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Heatmap: Cluster_219 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.88 -0.66 -0.19 0.06 0.13 -0.04 0.58 0.51 0.57 0.65 0.49 0.4 -0.46 0.16 -0.28 0.51 0.05 -0.53 -0.35 0.17 -4.07 -0.87 -0.03 -0.13 -0.09 -0.03
0.18 -0.24 -0.23 0.09 0.28 0.03 0.16 0.32 0.31 0.33 0.5 0.52 0.49 -0.16 -0.54 -0.72 -0.93 -0.11 -0.27 -0.92 -2.13 -0.13 0.59 0.42 -0.14 -0.2
-0.21 0.09 0.27 0.49 0.32 -0.06 0.18 0.12 -0.13 0.07 0.11 -0.0 0.01 0.33 -0.35 0.06 -0.03 0.39 0.01 -0.28 -2.01 -1.39 -0.13 -0.16 0.33 0.13
0.14 -0.52 -0.25 0.14 0.09 0.13 0.53 0.6 0.26 0.3 0.34 0.35 0.36 0.42 -0.71 0.07 -0.34 0.27 -0.34 -0.46 -2.59 -0.46 -1.06 -0.9 0.46 0.13
-0.69 -0.6 -0.4 -0.26 -0.03 0.38 0.6 0.56 0.73 0.54 0.32 0.31 -0.4 0.04 -0.51 0.12 -0.27 -0.2 -0.19 -0.0 -2.21 -0.45 0.36 0.04 -0.17 -0.07
-0.6 -0.54 -0.39 0.1 0.49 0.65 0.48 0.3 0.61 0.47 0.34 0.51 -0.06 0.13 -0.11 0.04 -0.4 -0.14 -0.4 -0.11 -2.77 -0.37 -0.58 -0.36 -0.35 0.14
-0.21 -0.06 0.14 0.38 0.46 -0.13 0.51 0.34 -0.17 0.09 -0.03 0.17 0.21 0.18 -0.21 0.28 0.23 0.1 -0.23 -0.03 -4.05 -1.38 -0.38 -1.07 0.68 0.01
-0.12 -0.13 -0.05 0.46 0.44 0.19 0.26 0.37 0.28 0.34 0.64 0.58 -0.17 0.2 -0.43 0.06 -0.32 -0.1 -0.12 -0.18 -6.29 -2.43 -0.14 -0.04 -0.12 -0.05
0.1 -0.07 0.01 0.24 0.2 0.31 0.45 0.37 0.48 0.42 0.25 0.15 0.26 0.17 -0.18 0.04 -0.23 -0.03 -0.29 -0.35 -3.11 -0.38 -0.69 -0.77 0.19 -0.3
0.06 -0.22 -0.27 0.17 0.46 0.52 0.59 0.41 0.49 0.19 -0.08 -0.15 0.38 -0.35 -0.02 0.3 -0.76 0.19 -0.22 -0.35 -3.02 -1.07 0.34 0.11 -0.08 -0.86
-0.31 -0.01 -0.16 0.02 0.04 -0.01 0.24 0.34 0.56 0.45 0.38 0.33 -0.29 -0.25 -0.02 -0.21 -0.36 -0.01 -0.12 -0.53 -3.23 -0.68 0.34 0.34 0.39 -0.09
0.06 -0.29 -0.24 0.19 0.33 0.12 0.29 0.17 0.48 0.03 0.38 0.46 -0.01 0.04 -0.39 0.18 -0.33 -0.16 -0.44 -0.6 -2.13 -1.08 0.39 -0.33 0.3 0.38
-0.76 -0.51 0.21 0.09 0.49 0.46 0.47 0.49 0.11 0.66 0.27 0.42 -1.06 -0.08 -0.29 -0.31 -0.69 0.39 0.11 -0.53 -2.7 -1.59 -1.2 1.27 -0.5 -0.12
0.24 -0.75 -1.22 0.06 0.01 -0.09 0.23 -0.06 0.13 0.06 0.57 0.5 0.02 -0.08 -0.13 0.32 -0.48 0.19 -0.44 -0.88 -2.1 -0.74 0.48 0.7 0.37 0.31
