Heatmap: Cluster_120 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.7 0.81 0.76 0.71 0.54 0.35 0.25 0.33 0.33 0.41 0.45 0.54 0.54 0.19 0.22 0.15 0.43 0.51 0.48 0.57 0.19 0.97 0.5 0.74 1.0 0.86
0.55 0.86 0.93 1.0 0.9 0.8 0.59 0.62 0.6 0.39 0.45 0.33 0.39 0.33 0.27 0.22 0.23 0.47 0.6 0.61 0.52 0.22 0.18 0.32 0.57 0.81
0.92 0.97 1.0 0.87 0.76 0.69 0.65 0.77 0.73 0.64 0.75 0.73 0.73 0.59 0.57 0.67 0.65 0.72 0.67 0.93 0.49 0.93 0.49 0.78 0.94 0.99
0.94 0.93 1.0 0.95 0.81 0.78 0.76 0.88 0.9 0.69 0.73 0.77 0.83 0.58 0.54 0.73 0.59 0.72 0.66 0.88 0.28 1.0 0.44 0.68 0.79 0.86
0.33 0.49 0.75 0.84 0.63 0.48 0.41 0.43 0.2 0.23 0.28 0.38 0.68 0.12 0.15 0.16 0.5 0.35 0.28 0.3 0.32 0.45 1.0 0.4 0.82 0.91
0.6 0.67 0.62 0.57 0.52 0.47 0.46 0.48 0.51 0.36 0.41 0.45 0.5 0.32 0.38 0.46 0.43 0.47 0.52 0.49 0.18 1.0 0.64 0.84 0.75 0.76
0.72 0.67 0.93 1.0 0.46 0.16 0.16 0.3 0.08 0.06 0.1 0.13 0.52 0.48 0.43 0.39 0.16 0.29 0.25 0.2 0.16 0.53 0.08 0.21 0.6 0.83
0.31 0.15 0.19 0.59 0.67 0.32 0.27 0.38 0.16 0.15 0.23 0.14 0.15 0.08 0.03 0.04 0.03 0.1 0.04 0.08 0.05 1.0 0.41 0.16 0.6 0.49
0.81 0.97 0.99 0.95 0.76 0.63 0.72 0.86 0.87 0.68 0.67 0.67 0.76 0.44 0.42 0.52 0.58 0.67 0.52 0.77 0.17 1.0 0.17 0.4 0.82 0.69
0.23 0.12 0.09 0.28 0.2 0.09 0.35 0.36 0.46 0.28 0.21 0.23 0.08 0.14 0.2 0.15 0.06 0.36 0.23 0.24 0.46 0.68 1.0 0.42 0.76 0.46
0.5 0.7 0.64 1.0 0.7 0.36 0.51 0.68 0.14 0.18 0.22 0.2 0.56 0.04 0.04 0.05 0.08 0.18 0.15 0.28 0.12 0.94 0.11 0.16 0.62 0.5
0.61 0.81 0.75 0.88 0.83 0.71 0.55 0.47 0.45 0.36 0.38 0.38 0.52 0.41 0.37 0.75 0.37 0.67 0.52 0.42 0.08 1.0 0.24 0.33 0.92 0.56
0.36 0.48 0.9 1.0 0.5 0.12 0.14 0.2 0.02 0.05 0.08 0.14 0.41 0.09 0.04 0.16 0.05 0.06 0.05 0.21 0.29 0.6 0.12 0.14 0.62 0.78
0.32 0.45 0.68 1.0 0.41 0.13 0.13 0.19 0.03 0.05 0.08 0.15 0.38 0.07 0.03 0.27 0.05 0.05 0.04 0.19 0.25 0.47 0.11 0.13 0.52 0.75
0.34 0.24 0.19 0.63 0.44 0.17 0.22 0.29 0.13 0.14 0.19 0.16 0.39 0.05 0.04 0.07 0.02 0.11 0.06 0.07 0.07 1.0 0.28 0.18 0.6 0.42
0.76 0.42 0.25 0.22 0.12 0.1 0.22 0.32 0.21 0.32 0.31 0.44 0.72 0.59 0.3 0.54 0.32 0.56 0.28 0.27 0.26 0.63 0.68 0.63 1.0 0.95
