Heatmap: Cluster_184 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
1.0 0.69 0.55 0.62 0.71 0.81 0.84 0.93 0.99 0.83 0.76 0.7 0.98 0.41 0.37 0.39 0.38 0.48 0.34 0.38 0.09 0.33 0.84 0.59 0.74 0.72
0.68 0.19 0.2 0.19 0.12 0.1 0.4 0.43 0.37 0.72 0.86 0.91 0.84 0.19 0.08 0.09 0.37 0.39 0.33 0.43 0.01 0.04 1.0 0.57 0.48 0.38
0.58 0.57 0.72 0.78 0.84 0.78 0.59 0.57 0.68 0.78 0.97 1.0 0.76 0.5 0.58 0.72 0.57 0.54 0.52 0.6 0.37 0.61 0.84 0.57 0.54 0.58
0.38 0.47 0.62 0.58 0.53 0.62 0.49 0.46 0.64 0.62 0.89 0.9 0.28 0.36 0.58 0.45 0.43 0.37 0.47 0.47 0.25 0.57 1.0 0.88 0.36 0.38
0.63 0.17 0.17 0.19 0.34 0.51 0.76 0.78 0.69 0.81 0.83 1.0 0.81 0.25 0.22 0.2 0.3 0.48 0.34 0.54 0.25 0.46 0.77 0.42 0.4 0.53
0.54 0.32 0.33 0.28 0.19 0.14 0.29 0.39 0.54 0.69 0.9 1.0 0.64 0.27 0.3 0.27 0.35 0.5 0.46 0.34 0.03 0.33 0.64 0.73 0.46 0.4
0.54 0.43 0.47 0.37 0.32 0.19 0.29 0.36 0.34 0.47 0.68 0.9 0.71 0.14 0.22 0.15 0.11 0.23 0.3 0.18 0.07 0.09 1.0 0.82 0.44 0.61
0.41 0.34 0.4 0.22 0.15 0.14 0.24 0.37 0.62 0.76 0.97 0.99 0.62 0.3 0.31 0.29 0.09 0.21 0.23 0.22 0.14 0.35 1.0 0.92 0.74 0.34
0.35 0.77 0.71 0.61 0.56 0.76 0.54 0.56 0.69 0.78 0.85 0.95 0.52 0.49 0.52 0.57 0.52 0.47 0.52 0.62 0.14 0.61 1.0 1.0 0.48 0.56
0.52 0.27 0.19 0.15 0.18 0.23 0.34 0.43 0.55 0.85 1.0 0.95 0.62 0.16 0.22 0.15 0.07 0.54 0.27 0.28 0.09 0.11 0.64 0.43 0.19 0.12
0.51 0.28 0.18 0.18 0.14 0.2 0.31 0.45 0.58 0.74 1.0 0.86 0.63 0.14 0.15 0.13 0.06 0.63 0.2 0.22 0.09 0.17 0.87 0.32 0.18 0.12
0.18 0.08 0.09 0.09 0.07 0.08 0.24 0.36 0.48 0.7 1.0 0.99 0.38 0.09 0.04 0.06 0.14 0.31 0.24 0.25 0.09 0.34 0.48 0.69 0.51 0.35
0.74 0.15 0.07 0.07 0.14 0.23 0.36 0.54 0.71 0.54 1.0 0.85 0.81 0.15 0.08 0.13 0.16 0.3 0.25 0.21 0.04 0.33 0.44 0.5 0.19 0.35
1.0 0.69 0.2 0.06 0.05 0.16 0.36 0.39 0.41 0.55 0.71 0.91 0.81 0.02 0.06 0.03 0.12 0.26 0.19 0.18 0.05 0.02 0.68 0.72 0.19 0.07
1.0 0.61 0.25 0.1 0.05 0.13 0.29 0.38 0.47 0.55 0.74 0.88 0.81 0.05 0.05 0.02 0.15 0.2 0.2 0.21 0.05 0.06 0.96 0.71 0.21 0.08
0.98 0.56 0.46 0.44 0.12 0.07 0.28 0.62 0.47 0.61 0.78 0.93 1.0 0.03 0.09 0.07 0.18 0.22 0.17 0.3 0.15 0.14 0.4 0.63 0.46 0.28
0.59 0.36 0.3 0.34 0.28 0.3 0.3 0.35 0.4 0.52 0.64 0.74 0.65 0.14 0.21 0.13 0.16 0.36 0.35 0.18 0.13 0.22 0.9 1.0 0.49 0.43
