.28 0.29 0.48 0.63 0.56 0.84 0.72 0.65 0.45 0.36 0.23 0.21 0.41 0.44 0.5 0.52 0.6 0.51 0.42 0.24 0.77 0.78 0.56 1.0 0.59
0.15 0.44 0.54 0.78 0.91 1.0 0.87 0.92 0.78 0.7 0.55 0.42 0.1 0.39 0.52 0.5 0.45 0.56 0.58 0.43 0.14 0.59 0.79 0.44 0.74 0.48
0.34 0.48 0.5 0.78 0.68 0.68 0.73 0.66 0.59 0.6 0.46 0.57 0.32 0.61 0.62 0.5 0.31 0.76 0.78 0.24 0.21 1.0 0.72 0.65 0.87 0.65
0.45 0.55 0.59 0.87 0.99 0.75 0.8 0.83 0.99 0.91 0.87 0.76 0.29 0.73 0.75 0.57 0.56 1.0 0.94 0.64 0.02 0.55 0.68 0.76 0.78 0.64
0.04 0.05 0.25 0.35 0.49 0.51 0.47 0.57 0.64 0.43 0.35 0.35 0.04 0.4 0.48 0.31 0.23 0.46 0.44 0.24 0.17 1.0 0.76 0.19 0.86 0.44
0.47 0.79 0.89 1.0 0.87 0.75 0.85 0.93 0.91 0.89 0.8 0.69 0.54 0.38 0.57 0.47 0.56 0.8 0.61 0.61 0.05 0.95 0.63 0.49 0.75 0.5
0.4 0.49 0.5 0.72 0.84 0.72 0.83 0.82 0.82 0.65 0.7 0.58 0.35 0.6 0.63 0.61 0.52 0.8 0.77 0.52 0.31 0.87 1.0 0.69 0.99 0.86
0.44 0.4 0.43 0.49 0.59 0.49 0.61 0.6 0.55 0.5 0.47 0.33 0.37 0.42 0.29 0.44 0.37 0.47 0.44 0.39 0.17 1.0 0.42 0.49 0.81 0.49
0.46 0.62 0.6 0.91 1.0 0.72 0.76 0.72 0.72 0.51 0.55 0.47 0.22 0.35 0.47 0.44 0.47 0.77 0.65 0.48 0.03 0.67 0.84 0.32 0.97 0.68
0.33 0.55 0.58 0.85 0.86 0.85 0.89 0.87 1.0 0.67 0.68 0.59 0.3 0.72 0.78 0.85 0.69 0.93 0.9 0.6 0.14 0.65 0.69 0.58 0.99 0.75
0.04 0.06 0.26 0.37 0.39 0.45 1.0 0.83 0.82 0.46 0.32 0.25 0.05 0.31 0.26 0.51 0.43 0.52 0.39 0.4 0.1 0.87 0.3 0.29 0.92 0.46
0.44 0.31 0.38 0.67 0.89 0.94 1.0 0.86 0.56 0.42 0.44 0.36 0.3 0.32 0.35 0.36 0.37 0.41 0.54 0.42 0.05 0.89 0.47 0.46 0.71 0.57
0.4 0.43 0.57 0.73 0.83 0.7 0.69 0.67 0.58 0.54 0.53 0.43 0.39 0.29 0.4 0.38 0.36 0.75 0.47 0.46 0.07 1.0 0.57 0.36 0.83 0.44
0.69 0.37 0.26 0.42 0.4 0.33 0.52 0.68 0.54 0.49 0.49 0.33 0.5 0.21 0.17 0.2 0.23 0.41 0.33 0.24 0.06 1.0 0.41 0.4 0.75 0.45
0.36 0.5 0.56 0.63 0.78 0.73 1.0 0.97 0.93 0.55 0.52 0.42 0.21 0.4 0.54 0.61 0.57 0.86 0.66 0.71 0.18 0.98 0.66 0.72 0.66 0.53
0.22 0.28 0.34 0.73 0.81 0.89 1.0 0.91 0.67 0.52 0.46 0.27 0.19 0.39 0.26 0.43 0.34 0.51 0.41 0.35 0.04 0.9 0.6 0.52 0.97 0.49
0.55 0.38 0.48 0.62 0.71 0.95 1.0 0.89 0.59 0.45 0.44 0.51 0.63 0.51 0.4 0.64 0.47 0.55 0.62 0.54 0.13 0.66 0.5 0.34 0.53 0.51
0.29 0.5 0.61 0.93 0.81 0.48 0.62 0.78 0.58 0.62 0.67 0.5 0.17 0.34 0.28 0.32 0.38 0.55 0.45 0.4 0.01 0.83 0.45 0.58 1.0 0.69
0.32 0.5 0.54 0.58 0.7 0.76 0.6 0.54 0.51 0.48 0.4 0.4 0.26 0.52 0.61 0.55 0.43 0.83 0.58 0.37 0.21 0.91 0.42 0.6 1.0 0.73
0.12 0.24 0.19 0.28 0.56 1.0 0.94 0.99 0.32 0.26 0.13 0.08 0.14 0.31 0.11 0.16 0.32 0.63 0.54 0.52 0.06 0.7 0.55 0.28 0.43 0.45
0.05 0.1 0.32 0.75 1.0 0.79 0.63 0.56 0.63 0.63 0.48 0.42 0.07 0.44 0.37 0.47 0.38 0.73 0.48 0.43 0.07 0.6 0.73 0.4 0.84 0.66
