Heatmap: Cluster_173 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
1.0 0.81 0.77 0.75 0.71 0.6 0.65 0.69 0.56 0.59 0.66 0.61 0.8 0.35 0.43 0.43 0.52 0.81 0.62 0.68 0.03 0.08 0.31 0.25 0.33 0.47
0.97 0.94 0.85 0.63 0.56 0.64 0.95 1.0 0.79 0.54 0.47 0.41 0.82 0.41 0.61 0.53 0.63 0.85 0.75 0.64 0.04 0.1 0.28 0.28 0.32 0.28
1.0 0.66 0.39 0.33 0.49 0.63 0.78 0.76 0.57 0.54 0.4 0.3 0.81 0.24 0.44 0.23 0.51 0.71 0.67 0.6 0.02 0.16 0.11 0.19 0.25 0.15
0.01 0.14 0.24 0.32 0.48 0.87 0.57 0.37 0.54 0.37 0.25 0.26 0.03 0.94 0.28 1.0 0.28 0.23 0.28 0.23 0.07 0.03 0.12 0.07 0.27 0.32
0.76 0.55 0.67 0.98 1.0 0.73 0.76 0.9 0.7 0.62 0.79 0.61 0.85 0.62 0.74 0.83 0.51 0.9 0.78 0.59 0.04 0.31 0.28 0.25 0.44 0.65
1.0 0.63 0.37 0.32 0.46 0.52 0.84 0.72 0.52 0.52 0.4 0.31 0.7 0.23 0.42 0.29 0.58 0.75 0.65 0.62 0.03 0.32 0.2 0.33 0.36 0.28
1.0 0.65 0.49 0.45 0.55 0.71 0.96 0.99 0.91 0.83 0.69 0.53 0.91 0.6 0.48 0.41 0.58 0.44 0.54 0.53 0.07 0.16 0.25 0.32 0.42 0.38
0.66 0.56 0.54 0.54 0.75 0.86 1.0 0.84 0.91 0.69 0.61 0.5 0.68 0.78 0.9 0.64 0.76 0.72 0.62 0.7 0.08 0.51 0.33 0.4 0.46 0.56
0.68 0.46 0.59 0.6 0.75 1.0 0.8 0.72 0.8 0.61 0.64 0.63 0.69 0.79 0.88 0.88 0.71 0.62 0.6 0.57 0.12 0.33 0.52 0.53 0.62 0.8
0.78 0.62 0.95 1.0 0.61 0.3 0.55 0.59 0.32 0.24 0.29 0.47 0.86 0.84 0.62 0.66 0.58 0.46 0.52 0.54 0.03 0.47 0.08 0.36 0.42 0.89
0.07 0.21 0.36 0.47 0.58 0.84 1.0 0.74 0.91 0.32 0.18 0.11 0.08 0.56 0.83 0.49 0.42 0.66 0.42 0.35 0.02 0.24 0.11 0.08 0.15 0.11
1.0 0.72 0.61 0.57 0.59 0.62 0.74 0.79 0.48 0.52 0.52 0.48 0.9 0.38 0.46 0.45 0.62 0.81 0.68 0.64 0.09 0.17 0.24 0.32 0.4 0.31
0.9 0.86 0.84 0.79 0.71 0.62 0.77 0.72 0.75 0.71 0.72 0.74 1.0 0.76 0.77 0.78 0.58 0.78 0.68 0.55 0.06 0.4 0.45 0.57 0.48 0.52
0.95 0.68 0.64 0.61 0.56 0.56 0.72 0.78 0.7 0.68 0.66 0.66 1.0 0.5 0.69 0.61 0.55 0.7 0.58 0.55 0.08 0.45 0.3 0.38 0.41 0.38
0.75 0.71 0.54 0.81 0.75 0.85 0.79 1.0 0.7 0.65 0.69 0.55 0.45 0.61 0.78 0.68 0.54 0.49 0.78 0.67 0.05 0.48 0.63 0.41 0.45 0.51