-0.0 0.02 0.1 0.42 0.4 0.45 0.41 0.54 0.19 -0.36 -0.43 -0.49 -0.07 -0.15 0.29 -0.17 -0.49 0.33 -0.09 -0.61 -1.19 -0.28 0.37 -0.23 -0.29 -0.05
-0.62 -0.58 -0.46 -0.24 0.12 0.19 0.44 0.49 0.41 0.64 0.37 0.13 -0.61 0.37 -0.63 0.18 -0.18 0.05 -0.21 0.13 -2.24 -0.84 0.24 0.03 0.36 -0.0
0.08 0.11 0.06 0.27 0.47 0.0 0.18 0.31 0.4 0.45 0.49 0.47 0.08 -0.18 -0.07 -0.28 -0.27 -0.01 -0.13 -0.08 -2.91 -0.26 -0.87 -0.49 -0.28 -0.09
-2.53 -0.16 -0.61 -0.01 0.32 -0.21 -0.48 -0.43 -0.22 0.49 0.22 -0.15 -2.16 0.8 -0.09 0.79 0.21 0.09 -0.58 -0.01 -6.03 -2.22 -0.21 1.96 0.11 -0.34
-1.51 -0.85 -1.0 -0.13 -0.25 -0.83 0.06 0.27 0.47 0.58 0.71 0.4 -1.32 0.41 -0.57 0.22 0.0 0.61 -0.13 0.28 -3.05 -0.56 -0.32 0.73 0.58 0.29
0.49 0.3 0.12 0.27 0.46 0.06 0.4 0.48 0.12 0.27 0.62 0.24 0.25 -0.66 -0.94 -0.85 -0.16 -0.03 -0.43 -0.4 -4.24 -0.42 -0.02 -0.16 0.27 -0.37
-2.14 -0.35 -0.22 -0.12 0.03 -0.36 0.31 0.38 0.59 0.84 0.82 0.47 -2.37 0.01 -0.44 -0.38 -0.16 0.69 0.06 0.38 -4.25 -1.04 -0.41 -0.11 0.48 0.32
-0.56 -0.29 -0.2 0.27 0.2 0.19 0.5 0.5 0.54 0.34 0.38 0.02 -0.71 -0.12 -0.41 -0.27 -0.13 0.09 -0.22 -0.06 -2.55 -0.35 0.3 0.07 0.33 -0.22
0.01 -0.32 -0.35 -0.18 -0.17 -0.13 0.51 0.49 0.25 0.21 0.38 0.37 0.19 0.08 0.03 0.08 -0.48 0.09 0.08 -0.52 -2.68 -1.24 -0.06 0.2 0.42 0.15
-0.11 0.2 0.41 0.57 0.5 0.42 0.35 0.12 0.46 0.22 0.04 0.24 -0.14 -1.05 0.03 -0.67 -0.28 0.31 0.07 -0.46 -5.03 -1.28 0.13 0.12 -0.04 -0.4
0.43 0.64 0.09 0.09 -0.01 0.08 0.47 0.51 0.52 0.58 0.58 0.45 0.35 -1.25 -1.34 -1.45 -0.88 -0.36 -0.7 -0.69 -3.09 -0.74 -0.0 -0.18 0.96 -0.38
-1.65 -1.08 -1.29 0.17 0.31 0.63 0.65 0.76 -0.6 -0.74 -1.9 -1.05 -0.61 0.16 -0.04 0.22 -1.07 0.01 -0.33 -0.55 -1.78 -1.79 0.66 1.92 0.88 -0.06
-1.07 -0.39 -0.3 -0.04 0.19 0.12 0.5 0.43 0.47 0.45 0.29 0.06 -0.93 0.2 -0.09 0.37 0.08 0.07 -0.28 0.19 -1.35 -0.43 -0.11 0.21 -0.42 0.07
0.38 0.02 0.05 0.76 0.76 0.2 0.34 0.41 0.1 0.18 0.52 0.74 0.66 -0.79 -0.63 -1.15 -0.48 -0.09 0.24 -0.71 -4.28 -0.33 -2.39 -0.39 -0.16 -0.31
-0.23 -0.68 -0.49 -0.0 0.13 -0.03 0.66 0.36 -0.02 0.2 0.33 0.27 0.08 0.06 -0.39 -0.06 -0.24 0.21 -0.33 -0.08 -1.68 -0.11 0.11 0.0 0.39 0.13
