Heatmap: Cluster_125 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.1 0.09 0.09 0.0 0.1 0.0 0.1 0.04 0.0 0.04 0.14 0.0 0.08 0.07 0.13 0.0 0.33 0.17 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.03 0.12
0.04 0.05 0.0 0.02 0.15 0.13 0.09 0.02 0.07 0.1 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.53 0.51 0.19 0.09 0.29 0.03 0.0 0.71 0.22
0.18 0.04 0.02 0.07 0.09 0.07 0.0 0.21 0.04 0.04 0.0 0.05 0.08 0.13 0.04 0.07 0.0 1.18 0.37 0.36 0.34 0.02 0.02 0.03 0.04 0.06
5.42 4.16 4.87 5.48 6.29 7.14 10.36 9.49 10.15 11.3 8.43 6.21 4.04 8.84 8.65 12.4 5.29 28.12 11.92 12.32 3.39 1.95 9.64 7.08 1.96 5.37
16.52 17.09 19.85 19.32 24.18 32.81 25.5 23.33 42.6 35.07 32.71 32.9 21.05 28.28 38.36 31.77 28.24 65.91 48.82 30.19 29.84 33.35 45.51 51.79 25.71 54.11
0.35 0.38 0.17 0.04 1.07 0.78 1.21 0.46 0.63 0.23 0.08 0.44 0.65 1.39 0.99 0.87 0.21 1.18 1.9 0.6 0.0 2.26 0.03 0.69 0.37 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
0.02 0.04 0.02 0.0 0.09 0.04 0.13 0.07 0.09 0.25 0.28 0.21 0.05 0.52 0.34 0.14 0.7 57.2 1.79 0.34 3.56 0.12 2.03 0.56 0.11 0.19
1.11 0.61 0.5 0.72 1.05 1.16 0.98 0.67 1.1 1.45 1.02 0.91 0.67 3.64 2.78 1.93 3.67 19.82 11.88 7.53 1.17 5.43 3.05 4.72 3.72 19.3
0.04 0.0 0.0 0.12 0.13 0.05 0.05 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.02 0.0 0.11 0.07 0.03 0.4 0.17 0.07 0.09 0.09 0.03 0.0 0.07 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.06 0.04 0.1 0.07 0.14 0.05 0.0 0.04 0.1 0.11 0.01 0.03
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.07 0.08 0.0 0.02 0.0 0.06 0.03 0.01 0.05
0.2 0.02 0.16 0.02 0.13 0.02 0.18 0.08 0.12 0.04 0.02 0.0 0.14 0.09 0.26 0.02 0.0 0.38 0.64 0.14 0.11 0.15 0.48 0.28 0.0 0.21
0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.06 0.0 0.0 0.19 0.16 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.08 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.06 0.03 0.06 0.0 0.02 0.33 0.14 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.11 0.0 0.02 0.0 0.08 0.0 0.0 0.09
0.04 0.03 0.02 0.02 0.0 0.04 0.06 0.04 0.0 0.04 0.06 0.09 0.0 0.02 0.13 0.04 0.11 1.21 0.27 0.51 0.14 0.0 0.73 0.23 0.0 0.05
0.0 0.12 0.0 0.0 0.05 0.14 0.0 0.1 0.04 0.08 0.15 0.09 0.06 0.04 0.14 0.08 0.14 1.83 0.58 1.04 0.5 0.07 1.21 0.84 0.0 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.28 0.0 0.04 5.46 0.14 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
8.27 7.99 15.23 29.86 45.3 59.14 50.35 44.21 37.86 33.21 29.46 20.83 8.18 12.44 37.54 14.46 12.81 93.25 67.9 40.01 4.3 35.87 25.22 10.17 46.88 28.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.06 0.04 0.0 0.1 0.17 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.07
7.67 5.85 5.19 6.15 12.32 19.59 29.21 29.16 23.57 20.12 17.19 12.33 7.98 5.98 6.97 5.07 15.44 37.72 17.39 17.48 3.87 4.49 11.53 13.49 10.74 8.6
