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Heatmap: Cluster_67 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-2.04 -0.74 -0.29 0.21 0.22 0.14 -0.06 0.23 0.05 -0.12 -0.03 -0.04 -1.95 -0.27 -0.68 -0.18 -1.05 -0.18 -0.36 -1.15 1.33 0.38 0.78 0.79 0.16 0.38
-2.06 -0.83 -0.73 0.06 0.07 -0.39 -0.5 -0.35 0.12 0.23 0.34 0.09 -1.82 -0.5 -0.59 -0.8 -1.06 -0.03 -0.22 -1.4 1.59 0.74 1.19 0.46 0.11 0.39
-3.53 -2.86 -2.61 -1.88 -1.73 -1.74 -1.39 -1.8 -1.38 -1.34 -1.61 -1.75 -3.11 -1.25 -1.0 -0.57 -2.3 0.11 -1.01 -2.55 2.59 2.26 2.24 -0.07 0.43 0.2
0.85 -0.52 -0.7 -0.47 -1.12 -2.08 -2.09 -1.71 -2.13 -1.41 -0.1 0.68 1.08 -2.03 -2.57 -2.53 -1.76 -1.73 -2.39 -1.6 2.1 1.45 1.3 0.93 0.18 0.53
-1.58 -1.38 -1.39 -1.03 -0.72 -0.82 -0.42 -0.41 -0.52 -0.48 -0.55 -0.81 -1.43 0.04 0.2 0.56 -0.14 0.37 0.39 -0.34 0.81 1.51 0.85 0.89 0.4 0.22
-1.32 -1.17 -1.15 -0.55 -0.69 -1.07 -1.03 -0.83 -0.73 -0.68 -0.29 -0.37 -0.95 -1.58 -0.43 -0.77 -1.21 -0.31 -1.0 -1.58 1.5 1.51 2.65 0.51 -0.33 -0.62
-1.18 -1.14 -1.0 -1.02 -1.21 -1.46 -1.45 -1.46 -1.12 -0.74 -0.87 -0.8 -1.11 -0.06 -0.61 0.23 -0.88 -0.51 -1.01 -1.07 1.7 1.52 1.44 1.06 0.92 1.1
-0.42 -0.38 -0.73 -0.82 -0.5 -0.45 -0.97 -0.81 -0.55 -0.51 -0.88 -0.61 -1.21 -0.84 -0.97 -1.16 -0.92 -0.22 -0.45 -0.36 1.68 0.89 1.9 0.25 0.96 0.51
-0.4 -0.57 -0.75 -0.29 -0.18 -0.5 -0.7 -0.53 -0.74 -0.87 -0.7 -0.86 -0.76 -0.09 0.41 0.25 -0.25 0.47 0.54 -0.53 0.51 1.23 0.83 0.09 0.58 0.5
-0.25 -0.43 -0.73 -0.33 -0.34 -0.57 -0.2 -0.32 -0.39 -0.35 -0.18 -0.36 -0.24 -0.3 -0.45 -0.45 -0.81 0.03 -0.7 -0.98 1.15 0.67 1.59 0.86 0.31 -0.04
0.08 -0.82 -1.2 -0.84 -1.37 -1.71 -1.23 -0.94 -0.66 -0.43 -0.06 -0.12 -0.42 -0.84 -1.54 -1.64 -1.59 -1.1 -2.05 -1.42 1.84 1.5 1.36 1.26 0.86 0.93
- - - - -3.17 - - - - -2.17 -3.1 - -2.67 -1.54 -1.57 -1.47 - -0.63 -3.42 -2.15 2.77 1.99 3.33 -1.77 -0.26 0.48
-1.36 -1.13 -1.1 -0.55 -0.73 -1.22 -1.1 -0.94 -0.65 -0.86 -0.31 -0.31 -0.91 -0.07 0.57 -0.09 -0.76 0.02 -0.1 -1.01 1.56 1.42 1.47 0.69 0.2 0.1
