Heatmap: Cluster_104 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
-2.54 3.13 - - 0.25 - -1.11 - -1.48 - - - - 0.27 - - - - -3.09 -0.75 - - - -2.91 - -3.14 - - -2.49 - 5.04 0.9 - - - - - - - - - - - - - - - -
0.82 2.85 - - - - - - - - - - - 2.39 - - - - - -0.62 - - - 0.15 - -3.77 -4.03 - 3.17 - 4.51 - - -5.89 - - -4.07 - -5.17 - - - - - - - - -
1.7 3.79 - - - -5.16 - -4.94 - - - - -4.54 -0.55 -2.61 - - - -6.29 1.51 - - - 1.05 - -0.42 - -1.4 2.11 - 4.29 - - -6.93 -7.0 - - -8.14 - - - - - - - - - -
0.91 2.87 -2.02 - - - - 0.19 0.53 0.17 -0.38 - 1.36 1.85 -1.75 - - - -0.17 0.83 - - - 0.66 - -1.2 -2.94 - 0.37 - 4.42 - - - -6.71 - - - - - - - - - - - - -
-1.41 3.25 - - - - - - - - - - -4.98 2.58 - - - - - 0.44 - - - 0.99 - -1.31 -2.34 - -1.62 -6.03 4.8 - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.11 4.63 - - - - - - - - - - - -2.52 2.0 - - - -2.07 2.15 - - - -3.11 - -2.17 -1.95 - - - 3.54 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT1G60985 (SCRL6)
1.12 3.59 - - - - - - - - - - - 2.16 - - - - -4.61 1.04 - - - 0.61 - -2.12 - - 2.92 - 4.13 - - -2.48 - - - -6.85 - - - - - -2.37 - - - -
-0.35 4.34 - - -0.9 - - - - - - - - -0.56 0.72 - - - - 2.77 - - - - - -3.97 -0.47 - - - 4.04 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.16 4.03 - - - - - - - - - - - 2.92 - - - - - -0.24 - - - 0.48 - -4.51 - - -0.24 - 4.33 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT1G72260 (THI2.1)
1.18 4.0 -11.24 -11.47 - -10.41 -11.36 - -12.56 -11.16 -12.55 - -6.96 0.95 0.49 -6.96 -6.59 1.39 -5.23 2.02 -4.46 -6.91 -4.99 0.46 -7.2 -3.13 -9.32 -10.75 -4.53 -9.45 4.17 -7.8 - -14.22 -5.32 -7.64 -7.57 -6.72 -8.99 - - - - - -8.27 - - -
AT1G73603 (LCR64)
0.8 3.31 - - - - -4.04 0.14 -1.05 - -4.18 - - 2.22 - - - - -3.78 -0.45 - - - -0.19 -4.54 -1.86 - -4.02 2.83 - 4.36 -6.13 - -3.36 - - - -8.9 -5.94 - - - - - -4.05 - - -5.14
0.47 3.83 - -2.71 - - - - - - - - - -0.64 - -3.95 - - -4.32 1.12 - - -1.64 -0.92 - -2.78 - - 2.52 - 4.45 -1.42 - -1.25 - - - -5.42 - - - - - - - - - -
2.15 3.8 - - - - - - - - - - - -1.3 -1.08 - - - - 2.2 - - -1.17 -0.34 - -1.43 - - -0.01 - 4.43 - - - -6.04 - - - - - - - - - - - - -
- 4.32 - 1.27 - - - - - - - - - - - - - - - 1.03 - - - -1.23 - - 2.15 - 0.02 -0.5 4.09 - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.01 4.49 - - - -1.49 - - - - - - 1.11 -1.34 2.29 - - - - 1.62 - - - -4.23 - - - - - - 3.65 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-4.3 3.64 - - - - -14.78 - -2.39 - - - - 1.64 - - -3.22 -3.48 -4.63 1.73 - - - 0.03 - -1.6 - - 1.92 - 4.54 - - - -8.46 - - -2.79 - - - - - -2.35 - - - -
