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Heatmap: Cluster_54 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- - - - 1.24 - - 1.56 - - - - - - 1.45 2.76 - - - - 0.55 1.15 2.49 - 0.93 -
- - - 0.89 - - 3.2 0.09 - - - - - -0.29 - -0.23 - 0.13 -0.13 - 0.87 1.16 2.06 - -0.74 0.45
- - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.15 2.16 - - - - - 3.1 - 2.03 - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.03 0.03 1.9 0.98 0.6 -0.09 - -0.22 - -0.22 - 1.0 0.29 1.63 - -0.12 - - - 0.57 2.42 - - - - -
2.25 - - - - - 3.12 - 2.16 3.01 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.59 3.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.98 2.34 - - 0.16 - 2.63 - - 1.53 -0.98 - - -0.32 - - - 0.57 0.83 - - 0.51 - -0.3 - -
- - - - - - 3.05 3.26 - - - - - - - 3.03 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.38 1.73 - 0.01 - - 2.11 0.82 - 2.04 - 1.61 1.63 - -0.16 - 0.16 - - 1.35 - - - - - -
0.86 - 1.92 -0.12 - - - -0.18 - - 0.77 - 1.65 1.7 - - 0.77 -0.35 0.45 -0.29 -0.19 -0.6 -0.58 0.4 0.77 -0.7
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.7 - - - 3.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.11 0.74 1.8 0.25 0.69 1.58 1.13 -0.94 - 0.38 -0.9 -0.73 -0.93 - - -0.84 0.47 - -1.18 -0.05 -1.27 - - - 0.32 1.13
- - - - - - 3.91 - - - - - - - - - - - - - 3.46 - - - - -
- - 3.16 - 3.06 - - - - - - - - - - - 3.13 - - - - - - - - -
-0.7 -1.17 3.83 0.47 -1.82 -0.48 2.26 -3.48 - -3.59 -1.69 -1.24 -0.51 - - - 0.75 - - - - - - - -2.31 -4.08
- - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.92 - - 1.98 - - - 1.77 1.67 1.72 1.9 2.22 - - - - - - - - - - - - -
- - 2.34 - - - 2.35 - 2.47 - - 2.45 - - - - - - - 2.26 - - - - - -
-0.52 -0.64 -0.75 -0.75 -0.43 -0.44 1.99 0.04 0.09 -0.52 -2.78 -3.23 -1.79 -1.37 -1.33 -1.18 -2.23 1.44 0.22 -0.58 -0.58 0.73 0.35 -0.98 0.49 1.68
- - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.01 2.53 - 3.23 0.01 - - - - 0.14 - - - - - - - - -0.62 -
- - - - 1.49 - 2.89 1.51 - 1.25 - - - 2.3 - - - 1.15 - - 0.86 - - - 0.68 -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.11 - - - - - - - - - - - - - 3.12 - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.14 - - - - 3.6 - - - - - - - - - - -0.7 - - 2.82 1.08 1.23 - - -0.61
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.24 - 2.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.71 - - - - - 3.69 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.15 3.02 - - - - - - - - - - - 1.93 - 2.22 - - - 2.33 - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.65 - - - - - 1.69 2.57 1.58 1.76 2.08 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.06 - 3.17 - - 3.07 - - - - - - - - 2.15 - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.83 - - - - - - - - - - - - - - 3.56 - - - -
- - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.13 - - - -0.15 2.51 -1.27 1.0 -0.26 - -1.05 - -1.75 -1.25 - - 1.88 0.29 - - -1.56 -0.41 0.91 -0.23 2.01
- - 4.03 - - - - - - - - - - - - - - 3.28 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.15 -0.42 0.52 - 1.29 -0.35 1.71 -0.49 1.91 0.73 0.52 -0.96 - 0.56 0.86 0.29 - 0.54 -0.36 - - - -0.99 0.12
- - - - - - 4.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 2.71 2.6 2.65 2.83 - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.18 - - - - - 3.31 - - - - - - - - - - 2.81 - - - - - -
- 1.99 -0.35 - 0.12 - 3.01 - - -0.63 - 2.33 0.31 - - 1.97 - - -0.94 - -1.57 - -1.24 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.