0.78 0.64 0.66 0.79 0.83 0.75 1.0 0.94 0.72 0.66 0.53 0.45 0.89 0.64 0.58 0.78 0.63 0.84 0.74 0.77 0.05 0.49 0.24 0.29 0.56 0.52
0.83 0.66 0.67 0.72 0.66 0.62 0.89 0.9 0.67 0.78 0.68 0.62 0.79 0.63 0.64 0.95 0.77 1.0 0.73 0.77 0.04 0.46 0.18 0.26 0.42 0.42
1.0 0.78 0.73 0.8 0.82 0.9 0.96 1.0 0.82 0.84 0.75 0.76 0.93 0.6 0.68 0.85 0.69 1.0 0.87 0.79 0.04 0.39 0.19 0.26 0.43 0.44
0.88 0.63 0.64 0.61 0.67 0.86 1.0 0.91 0.59 0.43 0.36 0.34 0.9 0.71 0.38 0.74 0.36 0.35 0.33 0.4 0.03 0.23 0.12 0.17 0.48 0.45
0.4 0.39 0.27 0.38 0.69 1.0 0.82 0.42 0.31 0.07 0.04 0.04 0.37 0.8 0.34 0.6 0.3 0.22 0.24 0.2 0.07 0.05 0.09 0.01 0.21 0.13
0.35 0.37 0.32 0.33 0.49 0.59 0.73 0.62 0.53 0.63 0.55 0.37 0.3 0.61 0.65 0.71 0.51 1.0 0.6 0.66 0.04 0.27 0.08 0.2 0.26 0.33
0.22 0.53 0.46 0.62 0.68 0.52 0.6 0.45 0.21 0.11 0.09 0.08 0.18 0.91 0.65 1.0 0.48 0.34 0.36 0.12 0.0 0.22 0.07 0.03 0.37 0.13
0.57 0.51 0.61 0.7 0.68 0.71 0.89 0.85 0.76 0.72 0.66 0.79 0.66 0.6 0.69 0.69 0.56 0.64 0.64 0.54 0.03 1.0 0.51 0.65 0.62 0.53
0.83 1.0 0.87 0.75 0.77 0.79 0.95 0.96 0.84 0.82 0.71 0.69 0.89 0.47 0.59 0.56 0.7 0.91 0.8 0.83 0.04 0.34 0.2 0.33 0.41 0.43
0.77 0.65 0.7 0.79 0.99 1.0 0.99 0.93 0.87 0.74 0.7 0.59 0.79 0.91 0.91 0.93 0.86 0.8 0.82 0.89 0.15 0.56 0.8 0.52 0.76 0.73
0.57 0.58 0.6 0.63 0.76 0.89 0.96 0.96 1.0 0.75 0.68 0.69 0.64 0.62 0.79 0.71 0.54 0.59 0.61 0.64 0.03 0.95 0.26 0.29 0.52 0.58
0.2 0.19 0.21 0.32 0.69 0.83 0.64 0.53 0.33 0.3 0.22 0.14 0.25 1.0 0.36 0.8 0.44 0.48 0.39 0.31 0.08 0.16 0.4 0.21 0.4 0.35
0.87 0.33 0.44 0.72 0.86 0.82 0.81 0.79 0.81 0.61 0.52 0.35 1.0 0.32 0.22 0.68 0.19 0.32 0.44 0.23 0.09 0.04 0.02 0.05 0.23 0.21
0.66 0.47 0.57 0.54 0.62 0.64 0.84 0.77 0.44 0.51 0.49 0.46 0.82 0.59 0.64 1.0 0.52 0.55 0.53 0.4 0.01 0.12 0.21 0.2 0.75 0.39
0.81 0.63 0.41 0.38 0.42 0.58 0.93 1.0 0.84 0.66 0.48 0.33 0.69 1.0 0.86 0.68 0.55 0.75 0.59 0.56 0.0 0.46 0.09 0.12 0.45 0.18