1.74 3.85 - - - - - - - - - -3.46 -3.28 -1.35 - - - - -2.68 2.65 - - - -0.96 - -3.09 - - -3.86 - 4.5 - - - - - - -8.29 - - - - - - - - - -
AT2G41997 (LCR51)
- 3.86 0.25 - 0.26 - - 0.48 - - - - - 2.5 - - - - - 0.51 - - - - - - - - 1.39 - 4.08 - - - - - 1.56 - -2.97 - - - - - - - - -
0.95 3.33 - -4.79 - - - - - - - - - 2.04 -3.81 - - - -4.48 0.45 - - - 1.64 -4.29 -0.8 -1.55 - 0.46 - 4.63 - - -3.6 - - - -8.4 - - - - - - - - - -
0.01 4.14 - -0.65 - - -1.72 - - - - - - 0.31 -0.6 - - -3.72 - 0.96 - - - -2.83 - -3.78 - - -3.12 - 4.52 - - -2.55 -4.42 -2.25 - -0.23 - - - - - - - - - -
-1.63 3.01 - - - - - - - -4.68 - - 3.08 0.58 - - - - - -0.46 - - - -4.06 - -5.17 -1.47 - - - 4.82 - - - - - -2.99 - - - - - - - - - - -
-1.03 3.4 - - - - - - - - - - - -0.41 0.89 - - - 0.63 1.43 - - - -1.45 - -1.27 - - - - 4.77 - - - - - - -2.28 - - - - 0.91 - - - - -
AT3G06985 (LCR44)
0.39 3.85 - - - - - - - - - - - -0.18 -0.17 - -1.96 - -3.44 2.13 - - -1.84 -1.51 - -3.28 - - - - 4.62 - -3.77 -4.81 -6.8 -1.81 - -5.7 -4.6 - - - - - - - - -
AT3G07005 (LCR43)
0.65 4.02 -2.46 -1.29 -2.86 -2.64 - - 0.34 -1.89 1.2 - -2.96 -0.37 0.4 - -1.4 - -1.81 2.18 - - - -2.26 - - - - - -4.06 4.15 -4.69 - - - - - - - - - - - - - - - -
2.33 3.47 - - - - -5.27 - - -8.46 - - -2.97 1.0 -0.07 - - -6.33 -5.96 1.11 -7.07 - -6.96 1.51 -5.28 -1.16 -4.64 - 2.06 - 4.25 - -8.78 -4.52 - -6.94 -5.97 -8.95 -9.12 - - - - - - - - -
1.64 3.76 - - - - - - - -6.04 - -7.12 - -0.32 -0.17 - - - - 1.94 -4.83 -3.21 -4.72 1.63 - -1.51 -4.83 - 1.08 - 4.28 - -5.92 -4.58 -3.46 -2.11 - -4.67 -6.35 - - - - - -2.29 - -8.01 -
AT3G20993 (LCR56)
0.7 3.01 -0.6 1.58 1.23 - -0.37 - - - - -4.32 - 2.69 - - - - - -0.6 - - - -2.46 - - - - -0.19 - 4.54 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT3G20997 (LCR55)
-2.0 2.66 0.36 2.55 1.62 - 3.01 - - -3.44 - -1.3 - -1.16 0.15 - - - 2.1 1.56 - - - -3.18 - - - - - - 3.78 - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.62 3.38 - -4.03 -2.02 - - - - - - - -4.7 0.95 1.65 - - - -4.73 1.38 - - - -1.1 -4.41 -2.49 -1.46 - 0.54 - 4.72 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.22 3.97 - - - - - -1.77 -3.16 -3.35 - - -0.94 -1.16 -1.76 - - - -4.4 1.46 - - - 0.13 - -0.82 -1.71 - -3.28 - 4.61 - - -5.08 - - - - - - - - - - - - - -
