Heatmap: Cluster_64 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.97 0.36 0.28 0.35 0.35 0.26 0.35 0.4 0.3 0.34 0.46 0.62 1.0 0.34 0.34 0.31 0.24 0.35 0.28 0.22 0.57 0.8 0.42 0.57 0.55 0.48
0.58 0.42 0.46 0.44 0.35 0.23 0.26 0.31 0.26 0.32 0.36 0.38 0.53 0.22 0.18 0.39 0.24 0.27 0.25 0.25 1.0 0.58 0.27 0.43 0.54 0.55
0.8 0.09 0.05 0.02 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.05 0.14 0.44 1.0 0.09 0.05 0.15 0.03 0.07 0.05 0.04 0.79 0.05 0.06 0.11 0.17 0.2
0.97 0.28 0.26 0.32 0.27 0.21 0.23 0.26 0.15 0.2 0.29 0.49 1.0 0.13 0.11 0.11 0.11 0.12 0.11 0.19 0.57 0.54 0.25 0.28 0.49 0.47
0.84 0.64 0.49 0.35 0.22 0.2 0.31 0.35 0.3 0.37 0.41 0.52 0.84 0.55 0.55 0.52 0.51 0.57 0.41 0.54 1.0 0.91 0.31 0.48 0.52 0.66
0.05 0.06 0.22 0.4 0.43 0.31 0.29 0.3 0.25 0.2 0.16 0.12 0.05 0.11 0.11 0.13 0.11 0.15 0.13 0.16 1.0 0.31 0.17 0.13 0.39 0.32
0.41 0.21 0.22 0.3 0.28 0.15 0.25 0.28 0.13 0.23 0.37 0.48 0.52 0.28 0.13 0.26 0.16 0.18 0.14 0.13 1.0 0.42 0.43 0.17 0.52 0.35
0.38 0.22 0.2 0.26 0.32 0.19 0.22 0.26 0.12 0.24 0.37 0.45 0.45 0.24 0.14 0.25 0.14 0.17 0.19 0.15 1.0 0.4 0.45 0.21 0.52 0.38
0.68 0.42 0.49 0.49 0.24 0.11 0.24 0.38 0.34 0.36 0.43 0.49 0.39 0.1 0.1 0.11 0.12 0.33 0.21 0.18 1.0 0.25 0.24 0.61 0.85 0.89
0.08 0.0 0.06 0.06 0.07 0.0 0.1 0.04 0.1 0.05 0.11 0.06 0.03 0.08 0.07 0.14 0.0 0.09 0.05 0.01 1.0 0.15 0.12 0.09 0.28 0.44
0.7 0.4 0.46 0.52 0.48 0.47 0.5 0.54 0.51 0.56 0.72 0.89 0.71 0.4 0.31 0.55 0.32 0.44 0.48 0.37 0.52 0.77 0.57 0.75 0.85 1.0
0.31 0.24 0.27 0.38 0.33 0.26 0.24 0.31 0.24 0.22 0.26 0.26 0.27 0.21 0.16 0.21 0.17 0.26 0.2 0.17 1.0 0.45 0.44 0.19 0.65 0.32
0.48 0.41 0.43 0.5 0.46 0.25 0.34 0.35 0.16 0.19 0.29 0.38 0.76 0.1 0.08 0.12 0.11 0.11 0.09 0.13 0.93 0.23 1.0 0.3 0.46 0.3
0.79 0.36 0.35 0.28 0.08 0.04 0.09 0.22 0.07 0.14 0.23 0.36 1.0 0.14 0.21 0.15 0.1 0.16 0.13 0.14 0.78 0.34 0.09 0.23 0.62 0.44
0.85 0.4 0.25 0.31 0.28 0.28 0.41 0.49 0.47 0.46 0.57 0.53 0.68 0.43 0.28 0.36 0.24 0.3 0.3 0.19 1.0 0.54 0.95 0.53 0.72 0.41
0.69 0.1 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.06 0.26 0.61 1.0 0.07 0.04 0.05 0.04 0.04 0.04 0.02 0.46 0.21 0.07 0.12 0.24 0.22
0.25 0.19 0.16 0.29 0.3 0.19 0.23 0.24 0.17 0.19 0.21 0.16 0.22 0.15 0.12 0.12 0.11 0.16 0.16 0.15 1.0 0.36 0.26 0.32 0.4 0.32