-0.87 -1.17 -1.23 -0.24 -0.37 -1.05 -1.0 -0.62 -0.67 -0.57 -0.22 -0.43 -0.72 -0.68 -0.59 -0.32 -1.23 -0.62 -0.95 -1.96 1.4 1.77 1.77 0.92 0.46 0.2
-1.12 -1.07 -0.8 -0.46 -0.51 -1.23 -0.88 -0.67 -0.87 -0.54 -0.4 -0.47 -0.8 0.3 0.28 0.87 -0.13 0.24 -0.15 -0.86 1.1 1.17 1.36 0.49 0.07 -0.08
-1.66 -1.24 -0.11 0.28 -0.19 -0.57 -0.25 -0.1 -0.19 0.2 0.54 0.66 -0.84 -1.04 -2.52 -0.84 -1.64 -0.47 -1.0 -1.28 1.33 0.24 1.38 1.18 0.33 0.24
-2.59 -1.4 -1.54 -0.78 -0.28 -0.26 -0.5 -0.79 -0.05 -0.26 -0.08 0.03 -2.95 -0.43 -0.25 -0.55 -0.98 -0.32 -0.36 -0.97 1.95 1.08 1.9 0.63 -0.41 -0.29
-0.48 -1.47 -1.82 -0.79 -0.53 -0.37 -0.19 -0.28 -0.25 0.1 0.29 -0.01 -0.42 -1.1 -2.57 -0.81 -1.86 -1.18 -2.15 -2.46 1.63 0.98 1.6 1.14 1.06 0.36
-2.58 -2.66 -2.53 -2.33 -1.62 -1.57 -1.58 -1.69 -1.53 -1.35 -1.41 -1.97 -2.16 -0.06 -0.7 -0.2 -0.45 0.94 0.11 -0.14 1.35 2.18 1.88 0.1 0.92 0.66
-0.28 -0.83 -1.21 -0.83 -1.08 -1.82 -1.38 -1.19 -1.32 -1.3 -0.77 -0.82 -0.45 -1.26 -1.22 -1.09 -1.79 -1.38 -1.68 -2.07 1.99 1.37 1.98 1.67 0.76 0.53
-0.23 -0.59 -0.71 -0.42 -0.37 -0.62 -0.14 -0.2 -0.29 -0.47 -0.37 -0.45 -0.49 -0.68 -1.01 -0.52 -0.62 0.03 -0.17 -0.28 0.87 0.82 1.49 0.84 0.68 0.22
-1.33 -0.71 -0.73 -0.34 0.02 0.04 -0.32 -0.59 -0.5 -0.33 -0.19 -0.42 -1.48 -0.35 -0.03 0.22 -0.17 0.59 0.58 -0.42 0.83 0.87 0.97 0.53 -0.18 0.17
-0.71 -1.14 -2.79 -1.14 -1.77 -1.86 -2.62 -2.16 -1.55 -1.43 -0.66 -0.08 -1.01 -1.92 -2.51 -2.18 -2.99 -1.04 -0.82 -3.97 2.02 1.8 2.55 1.17 0.98 0.11
-1.19 -1.34 -1.33 -0.5 -0.47 -1.33 -0.68 -0.42 -1.07 -0.76 -0.61 -0.83 -0.98 -0.4 -0.8 -0.43 -0.24 0.07 -0.66 -0.24 1.84 1.08 1.36 1.05 0.7 0.46
-0.64 -0.84 -0.6 -0.3 -0.11 -0.28 0.06 -0.12 -0.28 -0.41 -0.37 -0.26 -0.61 -0.67 -0.71 -0.21 -0.54 -0.11 -0.34 -0.56 1.4 0.88 1.46 0.25 0.29 -0.11
-2.03 -1.32 -1.13 -0.9 -0.48 -0.27 -0.2 -0.26 -0.37 -0.32 -0.56 -0.91 -1.98 -0.51 0.24 -0.32 -0.64 0.34 0.29 -0.66 0.71 1.63 1.99 0.12 -0.08 -0.15
-0.7 -0.7 -1.18 -0.06 -0.11 -0.53 0.01 -0.31 -0.08 -0.19 0.24 -0.33 -0.69 -0.27 -0.53 -0.25 -0.84 -0.06 -0.05 -0.49 1.45 0.68 1.24 0.19 0.2 -0.05
