1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_9 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
1.5 - - 2.32 - 1.38 - - - - - - - - - - - - - 0.99 2.7 - - - 1.69 1.94
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 0.86 - - - 0.89 1.95 0.16 - - 3.75 - 1.96 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.34 - 2.51 - - -
0.9 - - - - - 1.21 - 1.19 - 1.16 - 1.6 - - - - 1.87 - - 2.76 1.95 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - 1.58 - 1.7 - 0.91 - -0.3 - -0.41 - - - 1.08 - 1.39 -0.57 -0.5 -0.8 3.09 - - 0.18 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.11 - 3.13 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 2.03 - - - - - 2.81 3.9 - - - - -
- - - - 2.13 - - - - - - - - - - - - - - - 4.22 - - 1.55 - -
-1.67 - - - - - - -1.34 - - -2.98 - - -2.6 0.87 -0.84 0.45 -3.69 - -3.03 2.89 1.63 0.45 2.7 -0.76 1.05
- - - - - - - - - - - -2.11 - -2.8 1.24 -0.13 0.18 - -2.57 - 3.06 1.63 1.23 2.31 -0.55 0.71
- - - - - - - - - - - - - - 1.17 - - -2.59 - -2.22 3.21 2.07 -0.47 2.87 0.6 -1.42
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.67 0.5 - - 1.66 3.12
- - - - - - - - - - - - - - 2.49 - - - 2.74 - 1.76 - 3.37 - - -
- - -1.97 -0.89 -2.07 -0.24 - -1.76 0.4 -0.03 -1.96 -1.88 0.05 - -2.05 0.45 - -0.04 - -0.62 2.92 1.54 1.11 -0.36 0.97 0.45
- - - - 0.22 0.22 - - 0.31 - 1.31 1.43 - - - - - 0.9 - - 3.5 - -0.06 - 1.66 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.6 3.79 - - - -
- - - - 3.54 - - - - - - - - - - - - - - - 3.85 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - -1.56 - - - -1.49 - - - - - -3.91 - - 4.63 - - -0.97 - -
- - - - - - - - - - - 3.69 - - 2.5 - - - - - 2.9 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.96 3.39 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 2.0 - - 4.46 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
-1.21 -0.42 -0.76 -0.83 -0.85 0.26 0.25 0.37 0.43 -2.14 0.35 -1.08 -0.39 0.14 -1.35 -0.27 -0.8 0.31 -0.09 -0.07 0.63 - 1.51 -0.45 1.49 0.48
- - - - - - - - 1.72 - - 1.83 - - - - - - - - 4.26 - - - - -
- - - -0.29 - -0.23 - - - - - 1.85 - - 1.66 0.69 - 1.18 - - 2.66 0.94 1.68 - - 1.18
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.58 - 1.01 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.88 - 3.49 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 3.59 - - - - - - - - 3.81 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.33 - - - 2.55 -
- -1.71 - -1.21 -1.39 -1.04 - -1.26 -1.3 - - - - 1.06 0.1 - -0.18 1.59 -1.64 0.7 3.43 - 0.61 1.2 - -
- - - - - - - - - 1.86 - - - - 3.24 - 2.1 - - - - - 3.11 - - -
0.13 0.91 - 0.62 0.11 -1.37 -1.42 -1.6 0.55 -0.72 0.87 - -1.18 - -1.71 - 1.44 -2.37 - -0.78 2.33 0.32 0.86 -0.33 0.33 0.06
- - - - - - - - - 3.05 - - - - - - - - - - 4.15 - - - - -
- 0.91 - - - - - - - 0.66 - - - 0.61 1.69 - - 0.63 - 1.55 3.42 - - - - 1.36
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
0.82 1.37 - 1.2 1.31 1.02 - - 2.18 - - 1.21 - - - - - - - - 2.31 - 0.74 - 0.45 -
- - - - - 0.61 - - - - - 0.69 1.0 - - 2.08 - 1.91 0.53 - 3.24 - - - -0.01 0.02
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.67 3.35 - 3.24 - - -
3.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.63 - 1.0 1.28 - -
- - - - - - - - 2.56 - - - - - - - - - - - 4.33 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - 1.46 - - - - - - 0.67 - - 1.23 - 1.18 - 3.9 - 1.11 - - -
- - - - - - - 2.95 - - - - - - - - - - - - 4.19 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - 1.08 3.48 - - - - - - - - - - - 2.66 - 2.68 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.66 - - - - 0.55 - - - 2.33 - - - - 0.89 - - - 3.5 0.4 1.78 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.45 - 2.05 - - -
- - - - - - - - - - - - 3.16 - - - - - - - 4.09 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
-3.38 -3.5 - - -0.21 - - -2.19 -3.09 -0.57 -0.76 0.34 0.14 -0.81 2.63 0.53 -0.54 -3.67 -0.7 -0.34 2.23 1.37 -1.59 -0.97 0.81 -0.45
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- 1.09 - 0.92 - - - - - - - - - 0.68 2.63 1.91 0.81 - - - 1.64 - 1.46 0.74 0.17 -
- - - - - - - - 1.36 - - - - - - - - - - - 3.2 3.44 0.72 - - 0.8
- - - - - - - - - - - - - - 1.79 - 3.01 - - - 3.5 - 1.66 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 1.66 - 0.14 2.26 - 3.39 2.39 0.31 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.7 - - - - -
- - - - - 1.23 - - - - - - - - - - - - - - 3.47 3.65 - - - -
- - - - - 3.81 - - - - - - - - - - - - - - 3.58 - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.