1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_90 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
1.58 0.43 0.47 1.11 1.78 0.88 0.85 1.06 1.07 0.96 1.49 2.24 1.24 0.24 0.4 0.23 0.31 0.65 0.55 0.43 1.68 1.74 8.24 6.35 1.16 1.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.09 0.05 0.72 0.35 0.21 0.14
1.33 0.83 0.62 0.85 0.65 1.05 1.1 1.07 0.93 1.27 1.18 1.17 1.02 0.33 0.28 0.15 0.61 1.26 0.96 0.61 0.13 2.1 1.54 0.48 2.02 1.5
0.07 0.12 0.21 0.46 0.32 0.42 0.22 0.46 0.35 0.06 0.87 0.91 0.68 0.4 0.12 0.13 0.23 0.35 0.27 0.06 1.33 0.1 4.7 0.95 0.42 0.55
0.38 0.02 0.0 0.04 0.07 0.03 0.0 0.0 0.02 0.02 0.11 0.14 0.0 0.02 0.04 0.04 0.0 0.14 0.0 0.02 0.39 0.12 1.57 0.16 0.18 0.22
0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.02 0.02 0.21 0.28 0.07 0.03 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.06 0.05 0.72 0.22 0.1 0.08
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.05 0.0
0.07 0.1 0.05 0.0 0.05 0.04 0.18 0.0 0.05 0.08 0.13 0.19 0.04 0.0 0.04 0.09 0.05 0.0 0.0 0.0 0.32 0.12 0.65 0.0 0.06 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.07 0.02 0.03 0.07 0.11 0.07 0.28 0.0 0.68 0.05 0.21 0.09
0.26 0.03 0.05 0.22 0.33 0.42 0.5 0.27 0.43 0.47 0.4 0.3 0.29 0.16 0.04 0.0 0.0 0.23 0.19 0.07 1.02 0.03 2.37 0.44 0.12 0.29
0.09 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.05 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.42 0.09 0.06 0.11
0.04 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.05 0.05 0.07 0.13 0.0 0.37 0.0 0.86 0.1 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.18 0.2 0.05 0.49 0.32 1.57 0.5 0.1 0.49
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0
0.66 0.38 0.17 0.17 0.06 0.18 0.35 0.2 0.16 0.34 0.24 0.42 0.15 0.6 0.57 0.5 0.12 0.43 0.07 0.25 1.28 0.53 3.31 0.34 0.84 1.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.31 0.12 0.04 0.16 0.1 0.1 0.11 0.05 0.02 0.0 0.17 0.09 0.17 0.07 0.0 0.12 0.03 0.09 0.11 0.03 0.14 0.3 0.96 0.29 0.33 0.65
12.27 3.21 2.26 1.28 2.0 3.17 2.68 2.81 3.52 3.98 3.92 5.68 9.8 1.74 2.83 2.0 2.77 2.56 2.71 2.87 2.73 7.62 30.8 12.47 4.74 4.67
0.13 0.07 0.23 0.33 0.25 0.16 0.27 0.1 0.2 0.25 0.34 0.28 0.29 0.27 0.16 0.21 0.14 0.04 0.29 0.09 0.19 0.04 1.24 0.4 0.06 0.12
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.09 0.03 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.07
0.39 0.07 0.09 0.2 0.25 0.1 0.16 0.15 0.04 0.14 0.26 0.09 0.13 0.01 0.0 0.02 0.02 0.11 0.07 0.03 0.28 0.07 0.48 0.13 0.62 0.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.02 0.0 0.2 0.0 0.0 0.03
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.05 0.0 0.27 0.03 0.48 0.0 0.0 0.3
0.34 0.16 0.14 0.07 0.14 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.06 0.0 0.21 0.09 0.24 0.0 0.54 0.48 0.05 0.05 0.43 0.26 1.27 0.43 0.63 0.81
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 41.37 10.17 42.17 99.0 26.49 13.78
0.09 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 30.45 7.74 31.57 65.0 19.87 9.28
0.25 0.16 0.0 0.5 0.07 0.33 0.52 0.58 0.27 0.18 0.85 0.61 0.58 0.06 0.06 0.12 0.0 0.35 0.0 0.16 5.94 0.33 12.13 4.74 3.89 4.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0