0.06 0.13 -0.06 0.28 -0.15 -0.31 0.07 0.31 0.17 0.27 0.59 0.33 0.38 0.0 -0.8 -0.19 -1.17 0.05 -0.27 -0.09 -2.28 -1.78 -0.49 0.24 0.81 0.53
0.2 0.29 0.23 0.38 0.27 -0.23 0.17 0.43 0.21 0.34 0.45 0.27 0.34 -0.28 -0.13 -0.05 -0.37 -0.31 -0.29 -0.41 -4.58 -0.85 -0.2 -0.33 0.47 -0.2
-1.24 -0.58 -0.3 0.13 0.05 -0.15 0.24 0.37 0.51 0.72 0.61 0.52 -0.89 0.19 -0.11 0.24 -0.27 0.2 -0.28 -0.21 -2.25 -0.4 -0.34 0.23 0.08 0.18
0.24 -0.19 -0.5 -0.13 0.23 0.32 0.3 0.34 0.55 0.24 0.44 0.23 0.01 -0.1 -0.05 -0.24 -0.39 0.11 -0.13 -0.49 -4.32 -1.68 0.21 0.56 0.24 -0.21
-0.48 0.05 0.27 0.29 0.28 -0.28 -0.11 0.05 0.22 0.23 0.32 0.41 -0.55 0.34 0.19 0.21 0.01 0.11 0.31 -0.33 -2.2 -0.89 -0.19 -0.11 0.19 -0.26
0.32 -0.18 -0.03 0.05 0.36 0.42 0.4 0.36 0.2 0.1 0.16 0.22 0.52 0.18 -0.43 0.05 -0.4 -0.23 -0.71 -0.25 -3.1 0.04 -0.51 -0.38 0.11 0.04
-0.16 -2.89 -2.91 0.43 -0.37 0.76 0.2 0.0 -0.12 0.48 -0.16 -3.04 1.18 0.28 -1.8 -0.77 -0.38 1.21 -1.49 0.12 -4.07 - -1.72 2.35 -3.75 0.19
-4.42 -1.02 -0.8 -0.19 -0.28 -0.38 0.73 0.21 0.99 0.71 0.7 0.44 -3.25 -0.47 -0.01 0.12 0.14 0.33 0.16 0.2 - -1.09 -0.03 0.42 0.54 0.3
0.62 -0.23 -0.42 0.18 0.33 0.15 0.28 0.39 0.24 -0.04 0.01 -0.11 0.43 -0.22 -0.53 -0.09 -0.69 -0.16 -0.2 -0.77 -2.78 -0.39 0.31 0.69 0.33 -0.12
-0.06 -0.02 -1.48 0.17 0.01 1.56 0.91 0.81 0.48 -0.91 -0.57 -1.05 -1.25 -2.51 0.18 -1.16 -1.1 -0.36 -1.06 -1.05 -2.13 -3.4 0.42 2.33 -1.24 -1.31
-0.27 -0.11 -0.13 0.11 0.24 0.15 0.2 0.34 0.4 0.46 0.73 0.42 -0.57 -0.05 0.03 -0.08 0.05 0.3 0.06 0.0 -4.33 -1.81 -0.45 -0.25 0.18 -0.17
0.61 0.02 -0.03 -0.06 0.83 0.43 0.69 0.56 0.46 0.59 -1.12 -0.0 0.43 -0.48 -0.35 -0.15 0.04 0.3 0.06 -0.22 - -4.16 -2.24 0.84 -1.38 -0.69
-0.1 -0.26 -0.25 0.54 0.39 0.03 0.17 0.18 0.21 0.25 0.66 0.13 -0.68 -0.48 -0.26 -0.46 -0.4 -0.34 -0.46 0.18 -7.12 -0.74 0.81 -0.29 0.61 0.41
-0.95 -0.46 -0.25 -0.15 0.48 0.7 0.41 0.2 0.51 0.54 0.63 0.42 -0.53 -0.07 -0.23 -0.36 -0.61 -0.2 -0.53 -0.22 -3.75 0.38 -0.14 -0.1 -0.03 0.24
0.1 -0.01 0.15 0.23 0.1 -0.12 0.16 0.16 -0.13 0.33 0.24 0.21 0.48 -0.02 -0.63 -0.01 0.53 0.03 -0.39 -0.31 -2.55 -0.59 -0.54 -0.46 0.38 0.39