0.41 0.53 0.62 0.67 0.52 0.36 0.42 0.48 0.11 0.21 0.21 0.23 0.67 0.1 0.05 0.06 0.08 0.08 0.08 0.29 1.0 0.04 0.99 0.52 0.43 0.65
0.62 0.34 0.27 0.21 0.12 0.09 0.18 0.22 0.17 0.18 0.39 0.31 0.67 0.14 0.28 0.08 0.11 0.37 0.37 0.34 1.0 0.42 0.49 0.35 0.83 0.64
0.83 0.41 0.28 0.31 0.36 0.37 0.66 0.71 0.59 0.59 0.63 0.58 0.71 0.38 0.32 0.44 0.36 0.6 0.5 0.39 0.84 1.0 0.82 0.61 0.51 0.39
0.58 0.11 0.06 0.01 0.04 0.05 0.03 0.14 0.07 0.3 0.29 0.57 0.68 0.13 0.17 0.16 0.07 0.19 0.17 0.05 1.0 0.39 0.01 0.29 0.08 0.11
0.47 0.11 0.09 0.03 0.01 0.01 0.04 0.13 0.1 0.24 0.36 0.45 0.64 0.18 0.14 0.11 0.08 0.15 0.14 0.13 1.0 0.16 0.19 0.49 0.3 0.31
0.26 0.17 0.18 0.23 0.26 0.28 0.36 0.32 0.39 0.32 0.33 0.3 0.22 0.27 0.24 0.28 0.22 0.33 0.26 0.21 1.0 0.29 0.33 0.39 0.31 0.26
0.13 0.07 0.08 0.16 0.19 0.27 0.28 0.25 0.16 0.26 0.25 0.24 0.27 0.21 0.17 0.18 0.05 0.16 0.09 0.09 1.0 0.33 0.16 0.13 0.32 0.2
0.88 0.33 0.2 0.13 0.11 0.15 0.35 0.45 0.37 0.53 0.73 0.95 1.0 0.15 0.14 0.14 0.25 0.4 0.23 0.27 0.97 0.89 0.44 0.49 0.47 0.38
0.91 0.53 0.48 0.32 0.14 0.09 0.24 0.36 0.2 0.32 0.42 0.57 1.0 0.35 0.34 0.35 0.32 0.32 0.29 0.33 0.54 0.32 0.29 0.39 0.42 0.59
0.75 0.34 0.36 0.58 0.46 0.27 0.37 0.68 0.6 0.68 0.91 0.98 1.0 0.4 0.24 0.46 0.19 0.29 0.2 0.24 0.49 0.49 0.67 0.76 0.79 0.84
0.49 1.0 0.92 0.92 0.68 0.46 0.64 0.73 0.45 0.63 0.67 0.64 0.58 0.26 0.17 0.27 0.61 0.48 0.32 0.39 0.83 0.3 0.83 0.65 0.78 0.69
0.59 0.22 0.22 0.44 0.2 0.11 0.16 0.22 0.12 0.15 0.23 0.1 0.57 0.13 0.08 0.04 0.03 0.08 0.07 0.05 1.0 0.43 0.49 0.19 0.89 0.68
0.8 0.38 0.33 0.35 0.26 0.19 0.35 0.42 0.25 0.33 0.41 0.53 0.86 0.57 0.38 0.5 0.31 0.37 0.33 0.26 1.0 0.4 0.76 0.41 0.77 0.6
0.57 0.28 0.23 0.49 0.39 0.29 0.39 0.52 0.49 0.68 0.76 0.57 0.71 0.39 0.12 0.17 0.07 0.17 0.17 0.11 0.46 0.58 0.64 1.0 0.92 0.83
0.07 0.11 0.18 0.23 0.22 0.28 0.33 0.3 0.12 0.05 0.07 0.03 0.02 0.13 0.19 0.22 0.18 0.28 0.31 0.25 1.0 0.05 0.02 0.06 0.29 0.21
0.34 0.23 0.2 0.15 0.1 0.08 0.1 0.13 0.15 0.14 0.2 0.21 0.32 0.14 0.1 0.12 0.12 0.08 0.1 0.09 1.0 0.11 0.27 0.25 0.51 0.22
0.72 0.57 0.41 0.26 0.12 0.09 0.15 0.23 0.23 0.26 0.4 0.56 0.68 0.2 0.18 0.22 0.25 0.19 0.2 0.23 1.0 0.26 0.73 0.45 0.45 0.26
0.93 0.63 0.51 0.29 0.08 0.05 0.19 0.4 0.08 0.21 0.32 0.44 1.0 0.08 0.11 0.12 0.09 0.22 0.17 0.26 0.94 0.32 0.25 0.32 0.6 0.61