0.91 0.71 0.66 0.77 0.77 0.83 0.91 0.94 0.58 0.56 0.52 0.53 1.0 0.73 0.55 0.74 0.52 0.89 0.69 0.7 0.01 0.09 0.17 0.18 0.67 0.37
0.76 0.26 0.37 0.75 1.0 0.91 0.97 0.78 0.44 0.29 0.33 0.51 0.98 0.2 0.19 0.27 0.2 0.28 0.26 0.23 0.31 0.27 0.25 0.17 0.43 0.38
0.97 0.55 0.37 0.33 0.38 0.5 0.86 0.8 0.86 0.75 0.68 0.7 1.0 0.59 0.69 0.53 0.56 0.77 0.65 0.57 0.06 0.17 0.49 0.5 0.53 0.52
0.45 0.41 0.34 0.46 0.56 0.85 0.81 0.67 0.71 0.43 0.4 0.38 0.35 1.0 0.53 0.89 0.35 0.35 0.25 0.27 0.04 0.3 0.2 0.19 0.32 0.25
0.86 0.78 0.89 0.93 0.76 0.72 0.67 0.81 0.67 0.57 0.61 0.62 1.0 0.72 0.74 0.86 0.49 0.65 0.7 0.51 0.09 0.57 0.42 0.42 0.35 0.5
0.74 0.64 0.84 0.83 0.99 0.71 0.98 0.86 0.94 0.74 0.79 0.76 0.98 0.94 0.9 1.0 0.85 0.87 0.79 0.75 0.11 0.23 0.36 0.51 0.75 0.7
0.92 0.65 0.71 0.62 0.54 0.5 0.77 0.87 0.76 0.83 0.86 0.96 1.0 0.79 0.78 0.8 0.79 0.66 0.65 0.68 0.16 0.29 0.35 0.4 0.39 0.44
0.7 0.7 0.72 0.76 0.86 0.67 0.77 0.75 0.65 0.65 0.65 0.56 0.69 0.91 1.0 0.98 0.8 0.66 0.59 0.63 0.02 0.22 0.51 0.42 0.82 0.54
1.0 0.69 0.62 0.57 0.61 0.61 0.9 0.94 0.68 0.67 0.58 0.54 0.95 0.34 0.5 0.35 0.55 0.8 0.66 0.67 0.01 0.2 0.24 0.21 0.51 0.37
0.64 0.61 0.65 0.71 0.89 1.0 0.86 0.8 0.87 0.81 0.83 0.78 0.8 0.7 0.77 0.76 0.63 0.57 0.54 0.58 0.19 0.68 0.5 0.43 0.44 0.48
0.76 0.54 0.6 0.6 0.79 0.85 1.0 0.94 0.7 0.69 0.52 0.42 0.61 0.73 0.6 0.79 0.57 0.6 0.64 0.66 0.07 0.26 0.4 0.21 0.43 0.41
0.99 1.0 0.89 0.81 0.75 0.68 0.85 0.79 0.71 0.68 0.6 0.74 0.98 0.7 0.8 0.74 0.58 0.96 0.87 0.73 0.08 0.22 0.27 0.33 0.43 0.51
0.88 0.62 0.74 0.77 0.9 0.71 0.98 0.87 0.93 1.0 0.91 0.89 0.8 0.87 0.69 0.82 0.68 0.66 0.7 0.7 0.07 0.17 0.47 0.41 0.5 0.55
0.98 0.57 0.55 0.64 0.71 0.7 0.79 0.77 0.58 0.49 0.42 0.39 1.0 0.56 0.46 0.58 0.34 0.66 0.6 0.46 0.1 0.32 0.38 0.24 0.45 0.32
1.0 0.87 0.68 0.56 0.43 0.46 0.73 0.84 0.88 0.95 0.99 0.87 0.88 0.58 0.51 0.78 0.52 0.79 0.83 0.49 0.01 0.14 0.51 0.49 0.25 0.34
