Heatmap: Cluster_125 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 0.31 0.26 0.26 0.0 0.29 0.0 0.3 0.13 0.0 0.12 0.42 0.0 0.25 0.22 0.39 0.0 1.0 0.51 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.08 0.37
0.06 0.07 0.0 0.03 0.21 0.19 0.12 0.03 0.09 0.15 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.75 0.72 0.27 0.13 0.41 0.04 0.0 1.0 0.31
0.16 0.03 0.02 0.06 0.08 0.06 0.0 0.18 0.04 0.04 0.0 0.04 0.07 0.11 0.03 0.06 0.0 1.0 0.31 0.3 0.29 0.01 0.01 0.03 0.04 0.05
0.19 0.15 0.17 0.19 0.22 0.25 0.37 0.34 0.36 0.4 0.3 0.22 0.14 0.31 0.31 0.44 0.19 1.0 0.42 0.44 0.12 0.07 0.34 0.25 0.07 0.19
0.25 0.26 0.3 0.29 0.37 0.5 0.39 0.35 0.65 0.53 0.5 0.5 0.32 0.43 0.58 0.48 0.43 1.0 0.74 0.46 0.45 0.51 0.69 0.79 0.39 0.82
0.16 0.17 0.08 0.02 0.47 0.34 0.53 0.2 0.28 0.1 0.04 0.2 0.29 0.61 0.44 0.39 0.09 0.52 0.84 0.27 0.0 1.0 0.01 0.31 0.16 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 1.0 0.03 0.01 0.06 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0
0.06 0.03 0.03 0.04 0.05 0.06 0.05 0.03 0.06 0.07 0.05 0.05 0.03 0.18 0.14 0.1 0.19 1.0 0.6 0.38 0.06 0.27 0.15 0.24 0.19 0.97
0.1 0.0 0.0 0.29 0.33 0.12 0.12 0.0 0.0 0.05 0.11 0.0 0.05 0.0 0.29 0.16 0.06 1.0 0.43 0.18 0.22 0.22 0.08 0.0 0.17 0.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.43 0.31 0.71 0.52 1.0 0.37 0.0 0.27 0.73 0.78 0.1 0.24
0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.32 0.0 0.94 1.0 0.0 0.3 0.0 0.73 0.44 0.19 0.6
0.31 0.03 0.26 0.04 0.2 0.03 0.28 0.13 0.18 0.06 0.03 0.0 0.23 0.14 0.41 0.04 0.0 0.59 1.0 0.21 0.16 0.23 0.74 0.44 0.0 0.33
0.09 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.22 0.32 0.0 0.0 1.0 0.84 0.17 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.25 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.13 0.0 0.18 0.08 0.18 0.0 0.07 1.0 0.42 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.5 1.0 0.0 0.2 0.0 0.74 0.0 0.0 0.83
0.03 0.02 0.02 0.02 0.0 0.04 0.05 0.04 0.0 0.04 0.05 0.08 0.0 0.02 0.11 0.03 0.09 1.0 0.23 0.43 0.11 0.0 0.6 0.19 0.0 0.04
0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.07 0.0 0.06 0.02 0.05 0.08 0.05 0.03 0.02 0.08 0.05 0.07 1.0 0.32 0.57 0.27 0.04 0.66 0.46 0.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.01 1.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.09 0.16 0.32 0.49 0.63 0.54 0.47 0.41 0.36 0.32 0.22 0.09 0.13 0.4 0.16 0.14 1.0 0.73 0.43 0.05 0.38 0.27 0.11 0.5 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.34 0.24 0.0 0.6 1.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.16 0.38
0.2 0.16 0.14 0.16 0.33 0.52 0.77 0.77 0.62 0.53 0.46 0.33 0.21 0.16 0.18 0.13 0.41 1.0 0.46 0.46 0.1 0.12 0.31 0.36 0.28 0.23
0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.22 0.0 0.6 0.15 0.26 0.0 0.19 0.3 1.0 0.0 0.17 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.05 0.01 0.04 0.11 0.05 0.06 0.11 0.16 0.17 0.3 0.28 0.26 0.45 0.34 0.27 0.1 0.57 1.0 0.98 0.53 0.46 0.23 0.92 0.23 0.17