-1.83 -0.51 -0.82 0.14 -0.36 -0.61 0.12 0.63 0.79 0.81 0.68 0.62 -1.1 0.53 -0.49 0.57 -0.17 -0.36 -0.5 0.18 -5.3 0.1 -0.4 -0.0 0.13 0.12
0.25 -0.24 -0.15 0.19 0.11 0.15 0.37 0.57 0.57 0.65 0.13 0.35 0.54 -0.12 -0.46 0.29 -0.08 0.24 0.08 -0.31 -4.75 -1.56 -1.02 -0.79 -0.22 -0.13
0.3 0.45 -0.11 0.5 0.08 -0.19 0.11 0.63 0.24 0.37 0.55 0.25 0.28 -0.62 -0.43 -1.12 -0.6 -0.08 -0.49 -0.66 -4.79 -1.35 0.31 0.02 0.72 0.02
-0.08 -0.07 0.13 0.36 0.54 0.71 0.3 0.2 0.33 0.41 0.17 0.08 -0.11 -0.61 -0.2 -0.12 -0.63 0.18 -0.57 -0.53 -3.88 -1.45 0.08 0.7 0.16 -0.44
0.11 0.03 0.1 0.41 0.36 0.16 0.33 0.41 0.32 0.21 0.12 0.07 -0.05 -0.31 0.2 0.07 -0.25 0.5 0.06 -0.17 -2.15 -1.38 -0.2 -0.55 -0.08 -0.5
0.0 0.16 0.32 0.44 0.34 0.33 0.56 0.51 0.5 0.26 0.28 0.25 0.43 0.24 -0.63 0.17 -0.47 -0.13 -0.65 -0.22 -4.52 -0.14 -1.32 -0.81 -0.37 -0.51
-0.05 -0.19 -0.21 0.09 0.22 0.04 0.29 0.32 0.35 0.45 0.39 0.32 -0.04 0.06 -0.11 0.01 -0.3 0.08 0.0 -0.17 -3.54 -0.8 -0.86 0.31 0.37 -0.14
0.22 -0.03 -0.31 0.23 0.55 0.23 0.37 0.34 0.53 0.51 0.27 0.25 0.44 -0.15 -0.58 -0.35 -0.47 -0.41 -0.41 -0.71 -3.28 0.09 -0.45 -0.14 0.24 -0.21
-0.18 -0.03 -0.25 0.06 0.1 0.31 0.33 0.49 0.62 0.64 0.47 0.32 0.12 -0.12 0.03 0.09 -0.42 -0.12 0.14 0.04 -3.33 -0.42 -0.49 -0.44 -0.59 -0.53
-0.27 -0.86 -0.76 0.11 0.1 -0.26 0.43 0.23 0.43 0.48 0.32 0.16 -0.89 -0.17 -0.31 0.18 -0.59 0.58 0.13 -0.36 -2.18 -0.54 -0.16 0.53 0.7 0.17
0.36 -0.02 -0.26 0.31 0.22 0.63 0.87 0.87 0.12 0.25 0.13 0.11 -0.29 -2.38 -2.35 -1.02 -1.87 -0.22 -0.38 -0.36 -4.46 -1.33 0.58 1.26 0.64 -0.8
0.07 -0.56 -0.43 0.05 0.33 0.03 0.29 0.36 0.53 0.55 0.46 0.55 0.01 0.42 -0.1 0.08 -0.68 -0.42 -0.4 -0.56 -3.61 -0.56 -0.17 0.28 -0.18 0.11
-0.09 -0.3 -0.33 0.38 0.39 0.06 0.42 0.69 0.38 0.5 0.48 0.15 0.02 -0.14 -0.41 -0.12 -0.57 -0.61 -0.31 -0.45 -4.15 -0.95 -0.03 0.06 0.5 0.18
-0.02 0.0 -0.09 0.15 0.22 0.0 0.38 0.53 0.31 0.45 0.43 0.07 -0.07 0.04 -0.44 0.16 -0.03 -0.06 -0.17 -0.04 -3.27 -0.16 -0.62 -0.48 0.33 -0.36
-1.34 0.33 - 0.34 0.61 1.56 0.62 1.62 0.05 -2.13 -1.09 - -1.15 - - -0.9 -2.07 -0.43 -1.39 -0.83 -0.02 - 0.78 2.62 -1.07 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.