Heatmap: Cluster_190 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.11 0.09 0.05 0.15 0.18 0.01 0.19 0.25 0.2 0.26 0.49 0.34 0.15 0.18 0.12 0.1 0.12 0.12 0.13 0.17 0.21 0.37 0.5 0.58 1.0 0.54
0.6 0.35 0.35 0.67 0.45 0.31 0.48 0.68 0.59 0.61 0.75 0.7 0.45 0.22 0.11 0.17 0.17 0.29 0.22 0.22 0.13 0.6 0.56 0.59 0.85 1.0
0.51 0.34 0.37 0.54 0.4 0.26 0.36 0.44 0.39 0.52 0.54 0.46 0.37 0.23 0.24 0.15 0.17 0.26 0.24 0.23 0.06 0.44 0.6 0.46 1.0 0.72
0.32 0.28 0.13 0.3 0.18 0.04 0.27 0.44 0.3 0.42 0.56 0.31 0.43 0.2 0.12 0.12 0.27 0.32 0.17 0.12 0.08 1.0 0.06 0.1 0.62 0.45
0.78 0.36 0.39 0.83 0.55 0.26 0.43 0.71 0.49 0.56 0.76 0.59 0.45 0.33 0.18 0.27 0.14 0.28 0.17 0.2 0.13 0.67 0.65 0.41 0.86 1.0
0.46 0.11 0.17 0.62 0.34 0.13 0.24 0.43 0.36 0.54 0.57 0.38 0.21 0.09 0.02 0.05 0.03 0.11 0.06 0.04 0.08 0.56 0.41 0.31 1.0 0.71
0.59 0.33 0.21 0.35 0.24 0.22 0.37 0.47 0.56 0.68 0.83 0.73 0.46 0.27 0.16 0.18 0.22 0.38 0.34 0.28 0.43 1.0 0.61 0.69 0.81 0.69
0.63 0.31 0.26 0.56 0.45 0.26 0.31 0.45 0.31 0.34 0.49 0.41 0.54 0.31 0.17 0.26 0.18 0.21 0.16 0.16 0.12 0.73 0.41 0.56 1.0 0.64
0.72 0.53 0.38 0.62 0.54 0.31 0.54 0.65 0.62 0.8 1.0 0.84 0.59 0.33 0.13 0.32 0.27 0.25 0.12 0.21 0.09 0.6 0.71 0.6 0.87 0.78
0.8 0.43 0.43 0.61 0.6 0.46 0.63 0.58 0.62 0.61 0.7 0.77 1.0 0.48 0.48 0.42 0.28 0.45 0.37 0.28 0.31 0.77 0.72 0.54 0.9 0.7
0.91 0.5 0.43 0.72 0.62 0.53 0.61 0.87 0.91 0.87 1.0 0.86 0.98 0.63 0.43 0.67 0.39 0.63 0.42 0.32 0.36 0.94 0.85 0.69 0.85 0.8
0.6 0.42 0.4 0.45 0.23 0.13 0.34 0.49 0.42 0.6 0.86 0.98 0.87 0.47 0.26 0.34 0.32 0.34 0.29 0.24 0.09 0.22 0.5 0.63 1.0 0.77
0.93 0.4 0.5 0.96 0.66 0.38 0.61 0.77 0.52 0.69 0.89 0.72 1.0 0.18 0.12 0.15 0.15 0.11 0.15 0.21 0.15 0.45 0.77 0.36 0.83 0.92
0.88 0.45 0.51 0.8 0.65 0.42 0.68 0.8 0.45 0.68 0.86 0.75 0.91 0.27 0.14 0.22 0.18 0.18 0.2 0.27 0.2 0.4 0.98 0.78 0.94 1.0
0.5 0.35 0.34 0.6 0.42 0.29 0.39 0.55 0.56 0.62 0.71 0.56 0.49 0.3 0.36 0.26 0.24 0.31 0.25 0.27 0.09 0.44 0.43 0.4 1.0 0.75
0.58 0.24 0.22 0.54 0.43 0.25 0.39 0.55 0.42 0.49 0.65 0.55 0.57 0.26 0.15 0.24 0.11 0.18 0.14 0.12 0.21 0.73 0.54 0.5 1.0 0.7
0.73 0.62 0.51 0.62 0.65 0.53 0.71 0.76 0.71 0.74 0.81 0.81 0.7 0.44 0.29 0.45 0.47 0.67 0.39 0.45 0.47 0.97 0.98 0.88 1.0 0.77