-4.57 3.92 - - - - - - - - - - - -0.06 -0.42 - - - -4.68 0.97 -4.43 - - -0.12 - -1.75 -3.95 - 0.11 - 4.73 -5.61 - -5.07 - - - - - - - - - - - - - -
0.49 3.14 - -1.91 - - - - - - - - - 1.7 -2.4 - - - -4.06 0.84 - - - 1.22 -3.87 -1.02 -3.59 - 0.35 - 4.8 - - -3.29 - - - - - - - - - - - - - -
AT3G61182 (LCR54)
1.69 3.98 - - - - - - - - - - - -0.54 0.91 - - - -1.01 1.28 - - - -2.78 - - 0.67 - -3.87 - 4.43 - - - - - -2.66 - - - - - - - - - - -
-1.38 3.91 - - - - - - - - - - - 0.94 -1.88 - -3.25 -3.51 -4.91 1.59 -3.41 - - 1.22 - -0.42 -1.92 - -3.28 - 4.55 -5.47 - - -5.94 - - - - - - - - - -2.96 - - -
1.01 4.07 - - - - - - - - - - - 0.68 0.12 - -27.75 - -5.4 1.44 - - - -3.15 -5.78 -3.64 -2.33 - -30.45 - 4.55 - - - -31.84 - - -9.61 - - - - - - - - - -
0.04 4.08 - - - - - - - - - - - 0.63 -2.04 - -27.75 - -5.4 1.42 - - - -3.33 -5.78 -3.55 - - -30.46 - 4.66 - - - -31.84 - - -9.61 - - - - - - - - - -
0.65 3.72 - - - - - - - - - - - 1.42 - - -27.61 - - 0.98 - - - -1.99 - -4.11 - - -30.31 - 4.82 - - - -31.69 - - - - - - - - - - - - -
1.01 4.07 - - - - - - - - - - - 0.68 0.12 - -27.75 - -5.4 1.44 - - - -3.15 -5.78 -3.64 -2.33 - -30.45 - 4.55 - - - -31.84 - - -9.61 - - - - - - - - - -
- 3.57 -0.72 0.57 1.34 - 0.57 - - - - - - -1.99 0.55 - - - -2.13 1.54 - - - - - - - - - -2.29 4.63 - -2.38 - - - - -6.22 -4.41 - - - - - - - - -
-3.37 3.07 -0.54 - - - - - - - - - - 1.71 - - - - -3.09 1.09 - - - -0.48 -2.14 -3.15 - - 0.46 - 4.94 - - -3.04 -7.82 - - - - - - - - - - - - -
1.34 4.09 0.59 - 0.02 - -2.74 - -3.11 - - - - -1.22 0.29 -3.7 - -3.1 -1.75 2.38 - -2.22 -2.8 -3.4 -3.19 -2.56 - - - - 3.48 - - -5.03 -3.68 1.22 - 0.2 -0.55 - - 0.54 -1.7 - -1.7 - - -3.92
-2.16 3.63 -4.59 -2.2 - - - - - - - - - 1.17 0.23 - - - -3.24 1.98 -4.9 - - -1.64 -3.95 -2.92 -1.87 - -0.95 - 4.72 - - - - - - -9.11 - - - - - - - - - -
AT4G30067 (LCR63)
1.43 3.33 - - - - - - - - - - - -0.27 -1.26 - - - -4.94 1.54 - - - 1.56 - -0.29 -3.21 - 3.02 - 4.26 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT4G30074 (LCR19)
-0.65 3.29 - - - - - - - - - - - 2.14 - - - - -6.46 -0.17 - - - -1.31 - -3.2 -4.71 - - - 4.99 -7.26 - - -7.8 - - - - - - - - - - - - -
1.34 3.47 0.95 -1.02 -0.52 -1.27 -0.69 -2.12 -1.18 -2.41 -1.05 - - -1.28 -0.5 - - - -0.12 1.75 - - - -1.2 -2.84 -2.33 -2.45 - 0.82 - 4.37 - - - -5.7 - - -7.15 -5.97 - - - - - - - - -