-2.94 -1.41 -0.74 -0.56 -0.58 -0.1 -0.31 -0.33 -0.2 -0.68 -0.85 -0.88 -3.08 -0.38 -0.41 -0.07 -0.63 0.03 -0.45 -1.14 1.62 1.96 1.13 0.64 0.32 0.02
-2.02 -1.26 -1.21 -1.07 -0.76 -0.96 -0.81 -0.85 -0.57 -0.52 -0.61 -0.83 -1.96 0.04 0.67 0.17 -0.53 0.46 -0.07 -0.73 1.73 1.81 0.84 0.47 0.12 -0.13
-0.89 -0.79 -0.89 -0.69 -0.85 -1.39 -1.0 -0.86 -1.07 -0.62 -0.49 -0.5 -0.5 0.06 0.47 0.25 -0.83 0.57 -0.06 -1.07 1.43 1.39 1.11 0.68 0.14 0.24
-1.31 -1.1 -1.21 -0.75 -0.63 -0.94 -0.8 -0.62 -0.37 -0.19 -0.0 -0.16 -0.91 -0.85 -0.54 -0.62 -1.47 -0.34 -0.69 -1.74 1.83 1.63 2.0 0.38 -0.19 -0.22
-1.98 -1.47 -1.24 -0.87 -0.57 -0.93 -0.84 -1.03 -0.68 -0.52 -0.56 -0.89 -1.83 -0.03 0.27 0.21 -0.76 -0.01 0.03 -1.35 1.38 1.54 2.06 0.4 0.02 -0.02
-2.27 -1.63 -1.35 -1.02 -0.9 -1.04 -0.8 -0.82 -0.58 -0.43 -0.48 -0.38 -1.98 -0.07 0.69 0.18 -0.51 0.59 0.03 -1.1 1.72 0.69 1.63 0.81 0.13 0.06
-1.49 -0.46 -0.64 -0.82 -0.63 -0.35 -0.6 -0.62 -0.49 -0.57 -0.7 -1.26 -1.57 -0.11 0.89 0.08 -0.28 0.77 0.62 -0.39 1.08 0.88 1.19 0.03 0.22 0.17
-1.3 -1.87 -2.04 -1.26 -1.39 -2.24 -1.48 -0.95 -1.44 -1.27 -1.29 -1.59 -1.23 -1.98 -1.55 -1.54 -2.59 -0.75 -1.37 -2.49 2.46 2.67 1.56 0.72 0.18 0.47
-2.75 -0.92 -0.57 -0.34 -0.39 -0.41 -0.63 -0.47 -0.3 -0.44 -0.44 -0.03 -2.94 -0.29 0.37 -0.22 -0.44 0.66 0.52 -0.41 1.13 0.87 1.27 0.57 0.16 0.09
-0.4 -1.05 -0.94 -0.41 -0.39 -0.66 -0.07 0.17 0.01 0.22 0.35 0.19 -0.08 -0.1 -1.3 0.02 -0.84 -0.76 -1.08 -1.24 1.46 0.43 1.4 0.33 0.15 -0.02
-0.95 -2.48 -2.16 -1.37 -1.39 -2.54 -2.11 -2.7 -1.62 -1.72 -1.67 -1.55 -2.38 -2.72 -3.39 -2.18 -2.18 -2.45 -3.43 -2.98 2.31 2.18 2.75 1.41 0.99 -1.73
-0.53 -0.74 -0.51 -0.24 -0.23 -1.22 -0.49 -0.48 -0.4 -0.58 -0.19 -0.64 -1.06 -0.2 -0.36 -0.66 -1.31 0.1 -0.27 -1.54 1.61 1.49 1.07 0.63 0.3 0.44
-0.85 -0.59 -0.67 -0.57 0.02 0.28 0.16 -0.2 -0.47 -0.62 -0.87 -1.02 -1.08 -0.18 -0.08 -0.28 -0.12 0.34 0.22 -0.06 0.27 1.27 1.11 0.25 0.29 0.31
-0.6 -0.59 -0.53 -0.4 -0.33 -0.47 -1.21 -1.33 -0.65 -0.6 -0.45 -0.08 -0.92 -1.1 0.46 -0.97 -0.01 0.04 -0.18 -0.09 0.98 1.47 1.02 0.74 0.2 0.66
