1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_62 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - 2.56 - - - - - - 3.29 2.3 2.44 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 1.46 - 3.79 - - - 2.25 - - - - 2.24 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.88 - - - - - 2.69 2.6 2.61 - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.07 - - - 0.27 - 0.06 0.98 - - - - 1.56 0.05 1.16 -0.68 - - - 2.71 - - - -
0.74 2.51 - - - - - - 2.39 2.22 - - - 0.88 2.01 - - 1.52 - - - - - - - -
- - 4.47 - - - - - - 1.93 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.13 1.4 - - - - - - - - - - - - 2.55 - - - - - - - - -
- - 4.11 - - - 3.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.69 - - - - 3.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.92 2.0 - - - - - 2.87 - - - - - - - 2.38 - - 0.98 - - - - -
- - 3.72 - - - - - - - 3.68 - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.76 1.92 - -0.7 - - - - 0.51 - - - 0.55 - -0.26 -0.43 -1.15 1.17 0.92 -0.85 2.22 -1.07 - 0.51 1.9
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.48 -0.06 - - -0.16 1.81 - 1.0 1.89 - 1.04 -0.17 -0.65 - 0.92 - -0.81 - - 1.77 - 1.06 0.54 0.29 -
1.68 -0.61 -1.26 0.17 -0.44 -0.59 -1.49 0.67 1.23 1.61 0.9 -1.4 -1.1 - 1.42 - -1.26 -0.83 -0.57 -0.58 -2.48 -0.82 0.3 0.27 -1.14 -1.03
1.83 - 3.7 - - - - - - 1.65 2.66 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 3.41 - - - 1.65 - - - 1.65 - - 1.25 1.84 - - 1.62 -
-0.74 - - - - - 1.16 - - 2.09 1.5 -0.35 -0.0 -0.09 -0.52 2.26 - 1.32 - - - - - - 1.92 0.64
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
0.66 - - - - - - 1.18 - 2.92 0.89 - 0.86 - 0.88 - - 1.37 - - - - - - 1.91 1.46
- - - - - - - - - 3.49 1.52 - - - 1.46 - - - 1.2 1.18 2.2 - - - - -
2.94 - - - - - - - - 4.2 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.93 - - - - - - 1.88 - - - - 1.67 2.07 - - - - 0.99 - - - - 2.42
1.07 - - - 0.27 - - - - 2.88 1.9 - - - 1.29 - - 1.29 - - 1.56 - - 0.98 - 0.84
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.72 - - - - - - 3.68 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.29 - - - - - 2.27 - 2.25 - - - 2.04 - - - - - - - - 2.89 - -
- - - - - - - - - 4.12 - - - - 3.1 - - - - - - - - - - -
- - - 2.4 2.15 2.46 - 2.47 - 2.4 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.45 0.48 - - - - - - 0.33 - - - - - 0.63 - - - - - - - - -
- - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.53 1.61 2.4 - - - - 3.73 - - - - - - - - - - 0.59 - - - - -
- - - - - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - -
0.94 - 3.2 1.83 2.65 - - - - - - -0.04 - - 1.78 - - - - - - -0.52 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.83 - - - - - 3.56 -
- - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.35 - - 3.29 - - - - - - - 2.59 - - - - - - - -
- - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.61 - - - - - 1.07 1.51 - 2.16 2.15 - - 1.03 - - - - 0.61 - 1.98 - - - -0.06 1.12
- -0.37 4.14 -0.43 - - -0.3 - -0.46 - -0.58 - - - - - - - -0.86 1.69 -1.49 -0.9 - - - -
- - - -0.35 - - - - 1.72 3.89 - - - - - 2.0 - -0.45 -0.31 - - - 0.62 - - -
1.72 -2.09 0.33 1.73 0.92 -1.66 0.23 0.8 0.9 2.67 0.63 0.74 -0.28 - -1.76 - - - - - - - - - - -2.18
- - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.21 - - - - - - - - - - - 2.12 - 2.18 - 2.2 2.13 - 1.82 - - - -
- - - 1.47 - - - - 1.98 2.33 1.35 0.48 - 1.8 - - - 0.85 1.03 1.01 -0.05 - - - - -
- - - - - - - - - 4.01 - - - - - - - 3.31 - - - - - - - -
0.47 0.59 - - 0.53 0.35 2.9 1.46 0.46 2.29 0.27 1.45 - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.31 - - - - 3.34 - - - - - - - - - 2.57 - - - - - - - -
- - 3.55 - - - - 3.16 - - - - - - - - -0.97 - 1.5 - - - - - - 0.99
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.71 - - - - - 1.58 - - 2.52 1.53 - - - - - - - - - 3.06 - - 1.47 - -
2.64 - - - 2.65 - - - - 2.9 - - - - - - - - 2.59 - - - - - - -
- - 0.87 - 1.59 - - -0.23 -0.13 2.27 -0.32 - 0.18 0.75 -0.5 -0.36 - 0.71 2.03 - -0.22 - - - 0.72 0.33

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.