AT5G04630 (CYP77A9)
1.33 2.42 1.25 0.83 0.28 0.8 -0.41 0.03 -3.26 -1.88 -3.48 0.2 1.79 0.05 0.16 -2.29 -2.48 -2.05 -1.51 0.91 -2.53 -3.86 -0.89 -1.28 -1.02 -1.9 -0.66 1.82 -2.76 -2.04 2.08 -1.42 -1.9 -1.45 0.69 -1.91 -0.81 -0.97 -2.31 -1.06 1.16 - -0.38 -0.43 -0.02 - - 0.08
2.21 4.19 - - - - -3.85 - - - - -7.71 - -2.26 -0.82 - - -4.35 -5.5 2.3 - - - -4.2 - -5.98 - - - - 4.26 - - - -6.77 - - - - - - - - - - - - -
-0.41 3.94 -1.96 -2.27 -1.42 - -1.5 -3.43 - - - - - 0.89 - - -4.67 - -2.43 1.19 - - - 1.02 -2.62 -1.05 -3.72 - 1.21 -4.41 4.33 -2.4 -5.81 -3.14 -4.13 -4.59 -3.48 -4.41 -8.23 - - -2.59 -4.5 -2.92 -3.51 - - -2.67
2.95 3.95 -3.04 - -1.93 -2.32 -0.48 - - - - - - -0.15 1.04 -4.08 - - -2.88 2.86 - - - -3.55 - -2.93 -2.97 - -4.18 - 3.64 - - - - - - - -6.54 - - -1.84 - - - - - -
1.56 4.36 - -1.25 -1.6 - -0.75 -3.33 - - - -1.37 -1.59 -0.39 -0.74 - -2.89 - - 1.33 - - - - - - - - - - 3.83 -4.35 -3.34 -2.09 - - - -7.36 -6.71 - - 1.35 0.27 - - - - -
1.28 3.71 - - - - - - - - - - - 1.22 - -3.85 - - - 1.8 - - - -4.86 -3.34 -2.72 - - - - 4.72 - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.13 3.95 - - - - - - - - - - -4.05 0.08 1.46 - - - -4.81 2.61 - - - -5.56 - -2.95 - - - - 4.4 - - - - -2.51 - - - - - - - - - - - -
-1.14 3.81 - - - - - - - - - - - 1.33 - -3.59 - - - 0.72 - -2.0 - -2.92 - - - - - - 4.83 - - - -6.45 -1.57 - -3.08 - - - - - - - - - -
AT5G38330 (LCR80)
0.05 4.05 - - - - - - - - - - - 0.13 - -5.39 - -4.61 -4.18 1.67 - - - -2.83 - -3.88 - - - - 4.69 - - - -7.83 - - - - - - - - - - - - -
-5.91 3.69 - - - - - - - - - - - 2.08 - - - - - 1.61 - - - -0.29 - - - - -1.77 - 4.74 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT5G48953 (LCR86)
2.59 3.61 -1.08 - - - -2.39 - - - - - - -0.04 -0.41 - - - - 1.98 - - - 0.4 - -1.99 - -2.37 3.24 - 3.61 - - - -5.65 - - -7.32 - - - - - - - - - -
2.86 3.51 -2.41 -1.97 1.02 3.24 -0.37 1.66 -0.1 -2.01 - - -4.34 -2.66 -1.32 -6.58 - - -1.3 1.54 - - - -5.48 - -5.08 -5.69 - -1.22 - 2.98 - - - -9.54 - - - - - - - - - - - - -
0.34 3.68 - - - - - - - -9.41 - - - 2.33 0.18 -7.26 - -8.14 -8.26 1.46 - - - 0.2 - -4.39 - - -7.93 - 4.57 -9.68 -10.09 -8.09 -9.33 -7.67 - -12.26 - - - -4.69 - - - - - -
0.62 3.88 - - - - - - - - - - -5.24 -0.21 -0.47 -5.78 - - -5.31 2.05 - - - -3.56 - -5.65 - - -1.11 - 4.66 -6.97 - - -2.38 - - -8.87 - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.