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Heatmap: Cluster_39 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.25 - - 4.04 - - - - -
- - - - - - - - - - 2.75 - - - - - - - - - 4.27 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - 1.98 - - - - - - - - - 1.32 - - - - 1.83 - 3.77 - 1.24 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - 2.1 - - - - 2.82 - - - - - - - - - 1.83 3.47 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
-1.27 0.06 -0.31 - 0.49 - - 0.74 0.38 -0.47 1.06 -0.28 -1.72 - -0.52 -2.13 - -0.44 -2.47 -0.62 3.05 -0.64 1.07 -0.82 - 0.4
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 2.7 2.26 - - - - - 3.88 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
0.39 - - - - 0.71 - - - 0.61 - - - - - - - -0.05 0.34 - 4.27 - - - - -
-0.63 -0.49 -0.9 0.03 0.89 1.25 1.12 0.17 0.96 0.55 0.37 -0.09 -0.85 -0.81 -1.64 -1.62 -1.26 -1.38 -0.88 -0.44 1.9 -1.84 -0.45 -2.92 -0.79 -0.72
- - - - - - - - - - - - 3.03 - - - - - - - 4.16 - - - - -
- - - - - - - - - 3.06 - - - - - - - - - - 4.14 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.83 - - 3.56 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - 1.37 - - - - - - - 1.19 4.4 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - 2.77 - - - - - - - - - - - - 4.26 - - - - -
- - - - - - - - - 3.29 - - - - - 1.78 - - - - 3.67 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.29 - 2.69 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - 0.16 - -0.65 - - - - - -0.83 - - - - - 1.25 -0.58 -1.19 - 4.08 - -1.21 - -1.45 1.33
- - - - 1.56 0.52 1.84 - - - - - - - - - - -0.08 - - 3.9 - 1.13 - - -
- - - - 0.1 - 0.21 - - - - - - - - - - - - - 3.81 - 1.69 1.81 0.56 0.63
- - - - 2.41 - - -0.4 - - - -0.52 - - - -0.47 - -1.15 - - 3.8 -1.0 1.84 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.43 0.22 - 1.22 -0.06 -
- - - - - - - - - - 2.27 - - - - - - - - - 4.4 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.39 - - - 2.34 -
-0.75 1.41 - - 0.82 - -0.88 0.23 1.27 - 0.69 -0.8 -0.99 - - - - 1.16 - -1.27 3.0 - -0.26 -0.28 0.06 -0.31
-0.26 -1.35 -1.09 -0.95 -0.27 -1.75 -0.1 0.26 0.76 -0.33 0.35 -0.68 -0.76 -0.43 -0.42 -1.49 -1.13 -2.26 0.25 -1.46 3.18 -2.83 -0.28 -1.33 -1.12 -0.72
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.29 - - 2.32 - 0.52
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - 1.61 - - - - - - 1.5 - - - - - 4.33 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 1.29 - - - - - 1.79 3.62 - - - 1.2 2.46
- - - -2.88 - - - - -2.71 -1.63 - - - - 0.44 0.95 - -1.66 - - 3.44 -1.38 1.3 2.34 -0.8 1.27
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - -0.69 -0.75 - -0.44 - 1.06 0.82 - - - 0.77 0.69 -0.67 - -1.24 -1.0 -0.97 3.49 - 0.91 - -1.32 0.36
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.52 - - - 1.61 -
- - - - - - 2.68 2.36 - - - - - - - - - - - - 3.86 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - 2.44 - - - - - 2.71 2.36 - - 3.15 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.49 -1.67 -0.68 -0.02 -0.17 -0.8 -0.19 -1.31 -1.05 -0.83 0.07 -0.15 -0.19 0.72 0.79 -1.54 -0.76 0.27 -0.17 0.21 2.48 -1.81 -0.73 0.34 -1.36 0.09
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.51 - - - - - - - - - - - - - 1.29 - - 1.25 -0.21 - 4.24 -0.46 - - - -
- - - - 0.73 - - - - - - - - - - - - 0.29 - - 3.4 - 1.86 1.44 2.64 -
-0.29 - - 1.38 -0.52 -0.52 -0.22 -0.21 1.03 - - -0.33 - - - - - - - - 3.58 - 1.55 - -1.1 0.4
- - - - - - - -0.03 - - - - - - - - - - - - 3.36 - 2.56 - 2.75 1.08
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.33 - - - - - - - - -0.37 1.27 - - 1.1 - 1.16 - - - - 4.14 - - - - -
- - - - - - - - - - 2.42 - - - - - - - 2.45 - 3.92 - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.