0.79 0.63 0.31 0.34 0.4 0.31 0.49 0.67 0.76 0.8 0.84 0.79 1.0 0.1 0.25 0.19 0.22 0.43 0.37 0.36 0.03 0.05 0.67 0.25 0.35 0.48
0.51 0.53 0.53 0.48 0.72 0.67 0.52 0.43 0.49 0.57 0.74 0.86 0.65 0.52 0.28 0.23 0.25 0.27 0.4 0.29 0.21 0.67 1.0 0.54 0.37 0.55
0.41 0.46 0.36 0.27 0.3 0.24 0.24 0.22 0.35 0.62 0.62 0.95 0.34 0.11 0.13 0.14 0.14 0.31 0.3 0.24 0.09 0.05 1.0 0.64 0.13 0.34
0.63 0.74 0.48 0.27 0.16 0.15 0.3 0.44 0.53 0.73 0.86 1.0 0.73 0.19 0.1 0.35 0.5 0.36 0.25 0.36 0.3 0.27 0.56 0.55 0.31 0.24
0.73 0.72 0.5 0.26 0.16 0.2 0.29 0.43 0.57 0.62 0.84 1.0 0.86 0.13 0.09 0.24 0.36 0.18 0.22 0.28 0.13 0.12 0.25 0.32 0.14 0.15
0.71 0.46 0.43 0.38 0.45 0.51 0.44 0.49 0.63 0.68 0.91 1.0 0.84 0.3 0.3 0.46 0.36 0.23 0.29 0.29 0.11 0.25 0.83 0.66 0.22 0.21
1.0 0.95 0.53 0.3 0.2 0.3 0.48 0.6 0.66 0.6 0.72 0.86 1.0 0.26 0.17 0.25 0.32 0.37 0.25 0.28 0.17 0.52 0.57 0.69 0.61 0.37
0.4 0.38 0.31 0.33 0.19 0.28 0.25 0.28 0.59 0.54 0.67 0.86 0.3 0.21 0.25 0.23 0.3 0.25 0.3 0.13 0.15 0.05 1.0 0.49 0.47 0.31
0.18 0.33 0.48 0.44 0.56 0.61 0.53 0.53 0.73 0.68 0.83 0.71 0.16 0.42 0.49 0.39 0.44 0.36 0.5 0.4 0.25 0.48 1.0 0.64 0.44 0.43
0.38 0.33 0.35 0.43 0.52 0.58 0.44 0.37 0.5 0.57 0.76 0.89 0.45 0.45 0.4 0.35 0.22 0.15 0.2 0.19 0.31 0.5 1.0 0.92 0.49 0.62
0.89 0.67 0.49 0.49 0.24 0.31 0.44 0.51 0.68 0.73 0.91 0.92 0.85 0.25 0.24 0.19 0.23 0.19 0.31 0.22 0.12 0.3 0.78 1.0 0.33 0.28
0.79 0.63 0.33 0.55 0.5 0.55 0.61 0.6 0.7 0.72 0.91 1.0 0.85 0.16 0.36 0.26 0.22 0.32 0.38 0.32 0.02 0.2 0.78 0.38 0.47 0.34
0.44 0.39 0.32 0.25 0.29 0.34 0.33 0.45 0.6 0.68 0.61 0.55 0.43 0.31 0.33 0.51 0.32 0.55 0.4 0.35 0.13 0.43 1.0 0.48 0.39 0.41
0.47 0.64 0.59 0.66 0.71 0.79 0.7 0.72 0.85 0.81 0.93 1.0 0.52 0.62 0.59 0.56 0.47 0.51 0.59 0.42 0.23 0.6 0.9 0.74 0.57 0.43
0.87 0.46 0.37 0.62 0.47 0.71 0.74 0.8 0.92 0.81 1.0 0.92 0.93 0.14 0.17 0.16 0.12 0.47 0.44 0.29 0.1 0.15 0.69 0.58 0.29 0.28
0.93 0.52 0.35 0.23 0.25 0.34 0.59 0.67 0.76 0.8 0.85 0.86 0.75 0.19 0.4 0.28 0.37 0.49 0.41 0.39 0.1 0.4 1.0 0.42 0.45 0.31
0.27 0.01 0.03 0.08 0.16 0.12 0.21 0.25 0.35 0.48 0.72 1.0 0.51 0.25 0.1 0.15 0.13 0.18 0.13 0.18 0.07 0.14 0.43 0.34 0.15 0.25