0.49 0.43 0.49 0.51 0.53 0.6 0.62 0.69 0.71 0.63 0.62 0.62 0.45 0.43 0.43 0.37 0.43 0.65 0.53 0.53 0.47 0.9 0.8 0.94 1.0 0.94
0.37 0.41 0.5 0.61 0.42 0.24 0.21 0.28 0.17 0.12 0.14 0.14 0.17 0.22 0.27 0.52 0.19 0.23 0.24 0.23 0.53 0.84 0.72 0.47 1.0 0.81
0.64 0.57 0.64 0.7 0.55 0.4 0.28 0.35 0.28 0.24 0.25 0.37 0.58 0.37 0.75 0.37 0.31 0.39 0.33 0.31 0.22 0.87 0.57 0.5 0.79 1.0
0.22 0.93 1.0 0.97 0.93 0.72 0.47 0.4 0.35 0.37 0.41 0.33 0.12 0.56 0.58 0.49 0.62 0.81 0.62 0.55 0.04 0.99 0.4 0.59 0.8 0.68
0.64 1.0 1.0 0.9 0.84 0.73 0.58 0.61 0.7 0.64 0.53 0.53 0.59 0.54 0.58 0.63 0.67 0.72 0.76 0.89 0.6 0.93 0.47 0.36 0.81 0.71
0.6 0.63 0.77 0.89 0.6 0.38 0.64 0.74 0.2 0.28 0.32 0.37 0.67 0.18 0.15 0.21 0.17 0.21 0.22 0.44 0.4 0.86 0.19 0.44 0.75 1.0
0.31 0.43 0.54 0.59 0.36 0.19 0.29 0.39 0.08 0.1 0.11 0.12 0.33 0.19 0.32 0.15 0.16 0.11 0.09 0.11 0.31 1.0 0.09 0.2 0.68 0.59
0.76 0.95 0.96 0.83 0.71 0.64 0.69 0.74 0.73 0.56 0.49 0.47 0.64 0.57 0.63 0.63 0.69 0.66 0.65 0.95 0.5 1.0 0.34 0.48 0.85 0.82
0.54 0.43 0.52 0.5 0.29 0.24 0.22 0.31 0.21 0.19 0.27 0.4 0.5 0.2 0.16 0.43 0.17 0.14 0.14 0.22 0.61 0.8 1.0 0.69 0.74 0.97
0.49 0.25 0.3 0.58 0.38 0.27 0.29 0.31 0.31 0.36 0.41 0.43 0.44 0.39 0.27 0.34 0.24 0.22 0.25 0.15 0.25 0.7 0.43 0.87 1.0 0.54
0.95 0.98 1.0 0.97 0.85 0.69 0.61 0.76 0.78 0.49 0.56 0.61 0.82 0.51 0.54 0.62 0.59 0.7 0.62 0.82 0.41 0.99 0.32 0.51 0.9 0.92
0.13 0.15 0.18 0.35 0.21 0.25 0.18 0.31 0.21 0.13 0.15 0.09 0.07 0.05 0.07 0.07 0.05 0.06 0.08 0.07 0.24 1.0 0.38 0.31 0.53 0.49
0.15 0.17 0.18 0.38 0.26 0.21 0.24 0.32 0.18 0.16 0.18 0.16 0.07 0.1 0.14 0.13 0.11 0.14 0.14 0.17 0.33 1.0 0.46 0.36 0.62 0.72
0.19 0.36 0.49 0.39 0.24 0.21 0.27 0.3 0.17 0.18 0.16 0.14 0.14 0.14 0.16 0.09 0.13 0.23 0.24 0.28 0.18 1.0 0.39 0.25 0.73 0.81
0.77 0.91 0.9 0.81 0.73 0.66 0.5 0.54 0.56 0.45 0.49 0.59 0.78 0.66 0.36 0.93 0.66 0.37 0.39 0.61 0.47 0.63 0.4 0.52 1.0 0.62
0.34 0.51 0.64 0.68 0.52 0.46 0.4 0.41 0.36 0.31 0.34 0.34 0.4 0.26 0.19 0.33 0.22 0.31 0.24 0.24 0.43 0.62 1.0 0.48 0.71 0.63
0.75 0.41 0.38 0.64 0.51 0.49 0.57 0.55 0.53 0.45 0.58 0.54 0.54 0.23 0.24 0.24 0.23 0.61 0.44 0.3 0.24 0.77 0.73 0.98 0.87 1.0