-0.97 -1.06 -0.68 -0.19 0.06 -0.13 0.16 0.1 0.1 -0.02 0.01 0.02 -0.82 -0.04 -0.59 -0.22 -0.38 -0.17 -0.58 -1.06 0.96 0.79 1.08 0.25 0.45 0.11
-3.86 -2.19 -0.77 -0.23 0.12 0.37 0.33 0.1 0.07 -0.0 -0.11 -0.16 -4.36 0.25 -0.48 -0.09 -0.04 0.03 -0.44 -0.76 1.42 -0.16 1.27 0.4 0.39 -0.22
-2.26 -1.66 -0.88 -0.5 -0.43 -0.84 -0.5 -0.4 0.04 0.17 0.11 -0.0 -1.84 0.06 0.45 0.47 -0.31 0.32 0.13 -0.59 1.2 0.87 1.13 0.31 -0.25 -0.11
-0.47 -0.75 -0.86 -0.67 -0.61 -0.72 -0.49 -0.51 -0.32 -0.32 -0.17 -0.33 -0.45 -0.28 -0.4 -0.21 -0.38 -0.17 -0.04 -0.33 1.31 1.55 0.95 0.64 0.36 -0.43
-0.45 -0.35 -0.61 -0.83 -1.72 -2.77 -2.13 -1.32 -0.86 -0.3 0.42 0.85 -0.35 0.09 -1.67 0.15 -0.33 -1.35 -1.68 -1.18 1.51 0.88 1.42 1.64 0.26 -0.33
-1.08 -0.98 -1.14 -0.78 -0.38 -0.54 -0.4 -0.61 -0.37 -0.58 -0.63 -0.43 -1.51 -0.05 -0.64 -0.03 -0.81 0.09 -0.21 -0.93 0.98 0.99 2.09 0.82 0.49 -0.11
-1.45 -0.91 -1.28 -1.15 -1.42 -1.38 -0.72 -0.56 -0.14 -0.12 -0.06 0.08 -1.15 -0.77 -0.5 -0.62 -0.66 0.19 -0.28 -1.37 1.75 1.93 1.13 0.68 0.19 -0.22
-1.31 -1.39 -1.19 -0.44 -0.5 -1.15 -0.91 -0.67 -0.38 -0.38 -0.26 -0.51 -0.92 -0.68 -0.05 -0.67 -1.0 0.32 -0.15 -1.09 1.06 1.76 1.81 0.89 -0.07 -0.03
-1.24 -2.02 -2.85 -1.67 -1.25 -1.14 -0.32 -0.92 -0.65 -0.53 -0.82 -0.8 -1.21 -0.38 -0.59 -0.47 -1.1 0.47 -0.42 -0.91 1.87 0.49 2.16 0.93 0.91 0.26
-2.36 -1.68 -2.33 -1.48 -0.5 -0.57 -0.38 -0.74 -0.61 -0.7 -0.42 -0.88 -2.8 0.13 0.26 0.11 -0.45 -0.04 0.19 -1.26 1.28 1.68 1.11 1.28 0.31 0.48
0.19 -0.56 -0.73 -0.4 -1.1 -1.83 -1.28 -0.56 -0.43 -0.27 0.35 0.46 -0.08 -1.67 -2.12 -1.42 -1.64 -1.04 -1.6 -1.53 1.58 0.42 1.6 1.49 0.78 0.59
-2.17 -1.31 -1.47 -0.44 -0.43 -0.85 -0.88 -0.71 -0.46 -0.4 -0.23 -0.43 -1.84 -0.95 -1.28 -0.5 -1.34 -0.47 -0.76 -1.94 1.82 1.35 2.28 0.77 0.53 -0.32
-0.74 -0.44 -0.57 0.06 -0.08 -0.53 -0.23 0.05 -0.26 -0.18 -0.02 -0.22 -0.86 -1.3 -0.31 -0.9 -0.58 0.36 0.21 -0.84 1.02 1.34 1.2 0.06 0.13 -0.16
-2.7 -2.73 -2.49 -1.54 -1.13 -1.16 -1.15 -1.15 -1.04 -0.97 -0.89 -1.34 -2.79 -1.77 -1.94 -1.22 -2.79 -0.78 -1.47 -2.38 2.44 2.14 2.15 1.11 0.57 0.2