0.75 0.42 0.35 0.63 0.63 0.41 0.63 0.68 0.68 0.77 0.85 0.78 0.91 0.44 0.32 0.49 0.24 0.32 0.29 0.21 0.21 0.68 0.6 0.43 1.0 0.73
0.66 0.32 0.21 0.54 0.5 0.26 0.37 0.45 0.49 0.57 0.78 0.68 0.57 0.2 0.16 0.31 0.13 0.23 0.21 0.11 0.24 0.76 0.6 0.67 1.0 0.62
0.38 0.12 0.12 0.34 0.28 0.29 0.38 0.21 0.45 0.6 0.82 0.78 0.52 0.14 0.18 0.15 0.16 0.22 0.24 0.13 0.18 0.95 0.69 0.65 1.0 0.62
0.6 0.39 0.36 0.7 0.69 0.51 0.71 0.74 0.83 0.77 0.87 0.8 0.66 0.65 0.37 0.56 0.39 0.41 0.4 0.3 0.48 1.0 0.83 0.82 0.98 0.8
0.61 0.52 0.36 0.38 0.39 0.38 0.52 0.58 0.6 0.65 0.76 0.72 0.77 0.56 0.36 0.47 0.25 0.29 0.28 0.24 0.19 1.0 0.55 0.62 0.65 0.67
0.41 0.54 0.52 0.59 0.53 0.41 0.45 0.45 0.4 0.35 0.38 0.41 0.36 0.56 0.17 0.63 0.3 0.27 0.21 0.24 0.07 0.47 0.58 0.38 1.0 0.57
0.62 0.3 0.31 0.51 0.58 0.49 0.42 0.39 0.28 0.31 0.5 0.77 0.82 0.48 0.23 0.38 0.31 0.31 0.19 0.25 0.1 0.38 0.45 0.44 1.0 0.73
1.0 0.56 0.47 0.72 0.56 0.4 0.43 0.63 0.58 0.65 0.91 0.89 0.91 0.77 0.52 0.58 0.45 0.28 0.39 0.28 0.31 0.61 0.87 0.68 0.97 0.79
0.57 0.33 0.29 0.53 0.48 0.27 0.49 0.54 0.59 0.63 0.86 0.76 0.76 0.31 0.21 0.29 0.21 0.26 0.17 0.14 0.34 0.95 0.75 0.64 1.0 0.6
0.35 0.49 0.45 0.71 0.68 0.46 0.53 0.51 0.53 0.53 0.6 0.53 0.36 0.45 0.31 0.41 0.28 0.31 0.29 0.29 0.06 0.48 0.5 0.42 1.0 0.65
0.78 0.51 0.37 0.78 0.69 0.32 0.41 0.6 0.35 0.41 0.66 0.42 0.68 0.11 0.04 0.09 0.1 0.12 0.06 0.13 0.12 1.0 0.82 0.6 0.92 0.96
0.58 0.59 0.45 0.83 0.62 0.33 0.41 0.49 0.52 0.48 0.63 0.6 0.43 0.33 0.2 0.27 0.22 0.39 0.32 0.18 0.1 0.97 0.69 0.55 1.0 0.79
0.33 0.29 0.09 0.29 0.36 0.09 0.43 0.41 0.44 0.45 0.53 0.27 0.39 0.44 0.12 0.3 0.12 0.2 0.25 0.02 0.13 1.0 0.66 0.43 0.95 0.77
0.58 0.37 0.41 0.49 0.53 0.43 0.59 0.55 0.5 0.56 0.65 0.75 0.81 0.46 0.44 0.52 0.44 0.49 0.41 0.43 0.06 0.48 0.86 0.64 1.0 0.71
0.74 0.68 0.6 0.69 0.64 0.56 0.68 0.79 0.81 0.8 0.79 0.8 0.74 0.68 0.6 0.65 0.44 0.57 0.52 0.43 0.08 0.75 0.83 0.8 1.0 0.88
0.68 0.4 0.56 0.7 0.39 0.18 0.34 0.62 0.58 0.56 0.72 0.87 0.7 0.64 0.4 0.43 0.29 0.31 0.33 0.27 0.16 0.46 0.55 0.53 1.0 0.88
0.61 0.26 0.3 0.57 0.55 0.3 0.52 0.62 0.58 0.58 0.76 0.82 0.65 0.39 0.24 0.31 0.24 0.24 0.19 0.16 0.23 0.53 0.72 0.75 1.0 0.7
0.64 0.63 0.59 0.75 0.55 0.36 0.47 0.56 0.58 0.62 0.72 0.66 0.6 0.56 0.28 0.36 0.26 0.4 0.26 0.28 0.09 0.43 0.43 0.47 1.0 0.7