0.09 0.08 0.08 0.15 0.08 0.07 0.11 0.14 0.12 0.1 0.12 0.07 0.04 0.05 0.04 0.04 0.03 0.08 0.05 0.05 1.0 0.17 0.29 0.1 0.35 0.2
1.0 0.53 0.54 0.56 0.42 0.38 0.33 0.6 0.47 0.45 0.49 0.51 0.89 0.38 0.43 0.37 0.27 0.57 0.55 0.36 0.79 0.99 0.63 0.46 0.62 0.57
0.9 0.49 0.38 0.43 0.22 0.11 0.17 0.24 0.14 0.27 0.48 0.58 1.0 0.09 0.04 0.22 0.12 0.17 0.12 0.15 0.59 0.4 0.21 0.24 0.54 0.35
0.87 0.48 0.3 0.16 0.11 0.09 0.1 0.11 0.08 0.13 0.16 0.26 0.81 0.3 0.16 0.35 0.12 0.19 0.12 0.14 1.0 0.2 0.46 0.39 0.37 0.49
0.99 0.53 0.36 0.18 0.15 0.14 0.13 0.14 0.11 0.15 0.21 0.32 1.0 0.31 0.17 0.35 0.14 0.16 0.14 0.15 0.7 0.14 0.36 0.37 0.35 0.39
0.81 0.42 0.36 0.58 0.26 0.09 0.17 0.29 0.28 0.31 0.51 0.51 0.75 0.34 0.14 0.23 0.3 0.18 0.17 0.14 1.0 0.29 0.44 0.41 0.51 0.49
0.99 0.46 0.28 0.15 0.1 0.15 0.28 0.36 0.18 0.22 0.31 0.47 1.0 0.19 0.2 0.2 0.19 0.26 0.22 0.24 0.87 0.29 0.17 0.2 0.34 0.32
0.88 0.31 0.17 0.18 0.08 0.13 0.11 0.13 0.07 0.15 0.35 0.64 1.0 0.07 0.07 0.07 0.1 0.13 0.12 0.1 0.89 0.54 0.11 0.23 0.49 0.33
0.7 0.34 0.3 0.36 0.29 0.2 0.26 0.28 0.28 0.45 0.63 0.78 1.0 0.22 0.26 0.38 0.35 0.37 0.25 0.24 0.7 0.79 0.59 0.63 0.69 0.62
0.08 0.06 0.05 0.17 0.11 0.06 0.09 0.11 0.14 0.12 0.13 0.09 0.07 0.05 0.04 0.04 0.04 0.08 0.03 0.03 1.0 0.73 0.18 0.17 0.4 0.21
0.36 0.2 0.25 0.36 0.27 0.17 0.12 0.17 0.2 0.24 0.43 0.55 0.38 0.12 0.08 0.11 0.04 0.08 0.07 0.06 1.0 0.06 0.74 0.51 0.19 0.28
0.42 0.31 0.4 0.39 0.28 0.16 0.12 0.24 0.16 0.1 0.14 0.22 0.28 0.08 0.13 0.1 0.09 0.18 0.17 0.29 1.0 0.32 0.45 0.31 0.49 0.65
1.0 0.32 0.16 0.23 0.05 0.02 0.06 0.25 0.11 0.18 0.24 0.28 0.68 0.08 0.07 0.15 0.07 0.15 0.14 0.09 0.91 0.31 0.34 0.26 0.62 0.49
0.82 0.33 0.26 0.35 0.32 0.26 0.37 0.47 0.35 0.46 0.7 0.87 1.0 0.31 0.22 0.25 0.22 0.4 0.24 0.2 0.71 0.59 0.86 0.55 0.54 0.42
0.85 0.4 0.25 0.19 0.1 0.11 0.25 0.39 0.12 0.17 0.24 0.34 1.0 0.08 0.09 0.13 0.13 0.2 0.12 0.17 0.51 0.42 0.12 0.22 0.51 0.45
0.98 0.93 0.75 0.84 0.69 0.48 0.57 0.65 0.68 0.79 0.99 1.0 0.92 0.52 0.3 0.55 0.39 0.51 0.45 0.36 0.77 0.6 0.74 0.95 0.95 0.92
0.04 0.19 0.37 0.4 0.34 0.27 0.23 0.26 0.15 0.16 0.19 0.19 0.06 0.25 0.18 0.26 0.12 0.14 0.19 0.2 1.0 0.18 0.28 0.44 0.37 0.84
0.15 0.1 0.09 0.13 0.14 0.12 0.17 0.2 0.23 0.22 0.33 0.26 0.17 0.11 0.06 0.13 0.1 0.17 0.11 0.06 1.0 0.31 0.46 0.28 0.36 0.24