0.55 0.21 0.28 0.64 0.38 0.26 0.32 0.69 0.47 0.28 0.36 0.17 0.21 0.04 0.07 0.31 0.04 0.12 0.17 0.14 0.08 1.0 0.05 0.13 0.71 0.87
0.33 0.52 0.44 0.38 0.45 0.39 0.28 0.31 0.32 0.25 0.22 0.24 0.31 0.28 0.31 0.28 0.36 0.43 0.4 0.47 0.18 1.0 0.17 0.33 0.84 0.61
1.0 0.87 0.69 0.46 0.5 0.43 0.41 0.52 0.46 0.49 0.67 0.62 0.67 0.26 0.23 0.17 0.46 0.35 0.36 0.62 0.44 0.54 0.43 0.76 0.35 0.48
0.81 0.71 0.49 0.45 0.21 0.12 0.3 0.32 0.31 0.4 0.49 0.65 0.82 0.24 0.29 0.24 0.36 0.35 0.27 0.35 0.33 0.29 0.63 0.52 1.0 0.57
0.59 0.5 0.98 0.88 0.44 0.53 0.72 0.82 0.28 0.24 0.24 0.25 0.6 0.63 0.34 0.5 0.18 0.15 0.23 0.35 0.19 0.98 0.17 0.13 0.76 1.0
0.42 0.37 0.35 0.32 0.3 0.33 0.33 0.38 0.42 0.39 0.39 0.36 0.4 0.18 0.2 0.17 0.22 0.39 0.26 0.34 0.39 0.9 0.59 0.58 1.0 0.73
0.13 0.47 0.7 0.82 0.58 0.4 0.45 0.5 0.35 0.4 0.42 0.43 0.11 0.29 0.34 0.3 0.27 0.46 0.42 0.36 0.38 0.94 1.0 0.59 0.77 0.97
0.0 0.17 0.11 0.23 0.28 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.09 0.09 0.06 0.87 1.0 0.27 0.78 0.53
0.73 0.69 0.86 0.67 0.54 0.33 0.31 0.41 0.27 0.25 0.32 0.41 0.51 0.3 0.26 0.33 0.37 0.49 0.44 0.63 0.09 0.82 0.25 0.46 1.0 0.9
0.57 0.61 0.69 0.71 0.8 0.48 0.32 0.29 0.18 0.3 0.35 0.48 0.51 0.37 0.25 0.38 0.53 0.51 0.38 0.52 0.44 0.83 0.39 0.7 0.91 1.0
0.09 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.11 1.0 0.87 0.0 0.68 0.44
0.29 0.14 0.08 0.64 0.4 0.12 0.23 0.29 0.21 0.31 0.31 0.29 0.32 0.11 0.05 0.08 0.04 0.07 0.07 0.06 0.05 0.91 0.28 0.54 1.0 0.36
0.63 0.89 0.77 1.0 0.94 0.74 0.46 0.33 0.25 0.12 0.23 0.37 0.45 0.08 0.07 0.05 0.17 0.16 0.2 0.28 0.3 0.75 0.51 0.43 0.8 0.47
0.5 0.53 0.84 1.0 0.67 0.28 0.14 0.18 0.09 0.11 0.13 0.15 0.41 0.15 0.13 0.14 0.12 0.16 0.13 0.23 0.34 0.55 0.31 0.31 0.49 0.54
0.69 0.94 0.91 0.83 0.56 0.39 0.52 0.52 0.56 0.67 0.65 0.72 0.65 0.54 0.56 0.54 0.56 0.61 0.61 0.66 0.5 0.98 0.71 0.77 0.89 1.0
0.45 0.58 0.75 0.65 0.36 0.3 0.3 0.41 0.4 0.38 0.45 0.5 0.4 0.3 0.41 0.32 0.37 0.4 0.4 0.38 0.43 0.54 0.74 0.65 1.0 0.62
0.37 0.52 0.5 0.56 0.53 0.42 0.34 0.31 0.25 0.2 0.18 0.17 0.33 0.34 0.41 0.41 0.35 0.48 0.32 0.28 0.05 1.0 0.14 0.19 0.49 0.41
0.35 0.63 0.88 0.99 0.64 0.49 0.55 0.6 0.29 0.32 0.33 0.33 0.32 0.14 0.12 0.14 0.18 0.28 0.27 0.36 0.44 0.62 0.37 0.33 0.65 1.0