0.68 0.66 0.67 0.71 0.85 1.0 0.63 0.72 0.72 0.57 0.55 0.59 0.52 0.86 0.92 0.81 0.55 0.47 0.68 0.67 0.14 0.14 0.5 0.38 0.38 0.54
0.9 0.55 0.58 0.55 0.48 0.52 0.79 0.74 0.53 0.53 0.5 0.58 1.0 0.59 0.68 0.78 0.68 0.97 0.81 0.78 0.12 0.09 0.33 0.29 0.42 0.44
0.78 0.83 0.68 0.7 0.68 0.75 0.79 0.8 0.84 0.94 1.0 0.82 0.77 0.76 0.64 0.88 0.51 0.85 0.74 0.5 0.27 0.33 0.76 0.45 0.39 0.49
0.47 0.39 0.44 0.52 0.52 0.73 1.0 0.96 0.72 0.57 0.39 0.33 0.45 0.83 0.85 0.85 0.43 0.43 0.38 0.42 0.04 0.09 0.39 0.23 0.41 0.58
0.85 0.63 0.4 0.34 0.5 0.68 0.99 0.89 0.9 0.6 0.43 0.29 0.62 0.96 0.84 0.73 0.73 1.0 0.81 0.53 0.01 0.33 0.26 0.34 0.56 0.37
0.83 0.89 0.92 0.91 1.0 0.83 0.88 0.92 0.91 0.85 0.88 0.81 0.97 0.64 0.82 0.7 0.65 0.8 0.73 0.67 0.04 0.34 0.22 0.35 0.36 0.45
0.82 0.8 0.91 0.9 0.74 0.6 0.6 0.6 0.38 0.39 0.36 0.38 0.91 0.68 0.62 0.64 1.0 0.68 0.63 0.55 0.12 0.61 0.35 0.39 0.66 0.82
0.81 0.68 0.71 0.81 0.64 0.43 0.75 0.8 0.55 0.49 0.54 0.47 0.88 0.67 0.66 1.0 0.62 0.6 0.66 0.73 0.05 0.25 0.25 0.55 0.74 0.73
0.84 0.96 0.9 0.93 0.89 0.84 1.0 0.96 0.88 0.68 0.82 0.82 0.93 0.8 0.91 0.85 0.6 0.81 0.53 0.45 0.04 0.56 0.51 0.36 0.88 0.65
0.49 0.42 0.34 0.36 0.49 0.74 1.0 0.87 0.9 0.59 0.43 0.3 0.4 0.57 0.65 0.73 0.78 0.76 0.62 0.63 0.02 0.25 0.14 0.17 0.38 0.26
0.33 0.32 0.43 0.55 0.69 0.74 1.0 0.83 0.71 0.47 0.38 0.33 0.25 0.65 0.66 0.84 0.53 0.44 0.58 0.51 0.03 0.27 0.65 0.22 0.43 0.28
0.96 0.8 0.74 0.78 0.67 0.42 0.79 0.82 0.65 0.77 0.8 0.72 1.0 0.59 0.63 0.63 0.63 0.87 0.77 0.78 0.23 0.23 0.48 0.42 0.54 0.5
0.71 0.55 0.62 0.67 0.62 0.41 0.66 0.64 0.61 0.74 0.73 1.0 0.68 0.63 0.51 0.62 0.34 0.6 0.51 0.51 0.04 0.02 0.43 0.39 0.47 0.62
0.31 0.4 0.27 0.24 0.35 0.55 0.64 0.5 0.44 0.21 0.13 0.09 0.24 0.65 0.71 1.0 0.59 0.58 0.52 0.41 0.01 0.15 0.08 0.08 0.38 0.19
0.37 0.45 0.33 0.31 0.38 0.57 0.75 0.65 0.56 0.25 0.16 0.13 0.33 0.61 0.62 1.0 0.56 0.55 0.38 0.36 0.0 0.13 0.11 0.07 0.45 0.18