0.06 0.49 0.55 0.74 0.9 0.92 0.66 0.66 0.54 0.54 0.54 0.38 0.07 0.39 0.37 0.4 0.35 0.7 0.61 0.43 0.0 1.0 0.43 0.53 0.92 0.78
0.17 0.29 0.28 0.46 0.6 0.43 0.78 0.73 0.82 0.47 0.49 0.41 0.2 0.39 0.44 0.4 0.45 0.47 0.49 0.41 0.08 1.0 0.52 0.55 0.95 0.53
0.33 0.45 0.56 0.82 0.88 0.81 1.0 0.91 0.75 0.57 0.52 0.47 0.24 0.45 0.48 0.56 0.6 0.89 0.7 0.56 0.15 0.78 0.64 0.59 0.84 0.65
0.49 0.45 0.44 0.7 0.8 0.72 0.77 0.75 0.4 0.46 0.49 0.42 0.36 0.33 0.29 0.34 0.29 0.4 0.41 0.39 0.03 1.0 0.3 0.33 0.92 0.58
0.37 0.4 0.33 0.52 0.58 0.72 0.75 0.65 0.65 0.51 0.5 0.44 0.26 0.36 0.36 0.39 0.39 0.61 0.43 0.41 0.04 1.0 0.75 0.56 0.67 0.42
0.45 0.48 0.53 0.74 1.0 0.77 0.87 0.75 0.62 0.65 0.59 0.54 0.28 0.54 0.53 0.49 0.6 0.6 0.51 0.44 0.04 0.8 0.61 0.59 0.88 0.6
0.08 0.3 0.54 0.78 0.54 0.47 0.53 0.61 0.51 0.52 0.68 0.46 0.06 0.2 0.22 0.17 0.3 0.39 0.38 0.45 0.0 0.76 0.37 0.54 1.0 0.66
0.29 0.51 0.44 0.8 0.99 1.0 0.96 0.77 0.66 0.55 0.56 0.52 0.27 0.51 0.47 0.66 0.49 0.73 0.7 0.56 0.07 0.55 0.77 0.41 0.66 0.5
0.57 0.61 0.58 0.95 1.0 0.83 0.65 0.7 0.62 0.6 0.66 0.76 0.63 0.35 0.29 0.36 0.4 0.49 0.45 0.43 0.05 0.73 0.53 0.51 0.74 0.68
0.1 0.31 0.45 0.59 0.79 0.75 1.0 0.82 0.77 0.74 0.66 0.38 0.11 0.58 0.47 0.45 0.32 0.41 0.38 0.32 0.25 0.59 0.68 0.35 0.77 0.58
0.37 0.56 0.65 1.0 0.83 0.5 0.55 0.7 0.59 0.61 0.71 0.55 0.24 0.52 0.41 0.44 0.4 0.64 0.47 0.43 0.02 0.92 0.51 0.46 0.93 0.75
0.59 0.5 0.5 0.72 0.7 0.58 0.81 0.95 0.74 0.72 0.63 0.43 0.45 0.36 0.36 0.51 0.54 0.69 0.56 0.7 0.12 1.0 0.61 0.54 0.84 0.72
0.15 0.36 0.41 0.53 0.73 0.87 0.89 0.76 0.66 0.62 0.63 0.48 0.17 0.47 0.56 0.53 0.51 0.76 0.73 0.47 0.16 0.61 0.87 0.79 1.0 0.74
0.03 0.3 0.38 0.61 0.72 0.63 0.67 0.58 0.72 0.56 0.48 0.32 0.04 0.34 0.38 0.37 0.47 0.7 0.53 0.45 0.03 1.0 0.54 0.59 0.84 0.55
0.44 0.64 0.45 0.59 0.7 0.63 0.62 0.65 0.79 0.64 0.69 0.57 0.45 0.44 0.62 0.37 0.4 0.67 0.51 0.52 0.04 1.0 0.37 0.43 0.66 0.55
0.55 0.47 0.45 0.7 0.84 0.84 0.92 1.0 0.67 0.51 0.56 0.34 0.39 0.4 0.34 0.53 0.46 0.62 0.6 0.45 0.29 0.8 0.58 0.58 0.92 0.69
0.13 0.56 0.62 0.93 0.93 0.75 0.84 0.85 0.73 0.98 0.84 0.88 0.14 0.27 0.34 0.32 0.6 0.78 0.73 0.74 0.03 0.94 0.53 0.47 1.0 0.65
0.01 0.11 0.23 0.46 0.52 0.37 0.41 0.39 0.47 0.4 0.34 0.24 0.02 0.41 0.41 0.41 0.38 0.41 0.36 0.25 0.07 1.0 0.42 0.53 0.82 0.43
0.62 0.76 0.62 0.85 1.0 0.78 0.89 0.92 0.86 0.81 0.75 0.62 0.42 0.46 0.64 0.54 0.64 0.95 0.77 0.75 0.04 0.83 0.71 0.65 0.86 0.62
0.17 0.29 0.22 0.42 0.42 0.42 0.63 0.61 0.59 0.47 0.41 0.36 0.16 0.4 0.3 0.41 0.25 0.59 0.5 0.33 0.07 0.37 0.66 0.6 1.0 0.5

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)