0.11 0.3 0.19 0.48 0.84 0.84 1.19 0.78 0.1 0.47 0.23 0.16 0.1 0.59 0.79 0.44 0.62 1.54 0.89 0.51 1.04 0.36 2.79 0.74 0.21 0.41
1.27 1.01 1.44 2.32 1.91 2.29 2.91 2.38 3.47 2.42 2.22 1.85 1.07 0.75 1.85 2.05 2.85 2.06 3.24 2.47 3.95 0.47 5.44 1.91 0.35 1.75
0.13 0.03 0.04 0.02 0.06 0.03 0.0 0.02 0.11 0.08 0.23 0.09 0.13 0.05 0.02 0.0 0.0 0.02 0.21 0.0 0.32 0.0 1.68 0.12 0.03 0.05
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.09 0.08 0.19 0.0 0.0 0.1 0.06 0.07 0.0 2.9 0.17 6.14 0.27 0.06 0.06
0.11 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.02 0.06 0.0 0.28 0.42 0.08 0.0 0.0 0.02 0.0 0.09 0.09 0.0 0.02 0.28 1.22 0.27 0.74 0.68
0.32 0.72 0.07 0.23 0.2 0.52 0.33 0.2 0.23 0.27 0.38 0.33 0.09 0.16 0.06 0.36 0.08 0.34 0.88 1.21 2.01 0.0 5.6 0.53 0.08 0.21
0.04 0.07 0.04 0.09 0.0 0.03 0.03 0.0 0.25 0.29 0.34 0.35 0.0 0.07 0.08 0.05 0.08 0.04 0.09 0.0 0.76 0.0 2.55 0.87 0.08 0.37
0.0 0.03 0.0 0.07 0.02 0.05 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.1 0.02 0.63 0.0 0.01 0.0
0.08 0.0 0.04 0.04 0.13 0.0 0.2 0.05 0.04 0.11 0.15 0.05 0.24 0.1 0.04 0.12 0.29 0.32 0.14 0.04 0.44 0.21 2.54 0.53 0.23 0.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.06 0.23 0.2 0.18 0.13 0.28 0.28 0.29 0.11 0.22 0.21 0.12 0.2 0.03 0.06 0.06 0.07 0.03 0.06 0.03 0.12 0.03 3.61 0.52 0.04 0.06
0.63 0.27 0.07 0.18 0.08 0.11 0.31 0.37 0.35 0.25 0.38 0.72 0.31 0.19 0.08 0.09 0.08 0.2 0.04 0.07 0.33 0.54 5.0 1.82 0.59 0.68
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03
0.11 0.1 0.09 0.21 0.11 0.27 0.2 0.15 0.05 0.04 0.11 0.02 0.05 0.03 0.06 0.11 0.12 0.1 0.0 0.0 0.96 0.1 0.54 0.05 0.15 0.12
0.45 0.39 0.54 0.38 0.36 0.47 0.53 0.49 0.54 0.27 0.32 0.72 0.23 0.83 0.45 0.83 0.42 0.44 0.4 0.42 0.57 0.61 1.22 1.18 1.76 1.17
0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.02 0.09 0.02 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.32 0.14 0.71 0.25 0.15 0.07
0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.02 1.42 0.03 1.59 0.11 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.17 0.02 0.05 0.0 0.09 0.02 0.08 0.08 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.18 0.66 0.0 0.08 0.19
0.11 0.0 0.0 0.09 0.12 0.0 0.0 0.15 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.2 0.26 0.0 0.24 0.15 0.07 1.23 0.07 3.02 0.43 0.35 0.35
0.34 0.32 0.26 0.65 0.33 0.13 0.5 0.27 0.64 0.63 0.93 1.54 0.71 0.35 0.22 0.41 0.06 0.32 0.1 0.14 0.61 0.12 3.02 0.57 0.09 0.15
0.0 0.07 0.15 0.0 0.07 0.14 0.0 0.13 0.26 0.12 0.21 0.23 0.09 0.06 0.0 0.27 0.93 1.52 1.72 1.39 14.9 5.82 33.48 53.78 17.85 16.3
0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.31 0.0 0.6 0.03 0.0 0.01
0.36 0.61 0.2 0.09 0.05 0.12 0.05 0.0 0.15 0.4 0.4 0.4 0.03 0.01 0.61 0.0 0.0 0.36 0.02 0.07 0.6 1.73 6.73 7.96 2.15 2.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.31
0.93 0.91 0.36 0.09 0.68 0.41 0.37 0.53 0.64 0.37 0.77 1.49 1.26 0.03 0.16 0.04 0.09 0.21 0.25 0.22 0.58 0.0 4.9 2.01 0.28 0.54
0.35 0.65 0.61 0.53 0.32 0.98 0.36 0.18 0.31 1.11 0.6 0.37 0.34 0.7 0.47 0.47 0.64 1.23 0.83 0.77 0.54 0.59 2.57 0.57 2.27 1.09
0.12 0.0 0.05 0.02 0.09 0.0 0.08 0.12 0.07 0.02 0.17 0.07 0.03 0.04 0.06 0.02 0.03 0.05 0.02 0.05 1.84 0.0 2.37 0.09 0.09 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.12 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.02 0.42 0.32 0.0 0.1