0.33 0.29 0.21 0.76 0.76 0.22 0.28 0.26 0.19 0.28 0.46 0.49 0.53 0.2 0.13 0.51 0.07 0.19 0.09 0.06 0.04 0.51 0.43 0.48 1.0 0.45
0.04 0.02 0.13 0.3 0.48 0.58 0.61 0.36 0.45 0.56 0.53 0.46 0.08 0.48 0.13 0.33 0.21 0.38 0.32 0.41 0.43 0.54 0.74 0.93 1.0 0.72
0.33 0.32 0.31 0.41 0.38 0.22 0.21 0.25 0.18 0.16 0.18 0.16 0.33 0.12 0.13 0.14 0.12 0.16 0.13 0.23 0.35 1.0 0.6 0.34 0.88 0.7
0.51 0.06 0.17 0.62 0.22 0.06 0.17 0.28 0.05 0.05 0.16 0.06 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.13 0.33 0.79 0.53 0.39 1.0 0.77
0.71 0.46 0.41 0.35 0.13 0.07 0.17 0.29 0.29 0.36 0.44 0.52 0.62 0.29 0.3 0.32 0.33 0.32 0.26 0.28 0.37 0.68 0.63 0.63 1.0 0.67
0.64 0.57 0.33 0.29 0.37 0.54 0.72 0.69 0.73 0.64 0.6 0.51 0.52 0.22 0.21 0.18 0.43 0.69 0.55 0.51 0.35 1.0 0.81 0.75 1.0 0.62
0.38 0.36 0.45 0.59 0.49 0.38 0.34 0.37 0.19 0.14 0.16 0.16 0.3 0.29 0.26 0.32 0.2 0.3 0.28 0.24 0.15 1.0 0.3 0.2 0.68 0.84
0.26 0.15 0.14 0.42 0.23 0.09 0.16 0.33 0.09 0.17 0.13 0.08 0.26 0.03 0.01 0.01 0.02 0.04 0.06 0.07 0.01 1.0 0.04 0.02 0.2 0.3
0.47 0.41 0.41 0.4 0.39 0.46 0.52 0.44 0.47 0.45 0.38 0.41 0.45 0.35 0.41 0.45 0.45 0.64 0.57 0.49 0.17 0.88 0.64 1.0 0.69 0.6
0.89 0.94 1.0 0.98 0.95 0.95 0.69 0.73 0.76 0.67 0.66 0.78 0.8 0.56 0.71 0.65 0.72 0.61 0.75 0.96 0.4 0.9 0.74 0.75 0.86 0.99
0.32 0.27 0.3 0.89 0.7 0.27 0.29 0.26 0.19 0.17 0.3 0.27 0.3 0.19 0.11 0.2 0.1 0.16 0.12 0.08 0.18 1.0 0.42 0.27 0.9 0.29
0.2 0.13 0.14 0.4 0.08 0.16 0.11 0.15 0.17 0.05 0.2 0.2 0.04 0.1 0.05 0.14 0.0 0.16 0.2 0.02 0.2 1.0 0.66 0.41 0.71 0.51
0.12 0.15 0.34 0.63 0.28 0.08 0.12 0.29 0.02 0.02 0.04 0.03 0.07 0.01 0.0 0.04 0.0 0.01 0.01 0.06 0.09 0.82 0.02 0.06 0.7 1.0
0.48 0.66 0.7 0.82 0.8 0.53 0.32 0.28 0.23 0.27 0.27 0.28 0.45 0.32 0.25 0.3 0.56 0.52 0.42 0.41 0.15 1.0 0.32 0.35 0.81 0.53
0.21 0.45 0.51 0.54 0.61 0.51 0.46 0.46 0.11 0.23 0.17 0.21 0.3 0.45 0.42 0.5 0.76 0.45 0.36 0.22 0.07 1.0 0.21 0.1 0.82 0.6
0.63 0.81 0.79 0.59 0.4 0.32 0.18 0.27 0.35 0.38 0.49 0.59 0.46 0.35 0.44 0.44 0.45 0.25 0.43 0.57 0.34 1.0 0.49 0.73 0.52 0.58

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)