0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.88 1.0 0.09 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.61 0.15 0.0 0.14 0.14 0.0 0.14 0.1 0.0 0.0 0.0 0.36 0.74 0.0 0.0 0.13 0.41 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.05 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.14 0.0 0.13 1.0 0.01 0.07 0.32 0.01 0.34 0.07 0.03 0.07
0.0 0.0 0.09 0.12 0.12 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.05 1.0 0.08 0.06 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.15 0.0 0.08 0.0 0.18 0.0 0.21 0.22 0.08 1.0 0.58 0.48 0.0 0.09 0.0 0.19 0.0 0.11 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 1.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0
0.1 0.03 0.06 0.06 0.08 0.09 0.14 0.17 0.19 0.59 0.6 0.49 0.16 0.1 0.45 0.02 0.49 1.0 0.27 0.28 0.01 0.03 0.14 0.17 0.12 0.18
0.09 0.0 0.11 1.0 0.68 0.44 0.44 0.32 0.23 0.91 0.75 0.58 0.1 0.0 0.0 0.0 0.13 0.46 0.0 0.08 0.0 0.27 0.28 0.17 0.0 0.07
0.04 0.02 0.05 0.01 0.03 0.03 0.07 0.02 0.04 0.02 0.04 0.02 0.04 0.11 0.07 0.05 0.03 1.0 0.1 0.03 0.0 0.01 0.06 0.05 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.11 0.28 0.11 0.09 1.0 0.51 0.22 0.21 0.14 0.32 0.32 0.06 0.36
0.12 0.15 0.23 0.27 0.16 0.09 0.06 0.12 0.07 0.13 0.14 0.15 0.1 0.0 0.03 0.16 0.02 1.0 0.12 0.24 0.02 0.01 0.1 0.15 0.44 0.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.08 0.0 1.0 0.22 0.0 0.13 0.07 0.04 0.0 0.11 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.3 0.0 0.0 0.27 0.0 0.28 0.99 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.18 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.07 0.08 0.0 0.22 0.0 0.06 1.0 0.05 0.34 0.03 0.0 0.3 0.0 0.08 0.04
0.11 0.0 0.34 0.12 0.0 0.12 0.16 0.0 0.0 0.11 0.0 0.24 0.0 0.08 0.0 0.0 0.13 0.55 0.54 0.09 0.31 1.0 0.0 0.0 0.07 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.51
0.91 0.29 0.65 1.0 0.34 0.2 0.32 0.25 0.35 0.18 0.63 0.21 0.45 0.25 0.27 0.22 0.09 0.74 0.63 0.09 0.1 0.94 0.03 0.04 0.7 0.57
0.03 0.1 0.11 0.12 0.14 0.14 0.13 0.05 0.06 0.12 0.12 0.09 0.03 0.0 0.11 0.0 0.18 1.0 0.72 0.19 0.13 0.48 0.01 0.04 0.36 0.08
0.6 0.38 0.3 0.13 0.05 0.08 0.05 0.24 0.23 0.36 0.79 0.35 0.59 0.05 0.26 0.0 0.08 0.35 1.0 0.41 0.2 0.16 0.77 0.17 0.6 0.46
0.05 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.03 0.0 0.03 0.03 0.11 0.03 0.0 0.45 0.08 0.12 0.18 1.0 0.11 0.16 0.63 0.0 0.79 0.18 0.04 0.33
0.35 0.24 0.29 0.34 0.33 0.37 0.31 0.26 0.5 0.39 0.34 0.34 0.23 0.38 0.36 0.45 0.31 1.0 0.53 0.28 0.46 0.64 0.32 0.36 0.52 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.13 0.39 0.1 0.0 0.45 0.08 0.07 1.0 0.07 0.15
0.02 0.2 0.37 0.55 0.77 0.8 0.75 0.71 1.0 0.84 0.58 0.44 0.03 0.13 0.18 0.2 0.38 0.95 0.57 0.44 0.17 0.2 0.44 0.47 0.23 0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)