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.1 0.03 0.04 0.0 0.03 0.05 0.17 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.98 0.36 0.04 0.28 0.8 0.36 0.45 0.79 1.15 1.26 2.21 2.07 1.91 3.3 2.5 1.95 0.73 4.17 7.33 7.19 3.92 3.4 1.68 6.78 1.69 1.23
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.45 0.51 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.27 0.07 0.0 0.06 0.06 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.16 0.32 0.0 0.0 0.05 0.18 0.0 0.0 0.44
0.0 0.0 0.07 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.04 0.18 0.0 0.17 1.27 0.02 0.09 0.4 0.02 0.43 0.09 0.04 0.09
0.0 0.0 0.09 0.13 0.13 0.04 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.05 1.1 0.08 0.07 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.12 0.0 0.06 0.0 0.14 0.0 0.17 0.17 0.06 0.8 0.46 0.38 0.0 0.07 0.0 0.15 0.0 0.08 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.09 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
2.23 0.71 1.33 1.38 1.67 1.91 3.02 3.67 4.21 12.77 13.05 10.61 3.5 2.14 9.8 0.36 10.57 21.78 5.79 6.02 0.25 0.76 3.12 3.7 2.6 3.94
0.02 0.0 0.02 0.2 0.14 0.09 0.09 0.06 0.05 0.18 0.15 0.12 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.0 0.02 0.0 0.05 0.06 0.03 0.0 0.01
0.19 0.08 0.25 0.05 0.17 0.14 0.34 0.09 0.18 0.13 0.19 0.12 0.18 0.54 0.34 0.23 0.15 5.02 0.5 0.14 0.01 0.05 0.31 0.25 0.04 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.38 0.92 0.36 0.3 3.27 1.65 0.73 0.68 0.46 1.04 1.04 0.21 1.17
6.96 8.96 13.52 15.76 9.0 5.38 3.27 6.78 4.15 7.45 8.07 8.63 5.89 0.27 1.6 9.54 1.03 57.91 6.8 13.81 1.12 0.73 5.96 8.43 25.49 16.83
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.06 0.0 0.78 0.17 0.0 0.1 0.05 0.03 0.0 0.08 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06 0.23 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.23 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.08 0.0 0.02 0.36 0.02 0.12 0.01 0.0 0.11 0.0 0.03 0.01
0.02 0.0 0.07 0.02 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.11 0.1 0.02 0.06 0.19 0.0 0.0 0.01 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.1
0.52 0.17 0.37 0.57 0.2 0.11 0.18 0.14 0.2 0.1 0.36 0.12 0.26 0.14 0.16 0.13 0.05 0.42 0.36 0.05 0.06 0.54 0.02 0.02 0.4 0.33
0.16 0.6 0.65 0.73 0.84 0.83 0.76 0.3 0.34 0.7 0.72 0.54 0.17 0.0 0.66 0.0 1.07 5.98 4.29 1.15 0.75 2.85 0.06 0.22 2.13 0.46
0.98 0.61 0.49 0.21 0.07 0.12 0.08 0.39 0.38 0.59 1.27 0.56 0.96 0.09 0.42 0.0 0.13 0.56 1.62 0.67 0.33 0.27 1.25 0.28 0.98 0.75
0.04 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.08 0.02 0.0 0.35 0.06 0.09 0.14 0.78 0.09 0.12 0.49 0.0 0.62 0.14 0.03 0.26
5.28 3.72 4.36 5.17 5.09 5.58 4.66 3.97 7.67 5.97 5.12 5.21 3.5 5.81 5.45 6.89 4.72 15.24 8.14 4.3 7.01 9.68 4.8 5.44 7.89 4.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.08 0.02 0.0 0.09 0.02 0.01 0.2 0.01 0.03
0.11 1.5 2.73 4.07 5.72 5.91 5.54 5.24 7.43 6.22 4.31 3.29 0.24 1.0 1.31 1.52 2.84 7.02 4.2 3.25 1.26 1.49 3.28 3.5 1.67 1.65

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)