0.18 0.16 0.13 0.16 0.19 0.16 0.22 0.26 0.31 0.39 0.38 0.33 0.22 0.2 0.14 0.25 0.17 0.21 0.18 0.13 1.0 0.3 0.36 0.32 0.44 0.28
0.2 0.12 0.06 0.15 0.17 0.14 0.15 0.19 0.27 0.27 0.37 0.21 0.22 0.16 0.09 0.14 0.1 0.15 0.13 0.1 1.0 0.37 0.47 0.48 0.9 0.33
0.42 0.28 0.37 0.31 0.13 0.1 0.1 0.19 0.05 0.03 0.05 0.07 0.3 0.03 0.04 0.03 0.05 0.18 0.11 0.19 1.0 0.12 0.07 0.1 0.4 0.46
0.9 0.64 0.88 0.92 0.67 0.61 0.7 0.88 0.63 0.52 0.59 0.63 0.88 0.47 0.41 0.53 0.35 0.39 0.36 0.53 0.89 0.24 0.87 0.92 0.66 1.0
0.88 0.33 0.23 0.47 0.39 0.18 0.29 0.42 0.19 0.28 0.35 0.43 0.74 0.08 0.02 0.05 0.03 0.06 0.06 0.05 1.0 0.09 0.66 0.47 0.84 0.65
0.63 0.31 0.23 0.37 0.24 0.2 0.24 0.4 0.17 0.18 0.33 0.36 0.61 0.06 0.04 0.05 0.03 0.04 0.05 0.06 1.0 0.14 0.7 0.18 0.9 0.58
0.92 0.82 0.71 0.64 0.48 0.29 0.32 0.46 0.51 0.48 0.59 0.71 0.89 0.31 0.4 0.33 0.38 0.34 0.3 0.41 1.0 0.58 0.64 0.67 0.83 0.72
0.06 0.14 0.15 0.32 0.32 0.25 0.22 0.24 0.22 0.16 0.16 0.14 0.07 0.09 0.06 0.08 0.07 0.09 0.07 0.11 1.0 0.12 0.37 0.11 0.26 0.18
0.71 0.33 0.48 0.77 0.51 0.3 0.34 0.56 0.4 0.36 0.49 0.45 0.67 0.22 0.17 0.3 0.16 0.22 0.17 0.27 0.89 0.05 1.0 0.52 0.64 0.76
0.95 0.61 0.41 0.48 0.32 0.14 0.24 0.31 0.23 0.33 0.42 0.47 1.0 0.19 0.12 0.15 0.14 0.21 0.16 0.18 0.41 0.29 0.21 0.22 0.48 0.37
0.3 0.25 0.27 0.27 0.21 0.14 0.18 0.2 0.23 0.3 0.4 0.54 0.29 0.11 0.11 0.12 0.18 0.21 0.15 0.21 1.0 0.7 0.2 0.42 0.3 0.34
0.02 0.04 0.11 0.16 0.2 0.21 0.25 0.25 0.23 0.22 0.22 0.12 0.02 0.11 0.07 0.12 0.08 0.09 0.06 0.07 1.0 0.11 0.69 0.12 0.43 0.19
0.35 0.25 0.41 0.35 0.14 0.09 0.16 0.32 0.16 0.19 0.25 0.3 0.42 0.16 0.08 0.11 0.04 0.23 0.1 0.22 1.0 0.12 0.17 0.27 0.73 0.63
0.26 0.27 0.36 0.49 0.35 0.27 0.4 0.48 0.38 0.34 0.34 0.3 0.22 0.24 0.18 0.18 0.17 0.23 0.15 0.24 1.0 0.37 0.25 0.18 0.58 0.57
0.45 0.37 0.32 0.26 0.17 0.13 0.15 0.19 0.14 0.14 0.18 0.27 0.39 0.2 0.28 0.46 0.26 0.34 0.3 0.25 1.0 0.37 0.32 0.46 0.31 0.28
0.26 0.15 0.14 0.3 0.22 0.08 0.06 0.09 0.01 0.03 0.05 0.1 0.33 0.11 0.02 0.11 0.03 0.01 0.01 0.02 1.0 0.27 0.11 0.15 0.38 0.31
0.49 0.13 0.14 0.09 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.04 0.12 0.45 0.01 0.02 0.13 0.01 0.02 0.01 0.03 1.0 0.11 0.29 0.3 0.18 0.23
0.27 0.14 0.25 0.4 0.37 0.18 0.15 0.27 0.13 0.16 0.2 0.26 0.27 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.98 0.13 0.21 0.31 0.56 1.0