0.96 0.96 0.54 0.33 0.22 0.36 0.5 0.6 0.75 0.71 0.86 1.0 0.83 0.32 0.15 0.23 0.36 0.36 0.28 0.31 0.16 0.28 0.52 0.75 0.45 0.3
0.71 0.57 0.39 0.44 0.5 0.39 0.55 0.57 0.62 0.77 0.81 1.0 0.82 0.38 0.37 0.31 0.31 0.51 0.42 0.32 0.05 0.18 0.58 0.79 0.43 0.45
0.59 0.38 0.36 0.36 0.41 0.43 0.41 0.56 0.71 1.0 0.96 0.96 0.59 0.35 0.33 0.45 0.48 0.56 0.51 0.32 0.19 0.08 0.96 0.7 0.65 0.58
0.63 0.5 0.44 0.55 0.46 0.47 0.62 0.66 0.71 0.77 0.93 1.0 0.55 0.5 0.4 0.51 0.37 0.49 0.46 0.44 0.15 0.3 0.87 0.68 0.53 0.51
0.48 0.27 0.3 0.38 0.44 0.4 0.28 0.29 0.3 0.47 0.73 1.0 0.59 0.18 0.14 0.08 0.05 0.05 0.08 0.05 0.13 0.12 0.91 0.64 0.26 0.29
0.78 0.69 0.42 0.29 0.15 0.09 0.28 0.41 0.54 0.6 0.71 0.76 1.0 0.09 0.21 0.15 0.18 0.23 0.25 0.17 0.01 0.06 0.25 0.49 0.44 0.25
0.89 0.59 0.51 0.47 0.46 0.48 0.62 0.73 0.76 0.81 0.91 1.0 0.93 0.28 0.43 0.35 0.52 0.51 0.46 0.48 0.09 0.42 0.65 0.48 0.45 0.36
0.9 0.96 0.63 0.33 0.24 0.35 0.54 0.64 0.7 0.69 0.78 0.9 1.0 0.18 0.1 0.12 0.2 0.19 0.14 0.19 0.2 0.16 0.29 0.32 0.29 0.21
0.79 0.66 0.7 0.75 0.79 0.68 0.67 0.7 0.66 0.81 0.85 0.97 0.92 0.51 0.5 0.56 0.56 0.51 0.53 0.55 0.41 0.62 1.0 0.93 0.62 0.62
0.25 0.26 0.16 0.27 0.28 0.14 0.16 0.18 0.51 0.63 0.75 0.73 0.17 0.1 0.09 0.05 0.16 0.42 0.2 0.15 0.06 0.37 1.0 0.39 0.22 0.36
0.36 0.45 0.27 0.15 0.04 0.02 0.06 0.16 0.17 0.34 0.62 0.84 0.68 0.08 0.04 0.01 0.03 0.08 0.07 0.07 0.06 0.12 1.0 0.66 0.3 0.32
0.55 0.36 0.21 0.17 0.09 0.07 0.15 0.23 0.42 0.56 0.72 1.0 0.62 0.06 0.11 0.17 0.19 0.21 0.16 0.16 0.11 0.17 0.59 0.52 0.27 0.07
0.48 0.26 0.19 0.17 0.12 0.08 0.15 0.21 0.24 0.38 0.62 1.0 0.5 0.07 0.07 0.13 0.18 0.23 0.15 0.27 0.06 0.29 0.15 0.32 0.12 0.15
0.68 0.53 0.56 0.63 0.73 0.78 0.58 0.55 0.65 0.72 0.92 1.0 0.75 0.48 0.41 0.5 0.44 0.32 0.52 0.48 0.27 0.54 0.87 0.65 0.52 0.47
0.5 0.54 0.42 0.24 0.27 0.24 0.44 0.51 0.63 0.7 0.78 1.0 0.58 0.25 0.16 0.17 0.15 0.53 0.28 0.31 0.04 0.11 0.92 0.36 0.3 0.49
0.29 0.32 0.58 0.7 0.69 0.7 0.63 0.63 0.8 0.84 1.0 0.97 0.38 0.46 0.41 0.64 0.52 0.54 0.62 0.46 0.3 0.66 0.84 0.94 0.6 0.56
0.88 1.0 0.64 0.43 0.31 0.42 0.5 0.58 0.64 0.59 0.7 0.84 0.88 0.43 0.25 0.35 0.5 0.29 0.37 0.43 0.11 0.49 0.36 0.65 0.59 0.35

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)