-1.62 -1.89 -1.66 -1.39 -0.76 -0.31 -0.1 -0.18 -0.18 -0.36 -0.63 -0.83 -1.25 -0.39 -0.03 -0.52 -0.53 0.61 0.07 -0.61 1.6 1.97 0.72 0.11 0.05 0.18
-2.16 -1.71 -1.2 -0.93 -0.81 -0.95 -0.85 -0.8 -0.46 -0.55 -0.61 -1.02 -2.38 -0.07 0.13 0.16 -1.09 -0.09 -0.35 -1.4 1.54 1.86 1.44 0.58 0.74 0.49
-1.81 -1.74 -1.07 -0.48 -0.63 -0.87 -0.89 -0.79 -0.18 -0.51 -0.34 -0.51 -2.25 -0.75 -1.12 -0.8 -1.55 -0.16 -0.55 -1.59 1.57 1.1 2.43 0.71 0.52 0.24
-0.16 -0.45 -0.51 -0.09 -0.38 -0.88 -1.03 -0.87 -1.09 -0.81 -0.12 0.05 -0.0 -1.55 -1.55 -1.33 -1.29 -1.22 -1.29 -1.12 1.96 1.04 2.01 0.65 0.26 -0.22
-2.8 -2.18 -1.25 -1.12 -0.95 -1.11 -0.91 -1.07 -0.76 -0.67 -0.82 -1.04 -2.69 -0.58 -0.26 -0.45 -0.64 1.04 -0.07 -0.94 1.33 1.96 2.21 0.54 -0.67 -0.29
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-0.83 -1.44 -1.65 -0.54 -1.15 -2.37 -0.71 -0.8 -0.45 -0.31 0.24 -0.34 -1.97 -0.8 -0.65 -0.07 -1.48 -0.16 -1.14 -1.53 1.82 1.83 1.64 0.9 0.08 0.15
-1.46 -1.27 -1.03 -0.56 -0.47 -0.83 -0.29 -0.54 -0.26 -0.03 -0.11 -0.45 -1.35 -0.22 -0.99 0.86 -0.72 -0.26 -0.78 -0.74 1.53 1.1 1.34 0.46 0.3 0.51
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-1.15 -0.68 -0.7 -0.11 -0.25 -0.87 -0.38 -0.12 -0.19 -0.29 -0.07 -0.34 -1.06 0.11 0.36 0.58 -0.35 0.41 0.09 -0.76 0.88 0.6 1.08 0.2 0.19 0.0
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-2.95 -0.99 0.04 0.43 -0.04 -0.47 -0.2 -0.19 -0.6 -0.83 -0.7 -0.62 -2.75 -0.16 -0.09 0.21 -0.82 -0.26 -0.74 -0.94 1.5 0.93 1.08 0.87 0.55 0.32
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-0.66 -0.36 -0.23 0.01 -0.06 -0.96 -1.31 -1.26 -0.76 -0.16 0.18 0.45 -0.95 -1.45 -0.66 -1.71 -1.04 -0.41 -1.4 -0.89 1.03 1.33 1.32 1.44 0.23 0.62
-0.18 -0.43 -0.53 0.03 -0.19 -0.57 -0.36 -0.52 -0.69 -0.41 0.0 -0.23 -0.46 -1.72 -1.75 -1.53 -0.86 -0.74 -1.08 -0.99 1.41 1.3 1.18 1.5 0.64 -0.3
-1.36 -1.22 -2.54 -0.46 -0.93 -2.16 -1.46 -0.74 -0.62 -1.44 -0.62 -0.49 -1.65 -1.07 -0.86 -0.82 -1.65 0.14 -1.59 -2.29 2.08 1.65 1.81 0.4 1.38 0.63

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.