0.81 0.78 0.65 0.71 0.4 0.16 0.26 0.46 0.35 0.39 0.53 0.57 0.76 0.4 0.15 0.23 0.08 0.14 0.12 0.15 1.0 0.94 0.38 0.18 0.62 0.67
0.54 0.45 0.36 0.35 0.39 0.4 0.43 0.6 0.42 0.34 0.33 0.3 0.7 0.25 0.31 0.25 0.22 0.46 0.32 0.21 0.6 1.0 0.69 0.31 0.41 0.44
0.5 0.3 0.41 0.38 0.29 0.19 0.35 0.45 0.4 0.48 0.71 0.89 0.72 0.75 0.1 0.51 0.09 0.13 0.11 0.15 0.34 0.51 0.51 0.52 0.63 1.0
0.49 0.42 0.37 0.31 0.11 0.07 0.11 0.2 0.13 0.18 0.2 0.29 0.62 0.1 0.1 0.12 0.09 0.12 0.12 0.15 1.0 0.1 0.33 0.21 0.32 0.3
1.0 0.66 0.35 0.21 0.13 0.14 0.26 0.35 0.3 0.27 0.37 0.56 0.96 0.14 0.15 0.14 0.23 0.29 0.24 0.2 0.79 0.15 0.33 0.46 0.85 0.4
0.83 0.2 0.17 0.18 0.05 0.02 0.09 0.18 0.05 0.13 0.26 0.47 1.0 0.08 0.08 0.15 0.06 0.14 0.1 0.08 0.39 0.61 0.21 0.24 0.79 0.48
0.23 0.2 0.32 0.5 0.39 0.31 0.4 0.48 0.32 0.37 0.41 0.36 0.24 0.37 0.09 0.23 0.11 0.2 0.24 0.25 1.0 0.13 0.53 0.18 0.49 0.58
0.57 0.31 0.35 0.34 0.17 0.07 0.1 0.16 0.08 0.16 0.21 0.3 0.53 0.07 0.04 0.08 0.02 0.05 0.05 0.03 1.0 0.2 0.31 0.06 0.17 0.29
0.36 0.15 0.11 0.07 0.06 0.04 0.07 0.09 0.1 0.16 0.22 0.34 0.38 0.07 0.06 0.09 0.05 0.06 0.06 0.07 1.0 0.29 0.41 0.57 0.16 0.29
0.9 0.39 0.31 0.46 0.35 0.27 0.39 0.41 0.27 0.33 0.41 0.55 1.0 0.27 0.15 0.35 0.21 0.26 0.16 0.26 0.54 0.69 0.49 0.48 0.74 0.63
0.83 0.57 0.61 0.8 0.56 0.26 0.31 0.46 0.38 0.49 0.77 0.92 1.0 0.13 0.12 0.13 0.19 0.25 0.16 0.26 0.71 0.62 0.53 0.65 0.8 0.72
0.27 0.18 0.26 0.31 0.1 0.02 0.06 0.16 0.01 0.01 0.03 0.03 0.19 0.02 0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.06 1.0 0.1 0.16 0.18 0.81 0.64
0.55 0.42 0.37 0.33 0.3 0.27 0.26 0.3 0.36 0.41 0.51 0.65 0.58 0.34 0.19 0.27 0.18 0.3 0.32 0.2 1.0 0.09 0.9 0.73 0.45 0.52
0.74 0.16 0.08 0.04 0.01 0.01 0.02 0.06 0.02 0.08 0.23 0.51 0.78 0.05 0.14 0.05 0.08 0.06 0.04 0.06 1.0 0.33 0.03 0.1 0.15 0.11
0.73 0.16 0.09 0.04 0.01 0.01 0.02 0.06 0.02 0.08 0.23 0.47 0.74 0.07 0.18 0.05 0.1 0.09 0.05 0.09 1.0 0.28 0.03 0.11 0.15 0.13
0.44 0.25 0.34 0.38 0.3 0.25 0.34 0.37 0.18 0.26 0.19 0.22 0.33 0.26 0.22 0.21 0.24 0.2 0.34 0.16 1.0 0.46 0.36 0.39 0.68 0.3
0.93 0.64 0.63 0.75 0.52 0.38 0.38 0.48 0.47 0.5 0.74 0.82 0.86 0.43 0.27 0.34 0.36 0.39 0.37 0.42 0.87 0.87 0.67 0.83 1.0 0.98

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)