0.46 0.21 0.21 0.31 0.33 0.19 0.33 0.39 0.42 0.37 0.53 0.7 0.72 0.43 0.36 0.53 0.33 0.3 0.27 0.18 0.28 1.0 0.62 0.58 0.89 0.65
0.61 0.42 0.48 0.72 0.52 0.31 0.38 0.54 0.23 0.38 0.55 0.54 1.0 0.47 0.16 0.4 0.19 0.21 0.17 0.18 0.1 0.3 0.49 0.32 0.91 0.63
0.89 0.44 0.33 0.42 0.47 0.42 0.46 0.5 0.59 0.69 0.77 0.85 0.79 0.7 0.49 0.62 0.29 0.36 0.34 0.25 0.1 0.85 0.67 0.5 1.0 0.81
1.0 0.49 0.46 0.7 0.6 0.34 0.57 0.74 0.6 0.68 0.99 0.95 0.95 0.57 0.3 0.5 0.25 0.25 0.26 0.24 0.12 0.48 0.53 0.74 0.76 0.56
0.68 0.35 0.45 0.66 0.79 0.63 0.74 0.84 0.88 0.84 0.93 1.0 0.88 0.66 0.41 0.71 0.45 0.73 0.44 0.47 0.37 0.82 0.93 0.77 0.94 0.71
0.5 0.14 0.16 0.26 0.18 0.19 0.55 0.71 0.56 0.63 0.86 0.57 0.56 0.27 0.18 0.28 0.2 0.39 0.17 0.19 0.25 0.84 0.44 0.28 1.0 0.58
0.46 0.22 0.23 0.5 0.39 0.26 0.31 0.41 0.44 0.42 0.63 0.63 0.32 0.25 0.09 0.21 0.12 0.21 0.12 0.14 0.29 0.52 0.63 0.81 1.0 0.77
0.33 0.15 0.14 0.32 0.5 0.21 0.3 0.33 0.41 0.36 0.62 0.47 0.33 0.24 0.06 0.15 0.08 0.19 0.14 0.04 0.23 0.6 0.65 0.62 1.0 0.68
1.0 0.32 0.39 0.5 0.21 0.09 0.2 0.5 0.27 0.38 0.53 0.54 0.75 0.26 0.12 0.16 0.08 0.08 0.13 0.15 0.02 0.4 0.54 0.22 0.55 0.83
0.43 0.3 0.44 0.47 0.43 0.37 0.5 0.58 0.72 0.67 0.64 0.59 0.44 0.47 0.27 0.38 0.31 0.42 0.31 0.36 0.05 0.6 0.54 0.45 1.0 0.94
0.82 0.62 0.58 0.88 0.76 0.64 0.64 0.77 0.68 0.68 0.77 0.68 0.71 0.68 0.53 0.58 0.36 0.53 0.4 0.43 0.18 0.47 0.7 0.68 0.88 1.0
0.48 0.18 0.23 0.53 0.57 0.4 0.39 0.34 0.19 0.34 0.48 0.53 0.6 0.5 0.15 0.3 0.13 0.11 0.09 0.08 0.02 0.33 0.29 0.3 1.0 0.67
0.43 0.27 0.39 0.65 0.72 0.42 0.59 0.64 0.56 0.57 0.67 0.79 0.57 0.31 0.27 0.43 0.23 0.31 0.32 0.23 0.33 0.64 0.4 0.47 0.85 1.0
0.56 0.43 0.35 0.64 0.67 0.61 0.32 0.33 0.4 0.45 0.55 0.51 0.26 0.0 0.0 0.32 0.09 0.0 0.08 0.0 0.28 0.99 0.92 0.41 1.0 0.87
0.66 0.28 0.33 0.52 0.49 0.36 0.59 0.67 0.59 0.62 0.69 0.77 0.84 0.45 0.3 0.47 0.35 0.34 0.25 0.27 0.13 0.51 0.48 0.57 1.0 0.87
0.42 0.29 0.26 0.44 0.42 0.55 0.39 0.38 0.46 0.48 0.5 0.53 0.34 0.39 0.23 0.41 0.08 0.21 0.19 0.14 0.16 0.52 0.45 0.35 1.0 0.82
0.85 0.48 0.47 0.46 0.5 0.37 0.66 0.64 0.52 0.68 0.76 0.83 0.86 0.28 0.32 0.36 0.41 0.71 0.41 0.49 0.52 1.0 0.68 0.69 0.82 0.7

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)