0.04 0.0 0.04 0.09 0.22 0.11 0.08 0.08 0.18 0.1 0.32 0.35 0.0 0.27 0.12 0.07 0.12 0.19 0.09 0.08 1.42 0.0 2.46 1.76 0.4 0.44
0.42 0.05 0.11 0.64 0.52 0.14 0.09 0.31 0.22 0.14 0.45 0.28 0.07 0.01 0.08 0.28 0.07 0.3 0.12 0.04 0.65 0.09 0.87 0.53 0.99 0.72
0.14 0.05 0.14 0.07 0.3 0.3 0.69 0.46 0.41 0.83 0.93 0.3 0.09 0.0 0.42 0.06 0.06 0.37 1.09 0.0 1.01 0.18 6.41 1.24 0.55 0.44
0.22 0.0 0.0 0.48 0.15 0.09 0.31 0.36 0.86 0.35 0.57 0.49 0.08 0.44 0.24 0.18 0.09 0.05 0.07 0.0 2.11 0.22 6.56 0.43 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.27 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.15 0.21 0.05 0.05 0.4 0.21 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.22 0.07 0.03 0.11 0.0 0.92 0.19 0.11 0.29
0.15 0.12 0.14 0.32 0.19 0.07 0.24 0.22 0.02 0.06 0.15 0.09 0.0 0.05 0.02 0.23 0.1 0.11 0.11 0.02 0.16 0.47 0.85 0.23 0.44 0.33
0.15 0.13 0.13 0.11 0.08 0.1 0.1 0.04 0.02 0.08 0.08 0.07 0.31 0.07 0.06 0.11 0.0 0.15 0.17 0.04 0.39 0.0 0.65 0.13 0.13 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.03 0.02 0.17 0.05 0.03 0.32 1.11 1.01 1.22 0.56 0.0 0.58 0.3 0.09 0.17 0.04 0.07 0.19 0.53 0.02 3.7 1.07 0.1 0.35
0.56 0.03 0.0 1.13 0.77 0.0 0.27 0.48 0.37 0.41 0.84 0.47 0.15 0.06 0.04 0.05 0.1 0.13 0.07 0.03 1.04 1.3 2.13 3.77 1.06 0.75
0.2 0.32 0.86 0.99 0.67 0.65 0.37 0.18 0.33 0.21 0.32 0.16 0.14 0.65 0.2 0.29 0.26 0.35 0.46 0.74 3.3 0.14 2.19 0.53 0.21 0.41
0.04 0.21 0.09 0.38 0.62 0.71 0.85 0.47 0.9 0.72 0.96 0.7 0.05 0.24 0.52 1.16 0.28 0.49 0.25 0.19 1.91 0.89 5.65 2.51 1.37 0.33
0.04 0.02 0.05 0.02 0.0 0.0 0.02 0.07 0.11 0.04 0.15 0.09 0.03 0.03 0.06 0.0 0.0 0.08 0.04 0.02 0.04 0.31 0.28 0.07 0.19 0.16
2.38 2.15 1.25 1.4 1.39 1.27 1.52 1.34 1.28 2.76 2.42 2.99 2.12 0.24 0.55 0.68 0.97 0.82 0.29 0.56 2.55 0.69 11.78 4.01 3.15 1.29
0.11 0.0 0.0 0.02 0.14 0.06 0.08 0.05 0.19 0.04 0.38 0.26 0.09 0.06 0.1 0.07 0.09 0.11 0.09 0.1 0.95 0.2 2.77 1.97 0.7 0.91
0.09 0.03 0.02 0.22 0.1 0.09 0.11 0.17 0.11 0.4 0.38 0.3 0.18 0.11 0.33 0.18 0.08 0.46 0.7 0.23 1.08 0.16 3.78 1.78 0.62 0.92
0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.29 0.24 1.24 1.75 0.0 2.51 0.49 0.05 0.0
0.45 0.25 0.07 0.25 0.38 0.52 0.24 0.48 0.4 0.43 0.56 0.54 0.15 0.15 0.04 0.17 0.26 0.35 0.07 0.14 0.72 0.27 2.19 1.88 0.58 0.63
0.06 0.13 0.11 0.14 0.0 0.02 0.09 0.13 0.02 0.02 0.09 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.1 0.09 0.02 0.02 0.14 0.04 1.34 0.32 0.08 0.09
0.0 0.04 0.07 0.02 0.12 0.03 0.12 0.07 0.02 0.06 0.04 0.02 0.03 0.08 0.1 0.04 0.16 0.14 0.12 0.04 0.3 0.1 0.68 0.11 0.23 0.14
0.27 0.12 0.12 0.12 0.02 0.0 0.04 0.17 0.18 0.2 0.32 0.14 0.1 0.0 0.0 0.02 0.02 0.11 0.11 0.05 0.07 0.07 2.08 0.77 0.45 0.11
0.04 0.0 0.05 0.0 0.02 0.05 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.05 0.08 0.1 0.6 0.0 0.07 0.18
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.09 0.04 0.17 0.19 0.06 0.1 0.12 0.05 0.0 0.24 0.28 0.12 0.96 0.19 2.2 0.68 0.33 0.37
0.14 0.0 0.02 0.13 0.15 0.16 0.19 0.18 0.4 0.21 0.38 0.26 0.08 0.13 0.16 0.15 0.05 0.28 0.15 0.04 1.0 0.7 2.05 0.96 0.79 0.33

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)