0.51 0.36 0.29 0.36 0.26 0.21 0.39 0.58 0.4 0.31 0.22 0.18 0.58 0.34 0.36 1.0 0.22 0.5 0.37 0.2 0.07 0.19 0.21 0.11 0.39 0.3
0.27 0.43 0.45 0.46 0.54 0.63 0.86 0.8 0.72 0.64 0.46 0.32 0.27 0.99 0.88 1.0 0.66 0.68 0.56 0.56 0.01 0.17 0.15 0.13 0.34 0.21
0.7 0.44 0.48 0.6 0.7 0.78 1.0 0.89 0.7 0.41 0.37 0.38 0.72 0.34 0.31 0.5 0.33 0.37 0.41 0.34 0.2 0.31 0.41 0.25 0.36 0.29
0.25 0.36 0.48 0.67 0.84 0.92 1.0 0.99 0.96 0.86 0.84 0.68 0.36 0.64 0.56 0.7 0.57 0.38 0.53 0.76 0.08 0.74 0.5 0.42 0.34 0.52
1.0 0.87 0.69 0.76 0.83 0.76 0.87 0.82 0.81 0.75 0.63 0.6 0.8 0.38 0.65 0.42 0.59 0.64 0.71 0.6 0.01 0.09 0.21 0.31 0.22 0.22
0.55 0.65 0.61 0.73 0.8 0.74 0.67 0.69 0.7 0.67 0.71 0.7 0.64 0.41 1.0 0.41 0.33 0.63 0.58 0.39 0.03 0.45 0.43 0.29 0.64 0.48
0.44 0.68 0.71 0.71 0.7 0.61 0.8 0.77 0.64 0.53 0.42 0.35 0.44 1.0 0.62 0.91 0.47 0.45 0.38 0.44 0.19 0.3 0.45 0.27 0.53 0.48
0.52 0.77 0.86 0.79 0.86 0.98 0.91 0.85 0.78 0.61 0.53 0.47 0.54 1.0 0.69 0.87 0.49 0.42 0.5 0.47 0.15 0.32 0.4 0.28 0.52 0.44
0.89 0.61 0.59 0.73 0.76 0.68 0.95 1.0 0.87 0.84 0.8 0.59 0.75 0.57 0.45 0.32 0.52 0.68 0.64 0.63 0.21 0.11 0.35 0.43 0.48 0.47
0.96 0.61 0.55 0.58 0.79 0.85 1.0 0.97 0.98 0.86 0.86 0.68 0.93 0.83 0.56 0.67 0.55 0.72 0.72 0.71 0.04 0.36 0.53 0.54 0.68 0.56
0.76 0.68 0.67 0.82 0.66 0.53 0.79 0.9 0.55 0.55 0.58 0.62 1.0 0.55 0.44 0.74 0.35 0.67 0.54 0.44 0.14 0.41 0.53 0.34 0.53 0.48
0.07 0.05 0.08 0.24 0.22 0.29 0.4 0.18 0.83 0.19 0.13 0.13 0.05 1.0 0.21 0.59 0.06 0.2 0.08 0.08 0.3 0.11 0.09 0.02 0.13 0.2
1.0 0.78 0.73 0.63 0.67 0.68 0.75 0.74 0.67 0.69 0.62 0.59 0.87 0.6 0.7 0.59 0.65 0.85 0.79 0.77 0.06 0.35 0.37 0.39 0.45 0.46
0.04 0.04 0.06 0.13 0.34 0.76 0.59 0.28 0.48 0.19 0.15 0.06 0.07 1.0 0.41 0.67 0.19 0.27 0.27 0.16 0.0 0.01 0.07 0.04 0.04 0.08
1.0 0.73 0.57 0.52 0.5 0.54 0.86 0.95 0.66 0.64 0.58 0.49 0.83 0.51 0.41 0.59 0.61 0.81 0.54 0.5 0.06 0.32 0.43 0.43 0.47 0.32

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)